MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 88030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010001	GAT	2	6	234125	234130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878346
4002	NC_010001	TTAA	2	8	234138	234145	50 %	50 %	0 %	0 %	160878346
4003	NC_010001	GTA	2	6	234541	234546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878347
4004	NC_010001	AGA	2	6	234555	234560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878347
4005	NC_010001	ATG	2	6	234586	234591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878347
4006	NC_010001	ATT	2	6	234594	234599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878347
4007	NC_010001	TCTGA	2	10	234642	234651	20 %	40 %	20 %	20 %	160878347
4008	NC_010001	ATT	2	6	234652	234657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878347
4009	NC_010001	GAG	2	6	234685	234690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878347
4010	NC_010001	ATT	2	6	234735	234740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878347
4011	NC_010001	TGG	2	6	234781	234786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878347
4012	NC_010001	ATT	2	6	234852	234857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878347
4013	NC_010001	TTA	2	6	234880	234885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878347
4014	NC_010001	AGA	2	6	234896	234901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878347
4015	NC_010001	ATT	2	6	234909	234914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878347
4016	NC_010001	ATG	2	6	234937	234942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878347
4017	NC_010001	A	6	6	235204	235209	100 %	0 %	0 %	0 %	160878348
4018	NC_010001	ATG	2	6	235285	235290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878348
4019	NC_010001	TTAT	2	8	235304	235311	25 %	75 %	0 %	0 %	160878348
4020	NC_010001	GTAT	2	8	235352	235359	25 %	50 %	25 %	0 %	160878348
4021	NC_010001	CAATTG	2	12	235382	235393	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	160878348
4022	NC_010001	GAA	2	6	235405	235410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878348
4023	NC_010001	GAAACT	2	12	235413	235424	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	160878348
4024	NC_010001	ACA	2	6	235522	235527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878348
4025	NC_010001	T	6	6	235582	235587	0 %	100 %	0 %	0 %	160878348
4026	NC_010001	T	6	6	235619	235624	0 %	100 %	0 %	0 %	160878348
4027	NC_010001	GGT	2	6	235777	235782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878348
4028	NC_010001	TAG	2	6	235817	235822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878348
4029	NC_010001	ATGT	2	8	235826	235833	25 %	50 %	25 %	0 %	160878348
4030	NC_010001	AGC	2	6	235859	235864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878348
4031	NC_010001	CAA	2	6	235892	235897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878348
4032	NC_010001	A	6	6	235896	235901	100 %	0 %	0 %	0 %	160878348
4033	NC_010001	TAC	2	6	235916	235921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878348
4034	NC_010001	TGA	2	6	235932	235937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878348
4035	NC_010001	GGGC	2	8	236001	236008	0 %	0 %	75 %	25 %	160878348
4036	NC_010001	AT	4	8	236090	236097	50 %	50 %	0 %	0 %	160878348
4037	NC_010001	GAT	2	6	236146	236151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878348
4038	NC_010001	GAA	2	6	236155	236160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878348
4039	NC_010001	ATA	2	6	236173	236178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878348
4040	NC_010001	ATC	2	6	236180	236185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878348
4041	NC_010001	CTT	2	6	236201	236206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878348
4042	NC_010001	CATA	2	8	236219	236226	50 %	25 %	0 %	25 %	160878348
4043	NC_010001	GAAA	2	8	236231	236238	75 %	0 %	25 %	0 %	160878348
4044	NC_010001	AGA	2	6	236439	236444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878348
4045	NC_010001	TGC	2	6	236498	236503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878348
4046	NC_010001	GAA	2	6	236538	236543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878348
4047	NC_010001	GCA	2	6	236545	236550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878348
4048	NC_010001	GAT	2	6	236686	236691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878349
4049	NC_010001	TCC	2	6	236707	236712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878349
4050	NC_010001	ATG	2	6	236861	236866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878349
4051	NC_010001	TTC	2	6	236927	236932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878349
4052	NC_010001	ATCC	2	8	237011	237018	25 %	25 %	0 %	50 %	160878349
4053	NC_010001	AGC	2	6	237063	237068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878349
4054	NC_010001	TGA	2	6	237087	237092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878349
4055	NC_010001	GCA	2	6	237121	237126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878349
4056	NC_010001	CA	3	6	237161	237166	50 %	0 %	0 %	50 %	160878349
4057	NC_010001	A	6	6	237171	237176	100 %	0 %	0 %	0 %	160878349
4058	NC_010001	TAC	2	6	237184	237189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878349
4059	NC_010001	GAG	2	6	237271	237276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878349
4060	NC_010001	AGG	2	6	237308	237313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878349
4061	NC_010001	TGG	2	6	237370	237375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878349
4062	NC_010001	TAT	2	6	237379	237384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878349
4063	NC_010001	ACCAA	2	10	237396	237405	60 %	0 %	0 %	40 %	160878349
4064	NC_010001	GA	3	6	237541	237546	50 %	0 %	50 %	0 %	160878349
4065	NC_010001	AG	3	6	237633	237638	50 %	0 %	50 %	0 %	160878349
4066	NC_010001	TAGAT	2	10	237672	237681	40 %	40 %	20 %	0 %	160878349
4067	NC_010001	AG	3	6	237712	237717	50 %	0 %	50 %	0 %	160878349
4068	NC_010001	CCAA	2	8	237760	237767	50 %	0 %	0 %	50 %	160878349
4069	NC_010001	GCAG	2	8	237777	237784	25 %	0 %	50 %	25 %	160878349
4070	NC_010001	TTA	2	6	237795	237800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878349
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4074	NC_010001	TAT	2	6	237967	237972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878349
4075	NC_010001	GAT	2	6	238048	238053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878349
4076	NC_010001	TAG	2	6	238076	238081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878349
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4078	NC_010001	CAG	2	6	238121	238126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878349
4079	NC_010001	ATT	2	6	238133	238138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878349
4080	NC_010001	TAT	2	6	238141	238146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878349
4081	NC_010001	TAC	2	6	238478	238483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878350
4082	NC_010001	GAGG	2	8	238490	238497	25 %	0 %	75 %	0 %	160878350
4083	NC_010001	CAA	2	6	238502	238507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878350
4084	NC_010001	ATC	2	6	238521	238526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878350
4085	NC_010001	ACA	2	6	238561	238566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878350
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4087	NC_010001	TTA	2	6	238668	238673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878350
4088	NC_010001	CAT	2	6	238786	238791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878350
4089	NC_010001	AATAG	2	10	238796	238805	60 %	20 %	20 %	0 %	160878350
4090	NC_010001	T	7	7	238806	238812	0 %	100 %	0 %	0 %	160878350
4091	NC_010001	TTG	2	6	238835	238840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878350
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4093	NC_010001	TCCA	2	8	238916	238923	25 %	25 %	0 %	50 %	160878350
4094	NC_010001	ATAAG	2	10	239033	239042	60 %	20 %	20 %	0 %	160878350
4095	NC_010001	ATA	2	6	239132	239137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878350
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4101	NC_010001	GA	3	6	239368	239373	50 %	0 %	50 %	0 %	160878350
4102	NC_010001	CGA	2	6	239390	239395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878350
4103	NC_010001	TTA	2	6	239434	239439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878350
4104	NC_010001	CTC	2	6	239444	239449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878350
4105	NC_010001	T	7	7	239455	239461	0 %	100 %	0 %	0 %	160878350
4106	NC_010001	CAA	2	6	239524	239529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878350
4107	NC_010001	GCA	2	6	239551	239556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878350
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4109	NC_010001	TCA	2	6	239632	239637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878350
4110	NC_010001	AG	3	6	239675	239680	50 %	0 %	50 %	0 %	160878350
4111	NC_010001	TAAT	2	8	239896	239903	50 %	50 %	0 %	0 %	160878350
4112	NC_010001	CCT	2	6	239907	239912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878350
4113	NC_010001	AAG	2	6	239951	239956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878350
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4115	NC_010001	ACC	3	9	239975	239983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160878350
4116	NC_010001	GGAA	2	8	240014	240021	50 %	0 %	50 %	0 %	160878350
4117	NC_010001	T	7	7	240062	240068	0 %	100 %	0 %	0 %	160878350
4118	NC_010001	ATA	2	6	240134	240139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878351
4119	NC_010001	TGGTTG	2	12	240147	240158	0 %	50 %	50 %	0 %	160878351
4120	NC_010001	AT	3	6	240222	240227	50 %	50 %	0 %	0 %	160878351
4121	NC_010001	TGC	3	9	240295	240303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878351
4122	NC_010001	TCA	2	6	240327	240332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878351
4123	NC_010001	ACTT	2	8	240358	240365	25 %	50 %	0 %	25 %	160878351
4124	NC_010001	TC	3	6	240380	240385	0 %	50 %	0 %	50 %	160878351
4125	NC_010001	CTG	2	6	240429	240434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878351
4126	NC_010001	TCC	2	6	240503	240508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878351
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4129	NC_010001	TG	3	6	240632	240637	0 %	50 %	50 %	0 %	160878351
4130	NC_010001	CTA	2	6	240659	240664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878351
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4138	NC_010001	CTG	2	6	240981	240986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878351
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4143	NC_010001	GTA	2	6	241277	241282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878351
4144	NC_010001	ACTT	2	8	241296	241303	25 %	50 %	0 %	25 %	160878351
4145	NC_010001	AAAG	2	8	241340	241347	75 %	0 %	25 %	0 %	160878351
4146	NC_010001	TTC	2	6	241375	241380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878351
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4152	NC_010001	GCT	2	6	241617	241622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160878351
4153	NC_010001	TACC	2	8	241641	241648	25 %	25 %	0 %	50 %	160878351
4154	NC_010001	T	6	6	241702	241707	0 %	100 %	0 %	0 %	160878351
4155	NC_010001	ATG	2	6	241739	241744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878351
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4161	NC_010001	A	6	6	241863	241868	100 %	0 %	0 %	0 %	160878351
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4188	NC_010001	T	6	6	243480	243485	0 %	100 %	0 %	0 %	160878353
4189	NC_010001	GCG	2	6	243524	243529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160878353
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4209	NC_010001	CAACA	2	10	244580	244589	60 %	0 %	0 %	40 %	160878354
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4229	NC_010001	TAT	2	6	245824	245829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878356
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4231	NC_010001	A	6	6	245935	245940	100 %	0 %	0 %	0 %	160878356
4232	NC_010001	A	6	6	245949	245954	100 %	0 %	0 %	0 %	160878356
4233	NC_010001	CCTA	2	8	246009	246016	25 %	25 %	0 %	50 %	160878356
4234	NC_010001	GCA	2	6	246130	246135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878356
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4240	NC_010001	TATG	2	8	246492	246499	25 %	50 %	25 %	0 %	160878357
4241	NC_010001	TTG	2	6	246507	246512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878357
4242	NC_010001	GCA	2	6	246516	246521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878357
4243	NC_010001	AGC	2	6	246543	246548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878357
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4245	NC_010001	ATG	2	6	246615	246620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878357
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4491	NC_010001	ATG	2	6	260938	260943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878369
4492	NC_010001	GGA	2	6	261030	261035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	160878369
4493	NC_010001	TG	3	6	261061	261066	0 %	50 %	50 %	0 %	160878369
4494	NC_010001	TGA	2	6	261123	261128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878369
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