MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium phytofermentans ISDg chromosome

Total Repeats: 88030

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010001	CAG	2	6	31838	31843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878180
502	NC_010001	GCA	2	6	31846	31851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878180
503	NC_010001	CAGC	2	8	31860	31867	25 %	0 %	25 %	50 %	160878180
504	NC_010001	ATC	2	6	31870	31875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878180
505	NC_010001	ATT	2	6	31893	31898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878180
506	NC_010001	CAA	2	6	31907	31912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878180
507	NC_010001	CCA	2	6	31960	31965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160878180
508	NC_010001	AAT	2	6	32008	32013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878180
509	NC_010001	GAGT	2	8	32024	32031	25 %	25 %	50 %	0 %	160878180
510	NC_010001	ATA	2	6	32058	32063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878180
511	NC_010001	AT	3	6	32193	32198	50 %	50 %	0 %	0 %	160878180
512	NC_010001	CCA	2	6	32200	32205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160878180
513	NC_010001	TTTC	2	8	32209	32216	0 %	75 %	0 %	25 %	160878180
514	NC_010001	CTA	2	6	32237	32242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878180
515	NC_010001	T	6	6	32274	32279	0 %	100 %	0 %	0 %	160878180
516	NC_010001	GAT	2	6	32304	32309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878180
517	NC_010001	ATGA	2	8	32316	32323	50 %	25 %	25 %	0 %	160878180
518	NC_010001	AAC	2	6	32335	32340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878180
519	NC_010001	A	7	7	32424	32430	100 %	0 %	0 %	0 %	160878180
520	NC_010001	CTT	2	6	32467	32472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878180
521	NC_010001	CAG	2	6	32477	32482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878180
522	NC_010001	ACA	3	9	32560	32568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878180
523	NC_010001	AGT	2	6	32569	32574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878180
524	NC_010001	AAT	2	6	32616	32621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878180
525	NC_010001	T	6	6	32707	32712	0 %	100 %	0 %	0 %	160878180
526	NC_010001	TGA	2	6	33486	33491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878181
527	NC_010001	TAT	2	6	33547	33552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878181
528	NC_010001	AAT	2	6	33571	33576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878181
529	NC_010001	TAT	2	6	33583	33588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878181
530	NC_010001	AAT	2	6	33616	33621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878181
531	NC_010001	TAT	2	6	33628	33633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878181
532	NC_010001	AAT	2	6	33661	33666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878181
533	NC_010001	TAT	2	6	33673	33678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878181
534	NC_010001	AAT	2	6	33706	33711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878181
535	NC_010001	TAT	2	6	33718	33723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878181
536	NC_010001	AAT	2	6	33744	33749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878181
537	NC_010001	GGAAT	2	10	33809	33818	40 %	20 %	40 %	0 %	160878182
538	NC_010001	ATG	2	6	33835	33840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878182
539	NC_010001	AAT	2	6	33879	33884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878182
540	NC_010001	ATA	3	9	33973	33981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878182
541	NC_010001	ATG	2	6	34018	34023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878182
542	NC_010001	ATT	2	6	34038	34043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878182
543	NC_010001	TGATT	2	10	34076	34085	20 %	60 %	20 %	0 %	160878182
544	NC_010001	AG	3	6	34317	34322	50 %	0 %	50 %	0 %	160878182
545	NC_010001	AGA	2	6	34360	34365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878182
546	NC_010001	GAA	2	6	34380	34385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878182
547	NC_010001	TGA	2	6	34400	34405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878182
548	NC_010001	ATA	2	6	34486	34491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878182
549	NC_010001	GAA	2	6	34500	34505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878182
550	NC_010001	AG	3	6	34514	34519	50 %	0 %	50 %	0 %	160878182
551	NC_010001	AGA	2	6	34553	34558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878182
552	NC_010001	TTA	2	6	34561	34566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878182
553	NC_010001	GAGGCA	2	12	34575	34586	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	160878182
554	NC_010001	GTA	2	6	34675	34680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878182
555	NC_010001	A	6	6	34686	34691	100 %	0 %	0 %	0 %	160878182
556	NC_010001	ATAG	2	8	34715	34722	50 %	25 %	25 %	0 %	160878182
557	NC_010001	CTAA	2	8	34942	34949	50 %	25 %	0 %	25 %	160878183
558	NC_010001	T	6	6	34959	34964	0 %	100 %	0 %	0 %	160878183
559	NC_010001	AGT	2	6	34982	34987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878183
560	NC_010001	CTT	2	6	35041	35046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878183
561	NC_010001	CTT	2	6	35116	35121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878183
562	NC_010001	CTT	2	6	35125	35130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878183
563	NC_010001	CAA	2	6	35242	35247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	160878183
564	NC_010001	GTT	2	6	35253	35258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160878183
565	NC_010001	CTT	3	9	35305	35313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878183
566	NC_010001	CTT	2	6	35323	35328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878183
567	NC_010001	CTT	2	6	35353	35358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878183
568	NC_010001	CAG	2	6	35362	35367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878183
569	NC_010001	TTA	2	6	35368	35373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878183
570	NC_010001	AG	3	6	35423	35428	50 %	0 %	50 %	0 %	160878183
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572	NC_010001	TCA	2	6	35533	35538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878183
573	NC_010001	ATA	2	6	35560	35565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878183
574	NC_010001	ATC	2	6	35567	35572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878183
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582	NC_010001	ATT	2	6	35856	35861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878183
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594	NC_010001	AGA	2	6	36380	36385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160878184
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596	NC_010001	AATCA	2	10	36490	36499	60 %	20 %	0 %	20 %	160878184
597	NC_010001	GAT	2	6	36516	36521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160878184
598	NC_010001	GCA	2	6	36522	36527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878184
599	NC_010001	AAAAGA	2	12	36606	36617	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	160878184
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601	NC_010001	TAT	2	6	36706	36711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878184
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609	NC_010001	CAT	2	6	37207	37212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160878185
610	NC_010001	T	6	6	37226	37231	0 %	100 %	0 %	0 %	160878185
611	NC_010001	TCC	2	6	37266	37271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160878185
612	NC_010001	ATA	2	6	37284	37289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878185
613	NC_010001	TTC	2	6	37403	37408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160878185
614	NC_010001	TATGA	2	10	37526	37535	40 %	40 %	20 %	0 %	160878185
615	NC_010001	AAT	3	9	37600	37608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878185
616	NC_010001	AAT	2	6	37701	37706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	160878185
617	NC_010001	GA	3	6	38097	38102	50 %	0 %	50 %	0 %	160878186
618	NC_010001	A	6	6	38137	38142	100 %	0 %	0 %	0 %	160878186
619	NC_010001	GGT	2	6	38242	38247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878186
620	NC_010001	TAT	2	6	38251	38256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	160878186
621	NC_010001	GCA	2	6	38316	38321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160878186
622	NC_010001	CCAT	2	8	38349	38356	25 %	25 %	0 %	50 %	160878186
623	NC_010001	AT	3	6	38419	38424	50 %	50 %	0 %	0 %	160878186
624	NC_010001	GGT	2	6	38425	38430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160878186
625	NC_010001	CT	3	6	38461	38466	0 %	50 %	0 %	50 %	160878186
626	NC_010001	TAAA	2	8	38585	38592	75 %	25 %	0 %	0 %	160878186
627	NC_010001	CAGA	2	8	38611	38618	50 %	0 %	25 %	25 %	160878186
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