MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81116

Total Repeats: 1010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009839	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157414324
2	NC_009839	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157414324
3	NC_009839	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	157414325
4	NC_009839	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157414325
5	NC_009839	AATGAA	2	12	4478	4489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157414325
6	NC_009839	ATGCTA	2	12	9430	9441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157414329
7	NC_009839	ATTTAA	2	12	10234	10245	50 %	50 %	0 %	0 %	157414329
8	NC_009839	ATGGGT	2	12	17170	17181	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157414334
9	NC_009839	TTCATT	2	12	18322	18333	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157414336
10	NC_009839	AAGATA	2	12	20455	20466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157414338
11	NC_009839	AGCAAA	2	12	21238	21249	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157414338
12	NC_009839	TTTTCT	2	12	21745	21756	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	157414339
13	NC_009839	TATAAG	2	12	26196	26207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157414343
14	NC_009839	TTATGC	2	12	27621	27632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157414344
15	NC_009839	GAACTT	2	12	28106	28117	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157414345
16	NC_009839	CTTTAA	2	12	29868	29879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157414345
17	NC_009839	ATGTGT	2	12	30682	30693	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	157414346
18	NC_009839	CGCCAC	2	12	34060	34071	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	157414348
19	NC_009839	ATGGAT	2	12	34548	34559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157414349
20	NC_009839	GAAATT	2	12	34757	34768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157414349
21	NC_009839	TAAGGG	2	12	36422	36433	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	157414350
22	NC_009839	GCTTTA	2	12	50273	50284	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157414354
23	NC_009839	CCTGTG	2	12	50948	50959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157414354
24	NC_009839	ATTTTA	2	12	50996	51007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157414354
25	NC_009839	AAACAA	2	12	57442	57453	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	157414357
26	NC_009839	GAAAGA	2	12	57898	57909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157414357
27	NC_009839	TAAAAA	2	12	57928	57939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157414357
28	NC_009839	CAATTT	2	12	59805	59816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157414358
29	NC_009839	CAATTT	2	12	59961	59972	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157414358
30	NC_009839	AGAATT	2	12	60658	60669	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157414358
31	NC_009839	ATGAAA	2	12	63511	63522	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157414361
32	NC_009839	TAAACT	2	12	64043	64054	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157414361
33	NC_009839	AGTTTT	2	12	66225	66236	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157414363
34	NC_009839	TTCTTT	2	12	66441	66452	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	157414364
35	NC_009839	CGCCTT	2	12	66846	66857	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	157414364
36	NC_009839	CCAATG	2	12	70296	70307	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157414366
37	NC_009839	CAAAAT	2	12	70412	70423	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157414366
38	NC_009839	TTCATC	2	12	71346	71357	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157414367
39	NC_009839	TAATTT	2	12	73140	73151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157414369
40	NC_009839	ATTTTA	2	12	73392	73403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157414369
41	NC_009839	AAATAT	2	12	73749	73760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414369
42	NC_009839	GTTGGA	2	12	74689	74700	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	157414369
43	NC_009839	GTTTTT	2	12	74834	74845	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	157414369
44	NC_009839	ACGCAC	2	12	79551	79562	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	157414373
45	NC_009839	TAGCTT	2	12	80221	80232	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157414374
46	NC_009839	TTCATT	2	12	82580	82591	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157414377
47	NC_009839	CATCTT	2	12	84326	84337	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157414378
48	NC_009839	TTTAAA	2	12	86746	86757	50 %	50 %	0 %	0 %	157414381
49	NC_009839	CTAGCT	2	12	87178	87189	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157414382
50	NC_009839	GAATGA	2	12	87432	87443	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	157414382
51	NC_009839	GATGCT	2	12	88594	88605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157414383
52	NC_009839	TCTAAA	2	12	90949	90960	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157414387
53	NC_009839	TTTAGC	2	12	92506	92517	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157414388
54	NC_009839	TTTTTG	2	12	97811	97822	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	157414394
55	NC_009839	GAATTT	2	12	98131	98142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157414395
56	NC_009839	AACTCA	2	12	98646	98657	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157414395
57	NC_009839	CTTTAA	2	12	100426	100437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157414396
58	NC_009839	ATATTT	2	12	101186	101197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157414398
59	NC_009839	TGTAAC	2	12	103598	103609	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157414400
60	NC_009839	CAGGAA	2	12	104306	104317	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157414401
61	NC_009839	TTGTGT	2	12	104892	104903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157414401
62	NC_009839	ATAAAA	2	12	106717	106728	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157414402
63	NC_009839	TTAATG	2	12	108933	108944	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157414405
64	NC_009839	GCAAGC	2	12	109013	109024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157414405
65	NC_009839	AACTTA	2	12	111753	111764	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157414409
66	NC_009839	TTAGAA	2	12	114053	114064	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157414411
67	NC_009839	AAAAAT	2	12	116356	116367	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157414414
68	NC_009839	GGTTTG	2	12	122061	122072	0 %	50 %	50 %	0 %	157414421
69	NC_009839	AAAGAA	2	12	122340	122351	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	157414422
70	NC_009839	AAAATA	2	12	123872	123883	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157414424
71	NC_009839	AATAGT	2	12	124825	124836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157414425
72	NC_009839	ATTTTG	2	12	125409	125420	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157414426
73	NC_009839	GAAAAA	2	12	126316	126327	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	157414427
74	NC_009839	GTTGTG	2	12	127162	127173	0 %	50 %	50 %	0 %	157414428
75	NC_009839	ACGGAC	2	12	127201	127212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157414428
76	NC_009839	CGGTTG	2	12	127241	127252	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157414428
77	NC_009839	TTTGAT	2	12	128788	128799	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	157414430
78	NC_009839	TTCTTT	2	12	138504	138515	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	157414442
79	NC_009839	GGGCTT	2	12	139183	139194	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157414443
80	NC_009839	AAAGAT	2	12	142255	142266	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	157414445
81	NC_009839	GCTTTA	2	12	143564	143575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157414447
82	NC_009839	AAAGAA	2	12	144482	144493	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	157414449
83	NC_009839	GAAAAA	2	12	147177	147188	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	157414451
84	NC_009839	ATTAAA	2	12	147587	147598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414452
85	NC_009839	ATTTTT	2	12	148178	148189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	157414452
86	NC_009839	ATTTTT	2	12	148467	148478	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	157414453
87	NC_009839	ACCTTT	2	12	149774	149785	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157414454
88	NC_009839	CTATAC	2	12	150422	150433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414455
89	NC_009839	TAAGGT	2	12	156558	156569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157414460
90	NC_009839	TAAAGT	2	12	157356	157367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	157414460
91	NC_009839	TCATTA	2	12	157976	157987	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157414461
92	NC_009839	AACCTA	2	12	158163	158174	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	157414461
93	NC_009839	TTTTAC	2	12	159463	159474	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157414463
94	NC_009839	CTGCTC	2	12	161339	161350	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	157414466
95	NC_009839	ATTTTC	2	12	162261	162272	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157414467
96	NC_009839	TTAGAT	2	12	163564	163575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	157414468
97	NC_009839	AAAACT	2	12	165300	165311	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157414470
98	NC_009839	ATAAAA	2	12	165368	165379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157414470
99	NC_009839	TTTTGC	2	12	165924	165935	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	157414471
100	NC_009839	AGCTAT	2	12	166979	166990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	157414473
101	NC_009839	GGCTAA	2	12	167378	167389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	157414473
102	NC_009839	ATTTTT	2	12	168105	168116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	157414475
103	NC_009839	TCAAAT	2	12	169004	169015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	157414476
104	NC_009839	AAATAA	2	12	171773	171784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	157414481
105	NC_009839	ATTTTC	2	12	173845	173856	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	157414483
106	NC_009839	AGCTTT	2	12	174541	174552	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157414484
107	NC_009839	GGCTGT	2	12	175184	175195	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	157414485
108	NC_009839	TATAAA	2	12	175849	175860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157414486
109	NC_009839	AAAAGC	2	12	177347	177358	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157414487
110	NC_009839	AACAAG	2	12	178139	178150	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	157414488
111	NC_009839	TCCTTA	2	12	180044	180055	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	157414489
112	NC_009839	ATTCTA	2	12	180861	180872	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	157414491
113	NC_009839	GCTATT	2	12	181088	181099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157414491
114	NC_009839	TTGCAG	2	12	182435	182446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	157414492
115	NC_009839	AACATA	2	12	182783	182794	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157414492
116	NC_009839	TGACTT	2	12	185124	185135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	157414495
117	NC_009839	AAAACC	2	12	186228	186239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157414497
118	NC_009839	CAAGGA	2	12	188598	188609	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157414499
119	NC_009839	TAGGAT	2	12	190158	190169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157414500
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122	NC_009839	CCTAAT	2	12	194226	194237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157414504
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