MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter concisus 13826 plasmid pCCON31

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009795	CT	3	6	42	47	0 %	50 %	0 %	50 %	157149597
2	NC_009795	AC	3	6	302	307	50 %	0 %	0 %	50 %	157149597
3	NC_009795	AT	3	6	667	672	50 %	50 %	0 %	0 %	157149597
4	NC_009795	TA	3	6	940	945	50 %	50 %	0 %	0 %	157149597
5	NC_009795	AC	3	6	1066	1071	50 %	0 %	0 %	50 %	157149597
6	NC_009795	AT	3	6	2474	2479	50 %	50 %	0 %	0 %	157149592
7	NC_009795	CT	3	6	2876	2881	0 %	50 %	0 %	50 %	157149590
8	NC_009795	GT	3	6	2896	2901	0 %	50 %	50 %	0 %	157149590
9	NC_009795	AT	3	6	3728	3733	50 %	50 %	0 %	0 %	157149590
10	NC_009795	GA	3	6	4349	4354	50 %	0 %	50 %	0 %	157149590
11	NC_009795	TC	3	6	4734	4739	0 %	50 %	0 %	50 %	157149588
12	NC_009795	TA	3	6	6216	6221	50 %	50 %	0 %	0 %	157149588
13	NC_009795	TA	3	6	6613	6618	50 %	50 %	0 %	0 %	157149588
14	NC_009795	AT	4	8	7055	7062	50 %	50 %	0 %	0 %	157149588
15	NC_009795	AG	3	6	8337	8342	50 %	0 %	50 %	0 %	157149588
16	NC_009795	AG	3	6	8397	8402	50 %	0 %	50 %	0 %	157149588
17	NC_009795	AG	3	6	8767	8772	50 %	0 %	50 %	0 %	157149588
18	NC_009795	TA	3	6	9864	9869	50 %	50 %	0 %	0 %	157149609
19	NC_009795	TA	4	8	9975	9982	50 %	50 %	0 %	0 %	157149609
20	NC_009795	AG	3	6	10043	10048	50 %	0 %	50 %	0 %	157149609
21	NC_009795	AT	3	6	11589	11594	50 %	50 %	0 %	0 %	157149611
22	NC_009795	TA	4	8	12462	12469	50 %	50 %	0 %	0 %	157149608
23	NC_009795	TA	3	6	12523	12528	50 %	50 %	0 %	0 %	157149608
24	NC_009795	AT	3	6	12534	12539	50 %	50 %	0 %	0 %	157149608
25	NC_009795	AT	3	6	12858	12863	50 %	50 %	0 %	0 %	157149579
26	NC_009795	AT	3	6	12992	12997	50 %	50 %	0 %	0 %	157149579
27	NC_009795	AT	3	6	13031	13036	50 %	50 %	0 %	0 %	157149579
28	NC_009795	AT	3	6	13046	13051	50 %	50 %	0 %	0 %	157149579
29	NC_009795	GA	3	6	13586	13591	50 %	0 %	50 %	0 %	157149580
30	NC_009795	AT	3	6	13951	13956	50 %	50 %	0 %	0 %	157149607
31	NC_009795	CT	3	6	14068	14073	0 %	50 %	0 %	50 %	157149607
32	NC_009795	AT	3	6	14677	14682	50 %	50 %	0 %	0 %	157149610
33	NC_009795	AG	3	6	14900	14905	50 %	0 %	50 %	0 %	157149610
34	NC_009795	TG	3	6	14970	14975	0 %	50 %	50 %	0 %	157149610
35	NC_009795	AT	4	8	15000	15007	50 %	50 %	0 %	0 %	157149610
36	NC_009795	TA	3	6	15083	15088	50 %	50 %	0 %	0 %	157149610
37	NC_009795	AG	3	6	15159	15164	50 %	0 %	50 %	0 %	157149610
38	NC_009795	AT	3	6	15251	15256	50 %	50 %	0 %	0 %	157149610
39	NC_009795	AG	3	6	15515	15520	50 %	0 %	50 %	0 %	157149610
40	NC_009795	GA	3	6	15559	15564	50 %	0 %	50 %	0 %	157149583
41	NC_009795	AT	3	6	15692	15697	50 %	50 %	0 %	0 %	157149583
42	NC_009795	AT	3	6	15905	15910	50 %	50 %	0 %	0 %	157149583
43	NC_009795	AG	3	6	15981	15986	50 %	0 %	50 %	0 %	157149583
44	NC_009795	AT	3	6	16020	16025	50 %	50 %	0 %	0 %	157149583
45	NC_009795	TC	3	6	16295	16300	0 %	50 %	0 %	50 %	157149583
46	NC_009795	AC	4	8	16439	16446	50 %	0 %	0 %	50 %	157149583
47	NC_009795	AG	3	6	16643	16648	50 %	0 %	50 %	0 %	157149583
48	NC_009795	TA	3	6	16659	16664	50 %	50 %	0 %	0 %	157149583
49	NC_009795	GA	3	6	16936	16941	50 %	0 %	50 %	0 %	157149583
50	NC_009795	AG	3	6	17662	17667	50 %	0 %	50 %	0 %	157149583
51	NC_009795	TA	3	6	17904	17909	50 %	50 %	0 %	0 %	157149583
52	NC_009795	TA	3	6	17937	17942	50 %	50 %	0 %	0 %	157149583
53	NC_009795	AG	3	6	17994	17999	50 %	0 %	50 %	0 %	157149583
54	NC_009795	TA	3	6	18040	18045	50 %	50 %	0 %	0 %	157149583
55	NC_009795	AT	4	8	18074	18081	50 %	50 %	0 %	0 %	157149583
56	NC_009795	TA	3	6	18733	18738	50 %	50 %	0 %	0 %	157149594
57	NC_009795	TC	3	6	18787	18792	0 %	50 %	0 %	50 %	157149594
58	NC_009795	GA	3	6	19771	19776	50 %	0 %	50 %	0 %	157149584
59	NC_009795	CT	3	6	20037	20042	0 %	50 %	0 %	50 %	157149584
60	NC_009795	CT	3	6	20256	20261	0 %	50 %	0 %	50 %	157149584
61	NC_009795	AT	3	6	21916	21921	50 %	50 %	0 %	0 %	157149595
62	NC_009795	TA	3	6	22160	22165	50 %	50 %	0 %	0 %	157149595
63	NC_009795	AT	3	6	22694	22699	50 %	50 %	0 %	0 %	157149585
64	NC_009795	AT	3	6	24932	24937	50 %	50 %	0 %	0 %	157149591
65	NC_009795	TC	3	6	25074	25079	0 %	50 %	0 %	50 %	157149591
66	NC_009795	TA	3	6	25092	25097	50 %	50 %	0 %	0 %	157149591
67	NC_009795	TA	3	6	25107	25112	50 %	50 %	0 %	0 %	157149591
68	NC_009795	CT	3	6	25174	25179	0 %	50 %	0 %	50 %	157149591
69	NC_009795	CT	3	6	25339	25344	0 %	50 %	0 %	50 %	157149591
70	NC_009795	TA	3	6	25541	25546	50 %	50 %	0 %	0 %	157149591
71	NC_009795	AG	3	6	26446	26451	50 %	0 %	50 %	0 %	157149589
72	NC_009795	GT	3	6	26473	26478	0 %	50 %	50 %	0 %	157149589
73	NC_009795	AT	3	6	26796	26801	50 %	50 %	0 %	0 %	157149582
74	NC_009795	AT	3	6	27077	27082	50 %	50 %	0 %	0 %	157149582
75	NC_009795	TA	3	6	27158	27163	50 %	50 %	0 %	0 %	157149582
76	NC_009795	TA	3	6	27311	27316	50 %	50 %	0 %	0 %	157149582
77	NC_009795	AT	3	6	28453	28458	50 %	50 %	0 %	0 %	157149599
78	NC_009795	AG	3	6	29003	29008	50 %	0 %	50 %	0 %	157149596
79	NC_009795	AG	3	6	29734	29739	50 %	0 %	50 %	0 %	157149596
80	NC_009795	TA	3	6	30189	30194	50 %	50 %	0 %	0 %	157149601

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.