MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Citrobacter koseri ATCC BAA-895 chromosome

Total Repeats: 91881

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009792	TCGC	2	8	106692	106699	0 %	25 %	25 %	50 %	157144401
2002	NC_009792	CCGGC	2	10	106811	106820	0 %	0 %	40 %	60 %	157144401
2003	NC_009792	CGG	2	6	106863	106868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144401
2004	NC_009792	GGT	2	6	106872	106877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144401
2005	NC_009792	TGG	2	6	106889	106894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144401
2006	NC_009792	ACC	2	6	106951	106956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157144401
2007	NC_009792	CGG	2	6	107016	107021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144401
2008	NC_009792	CT	3	6	107032	107037	0 %	50 %	0 %	50 %	157144401
2009	NC_009792	GCG	2	6	107066	107071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144401
2010	NC_009792	CAT	2	6	107082	107087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144401
2011	NC_009792	CAACTG	2	12	107134	107145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	157144401
2012	NC_009792	CGC	2	6	107160	107165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144401
2013	NC_009792	GTG	2	6	107189	107194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144401
2014	NC_009792	TGA	2	6	107314	107319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144401
2015	NC_009792	GCC	2	6	107343	107348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144402
2016	NC_009792	TGCG	2	8	107368	107375	0 %	25 %	50 %	25 %	157144402
2017	NC_009792	CG	3	6	107382	107387	0 %	0 %	50 %	50 %	157144402
2018	NC_009792	AGC	2	6	107399	107404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144402
2019	NC_009792	CGC	2	6	107413	107418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144402
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2021	NC_009792	TTC	2	6	107438	107443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157144402
2022	NC_009792	GAT	2	6	107522	107527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144402
2023	NC_009792	GAA	2	6	107541	107546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157144402
2024	NC_009792	CGG	2	6	107575	107580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144402
2025	NC_009792	TCC	2	6	107607	107612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157144402
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2029	NC_009792	TGA	2	6	107723	107728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144402
2030	NC_009792	CAG	2	6	107760	107765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144402
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2032	NC_009792	ATC	2	6	107791	107796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144402
2033	NC_009792	GGGCA	2	10	107811	107820	20 %	0 %	60 %	20 %	157144402
2034	NC_009792	CGCTGG	2	12	107821	107832	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157144402
2035	NC_009792	CAG	2	6	107841	107846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144402
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2038	NC_009792	TCA	2	6	107914	107919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144402
2039	NC_009792	AAC	2	6	107920	107925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157144402
2040	NC_009792	GCCT	2	8	107970	107977	0 %	25 %	25 %	50 %	157144402
2041	NC_009792	GCG	2	6	107982	107987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144402
2042	NC_009792	CGA	2	6	108095	108100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144402
2043	NC_009792	GCGAT	2	10	108118	108127	20 %	20 %	40 %	20 %	157144402
2044	NC_009792	TGCG	2	8	108160	108167	0 %	25 %	50 %	25 %	157144402
2045	NC_009792	GCGCTG	2	12	108186	108197	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157144402
2046	NC_009792	A	6	6	108207	108212	100 %	0 %	0 %	0 %	157144402
2047	NC_009792	GCT	2	6	108335	108340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144402
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2049	NC_009792	CCGTT	2	10	108401	108410	0 %	40 %	20 %	40 %	157144402
2050	NC_009792	CGTC	2	8	108464	108471	0 %	25 %	25 %	50 %	157144402
2051	NC_009792	GCT	2	6	108509	108514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144402
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2053	NC_009792	GTG	2	6	108534	108539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144402
2054	NC_009792	TC	3	6	108542	108547	0 %	50 %	0 %	50 %	157144402
2055	NC_009792	CGA	3	9	108548	108556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144402
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2057	NC_009792	GGC	2	6	108746	108751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144402
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2065	NC_009792	CGG	2	6	109215	109220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144403
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2069	NC_009792	CATCG	2	10	109448	109457	20 %	20 %	20 %	40 %	157144403
2070	NC_009792	GGT	2	6	109469	109474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144403
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2083	NC_009792	TGA	2	6	110373	110378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144404
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2091	NC_009792	TGG	2	6	110730	110735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144404
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2105	NC_009792	ATGAA	2	10	111231	111240	60 %	20 %	20 %	0 %	157144404
2106	NC_009792	CCG	2	6	111258	111263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157144404
2107	NC_009792	TTA	2	6	111604	111609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157144407
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2109	NC_009792	GGTT	2	8	111664	111671	0 %	50 %	50 %	0 %	157144407
2110	NC_009792	AGA	2	6	111824	111829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157144407
2111	NC_009792	CTTCT	2	10	111841	111850	0 %	60 %	0 %	40 %	157144407
2112	NC_009792	TGC	3	9	111868	111876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144407
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2114	NC_009792	GA	4	8	112071	112078	50 %	0 %	50 %	0 %	157144405
2115	NC_009792	GCT	2	6	112166	112171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144408
2116	NC_009792	CAT	2	6	112190	112195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144408
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2118	NC_009792	GTT	2	6	112427	112432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157144408
2119	NC_009792	GCTG	2	8	112459	112466	0 %	25 %	50 %	25 %	157144408
2120	NC_009792	TGC	2	6	112495	112500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144408
2121	NC_009792	CAGC	2	8	112508	112515	25 %	0 %	25 %	50 %	157144408
2122	NC_009792	CAG	2	6	112541	112546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144408
2123	NC_009792	ATG	2	6	112606	112611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144408
2124	NC_009792	TCAG	2	8	112645	112652	25 %	25 %	25 %	25 %	157144408
2125	NC_009792	GCG	2	6	112659	112664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144408
2126	NC_009792	ACG	2	6	112665	112670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144408
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2132	NC_009792	CGG	2	6	113004	113009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144409
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2152	NC_009792	CTG	2	6	113916	113921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144410
2153	NC_009792	TGC	2	6	113977	113982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144410
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2192	NC_009792	CTG	2	6	115539	115544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144411
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2233	NC_009792	CGA	2	6	117691	117696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144412
2234	NC_009792	GAAGTG	2	12	117921	117932	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	157144412
2235	NC_009792	AT	3	6	117936	117941	50 %	50 %	0 %	0 %	157144412
2236	NC_009792	ACG	3	9	117955	117963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144413
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2238	NC_009792	TCA	2	6	118041	118046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157144413
2239	NC_009792	GGCA	2	8	118102	118109	25 %	0 %	50 %	25 %	157144413
2240	NC_009792	CAGGC	2	10	118130	118139	20 %	0 %	40 %	40 %	157144413
2241	NC_009792	CGCT	2	8	118152	118159	0 %	25 %	25 %	50 %	157144413
2242	NC_009792	CG	4	8	118257	118264	0 %	0 %	50 %	50 %	157144413
2243	NC_009792	CGA	2	6	118278	118283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144413
2244	NC_009792	TCG	2	6	118310	118315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144413
2245	NC_009792	T	6	6	118330	118335	0 %	100 %	0 %	0 %	157144413
2246	NC_009792	CTT	2	6	118452	118457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157144413
2247	NC_009792	GCA	2	6	118470	118475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157144413
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2250	NC_009792	CTT	2	6	118512	118517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157144413
2251	NC_009792	GTT	2	6	118567	118572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157144413
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2253	NC_009792	CGG	2	6	118648	118653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144413
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2273	NC_009792	CTGA	2	8	119376	119383	25 %	25 %	25 %	25 %	157144414
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2275	NC_009792	CTG	2	6	119589	119594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144414
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2349	NC_009792	TC	3	6	123288	123293	0 %	50 %	0 %	50 %	157144417
2350	NC_009792	ATA	2	6	123339	123344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157144417
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2359	NC_009792	TGAT	2	8	124249	124256	25 %	50 %	25 %	0 %	157144418
2360	NC_009792	TACGC	2	10	124295	124304	20 %	20 %	20 %	40 %	157144418
2361	NC_009792	TG	3	6	124333	124338	0 %	50 %	50 %	0 %	157144418
2362	NC_009792	A	7	7	124344	124350	100 %	0 %	0 %	0 %	157144418
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2365	NC_009792	TGG	2	6	124702	124707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144418
2366	NC_009792	GAA	2	6	124731	124736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157144418
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2473	NC_009792	GGCCGG	2	12	130037	130048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144424
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2483	NC_009792	GCT	2	6	130403	130408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144424
2484	NC_009792	TGG	2	6	130432	130437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144424
2485	NC_009792	CGG	2	6	130444	130449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144424
2486	NC_009792	CGT	2	6	130498	130503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144424
2487	NC_009792	CGTC	2	8	130558	130565	0 %	25 %	25 %	50 %	157144424
2488	NC_009792	TGA	2	6	130585	130590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144424
2489	NC_009792	CTG	2	6	130599	130604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144424
2490	NC_009792	GCG	2	6	130605	130610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144424
2491	NC_009792	GAT	2	6	130623	130628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157144424
2492	NC_009792	TTA	2	6	130678	130683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157144424
2493	NC_009792	CG	3	6	130747	130752	0 %	0 %	50 %	50 %	157144424
2494	NC_009792	GTG	2	6	130755	130760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144424
2495	NC_009792	CTGC	2	8	130779	130786	0 %	25 %	25 %	50 %	157144424
2496	NC_009792	GGC	3	9	130790	130798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157144424
2497	NC_009792	GCT	2	6	130814	130819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144424
2498	NC_009792	GCT	2	6	130838	130843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157144424
2499	NC_009792	TGG	2	6	130891	130896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157144424
2500	NC_009792	TTG	2	6	130995	131000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157144424

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