MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 2274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009727	CG	3	6	1300	1305	0 %	0 %	50 %	50 %	154706441
2	NC_009727	CT	3	6	1741	1746	0 %	50 %	0 %	50 %	154706526
3	NC_009727	CA	3	6	2986	2991	50 %	0 %	0 %	50 %	154707128
4	NC_009727	AC	3	6	3492	3497	50 %	0 %	0 %	50 %	154707128
5	NC_009727	CA	3	6	5647	5652	50 %	0 %	0 %	50 %	209363643
6	NC_009727	TA	3	6	5737	5742	50 %	50 %	0 %	0 %	209363643
7	NC_009727	TA	3	6	5946	5951	50 %	50 %	0 %	0 %	209363643
8	NC_009727	TA	3	6	6217	6222	50 %	50 %	0 %	0 %	209363643
9	NC_009727	AC	3	6	7838	7843	50 %	0 %	0 %	50 %	154707433
10	NC_009727	CG	3	6	9566	9571	0 %	0 %	50 %	50 %	154706378
11	NC_009727	GA	3	6	11474	11479	50 %	0 %	50 %	0 %	154705767
12	NC_009727	CG	3	6	16032	16037	0 %	0 %	50 %	50 %	154706946
13	NC_009727	GC	3	6	16688	16693	0 %	0 %	50 %	50 %	154706946
14	NC_009727	GC	3	6	17156	17161	0 %	0 %	50 %	50 %	154706946
15	NC_009727	CA	3	6	18594	18599	50 %	0 %	0 %	50 %	154705750
16	NC_009727	GA	3	6	23049	23054	50 %	0 %	50 %	0 %	209363646
17	NC_009727	CG	3	6	23982	23987	0 %	0 %	50 %	50 %	154707059
18	NC_009727	CG	3	6	24045	24050	0 %	0 %	50 %	50 %	154707059
19	NC_009727	CG	3	6	24177	24182	0 %	0 %	50 %	50 %	154707059
20	NC_009727	GC	3	6	25076	25081	0 %	0 %	50 %	50 %	154707059
21	NC_009727	CG	3	6	26902	26907	0 %	0 %	50 %	50 %	154707145
22	NC_009727	AT	3	6	27902	27907	50 %	50 %	0 %	0 %	209363647
23	NC_009727	TC	3	6	28543	28548	0 %	50 %	0 %	50 %	154705832
24	NC_009727	AC	3	6	28598	28603	50 %	0 %	0 %	50 %	154705832
25	NC_009727	TA	3	6	29577	29582	50 %	50 %	0 %	0 %	154705832
26	NC_009727	AG	3	6	32892	32897	50 %	0 %	50 %	0 %	154706970
27	NC_009727	CG	3	6	33142	33147	0 %	0 %	50 %	50 %	154706970
28	NC_009727	AT	3	6	35617	35622	50 %	50 %	0 %	0 %	154705743
29	NC_009727	GC	5	10	38209	38218	0 %	0 %	50 %	50 %	154707096
30	NC_009727	GC	3	6	38308	38313	0 %	0 %	50 %	50 %	154707096
31	NC_009727	CG	3	6	38441	38446	0 %	0 %	50 %	50 %	154707096
32	NC_009727	CG	3	6	40182	40187	0 %	0 %	50 %	50 %	154706192
33	NC_009727	GC	4	8	41908	41915	0 %	0 %	50 %	50 %	209363651
34	NC_009727	AC	3	6	41980	41985	50 %	0 %	0 %	50 %	209363651
35	NC_009727	CG	3	6	42862	42867	0 %	0 %	50 %	50 %	154706317
36	NC_009727	TC	3	6	45419	45424	0 %	50 %	0 %	50 %	154705781
37	NC_009727	AC	3	6	46753	46758	50 %	0 %	0 %	50 %	209363652
38	NC_009727	AT	3	6	47582	47587	50 %	50 %	0 %	0 %	154706010
39	NC_009727	AT	3	6	48231	48236	50 %	50 %	0 %	0 %	154706010
40	NC_009727	TA	3	6	48486	48491	50 %	50 %	0 %	0 %	154706010
41	NC_009727	AT	3	6	48983	48988	50 %	50 %	0 %	0 %	209363653
42	NC_009727	CT	3	6	49471	49476	0 %	50 %	0 %	50 %	209363653
43	NC_009727	GA	3	6	49856	49861	50 %	0 %	50 %	0 %	209363653
44	NC_009727	TC	3	6	50693	50698	0 %	50 %	0 %	50 %	154706619
45	NC_009727	TG	3	6	50835	50840	0 %	50 %	50 %	0 %	154706619
46	NC_009727	AG	3	6	52093	52098	50 %	0 %	50 %	0 %	154707221
47	NC_009727	AT	3	6	52460	52465	50 %	50 %	0 %	0 %	154707221
48	NC_009727	GC	3	6	52920	52925	0 %	0 %	50 %	50 %	209363656
49	NC_009727	GC	3	6	52931	52936	0 %	0 %	50 %	50 %	209363656
50	NC_009727	GC	3	6	53850	53855	0 %	0 %	50 %	50 %	154706090
51	NC_009727	GC	3	6	55236	55241	0 %	0 %	50 %	50 %	209363657
52	NC_009727	AT	3	6	56003	56008	50 %	50 %	0 %	0 %	209363658
53	NC_009727	AG	4	8	56507	56514	50 %	0 %	50 %	0 %	209363658
54	NC_009727	AT	3	6	56611	56616	50 %	50 %	0 %	0 %	209363658
55	NC_009727	TG	3	6	56681	56686	0 %	50 %	50 %	0 %	209363658
56	NC_009727	TG	3	6	56795	56800	0 %	50 %	50 %	0 %	209363658
57	NC_009727	TC	3	6	57678	57683	0 %	50 %	0 %	50 %	154706735
58	NC_009727	GC	3	6	57872	57877	0 %	0 %	50 %	50 %	154706735
59	NC_009727	GC	4	8	58166	58173	0 %	0 %	50 %	50 %	154706735
60	NC_009727	CA	3	6	58502	58507	50 %	0 %	0 %	50 %	154706735
61	NC_009727	TC	3	6	58693	58698	0 %	50 %	0 %	50 %	154706083
62	NC_009727	TC	3	6	59871	59876	0 %	50 %	0 %	50 %	154706083
63	NC_009727	CG	3	6	61982	61987	0 %	0 %	50 %	50 %	154706011
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67	NC_009727	TC	3	6	63849	63854	0 %	50 %	0 %	50 %	154707003
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70	NC_009727	AT	3	6	66319	66324	50 %	50 %	0 %	0 %	209363660
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111	NC_009727	CG	3	6	121130	121135	0 %	0 %	50 %	50 %	154706614
112	NC_009727	TC	3	6	121927	121932	0 %	50 %	0 %	50 %	209363688
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121	NC_009727	CA	3	6	130295	130300	50 %	0 %	0 %	50 %	209363692
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123	NC_009727	AG	3	6	130770	130775	50 %	0 %	50 %	0 %	154707764
124	NC_009727	TC	3	6	134110	134115	0 %	50 %	0 %	50 %	154706602
125	NC_009727	AT	3	6	134171	134176	50 %	50 %	0 %	0 %	154706602
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