MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 1387

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009727	TGGAT	2	10	291	300	20 %	40 %	40 %	0 %	154706441
2	NC_009727	AAATT	2	10	1642	1651	60 %	40 %	0 %	0 %	154706526
3	NC_009727	TCTTT	2	10	9822	9831	0 %	80 %	0 %	20 %	154706378
4	NC_009727	ATAAA	2	10	10265	10274	80 %	20 %	0 %	0 %	154705767
5	NC_009727	GCTTC	2	10	11416	11425	0 %	40 %	20 %	40 %	154705767
6	NC_009727	CAACG	2	10	16264	16273	40 %	0 %	20 %	40 %	154706946
7	NC_009727	CTTTT	2	10	25770	25779	0 %	80 %	0 %	20 %	154707059
8	NC_009727	TAATT	2	10	27001	27010	40 %	60 %	0 %	0 %	154707145
9	NC_009727	GGGAT	2	10	27676	27685	20 %	20 %	60 %	0 %	154707145
10	NC_009727	GAGAA	2	10	28241	28250	60 %	0 %	40 %	0 %	209363647
11	NC_009727	TTATT	2	10	29532	29541	20 %	80 %	0 %	0 %	154705832
12	NC_009727	ATTTT	2	10	30006	30015	20 %	80 %	0 %	0 %	154705832
13	NC_009727	ATTGA	2	10	30437	30446	40 %	40 %	20 %	0 %	154707346
14	NC_009727	TTTTA	2	10	30890	30899	20 %	80 %	0 %	0 %	154707463
15	NC_009727	AAGCA	2	10	30973	30982	60 %	0 %	20 %	20 %	154707463
16	NC_009727	AAAAG	2	10	31181	31190	80 %	0 %	20 %	0 %	154707463
17	NC_009727	GGAAA	2	10	31864	31873	60 %	0 %	40 %	0 %	209363648
18	NC_009727	CAAAA	2	10	32466	32475	80 %	0 %	0 %	20 %	154707564
19	NC_009727	AAGTA	2	10	33024	33033	60 %	20 %	20 %	0 %	154706970
20	NC_009727	CTCAT	2	10	34601	34610	20 %	40 %	0 %	40 %	209363650
21	NC_009727	AAGGA	2	10	36442	36451	60 %	0 %	40 %	0 %	154707121
22	NC_009727	GAAAC	2	10	37577	37586	60 %	0 %	20 %	20 %	154706652
23	NC_009727	AAATT	2	10	37953	37962	60 %	40 %	0 %	0 %	154706652
24	NC_009727	TAATA	2	10	38835	38844	60 %	40 %	0 %	0 %	154706910
25	NC_009727	CGTTG	2	10	38900	38909	0 %	40 %	40 %	20 %	154706910
26	NC_009727	GGGAA	2	10	41214	41223	40 %	0 %	60 %	0 %	154706192
27	NC_009727	AAAAT	2	10	41323	41332	80 %	20 %	0 %	0 %	154706192
28	NC_009727	GTTGT	2	10	41847	41856	0 %	60 %	40 %	0 %	209363651
29	NC_009727	CTAAA	2	10	42663	42672	60 %	20 %	0 %	20 %	154707187
30	NC_009727	ATTTA	2	10	44181	44190	40 %	60 %	0 %	0 %	154705781
31	NC_009727	GCCGC	2	10	44353	44362	0 %	0 %	40 %	60 %	154705781
32	NC_009727	GCTTT	2	10	44603	44612	0 %	60 %	20 %	20 %	154705781
33	NC_009727	GGAAT	2	10	46911	46920	40 %	20 %	40 %	0 %	209363652
34	NC_009727	CTCTT	2	10	48757	48766	0 %	60 %	0 %	40 %	154706010
35	NC_009727	ACGCT	2	10	49524	49533	20 %	20 %	20 %	40 %	209363653
36	NC_009727	GAGAT	2	10	52652	52661	40 %	20 %	40 %	0 %	154707221
37	NC_009727	CCGTG	2	10	53744	53753	0 %	20 %	40 %	40 %	154706090
38	NC_009727	GGCGA	2	10	54130	54139	20 %	0 %	60 %	20 %	154706090
39	NC_009727	TAAAA	2	10	56352	56361	80 %	20 %	0 %	0 %	209363658
40	NC_009727	GATTT	2	10	56737	56746	20 %	60 %	20 %	0 %	209363658
41	NC_009727	AGGAG	2	10	56767	56776	40 %	0 %	60 %	0 %	209363658
42	NC_009727	TATTG	2	10	56868	56877	20 %	60 %	20 %	0 %	154707663
43	NC_009727	CACTA	2	10	56912	56921	40 %	20 %	0 %	40 %	154707663
44	NC_009727	TTTTC	2	10	58685	58694	0 %	80 %	0 %	20 %	154706083
45	NC_009727	TTCGT	2	10	59958	59967	0 %	60 %	20 %	20 %	154706083
46	NC_009727	TAACA	2	10	65303	65312	60 %	20 %	0 %	20 %	154707185
47	NC_009727	GTAAT	2	10	66734	66743	40 %	40 %	20 %	0 %	154707208
48	NC_009727	AAATA	2	10	67622	67631	80 %	20 %	0 %	0 %	209363661
49	NC_009727	GCGCG	2	10	68369	68378	0 %	0 %	60 %	40 %	154705751
50	NC_009727	AAGTC	2	10	70319	70328	40 %	20 %	20 %	20 %	209363662
51	NC_009727	GCTAC	2	10	70934	70943	20 %	20 %	20 %	40 %	209363663
52	NC_009727	GCAAC	2	10	70978	70987	40 %	0 %	20 %	40 %	209363663
53	NC_009727	GAAAA	2	10	73043	73052	80 %	0 %	20 %	0 %	209363665
54	NC_009727	GTCTT	2	10	77643	77652	0 %	60 %	20 %	20 %	154707050
55	NC_009727	CTTCT	2	10	78103	78112	0 %	60 %	0 %	40 %	154707050
56	NC_009727	GTTTT	2	10	78965	78974	0 %	80 %	20 %	0 %	154706599
57	NC_009727	CTCGT	2	10	79762	79771	0 %	40 %	20 %	40 %	154706599
58	NC_009727	AATAA	2	10	80331	80340	80 %	20 %	0 %	0 %	154706078
59	NC_009727	CCCAA	2	10	82437	82446	40 %	0 %	0 %	60 %	209363671
60	NC_009727	AAAAT	2	10	82554	82563	80 %	20 %	0 %	0 %	209363671
61	NC_009727	ATTTT	2	10	84290	84299	20 %	80 %	0 %	0 %	154706074
62	NC_009727	GCGCG	2	10	87695	87704	0 %	0 %	60 %	40 %	154707212
63	NC_009727	AGGCC	2	10	89005	89014	20 %	0 %	40 %	40 %	154707212
64	NC_009727	AAAAT	2	10	92716	92725	80 %	20 %	0 %	0 %	209363673
65	NC_009727	GGAGG	2	10	93434	93443	20 %	0 %	80 %	0 %	209363674
66	NC_009727	AATTT	2	10	93855	93864	40 %	60 %	0 %	0 %	209363674
67	NC_009727	TTGCC	2	10	94806	94815	0 %	40 %	20 %	40 %	209363674
68	NC_009727	AATTA	2	10	98248	98257	60 %	40 %	0 %	0 %	209363677
69	NC_009727	GCCCC	2	10	102816	102825	0 %	0 %	20 %	80 %	154706977
70	NC_009727	GAAAT	2	10	102921	102930	60 %	20 %	20 %	0 %	154707531
71	NC_009727	TGTCT	2	10	103222	103231	0 %	60 %	20 %	20 %	154707531
72	NC_009727	AATAA	2	10	103286	103295	80 %	20 %	0 %	0 %	154707531
73	NC_009727	ACTTT	2	10	103701	103710	20 %	60 %	0 %	20 %	154707531
74	NC_009727	TCAAA	2	10	107497	107506	60 %	20 %	0 %	20 %	154706447
75	NC_009727	CGAGG	2	10	107860	107869	20 %	0 %	60 %	20 %	154706447
76	NC_009727	TGAAT	2	10	109025	109034	40 %	40 %	20 %	0 %	154705953
77	NC_009727	AAATA	2	10	109403	109412	80 %	20 %	0 %	0 %	154705953
78	NC_009727	AATTT	2	10	112828	112837	40 %	60 %	0 %	0 %	209363682
79	NC_009727	GTGTT	2	10	114216	114225	0 %	60 %	40 %	0 %	154706162
80	NC_009727	ACCCT	2	10	114540	114549	20 %	20 %	0 %	60 %	154706757
81	NC_009727	CAAAC	2	10	116664	116673	60 %	0 %	0 %	40 %	209363685
82	NC_009727	TAGCC	2	10	116935	116944	20 %	20 %	20 %	40 %	209363685
83	NC_009727	AAAAC	2	10	119375	119384	80 %	0 %	0 %	20 %	154707193
84	NC_009727	CTCGG	2	10	119556	119565	0 %	20 %	40 %	40 %	154707193
85	NC_009727	TAATT	2	10	120368	120377	40 %	60 %	0 %	0 %	154707193
86	NC_009727	TTTTC	2	10	121656	121665	0 %	80 %	0 %	20 %	209363687
87	NC_009727	ATGAC	2	10	122499	122508	40 %	20 %	20 %	20 %	209363688
88	NC_009727	TGCGC	2	10	127225	127234	0 %	20 %	40 %	40 %	209363690
89	NC_009727	AAACA	2	10	128528	128537	80 %	0 %	0 %	20 %	209363692
90	NC_009727	TGCTC	2	10	128786	128795	0 %	40 %	20 %	40 %	209363692
91	NC_009727	AATCA	2	10	129512	129521	60 %	20 %	0 %	20 %	209363692
92	NC_009727	CAGAA	2	10	130398	130407	60 %	0 %	20 %	20 %	209363692
93	NC_009727	GAGTG	2	10	133905	133914	20 %	20 %	60 %	0 %	154706602
94	NC_009727	GCAGG	2	10	138206	138215	20 %	0 %	60 %	20 %	154705989
95	NC_009727	CCATT	2	10	139880	139889	20 %	40 %	0 %	40 %	154707736
96	NC_009727	GCAAA	2	10	140044	140053	60 %	0 %	20 %	20 %	154707736
97	NC_009727	AAATT	2	10	140314	140323	60 %	40 %	0 %	0 %	154707534
98	NC_009727	TATTT	2	10	142926	142935	20 %	80 %	0 %	0 %	154706183
99	NC_009727	AATAA	2	10	143344	143353	80 %	20 %	0 %	0 %	154706642
100	NC_009727	CCATC	2	10	145871	145880	20 %	20 %	0 %	60 %	154707126
101	NC_009727	TTTTG	2	10	149540	149549	0 %	80 %	20 %	0 %	154706034
102	NC_009727	AATGA	2	10	149851	149860	60 %	20 %	20 %	0 %	154706034
103	NC_009727	CCAAG	2	10	150264	150273	40 %	0 %	20 %	40 %	154706034
104	NC_009727	CATTC	2	10	152294	152303	20 %	40 %	0 %	40 %	209363696
105	NC_009727	AATGC	2	10	154320	154329	40 %	20 %	20 %	20 %	154705921
106	NC_009727	CTATT	2	10	156087	156096	20 %	60 %	0 %	20 %	154706823
107	NC_009727	ATAAA	2	10	156655	156664	80 %	20 %	0 %	0 %	154707756
108	NC_009727	TTTCA	2	10	161100	161109	20 %	60 %	0 %	20 %	209363699
109	NC_009727	GCAAA	2	10	161271	161280	60 %	0 %	20 %	20 %	209363699
110	NC_009727	AACAT	2	10	164153	164162	60 %	20 %	0 %	20 %	154705840
111	NC_009727	TTTAA	2	10	164427	164436	40 %	60 %	0 %	0 %	154706716
112	NC_009727	TTGTT	2	10	164642	164651	0 %	80 %	20 %	0 %	154706716
113	NC_009727	AATGC	2	10	164857	164866	40 %	20 %	20 %	20 %	154706716
114	NC_009727	CCAAT	2	10	168830	168839	40 %	20 %	0 %	40 %	209363701
115	NC_009727	GTTTT	2	10	174069	174078	0 %	80 %	20 %	0 %	209363705
116	NC_009727	GCCAC	2	10	175403	175412	20 %	0 %	20 %	60 %	209363706
117	NC_009727	GAAGC	2	10	175974	175983	40 %	0 %	40 %	20 %	209363706
118	NC_009727	TTTTC	2	10	176571	176580	0 %	80 %	0 %	20 %	209363707
119	NC_009727	ACGAA	2	10	177388	177397	60 %	0 %	20 %	20 %	209363707
120	NC_009727	TCGAT	2	10	177465	177474	20 %	40 %	20 %	20 %	209363707
121	NC_009727	AAAGT	2	10	177796	177805	60 %	20 %	20 %	0 %	209363707
122	NC_009727	CGATT	2	10	178790	178799	20 %	40 %	20 %	20 %	209363707
123	NC_009727	TAAAA	2	10	180097	180106	80 %	20 %	0 %	0 %	154706213
124	NC_009727	ATTTT	2	10	183663	183672	20 %	80 %	0 %	0 %	209363710
125	NC_009727	CAAAA	2	10	185794	185803	80 %	0 %	0 %	20 %	154706390
126	NC_009727	ACGCA	2	10	190444	190453	40 %	0 %	20 %	40 %	209363714
127	NC_009727	TTGAG	2	10	191567	191576	20 %	40 %	40 %	0 %	209363714
128	NC_009727	TCCAT	2	10	192424	192433	20 %	40 %	0 %	40 %	154707612
129	NC_009727	ATTGC	2	10	194424	194433	20 %	40 %	20 %	20 %	154707560
130	NC_009727	ATAAA	2	10	195269	195278	80 %	20 %	0 %	0 %	209363717
131	NC_009727	TCCAT	2	10	197224	197233	20 %	40 %	0 %	40 %	209363719
132	NC_009727	ATGAG	2	10	198397	198406	40 %	20 %	40 %	0 %	154706782
133	NC_009727	TTCAT	2	10	200662	200671	20 %	60 %	0 %	20 %	154706112
134	NC_009727	CAAAT	2	10	200885	200894	60 %	20 %	0 %	20 %	154706112
135	NC_009727	TGGCA	2	10	206045	206054	20 %	20 %	40 %	20 %	209363722
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