MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 5191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009727	CAAA	2	8	247	254	75 %	0 %	0 %	25 %	154706441
2	NC_009727	CCAA	2	8	401	408	50 %	0 %	0 %	50 %	154706441
3	NC_009727	TTTA	2	8	596	603	25 %	75 %	0 %	0 %	154706441
4	NC_009727	GATC	2	8	821	828	25 %	25 %	25 %	25 %	154706441
5	NC_009727	TCAA	2	8	1144	1151	50 %	25 %	0 %	25 %	154706441
6	NC_009727	TTGC	2	8	1430	1437	0 %	50 %	25 %	25 %	154706441
7	NC_009727	CAAA	2	8	2194	2201	75 %	0 %	0 %	25 %	154706526
8	NC_009727	AATT	2	8	2348	2355	50 %	50 %	0 %	0 %	154706526
9	NC_009727	ATCG	2	8	2416	2423	25 %	25 %	25 %	25 %	154706526
10	NC_009727	AATC	2	8	2877	2884	50 %	25 %	0 %	25 %	154707128
11	NC_009727	CGAT	2	8	3028	3035	25 %	25 %	25 %	25 %	154707128
12	NC_009727	CCTT	2	8	3188	3195	0 %	50 %	0 %	50 %	154707128
13	NC_009727	GTGG	2	8	3420	3427	0 %	25 %	75 %	0 %	154707128
14	NC_009727	TTAC	2	8	3585	3592	25 %	50 %	0 %	25 %	154707128
15	NC_009727	ATTT	2	8	3647	3654	25 %	75 %	0 %	0 %	154707128
16	NC_009727	TGAT	2	8	3702	3709	25 %	50 %	25 %	0 %	154707128
17	NC_009727	GCTT	2	8	4715	4722	0 %	50 %	25 %	25 %	209363643
18	NC_009727	CCAT	2	8	4840	4847	25 %	25 %	0 %	50 %	209363643
19	NC_009727	CACT	2	8	4973	4980	25 %	25 %	0 %	50 %	209363643
20	NC_009727	CTTG	2	8	5216	5223	0 %	50 %	25 %	25 %	209363643
21	NC_009727	TGAG	2	8	5995	6002	25 %	25 %	50 %	0 %	209363643
22	NC_009727	CTTT	2	8	8023	8030	0 %	75 %	0 %	25 %	154707433
23	NC_009727	GGGT	2	8	8057	8064	0 %	25 %	75 %	0 %	154707433
24	NC_009727	ACAT	2	8	8437	8444	50 %	25 %	0 %	25 %	154706378
25	NC_009727	ATTC	2	8	9151	9158	25 %	50 %	0 %	25 %	154706378
26	NC_009727	CTTG	2	8	9746	9753	0 %	50 %	25 %	25 %	154706378
27	NC_009727	CTCG	2	8	9785	9792	0 %	25 %	25 %	50 %	154706378
28	NC_009727	TCAA	2	8	10150	10157	50 %	25 %	0 %	25 %	154705767
29	NC_009727	TACC	2	8	10696	10703	25 %	25 %	0 %	50 %	154705767
30	NC_009727	AATT	2	8	10725	10732	50 %	50 %	0 %	0 %	154705767
31	NC_009727	TATT	2	8	11558	11565	25 %	75 %	0 %	0 %	154705767
32	NC_009727	AAAT	2	8	11972	11979	75 %	25 %	0 %	0 %	154705767
33	NC_009727	CACG	2	8	15766	15773	25 %	0 %	25 %	50 %	154706946
34	NC_009727	TTTA	2	8	16151	16158	25 %	75 %	0 %	0 %	154706946
35	NC_009727	TGCG	2	8	16438	16445	0 %	25 %	50 %	25 %	154706946
36	NC_009727	TTGG	2	8	16480	16487	0 %	50 %	50 %	0 %	154706946
37	NC_009727	AATT	2	8	16818	16825	50 %	50 %	0 %	0 %	154706946
38	NC_009727	TTGA	2	8	17117	17124	25 %	50 %	25 %	0 %	154706946
39	NC_009727	CCAC	2	8	17237	17244	25 %	0 %	0 %	75 %	154706946
40	NC_009727	ATTG	2	8	18114	18121	25 %	50 %	25 %	0 %	209363645
41	NC_009727	AGCA	2	8	18188	18195	50 %	0 %	25 %	25 %	209363645
42	NC_009727	CGGT	2	8	18272	18279	0 %	25 %	50 %	25 %	209363645
43	NC_009727	ATTG	2	8	18389	18396	25 %	50 %	25 %	0 %	154705750
44	NC_009727	AATA	3	12	23178	23189	75 %	25 %	0 %	0 %	209363646
45	NC_009727	TAAA	2	8	23778	23785	75 %	25 %	0 %	0 %	154707059
46	NC_009727	AAAT	2	8	23878	23885	75 %	25 %	0 %	0 %	154707059
47	NC_009727	AATT	2	8	23969	23976	50 %	50 %	0 %	0 %	154707059
48	NC_009727	TTAA	2	8	24079	24086	50 %	50 %	0 %	0 %	154707059
49	NC_009727	AATT	2	8	25347	25354	50 %	50 %	0 %	0 %	154707059
50	NC_009727	GTCA	2	8	25683	25690	25 %	25 %	25 %	25 %	154707059
51	NC_009727	TGGC	2	8	26049	26056	0 %	25 %	50 %	25 %	154707059
52	NC_009727	ATCA	2	8	26115	26122	50 %	25 %	0 %	25 %	154707059
53	NC_009727	GGTT	2	8	26291	26298	0 %	50 %	50 %	0 %	154707145
54	NC_009727	CGTT	2	8	26385	26392	0 %	50 %	25 %	25 %	154707145
55	NC_009727	CTTA	2	8	26498	26505	25 %	50 %	0 %	25 %	154707145
56	NC_009727	AAGC	2	8	26864	26871	50 %	0 %	25 %	25 %	154707145
57	NC_009727	CCTT	2	8	27312	27319	0 %	50 %	0 %	50 %	154707145
58	NC_009727	ATTC	2	8	27532	27539	25 %	50 %	0 %	25 %	154707145
59	NC_009727	CTTA	2	8	27606	27613	25 %	50 %	0 %	25 %	154707145
60	NC_009727	GCTC	2	8	27724	27731	0 %	25 %	25 %	50 %	154707145
61	NC_009727	TCAC	2	8	27786	27793	25 %	25 %	0 %	50 %	154707145
62	NC_009727	ATTA	2	8	28044	28051	50 %	50 %	0 %	0 %	209363647
63	NC_009727	TTAT	2	8	29087	29094	25 %	75 %	0 %	0 %	154705832
64	NC_009727	TACA	2	8	29119	29126	50 %	25 %	0 %	25 %	154705832
65	NC_009727	TTTA	2	8	29250	29257	25 %	75 %	0 %	0 %	154705832
66	NC_009727	ATTT	2	8	30227	30234	25 %	75 %	0 %	0 %	154705832
67	NC_009727	ACAT	2	8	30480	30487	50 %	25 %	0 %	25 %	154707346
68	NC_009727	AGAT	2	8	30649	30656	50 %	25 %	25 %	0 %	154707346
69	NC_009727	GTGA	2	8	30770	30777	25 %	25 %	50 %	0 %	154707346
70	NC_009727	AATG	2	8	31050	31057	50 %	25 %	25 %	0 %	154707463
71	NC_009727	TTAA	2	8	31197	31204	50 %	50 %	0 %	0 %	154707463
72	NC_009727	GAAT	2	8	31524	31531	50 %	25 %	25 %	0 %	209363648
73	NC_009727	TTAA	2	8	31807	31814	50 %	50 %	0 %	0 %	209363648
74	NC_009727	GTGA	2	8	32167	32174	25 %	25 %	50 %	0 %	154707564
75	NC_009727	GTTT	2	8	32689	32696	0 %	75 %	25 %	0 %	154706970
76	NC_009727	AATT	2	8	32763	32770	50 %	50 %	0 %	0 %	154706970
77	NC_009727	CTGT	2	8	32866	32873	0 %	50 %	25 %	25 %	154706970
78	NC_009727	TTGG	2	8	33049	33056	0 %	50 %	50 %	0 %	154706970
79	NC_009727	TTGA	2	8	34114	34121	25 %	50 %	25 %	0 %	154706089
80	NC_009727	AATT	2	8	34189	34196	50 %	50 %	0 %	0 %	154706089
81	NC_009727	AAAT	2	8	34650	34657	75 %	25 %	0 %	0 %	209363650
82	NC_009727	CTCA	2	8	34720	34727	25 %	25 %	0 %	50 %	154707024
83	NC_009727	TACT	2	8	34899	34906	25 %	50 %	0 %	25 %	154707024
84	NC_009727	CCAC	2	8	34909	34916	25 %	0 %	0 %	75 %	154707024
85	NC_009727	ACAA	2	8	35127	35134	75 %	0 %	0 %	25 %	154706190
86	NC_009727	CTTC	2	8	36234	36241	0 %	50 %	0 %	50 %	154707121
87	NC_009727	TTTG	2	8	36302	36309	0 %	75 %	25 %	0 %	154707121
88	NC_009727	ATGT	2	8	36310	36317	25 %	50 %	25 %	0 %	154707121
89	NC_009727	CGAT	2	8	37473	37480	25 %	25 %	25 %	25 %	154706652
90	NC_009727	GTTT	2	8	37655	37662	0 %	75 %	25 %	0 %	154706652
91	NC_009727	CATC	2	8	37806	37813	25 %	25 %	0 %	50 %	154706652
92	NC_009727	CTAT	2	8	38005	38012	25 %	50 %	0 %	25 %	154707096
93	NC_009727	TGAA	2	8	39069	39076	50 %	25 %	25 %	0 %	154706910
94	NC_009727	GAAT	2	8	39565	39572	50 %	25 %	25 %	0 %	154706910
95	NC_009727	AAAC	2	8	39808	39815	75 %	0 %	0 %	25 %	154706910
96	NC_009727	TTGA	2	8	40100	40107	25 %	50 %	25 %	0 %	154706192
97	NC_009727	GTTT	2	8	41972	41979	0 %	75 %	25 %	0 %	209363651
98	NC_009727	AGCA	2	8	42224	42231	50 %	0 %	25 %	25 %	209363651
99	NC_009727	AGGA	2	8	42530	42537	50 %	0 %	50 %	0 %	209363651
100	NC_009727	TAAA	2	8	42556	42563	75 %	25 %	0 %	0 %	209363651
101	NC_009727	GGCG	2	8	43073	43080	0 %	0 %	75 %	25 %	154706317
102	NC_009727	ATTT	2	8	43643	43650	25 %	75 %	0 %	0 %	154705781
103	NC_009727	TGAG	2	8	44020	44027	25 %	25 %	50 %	0 %	154705781
104	NC_009727	CGAT	2	8	44224	44231	25 %	25 %	25 %	25 %	154705781
105	NC_009727	CTCA	2	8	44544	44551	25 %	25 %	0 %	50 %	154705781
106	NC_009727	AATT	2	8	45033	45040	50 %	50 %	0 %	0 %	154705781
107	NC_009727	TTGA	2	8	45129	45136	25 %	50 %	25 %	0 %	154705781
108	NC_009727	TTGA	2	8	45183	45190	25 %	50 %	25 %	0 %	154705781
109	NC_009727	ACGA	2	8	45644	45651	50 %	0 %	25 %	25 %	154707506
110	NC_009727	GCCG	2	8	45814	45821	0 %	0 %	50 %	50 %	154707506
111	NC_009727	TCGT	2	8	46110	46117	0 %	50 %	25 %	25 %	154707506
112	NC_009727	TGCG	2	8	46249	46256	0 %	25 %	50 %	25 %	209363652
113	NC_009727	TTAC	2	8	46630	46637	25 %	50 %	0 %	25 %	209363652
114	NC_009727	CCAA	2	8	46708	46715	50 %	0 %	0 %	50 %	209363652
115	NC_009727	AGTG	2	8	46776	46783	25 %	25 %	50 %	0 %	209363652
116	NC_009727	GAAA	2	8	47115	47122	75 %	0 %	25 %	0 %	209363652
117	NC_009727	AGTT	2	8	48114	48121	25 %	50 %	25 %	0 %	154706010
118	NC_009727	ATTT	2	8	48945	48952	25 %	75 %	0 %	0 %	209363653
119	NC_009727	CAAA	2	8	49179	49186	75 %	0 %	0 %	25 %	209363653
120	NC_009727	TTTA	2	8	49358	49365	25 %	75 %	0 %	0 %	209363653
121	NC_009727	ATTT	2	8	49411	49418	25 %	75 %	0 %	0 %	209363653
122	NC_009727	CACT	2	8	49923	49930	25 %	25 %	0 %	50 %	209363653
123	NC_009727	ACAA	2	8	49957	49964	75 %	0 %	0 %	25 %	209363653
124	NC_009727	TCAA	2	8	50031	50038	50 %	25 %	0 %	25 %	209363654
125	NC_009727	AATA	2	8	50222	50229	75 %	25 %	0 %	0 %	209363654
126	NC_009727	AGAA	2	8	50931	50938	75 %	0 %	25 %	0 %	154706619
127	NC_009727	ATAA	2	8	51934	51941	75 %	25 %	0 %	0 %	154707221
128	NC_009727	ACAG	2	8	52011	52018	50 %	0 %	25 %	25 %	154707221
129	NC_009727	AATT	2	8	52052	52059	50 %	50 %	0 %	0 %	154707221
130	NC_009727	CAAA	2	8	52113	52120	75 %	0 %	0 %	25 %	154707221
131	NC_009727	ATTT	2	8	52802	52809	25 %	75 %	0 %	0 %	154707221
132	NC_009727	CAAA	3	12	53825	53836	75 %	0 %	0 %	25 %	154706090
133	NC_009727	AACC	2	8	54319	54326	50 %	0 %	0 %	50 %	154706090
134	NC_009727	GTTA	2	8	54392	54399	25 %	50 %	25 %	0 %	209363657
135	NC_009727	GAAA	2	8	54500	54507	75 %	0 %	25 %	0 %	209363657
136	NC_009727	GGAA	2	8	55073	55080	50 %	0 %	50 %	0 %	209363657
137	NC_009727	GCTT	2	8	55285	55292	0 %	50 %	25 %	25 %	209363657
138	NC_009727	ATTT	2	8	55343	55350	25 %	75 %	0 %	0 %	209363657
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