MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Coxiella burnetii Dugway 5J108-111 chromosome

Total Repeats: 38734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_009727	ATA	2	6	32596	32601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707564
503	NC_009727	GTTT	2	8	32689	32696	0 %	75 %	25 %	0 %	154706970
504	NC_009727	GTT	2	6	32711	32716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706970
505	NC_009727	T	6	6	32730	32735	0 %	100 %	0 %	0 %	154706970
506	NC_009727	AATT	2	8	32763	32770	50 %	50 %	0 %	0 %	154706970
507	NC_009727	TAA	2	6	32783	32788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706970
508	NC_009727	ATG	2	6	32848	32853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706970
509	NC_009727	CTGT	2	8	32866	32873	0 %	50 %	25 %	25 %	154706970
510	NC_009727	CGA	2	6	32882	32887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706970
511	NC_009727	AG	3	6	32892	32897	50 %	0 %	50 %	0 %	154706970
512	NC_009727	TTTTTA	2	12	32930	32941	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154706970
513	NC_009727	TGG	2	6	33017	33022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154706970
514	NC_009727	AAGTA	2	10	33024	33033	60 %	20 %	20 %	0 %	154706970
515	NC_009727	TTGG	2	8	33049	33056	0 %	50 %	50 %	0 %	154706970
516	NC_009727	AAT	2	6	33078	33083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706970
517	NC_009727	ATA	2	6	33097	33102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706970
518	NC_009727	A	6	6	33118	33123	100 %	0 %	0 %	0 %	154706970
519	NC_009727	TCG	2	6	33138	33143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706970
520	NC_009727	CG	3	6	33142	33147	0 %	0 %	50 %	50 %	154706970
521	NC_009727	A	6	6	33187	33192	100 %	0 %	0 %	0 %	154706970
522	NC_009727	AAT	2	6	33401	33406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209363649
523	NC_009727	CTG	2	6	33430	33435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363649
524	NC_009727	ACT	2	6	33494	33499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209363649
525	NC_009727	AGT	2	6	33533	33538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209363649
526	NC_009727	TCT	2	6	33591	33596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209363649
527	NC_009727	ACG	2	6	33719	33724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706089
528	NC_009727	AAT	2	6	33727	33732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706089
529	NC_009727	ATT	2	6	33775	33780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706089
530	NC_009727	T	6	6	33786	33791	0 %	100 %	0 %	0 %	154706089
531	NC_009727	T	6	6	33811	33816	0 %	100 %	0 %	0 %	154706089
532	NC_009727	GGC	2	6	33848	33853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154706089
533	NC_009727	TAA	2	6	33867	33872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706089
534	NC_009727	TCA	2	6	33908	33913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706089
535	NC_009727	A	6	6	33915	33920	100 %	0 %	0 %	0 %	154706089
536	NC_009727	ATC	2	6	34087	34092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706089
537	NC_009727	TTGA	2	8	34114	34121	25 %	50 %	25 %	0 %	154706089
538	NC_009727	A	6	6	34121	34126	100 %	0 %	0 %	0 %	154706089
539	NC_009727	AATT	2	8	34189	34196	50 %	50 %	0 %	0 %	154706089
540	NC_009727	GAT	2	6	34306	34311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706089
541	NC_009727	TCG	2	6	34587	34592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209363650
542	NC_009727	CTCAT	2	10	34601	34610	20 %	40 %	0 %	40 %	209363650
543	NC_009727	CAA	2	6	34630	34635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209363650
544	NC_009727	AAAT	2	8	34650	34657	75 %	25 %	0 %	0 %	209363650
545	NC_009727	A	6	6	34681	34686	100 %	0 %	0 %	0 %	154707024
546	NC_009727	CTCA	2	8	34720	34727	25 %	25 %	0 %	50 %	154707024
547	NC_009727	T	6	6	34817	34822	0 %	100 %	0 %	0 %	154707024
548	NC_009727	CAA	2	6	34875	34880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154707024
549	NC_009727	TACT	2	8	34899	34906	25 %	50 %	0 %	25 %	154707024
550	NC_009727	CCAC	2	8	34909	34916	25 %	0 %	0 %	75 %	154707024
551	NC_009727	GCT	2	6	34972	34977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154706190
552	NC_009727	A	7	7	34991	34997	100 %	0 %	0 %	0 %	154706190
553	NC_009727	ACC	2	6	35005	35010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154706190
554	NC_009727	ACAA	2	8	35127	35134	75 %	0 %	0 %	25 %	154706190
555	NC_009727	TCC	2	6	35156	35161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154706190
556	NC_009727	TAA	2	6	35212	35217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706190
557	NC_009727	A	6	6	35307	35312	100 %	0 %	0 %	0 %	154706190
558	NC_009727	CTG	2	6	35409	35414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154705743
559	NC_009727	CAT	2	6	35485	35490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154705743
560	NC_009727	CTT	2	6	35492	35497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705743
561	NC_009727	A	6	6	35500	35505	100 %	0 %	0 %	0 %	154705743
562	NC_009727	T	6	6	35573	35578	0 %	100 %	0 %	0 %	154705743
563	NC_009727	TTC	2	6	35582	35587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154705743
564	NC_009727	AT	3	6	35617	35622	50 %	50 %	0 %	0 %	154705743
565	NC_009727	TGG	2	6	36157	36162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	154707121
566	NC_009727	TCT	2	6	36224	36229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154707121
567	NC_009727	CTTC	2	8	36234	36241	0 %	50 %	0 %	50 %	154707121
568	NC_009727	CAG	2	6	36279	36284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154707121
569	NC_009727	TTTG	2	8	36302	36309	0 %	75 %	25 %	0 %	154707121
570	NC_009727	ATGT	2	8	36310	36317	25 %	50 %	25 %	0 %	154707121
571	NC_009727	CTT	2	6	36330	36335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154707121
572	NC_009727	AAGGA	2	10	36442	36451	60 %	0 %	40 %	0 %	154707121
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574	NC_009727	CTG	3	9	36516	36524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	154707121
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577	NC_009727	AGG	2	6	36910	36915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	154706652
578	NC_009727	CCG	2	6	36998	37003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	154706652
579	NC_009727	AAT	2	6	37015	37020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706652
580	NC_009727	CTA	2	6	37026	37031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154706652
581	NC_009727	CGA	2	6	37040	37045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	154706652
582	NC_009727	GCG	2	6	37054	37059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154706652
583	NC_009727	ATA	2	6	37118	37123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706652
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589	NC_009727	ATT	2	6	37336	37341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154706652
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593	NC_009727	A	6	6	37517	37522	100 %	0 %	0 %	0 %	154706652
594	NC_009727	A	8	8	37551	37558	100 %	0 %	0 %	0 %	154706652
595	NC_009727	GAAAC	2	10	37577	37586	60 %	0 %	20 %	20 %	154706652
596	NC_009727	GTTT	2	8	37655	37662	0 %	75 %	25 %	0 %	154706652
597	NC_009727	TTG	2	6	37717	37722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706652
598	NC_009727	TTG	2	6	37762	37767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706652
599	NC_009727	TGT	2	6	37781	37786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154706652
600	NC_009727	CATC	2	8	37806	37813	25 %	25 %	0 %	50 %	154706652
601	NC_009727	TAA	2	6	37816	37821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154706652
602	NC_009727	ACA	2	6	37892	37897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	154706652
603	NC_009727	AAG	2	6	37931	37936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	154706652
604	NC_009727	AAATT	2	10	37953	37962	60 %	40 %	0 %	0 %	154706652
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607	NC_009727	GGC	2	6	38057	38062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	154707096
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609	NC_009727	CTC	2	6	38102	38107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	154707096
610	NC_009727	CTT	2	6	38137	38142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	154707096
611	NC_009727	ATA	2	6	38187	38192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707096
612	NC_009727	GC	5	10	38209	38218	0 %	0 %	50 %	50 %	154707096
613	NC_009727	CCA	2	6	38241	38246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	154707096
614	NC_009727	ATG	2	6	38264	38269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154707096
615	NC_009727	GC	3	6	38308	38313	0 %	0 %	50 %	50 %	154707096
616	NC_009727	TAA	2	6	38390	38395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707096
617	NC_009727	AAT	2	6	38400	38405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707096
618	NC_009727	CG	3	6	38441	38446	0 %	0 %	50 %	50 %	154707096
619	NC_009727	TAA	2	6	38483	38488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154707096
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623	NC_009727	A	6	6	38595	38600	100 %	0 %	0 %	0 %	154707096
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625	NC_009727	GAT	2	6	38712	38717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154706910
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