MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter hominis ATCC BAA-381

Total Repeats: 854

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009714	AATGCA	2	12	3404	3415	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154148768
2	NC_009714	CCGATG	2	12	3999	4010	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	154148768
3	NC_009714	AAGATT	2	12	7350	7361	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154148070
4	NC_009714	CTTTAT	2	12	9194	9205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154149206
5	NC_009714	TTTAAA	2	12	9398	9409	50 %	50 %	0 %	0 %	154148436
6	NC_009714	AAAGAT	2	12	9897	9908	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	154148436
7	NC_009714	AAAGAC	2	12	17787	17798	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	154148587
8	NC_009714	ACCTGC	2	12	20286	20297	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	154148439
9	NC_009714	ATTGAA	2	12	20798	20809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154148276
10	NC_009714	TAGCGG	2	12	22182	22193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	154149015
11	NC_009714	ATTTAC	2	12	26197	26208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	154148001
12	NC_009714	GGTCTT	2	12	26531	26542	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	154148732
13	NC_009714	CATAAC	2	12	31766	31777	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	154149040
14	NC_009714	CAGTAT	2	12	31859	31870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154149040
15	NC_009714	AAAATT	2	12	32402	32413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154149040
16	NC_009714	TTTGTT	2	12	32485	32496	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	154149040
17	NC_009714	TTTTAT	2	12	32844	32855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154147873
18	NC_009714	TAAAAA	2	12	37394	37405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	154148536
19	NC_009714	GCTCAC	2	12	38944	38955	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	154148303
20	NC_009714	GCAAAA	2	12	39755	39766	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	154148924
21	NC_009714	ATCTCC	2	12	62330	62341	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	154148820
22	NC_009714	ATTTTT	2	12	62636	62647	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154148820
23	NC_009714	TTTATT	2	12	65762	65773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154148412
24	NC_009714	ATAAAA	2	12	69982	69993	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	154148346
25	NC_009714	TCAAAA	2	12	76284	76295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	154149098
26	NC_009714	TTTAAT	2	12	76981	76992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154147961
27	NC_009714	TATAAA	2	12	81547	81558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154149468
28	NC_009714	GGTAAA	2	12	82195	82206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	154148600
29	NC_009714	AGCTAA	2	12	83974	83985	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154149067
30	NC_009714	AAAGGC	2	12	85088	85099	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	154148630
31	NC_009714	AAAAGA	2	12	85208	85219	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	154148292
32	NC_009714	AGGCGC	2	12	86315	86326	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	154148588
33	NC_009714	TGTTCC	2	12	86455	86466	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	154149113
34	NC_009714	TTAAAA	2	12	92135	92146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154148180
35	NC_009714	GCATTT	2	12	92813	92824	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154149306
36	NC_009714	AAGCGG	2	12	95351	95362	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	154149335
37	NC_009714	AAAATT	2	12	97052	97063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154148015
38	NC_009714	CGGTTT	2	12	108328	108339	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	154149331
39	NC_009714	GTTTTG	2	12	108882	108893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	154149331
40	NC_009714	CGGTGA	2	12	115750	115761	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	154149163
41	NC_009714	CAAAGA	2	12	124337	124348	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	154147960
42	NC_009714	ATAAAA	2	12	126221	126232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	154148882
43	NC_009714	GGAGAA	2	12	126962	126973	50 %	0 %	50 %	0 %	154147895
44	NC_009714	CTCATA	2	12	130673	130684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149403
45	NC_009714	AGATAT	2	12	131453	131464	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154149403
46	NC_009714	TAAATC	2	12	133258	133269	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	154148864
47	NC_009714	GGAGTT	2	12	133885	133896	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	154147933
48	NC_009714	AAAGCT	2	12	134759	134770	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154148325
49	NC_009714	TTTCAT	2	12	136877	136888	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154149046
50	NC_009714	CTATCT	2	12	138055	138066	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	154149046
51	NC_009714	TAATTT	2	12	140984	140995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154149046
52	NC_009714	TTTAAA	2	12	141091	141102	50 %	50 %	0 %	0 %	154149046
53	NC_009714	ATTTGG	2	12	141537	141548	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	154149046
54	NC_009714	TTGTTT	2	12	143013	143024	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	154149046
55	NC_009714	CTTTTT	2	12	143153	143164	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	154148545
56	NC_009714	ATTTTC	2	12	143262	143273	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154148545
57	NC_009714	ATTTTC	2	12	143919	143930	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154148545
58	NC_009714	ATCTTT	2	12	145001	145012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154148360
59	NC_009714	ATTTCA	2	12	146582	146593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	154149082
60	NC_009714	TTCAAA	2	12	147109	147120	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	154149082
61	NC_009714	TTTTTA	2	12	147278	147289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154149082
62	NC_009714	AAAATT	2	12	147601	147612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154149082
63	NC_009714	TCAACT	2	12	150282	150293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154149472
64	NC_009714	TTTCAC	2	12	151175	151186	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	154149168
65	NC_009714	TCTTTT	2	12	153272	153283	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	154148275
66	NC_009714	TTTCTG	2	12	153432	153443	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	154148275
67	NC_009714	TATTTC	2	12	154849	154860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154148212
68	NC_009714	TTCCAC	2	12	154963	154974	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	154148212
69	NC_009714	TATAAT	2	12	155359	155370	50 %	50 %	0 %	0 %	154148212
70	NC_009714	TTTTTG	2	12	156300	156311	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	154148925
71	NC_009714	TATCTT	2	12	156353	156364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154148925
72	NC_009714	TAATTG	2	12	158284	158295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154149461
73	NC_009714	ATTTAT	2	12	159663	159674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154148853
74	NC_009714	CTTTAT	2	12	160452	160463	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154148853
75	NC_009714	ATTTTT	2	12	164237	164248	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154148904
76	NC_009714	TGCGAA	2	12	165071	165082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	154149064
77	NC_009714	TGAAAA	2	12	167008	167019	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	154149064
78	NC_009714	TCGGGC	2	12	169662	169673	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	154149547
79	NC_009714	TTTTAT	2	12	174332	174343	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154149049
80	NC_009714	TAATTT	2	12	174776	174787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154149104
81	NC_009714	TTTATT	2	12	175138	175149	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	154149104
82	NC_009714	CGAAAT	2	12	175659	175670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154147914
83	NC_009714	AAATGT	2	12	175977	175988	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154147914
84	NC_009714	ATAAAA	2	12	179842	179853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	154148146
85	NC_009714	TGGCGA	2	12	179882	179893	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	154148146
86	NC_009714	AAATTT	2	12	183578	183589	50 %	50 %	0 %	0 %	154149371
87	NC_009714	GTTCAA	2	12	189185	189196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154148029
88	NC_009714	ATTTTC	2	12	190174	190185	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154149116
89	NC_009714	TTCATT	2	12	190291	190302	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154149116
90	NC_009714	TTCATA	2	12	190798	190809	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	154149116
91	NC_009714	TTTCAT	2	12	190842	190853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154149116
92	NC_009714	ATTTTC	2	12	194495	194506	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154148520
93	NC_009714	TACGGT	2	12	195074	195085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	154148520
94	NC_009714	CCTTCG	2	12	197718	197729	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	154147987
95	NC_009714	TTCATT	2	12	198929	198940	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154149033
96	NC_009714	TCAGTT	2	12	199485	199496	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	154148903
97	NC_009714	TAATGA	2	12	202446	202457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	154148898
98	NC_009714	TATTTA	2	12	204739	204750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	154148147
99	NC_009714	ATTTTG	2	12	205104	205115	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	154148147
100	NC_009714	AGGCGA	2	12	210849	210860	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	154148729
101	NC_009714	GCAAAT	2	12	213904	213915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	154147997
102	NC_009714	ATCTTT	2	12	217885	217896	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154148101
103	NC_009714	CTTGGA	2	12	219776	219787	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	154148392
104	NC_009714	ATTGAT	2	12	222193	222204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	154149494
105	NC_009714	TTAAAA	2	12	225012	225023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	154149019
106	NC_009714	TCTAAG	2	12	228730	228741	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	154148645
107	NC_009714	TAAAAA	2	12	229290	229301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	154147995
108	NC_009714	TTTATG	2	12	243857	243868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	154149417
109	NC_009714	CAAAGG	2	12	245369	245380	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	154149442
110	NC_009714	AAAGAA	3	18	248198	248215	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	154148189
111	NC_009714	AAAAGC	2	12	248354	248365	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	154149418
112	NC_009714	TTTAAA	2	12	253752	253763	50 %	50 %	0 %	0 %	154149009
113	NC_009714	TTGAAG	2	12	254752	254763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	154149009
114	NC_009714	GCAAAA	2	12	255806	255817	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	154149213
115	NC_009714	AAAAAG	2	12	257237	257248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	154148094
116	NC_009714	CTTTTA	2	12	258610	258621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	154149204
117	NC_009714	ACTTAC	2	12	263015	263026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	154147949
118	NC_009714	ATACGC	2	12	264328	264339	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	154148554
119	NC_009714	GTTTTT	2	12	266094	266105	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	154149193
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