MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 chromosome

Total Repeats: 82712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009706	ATGC	2	8	27267	27274	25 %	25 %	25 %	25 %	153952689
502	NC_009706	TA	3	6	27279	27284	50 %	50 %	0 %	0 %	153952689
503	NC_009706	GAA	2	6	27355	27360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952689
504	NC_009706	TTA	2	6	27573	27578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952690
505	NC_009706	TTTA	2	8	27583	27590	25 %	75 %	0 %	0 %	153952690
506	NC_009706	ATA	2	6	27615	27620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952690
507	NC_009706	GAAG	2	8	27635	27642	50 %	0 %	50 %	0 %	153952690
508	NC_009706	AAACAA	2	12	27673	27684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	153952690
509	NC_009706	TTG	2	6	27720	27725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153952690
510	NC_009706	A	6	6	27732	27737	100 %	0 %	0 %	0 %	153952690
511	NC_009706	GAA	2	6	27761	27766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952690
512	NC_009706	GTT	2	6	27767	27772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153952690
513	NC_009706	AGA	2	6	27779	27784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952690
514	NC_009706	TGA	2	6	27817	27822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952690
515	NC_009706	GAA	2	6	27851	27856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952690
516	NC_009706	AGA	2	6	27955	27960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952690
517	NC_009706	ATA	2	6	28497	28502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952691
518	NC_009706	ATG	2	6	28541	28546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952691
519	NC_009706	ATA	2	6	28571	28576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952691
520	NC_009706	AGC	2	6	28613	28618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153952691
521	NC_009706	AATT	2	8	28891	28898	50 %	50 %	0 %	0 %	153952691
522	NC_009706	AAT	2	6	28904	28909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952691
523	NC_009706	CT	3	6	29096	29101	0 %	50 %	0 %	50 %	153952691
524	NC_009706	CTA	2	6	29200	29205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952691
525	NC_009706	ATA	2	6	29241	29246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952691
526	NC_009706	TCA	2	6	29250	29255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952691
527	NC_009706	AGT	2	6	29264	29269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952691
528	NC_009706	TAA	2	6	29377	29382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952691
529	NC_009706	AAT	2	6	29431	29436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952691
530	NC_009706	TTCCA	2	10	29447	29456	20 %	40 %	0 %	40 %	153952691
531	NC_009706	GGA	2	6	29468	29473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153952691
532	NC_009706	TAAG	2	8	29491	29498	50 %	25 %	25 %	0 %	153952691
533	NC_009706	AAT	2	6	29573	29578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952691
534	NC_009706	AGT	2	6	30019	30024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952692
535	NC_009706	GAA	2	6	30115	30120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952692
536	NC_009706	A	7	7	30119	30125	100 %	0 %	0 %	0 %	153952692
537	NC_009706	GGA	2	6	30147	30152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153952692
538	NC_009706	ATA	2	6	30191	30196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952692
539	NC_009706	GAA	2	6	30238	30243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952692
540	NC_009706	AT	3	6	30251	30256	50 %	50 %	0 %	0 %	153952692
541	NC_009706	AGA	2	6	30276	30281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952692
542	NC_009706	ATC	2	6	30296	30301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952692
543	NC_009706	AGG	2	6	30365	30370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153952692
544	NC_009706	A	6	6	30400	30405	100 %	0 %	0 %	0 %	153952692
545	NC_009706	T	7	7	30536	30542	0 %	100 %	0 %	0 %	153952693
546	NC_009706	TAT	2	6	30547	30552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952693
547	NC_009706	ATT	2	6	30555	30560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952693
548	NC_009706	ATT	2	6	30578	30583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952693
549	NC_009706	A	7	7	30632	30638	100 %	0 %	0 %	0 %	153952693
550	NC_009706	AAT	2	6	30684	30689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952693
551	NC_009706	TAT	2	6	30709	30714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952693
552	NC_009706	T	6	6	30731	30736	0 %	100 %	0 %	0 %	153952693
553	NC_009706	GAG	2	6	30778	30783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	153952693
554	NC_009706	TTGT	2	8	30832	30839	0 %	75 %	25 %	0 %	153952693
555	NC_009706	AATT	2	8	30862	30869	50 %	50 %	0 %	0 %	153952693
556	NC_009706	ATT	2	6	30920	30925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952693
557	NC_009706	ATC	2	6	31043	31048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952693
558	NC_009706	ATA	2	6	31073	31078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153952693
559	NC_009706	T	7	7	31123	31129	0 %	100 %	0 %	0 %	153952693
560	NC_009706	GCC	2	6	31155	31160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153952693
561	NC_009706	AAG	2	6	31232	31237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153952693
562	NC_009706	TA	3	6	31238	31243	50 %	50 %	0 %	0 %	153952693
563	NC_009706	CTTT	2	8	31250	31257	0 %	75 %	0 %	25 %	153952693
564	NC_009706	CAT	2	6	31258	31263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952693
565	NC_009706	CAAT	2	8	31317	31324	50 %	25 %	0 %	25 %	153952693
566	NC_009706	TGC	3	9	31363	31371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153952693
567	NC_009706	TAT	2	6	31391	31396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952693
568	NC_009706	TTC	2	6	31398	31403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153952693
569	NC_009706	ATT	2	6	31404	31409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952693
570	NC_009706	AGT	2	6	31598	31603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952694
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573	NC_009706	CTAT	2	8	31683	31690	25 %	50 %	0 %	25 %	153952694
574	NC_009706	ATTC	2	8	31691	31698	25 %	50 %	0 %	25 %	153952694
575	NC_009706	CATTTA	2	12	31701	31712	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153952694
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582	NC_009706	TGA	2	6	32649	32654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952695
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589	NC_009706	AAGA	2	8	32919	32926	75 %	0 %	25 %	0 %	153952695
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593	NC_009706	CAGA	2	8	33029	33036	50 %	0 %	25 %	25 %	153952695
594	NC_009706	AAAG	2	8	33097	33104	75 %	0 %	25 %	0 %	153952695
595	NC_009706	AT	4	8	33152	33159	50 %	50 %	0 %	0 %	153952695
596	NC_009706	ATT	2	6	33164	33169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153952695
597	NC_009706	TGA	2	6	33225	33230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153952695
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599	NC_009706	GATTT	2	10	33365	33374	20 %	60 %	20 %	0 %	153952695
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611	NC_009706	TATT	2	8	33939	33946	25 %	75 %	0 %	0 %	153952696
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615	NC_009706	TA	3	6	34075	34080	50 %	50 %	0 %	0 %	153952696
616	NC_009706	CT	3	6	34093	34098	0 %	50 %	0 %	50 %	153952696
617	NC_009706	TTTTCA	2	12	34106	34117	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153952696
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620	NC_009706	CAT	2	6	34221	34226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153952696
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623	NC_009706	CT	3	6	34331	34336	0 %	50 %	0 %	50 %	153952696
624	NC_009706	AT	3	6	34348	34353	50 %	50 %	0 %	0 %	153952696
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626	NC_009706	A	7	7	35299	35305	100 %	0 %	0 %	0 %	153952697
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