MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. Hall chromosome

Total Repeats: 1930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009698	TAGCAG	2	12	401	412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	153935412
2	NC_009698	AAAAAT	2	12	1340	1351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153935412
3	NC_009698	GATAAT	2	12	2159	2170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153937046
4	NC_009698	AAGTTA	2	12	2841	2852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153936289
5	NC_009698	CAAATA	2	12	3074	3085	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153935303
6	NC_009698	ATAAAG	2	12	3170	3181	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153935303
7	NC_009698	GAAGTA	2	12	4802	4813	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153936801
8	NC_009698	TTGATA	2	12	5853	5864	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153936801
9	NC_009698	GATTAG	2	12	6499	6510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935617
10	NC_009698	TTTAAA	2	12	7364	7375	50 %	50 %	0 %	0 %	153935617
11	NC_009698	CAAGCT	2	12	7590	7601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	153935617
12	NC_009698	GATATA	2	12	7809	7820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935617
13	NC_009698	ATAGAT	2	12	17738	17749	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153937022
14	NC_009698	ACAAAT	2	12	18647	18658	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153937022
15	NC_009698	AATAAA	2	12	19620	19631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153937535
16	NC_009698	GCAAAA	2	12	23476	23487	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153937253
17	NC_009698	TATAAT	2	12	29355	29366	50 %	50 %	0 %	0 %	153935706
18	NC_009698	ATTTAG	2	12	31138	31149	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153937664
19	NC_009698	ATATAG	2	12	32454	32465	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153937271
20	NC_009698	AGAAGC	2	12	32872	32883	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153937271
21	NC_009698	AGATGA	2	12	40006	40017	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153934643
22	NC_009698	CTATAG	2	12	40187	40198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153937733
23	NC_009698	AGAAAA	2	12	42010	42021	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153937461
24	NC_009698	ATGTTT	2	12	47064	47075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153935425
25	NC_009698	ATTTAA	2	12	77910	77921	50 %	50 %	0 %	0 %	153936188
26	NC_009698	ATTATA	2	12	81028	81039	50 %	50 %	0 %	0 %	153935270
27	NC_009698	AATATG	2	12	81048	81059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935270
28	NC_009698	AATTAT	2	12	83070	83081	50 %	50 %	0 %	0 %	153935866
29	NC_009698	GAAAAA	2	12	83611	83622	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153935087
30	NC_009698	TGTAGA	2	12	84446	84457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153937748
31	NC_009698	AAAATA	2	12	86063	86074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153936779
32	NC_009698	GTTTTA	2	12	86296	86307	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153936779
33	NC_009698	AGAAAA	2	12	86331	86342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153936779
34	NC_009698	GTAAGA	2	12	87735	87746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153937146
35	NC_009698	ATTTAA	2	12	97437	97448	50 %	50 %	0 %	0 %	153936342
36	NC_009698	ATAAAT	2	12	101386	101397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937583
37	NC_009698	AGTTAA	2	12	103250	103261	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935585
38	NC_009698	AGAACA	2	12	106122	106133	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	153937636
39	NC_009698	AATATA	2	12	108496	108507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936181
40	NC_009698	AGGACA	2	12	109244	109255	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	153937786
41	NC_009698	GTAGAT	2	12	109512	109523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153937786
42	NC_009698	TACTGA	2	12	112169	112180	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	153935572
43	NC_009698	AATAAA	2	12	115349	115360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153935494
44	NC_009698	GATATA	2	12	115437	115448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935494
45	NC_009698	TAAAGA	2	12	116685	116696	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153935349
46	NC_009698	TTAAAT	2	12	120456	120467	50 %	50 %	0 %	0 %	153937324
47	NC_009698	TCAAAA	2	12	122972	122983	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153934659
48	NC_009698	TTTGCT	2	12	123998	124009	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	153934659
49	NC_009698	GAAAAA	2	12	126133	126144	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153937141
50	NC_009698	AGGAAA	2	12	126395	126406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153937141
51	NC_009698	AATGTA	2	12	127205	127216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153937141
52	NC_009698	TGGATA	2	12	130256	130267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153936480
53	NC_009698	CATGAA	2	12	131429	131440	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153937649
54	NC_009698	ATAAAT	2	12	131543	131554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937649
55	NC_009698	ATAAGA	2	12	137141	137152	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153937177
56	NC_009698	ATATAA	2	12	139825	139836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937527
57	NC_009698	ATTTTT	2	12	142746	142757	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153934675
58	NC_009698	GTAAGT	2	12	142980	142991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153934675
59	NC_009698	TTGAAA	2	12	143178	143189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935800
60	NC_009698	TGATTT	2	12	143644	143655	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153935800
61	NC_009698	AAAGAA	2	12	147772	147783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153937052
62	NC_009698	AATATA	2	12	148851	148862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935877
63	NC_009698	ATTAGT	2	12	151716	151727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153936778
64	NC_009698	TTAAAG	2	12	156612	156623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935571
65	NC_009698	TACCTA	2	12	157699	157710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153936337
66	NC_009698	GTAGAA	2	12	160686	160697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153937112
67	NC_009698	AAAAGA	2	12	161245	161256	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153936129
68	NC_009698	ATAAAT	2	12	161486	161497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936129
69	NC_009698	ATAGAA	2	12	161905	161916	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153936916
70	NC_009698	AGATTT	2	12	162497	162508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153937013
71	NC_009698	AAAGAA	2	12	162684	162695	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153937013
72	NC_009698	ATGAAT	2	12	164434	164445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153934496
73	NC_009698	GTGGTA	2	12	168664	168675	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	153935975
74	NC_009698	ATATAA	2	12	169870	169881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936703
75	NC_009698	AGGTAT	2	12	173524	173535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935683
76	NC_009698	AGTTAT	2	12	175771	175782	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153936575
77	NC_009698	TACAAC	2	12	176864	176875	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	153937423
78	NC_009698	AAAAAT	2	12	178406	178417	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153936404
79	NC_009698	ATGGTA	2	12	182414	182425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153935396
80	NC_009698	AACATA	2	12	182482	182493	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	153935396
81	NC_009698	AATTAA	2	12	184864	184875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153934961
82	NC_009698	TAATTT	2	12	185580	185591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153935794
83	NC_009698	AATAAA	2	12	186558	186569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153935043
84	NC_009698	ATAAAA	2	12	186631	186642	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	153935043
85	NC_009698	TAAAGT	2	12	189524	189535	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153936256
86	NC_009698	AATGGT	2	12	193723	193734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153936792
87	NC_009698	TTAAAA	2	12	195084	195095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936042
88	NC_009698	TAAATA	2	12	195844	195855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153936042
89	NC_009698	AAAGAT	2	12	196461	196472	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153936042
90	NC_009698	TGTAAT	2	12	201221	201232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153935608
91	NC_009698	AAAGAA	2	12	202152	202163	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153935608
92	NC_009698	GTAGAA	2	12	202389	202400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	153935608
93	NC_009698	GAAATA	2	12	203496	203507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153936079
94	NC_009698	AATTAA	2	12	204338	204349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153935137
95	NC_009698	GAAAAA	2	12	206174	206185	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153934599
96	NC_009698	CTATAT	2	12	206799	206810	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153934599
97	NC_009698	GGGTAA	2	12	210289	210300	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	153936476
98	NC_009698	ATATAG	2	12	210779	210790	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935408
99	NC_009698	TAAGAT	2	12	211311	211322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153934587
100	NC_009698	CAGATA	2	12	212387	212398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	153936679
101	NC_009698	GATAAA	2	12	213367	213378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153936679
102	NC_009698	TAAAAG	2	12	213785	213796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153936679
103	NC_009698	CTATAT	2	12	214938	214949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153935874
104	NC_009698	TATAAA	2	12	215947	215958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153937615
105	NC_009698	TTTATA	2	12	222287	222298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153935232
106	NC_009698	ATAGAT	2	12	223376	223387	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153935961
107	NC_009698	TCATAA	2	12	224861	224872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153937182
108	NC_009698	TTTATA	2	12	226846	226857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153937058
109	NC_009698	AAATGA	2	12	226953	226964	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153937058
110	NC_009698	CTTATT	2	12	231621	231632	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153935718
111	NC_009698	ATTTAG	2	12	238954	238965	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	153935506
112	NC_009698	TTTAGG	2	12	241297	241308	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	153937822
113	NC_009698	TATGTT	2	12	245172	245183	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153934586
114	NC_009698	AGATAA	2	12	246372	246383	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	153935793
115	NC_009698	TTATGG	2	12	247461	247472	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	153935023
116	NC_009698	TCAATA	2	12	247642	247653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	153935023
117	NC_009698	ATTTTT	2	12	250010	250021	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153935647
118	NC_009698	CTGTAG	2	12	250196	250207	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	153935647
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120	NC_009698	GAAAAA	2	12	251402	251413	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	153937127
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