MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. Hall chromosome

Total Repeats: 3059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009698	AATAA	2	10	3298	3307	80 %	20 %	0 %	0 %	153935303
2	NC_009698	TAAAT	2	10	3603	3612	60 %	40 %	0 %	0 %	153935303
3	NC_009698	TAAAA	2	10	4083	4092	80 %	20 %	0 %	0 %	153935303
4	NC_009698	ACTTT	2	10	5927	5936	20 %	60 %	0 %	20 %	153936801
5	NC_009698	AAGAT	2	10	6315	6324	60 %	20 %	20 %	0 %	153936801
6	NC_009698	TAAAA	2	10	6968	6977	80 %	20 %	0 %	0 %	153935617
7	NC_009698	AAATT	2	10	14637	14646	60 %	40 %	0 %	0 %	153934873
8	NC_009698	AATAA	2	10	15375	15384	80 %	20 %	0 %	0 %	153937121
9	NC_009698	ATATA	2	10	15753	15762	60 %	40 %	0 %	0 %	153936038
10	NC_009698	TTTTA	2	10	16315	16324	20 %	80 %	0 %	0 %	153936038
11	NC_009698	AATAA	2	10	16664	16673	80 %	20 %	0 %	0 %	153937022
12	NC_009698	TTATT	2	10	17107	17116	20 %	80 %	0 %	0 %	153937022
13	NC_009698	TATAA	2	10	17753	17762	60 %	40 %	0 %	0 %	153937022
14	NC_009698	CAAAG	2	10	18542	18551	60 %	0 %	20 %	20 %	153937022
15	NC_009698	TAATG	2	10	18727	18736	40 %	40 %	20 %	0 %	153937022
16	NC_009698	TAAAA	2	10	19275	19284	80 %	20 %	0 %	0 %	153937022
17	NC_009698	GAAAT	2	10	19564	19573	60 %	20 %	20 %	0 %	153937535
18	NC_009698	ATATT	2	10	20003	20012	40 %	60 %	0 %	0 %	153937535
19	NC_009698	TAATA	2	10	20063	20072	60 %	40 %	0 %	0 %	153937535
20	NC_009698	ATAGT	2	10	21121	21130	40 %	40 %	20 %	0 %	153935047
21	NC_009698	AATTT	2	10	21611	21620	40 %	60 %	0 %	0 %	153935047
22	NC_009698	CTAAA	2	10	22541	22550	60 %	20 %	0 %	20 %	153937253
23	NC_009698	TGAAA	2	10	22584	22593	60 %	20 %	20 %	0 %	153937253
24	NC_009698	TCAAT	2	10	23199	23208	40 %	40 %	0 %	20 %	153937253
25	NC_009698	AATAA	2	10	27870	27879	80 %	20 %	0 %	0 %	153936191
26	NC_009698	TATGT	2	10	28699	28708	20 %	60 %	20 %	0 %	153936228
27	NC_009698	TTATT	2	10	28817	28826	20 %	80 %	0 %	0 %	153935706
28	NC_009698	GGATT	2	10	29020	29029	20 %	40 %	40 %	0 %	153935706
29	NC_009698	ATTAT	2	10	29810	29819	40 %	60 %	0 %	0 %	153934746
30	NC_009698	ATTTT	2	10	30320	30329	20 %	80 %	0 %	0 %	153934746
31	NC_009698	TAATT	2	10	32495	32504	40 %	60 %	0 %	0 %	153937271
32	NC_009698	ATTTT	2	10	33324	33333	20 %	80 %	0 %	0 %	153934830
33	NC_009698	AATAA	2	10	35507	35516	80 %	20 %	0 %	0 %	153935787
34	NC_009698	AAAAT	2	10	37116	37125	80 %	20 %	0 %	0 %	153937691
35	NC_009698	CAATA	2	10	37207	37216	60 %	20 %	0 %	20 %	153937691
36	NC_009698	GATTT	2	10	38624	38633	20 %	60 %	20 %	0 %	153935315
37	NC_009698	GAATA	2	10	41244	41253	60 %	20 %	20 %	0 %	153935371
38	NC_009698	TTATT	2	10	41260	41269	20 %	80 %	0 %	0 %	153935371
39	NC_009698	GATTT	2	10	41994	42003	20 %	60 %	20 %	0 %	153937461
40	NC_009698	ACACC	2	10	42203	42212	40 %	0 %	0 %	60 %	153937461
41	NC_009698	AAAAG	2	10	42253	42262	80 %	0 %	20 %	0 %	153937461
42	NC_009698	ATAGA	2	10	43916	43925	60 %	20 %	20 %	0 %	153934545
43	NC_009698	GCAAT	2	10	44573	44582	40 %	20 %	20 %	20 %	153934545
44	NC_009698	AAAGA	2	10	44590	44599	80 %	0 %	20 %	0 %	153934545
45	NC_009698	AGTAT	2	10	45599	45608	40 %	40 %	20 %	0 %	153935856
46	NC_009698	TTAAT	2	10	46636	46645	40 %	60 %	0 %	0 %	153935425
47	NC_009698	ATTGT	2	10	47819	47828	20 %	60 %	20 %	0 %	153934499
48	NC_009698	ATAGA	2	10	47924	47933	60 %	20 %	20 %	0 %	153934499
49	NC_009698	AATAA	2	10	53765	53774	80 %	20 %	0 %	0 %	153937546
50	NC_009698	GAATA	2	10	54116	54125	60 %	20 %	20 %	0 %	153937546
51	NC_009698	GAAGA	2	10	68173	68182	60 %	0 %	40 %	0 %	153936847
52	NC_009698	AAATA	2	10	68791	68800	80 %	20 %	0 %	0 %	153936847
53	NC_009698	CAATC	2	10	75503	75512	40 %	20 %	0 %	40 %	153935897
54	NC_009698	TTATT	2	10	77780	77789	20 %	80 %	0 %	0 %	153936188
55	NC_009698	ATTTT	2	10	77797	77806	20 %	80 %	0 %	0 %	153936188
56	NC_009698	ATTTT	2	10	78150	78159	20 %	80 %	0 %	0 %	153936188
57	NC_009698	AAAAT	2	10	78184	78193	80 %	20 %	0 %	0 %	153936188
58	NC_009698	TATAA	2	10	81018	81027	60 %	40 %	0 %	0 %	153935270
59	NC_009698	TAAAT	2	10	82868	82877	60 %	40 %	0 %	0 %	153935866
60	NC_009698	TAAAT	2	10	83661	83670	60 %	40 %	0 %	0 %	153935087
61	NC_009698	TAGAA	2	10	83790	83799	60 %	20 %	20 %	0 %	153935087
62	NC_009698	GATAG	2	10	85398	85407	40 %	20 %	40 %	0 %	153935508
63	NC_009698	AGGAT	2	10	86099	86108	40 %	20 %	40 %	0 %	153936779
64	NC_009698	AATGG	2	10	86346	86355	40 %	20 %	40 %	0 %	153936779
65	NC_009698	AAAGA	2	10	87087	87096	80 %	0 %	20 %	0 %	153937146
66	NC_009698	ATTTA	2	10	93570	93579	40 %	60 %	0 %	0 %	153936920
67	NC_009698	TAATA	2	10	95025	95034	60 %	40 %	0 %	0 %	153934572
68	NC_009698	ATATT	2	10	97209	97218	40 %	60 %	0 %	0 %	153935117
69	NC_009698	AGAAA	2	10	99709	99718	80 %	0 %	20 %	0 %	153936823
70	NC_009698	AAAAC	2	10	99754	99763	80 %	0 %	0 %	20 %	153936823
71	NC_009698	AAATT	2	10	100724	100733	60 %	40 %	0 %	0 %	153937583
72	NC_009698	AAATG	2	10	100992	101001	60 %	20 %	20 %	0 %	153937583
73	NC_009698	GAAGT	2	10	102005	102014	40 %	20 %	40 %	0 %	153934841
74	NC_009698	AGATA	2	10	102627	102636	60 %	20 %	20 %	0 %	153934841
75	NC_009698	GAAAA	2	10	103570	103579	80 %	0 %	20 %	0 %	153935585
76	NC_009698	ACATT	2	10	106581	106590	40 %	40 %	0 %	20 %	153937636
77	NC_009698	AAAAT	2	10	109069	109078	80 %	20 %	0 %	0 %	153937786
78	NC_009698	ATTTA	2	10	110046	110055	40 %	60 %	0 %	0 %	153934714
79	NC_009698	ATTTT	2	10	114398	114407	20 %	80 %	0 %	0 %	153935993
80	NC_009698	ATACA	2	10	114915	114924	60 %	20 %	0 %	20 %	153935494
81	NC_009698	AATAT	2	10	115219	115228	60 %	40 %	0 %	0 %	153935494
82	NC_009698	AAGAA	2	10	116484	116493	80 %	0 %	20 %	0 %	153935349
83	NC_009698	TAATA	2	10	116772	116781	60 %	40 %	0 %	0 %	153935349
84	NC_009698	AGAGA	2	10	116806	116815	60 %	0 %	40 %	0 %	153935349
85	NC_009698	TAAAT	2	10	117396	117405	60 %	40 %	0 %	0 %	153935349
86	NC_009698	TAATT	2	10	119736	119745	40 %	60 %	0 %	0 %	153936562
87	NC_009698	ATTAT	2	10	120468	120477	40 %	60 %	0 %	0 %	153937324
88	NC_009698	GAAAA	2	10	121839	121848	80 %	0 %	20 %	0 %	153934659
89	NC_009698	GTAAC	2	10	121893	121902	40 %	20 %	20 %	20 %	153934659
90	NC_009698	AAAAG	2	10	122623	122632	80 %	0 %	20 %	0 %	153934659
91	NC_009698	TTAAA	2	10	122685	122694	60 %	40 %	0 %	0 %	153934659
92	NC_009698	GCTTA	2	10	123600	123609	20 %	40 %	20 %	20 %	153934659
93	NC_009698	AGAAA	2	10	123851	123860	80 %	0 %	20 %	0 %	153934659
94	NC_009698	TATAA	2	10	124736	124745	60 %	40 %	0 %	0 %	153935392
95	NC_009698	ATAAA	2	10	127175	127184	80 %	20 %	0 %	0 %	153937141
96	NC_009698	ATTAT	2	10	127305	127314	40 %	60 %	0 %	0 %	153937141
97	NC_009698	TAATT	2	10	127707	127716	40 %	60 %	0 %	0 %	153937141
98	NC_009698	TTATG	2	10	129369	129378	20 %	60 %	20 %	0 %	153937141
99	NC_009698	ACAAA	2	10	131941	131950	80 %	0 %	0 %	20 %	153937649
100	NC_009698	TAGAA	2	10	133151	133160	60 %	20 %	20 %	0 %	153934535
101	NC_009698	TAATA	2	10	134921	134930	60 %	40 %	0 %	0 %	153935988
102	NC_009698	ATGGA	2	10	135007	135016	40 %	20 %	40 %	0 %	153935988
103	NC_009698	TCCTA	2	10	136131	136140	20 %	40 %	0 %	40 %	153937177
104	NC_009698	ATTAT	2	10	136319	136328	40 %	60 %	0 %	0 %	153937177
105	NC_009698	TATAA	2	10	136350	136359	60 %	40 %	0 %	0 %	153937177
106	NC_009698	AGAAT	2	10	136575	136584	60 %	20 %	20 %	0 %	153937177
107	NC_009698	TATAA	2	10	138566	138575	60 %	40 %	0 %	0 %	153936541
108	NC_009698	TACAA	2	10	138705	138714	60 %	20 %	0 %	20 %	153936541
109	NC_009698	AATGT	2	10	139112	139121	40 %	40 %	20 %	0 %	153936541
110	NC_009698	AAAGA	2	10	139665	139674	80 %	0 %	20 %	0 %	153937436
111	NC_009698	TTATC	2	10	140412	140421	20 %	60 %	0 %	20 %	153937527
112	NC_009698	ATAAA	2	10	142451	142460	80 %	20 %	0 %	0 %	153934675
113	NC_009698	ATGCA	2	10	146961	146970	40 %	20 %	20 %	20 %	153935078
114	NC_009698	TTTGA	2	10	148444	148453	20 %	60 %	20 %	0 %	153937052
115	NC_009698	ATATA	2	10	148930	148939	60 %	40 %	0 %	0 %	153935877
116	NC_009698	ATTAT	2	10	150386	150395	40 %	60 %	0 %	0 %	153935877
117	NC_009698	AAAAG	2	10	151282	151291	80 %	0 %	20 %	0 %	153936778
118	NC_009698	ATGTA	2	10	152768	152777	40 %	40 %	20 %	0 %	153936618
119	NC_009698	TTAGC	2	10	153577	153586	20 %	40 %	20 %	20 %	153936618
120	NC_009698	AGAGG	2	10	154441	154450	40 %	0 %	60 %	0 %	153937566
121	NC_009698	AACAG	2	10	154758	154767	60 %	0 %	20 %	20 %	153937566
122	NC_009698	ATTTT	2	10	155086	155095	20 %	80 %	0 %	0 %	153937566
123	NC_009698	ATAAA	2	10	155376	155385	80 %	20 %	0 %	0 %	153934816
124	NC_009698	ATAAA	2	10	155886	155895	80 %	20 %	0 %	0 %	153934816
125	NC_009698	AATAA	2	10	156355	156364	80 %	20 %	0 %	0 %	153934816
126	NC_009698	AAATA	2	10	156547	156556	80 %	20 %	0 %	0 %	153935571
127	NC_009698	ATTTT	2	10	157203	157212	20 %	80 %	0 %	0 %	153936337
128	NC_009698	ATTTT	2	10	157830	157839	20 %	80 %	0 %	0 %	153936337
129	NC_009698	ATTTA	2	10	157964	157973	40 %	60 %	0 %	0 %	153936337
130	NC_009698	TTATG	2	10	159965	159974	20 %	60 %	20 %	0 %	153936395
131	NC_009698	AATAT	2	10	160084	160093	60 %	40 %	0 %	0 %	153936395
132	NC_009698	TATAA	2	10	161164	161173	60 %	40 %	0 %	0 %	153937112
133	NC_009698	TGGAA	2	10	161341	161350	40 %	20 %	40 %	0 %	153936129
134	NC_009698	AGAAA	2	10	161979	161988	80 %	0 %	20 %	0 %	153936916
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136	NC_009698	CAAAT	2	10	162771	162780	60 %	20 %	0 %	20 %	153937013
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