MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum A str. Hall chromosome

Total Repeats: 9248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009698	AATA	2	8	36	43	75 %	25 %	0 %	0 %	153935412
2	NC_009698	AAGT	2	8	65	72	50 %	25 %	25 %	0 %	153935412
3	NC_009698	TTAC	2	8	205	212	25 %	50 %	0 %	25 %	153935412
4	NC_009698	TTTA	2	8	438	445	25 %	75 %	0 %	0 %	153935412
5	NC_009698	ATGC	2	8	481	488	25 %	25 %	25 %	25 %	153935412
6	NC_009698	AATT	3	12	563	574	50 %	50 %	0 %	0 %	153935412
7	NC_009698	AAAT	2	8	606	613	75 %	25 %	0 %	0 %	153935412
8	NC_009698	AGAA	2	8	666	673	75 %	0 %	25 %	0 %	153935412
9	NC_009698	AACA	2	8	718	725	75 %	0 %	0 %	25 %	153935412
10	NC_009698	TAAA	2	8	1322	1329	75 %	25 %	0 %	0 %	153935412
11	NC_009698	AAAT	2	8	1869	1876	75 %	25 %	0 %	0 %	153937046
12	NC_009698	TTTA	2	8	2272	2279	25 %	75 %	0 %	0 %	153937046
13	NC_009698	AATT	2	8	2746	2753	50 %	50 %	0 %	0 %	153936289
14	NC_009698	TTCT	2	8	2773	2780	0 %	75 %	0 %	25 %	153936289
15	NC_009698	GAAA	2	8	3484	3491	75 %	0 %	25 %	0 %	153935303
16	NC_009698	AAGT	2	8	3797	3804	50 %	25 %	25 %	0 %	153935303
17	NC_009698	ATAA	2	8	3805	3812	75 %	25 %	0 %	0 %	153935303
18	NC_009698	GGAT	2	8	4241	4248	25 %	25 %	50 %	0 %	153937594
19	NC_009698	GCAT	2	8	4653	4660	25 %	25 %	25 %	25 %	153936801
20	NC_009698	TTTA	2	8	5088	5095	25 %	75 %	0 %	0 %	153936801
21	NC_009698	GATG	2	8	5150	5157	25 %	25 %	50 %	0 %	153936801
22	NC_009698	GACA	2	8	5409	5416	50 %	0 %	25 %	25 %	153936801
23	NC_009698	ATTT	2	8	5666	5673	25 %	75 %	0 %	0 %	153936801
24	NC_009698	AATG	2	8	5758	5765	50 %	25 %	25 %	0 %	153936801
25	NC_009698	GTAA	2	8	6375	6382	50 %	25 %	25 %	0 %	153935617
26	NC_009698	ATAA	2	8	6750	6757	75 %	25 %	0 %	0 %	153935617
27	NC_009698	ATAC	2	8	7894	7901	50 %	25 %	0 %	25 %	153935617
28	NC_009698	TTAA	2	8	14817	14824	50 %	50 %	0 %	0 %	153934873
29	NC_009698	TAAA	2	8	14848	14855	75 %	25 %	0 %	0 %	153934873
30	NC_009698	AGAA	2	8	14921	14928	75 %	0 %	25 %	0 %	153937121
31	NC_009698	TATG	2	8	15257	15264	25 %	50 %	25 %	0 %	153937121
32	NC_009698	TACT	2	8	15319	15326	25 %	50 %	0 %	25 %	153937121
33	NC_009698	GGAA	2	8	16065	16072	50 %	0 %	50 %	0 %	153936038
34	NC_009698	TTTA	2	8	16645	16652	25 %	75 %	0 %	0 %	153937022
35	NC_009698	TAAA	2	8	16854	16861	75 %	25 %	0 %	0 %	153937022
36	NC_009698	TTTA	2	8	17230	17237	25 %	75 %	0 %	0 %	153937022
37	NC_009698	GCTA	2	8	17303	17310	25 %	25 %	25 %	25 %	153937022
38	NC_009698	AGTA	2	8	17416	17423	50 %	25 %	25 %	0 %	153937022
39	NC_009698	AGCA	2	8	17641	17648	50 %	0 %	25 %	25 %	153937022
40	NC_009698	TAAA	2	8	18129	18136	75 %	25 %	0 %	0 %	153937022
41	NC_009698	ATTT	2	8	18528	18535	25 %	75 %	0 %	0 %	153937022
42	NC_009698	ATGG	2	8	18773	18780	25 %	25 %	50 %	0 %	153937022
43	NC_009698	ATTT	2	8	18843	18850	25 %	75 %	0 %	0 %	153937022
44	NC_009698	TACT	2	8	19450	19457	25 %	50 %	0 %	25 %	153937535
45	NC_009698	TACA	2	8	19486	19493	50 %	25 %	0 %	25 %	153937535
46	NC_009698	AAGA	2	8	19494	19501	75 %	0 %	25 %	0 %	153937535
47	NC_009698	AAAT	2	8	19540	19547	75 %	25 %	0 %	0 %	153937535
48	NC_009698	GGAT	2	8	19761	19768	25 %	25 %	50 %	0 %	153937535
49	NC_009698	ATTC	2	8	20034	20041	25 %	50 %	0 %	25 %	153937535
50	NC_009698	TCAA	2	8	20904	20911	50 %	25 %	0 %	25 %	153935047
51	NC_009698	AAAT	2	8	21070	21077	75 %	25 %	0 %	0 %	153935047
52	NC_009698	ATAA	2	8	21087	21094	75 %	25 %	0 %	0 %	153935047
53	NC_009698	TAGT	2	8	21235	21242	25 %	50 %	25 %	0 %	153935047
54	NC_009698	AAAG	2	8	21260	21267	75 %	0 %	25 %	0 %	153935047
55	NC_009698	TAAA	2	8	21499	21506	75 %	25 %	0 %	0 %	153935047
56	NC_009698	AAAT	2	8	21533	21540	75 %	25 %	0 %	0 %	153935047
57	NC_009698	ATTT	2	8	21645	21652	25 %	75 %	0 %	0 %	153934720
58	NC_009698	GTTA	2	8	21786	21793	25 %	50 %	25 %	0 %	153934720
59	NC_009698	CAAG	2	8	23440	23447	50 %	0 %	25 %	25 %	153937253
60	NC_009698	TGGC	2	8	26834	26841	0 %	25 %	50 %	25 %	153936471
61	NC_009698	GTAA	2	8	27585	27592	50 %	25 %	25 %	0 %	153936191
62	NC_009698	TAAA	2	8	27862	27869	75 %	25 %	0 %	0 %	153936191
63	NC_009698	TTGT	2	8	28094	28101	0 %	75 %	25 %	0 %	153936228
64	NC_009698	CTAT	2	8	29143	29150	25 %	50 %	0 %	25 %	153935706
65	NC_009698	CATT	2	8	29628	29635	25 %	50 %	0 %	25 %	153934746
66	NC_009698	TATT	2	8	29974	29981	25 %	75 %	0 %	0 %	153934746
67	NC_009698	TTGA	2	8	31272	31279	25 %	50 %	25 %	0 %	153937664
68	NC_009698	ATTT	3	12	31320	31331	25 %	75 %	0 %	0 %	153937664
69	NC_009698	ATCT	2	8	31821	31828	25 %	50 %	0 %	25 %	153937271
70	NC_009698	AAAT	2	8	32194	32201	75 %	25 %	0 %	0 %	153937271
71	NC_009698	AAAT	2	8	32215	32222	75 %	25 %	0 %	0 %	153937271
72	NC_009698	ATAA	2	8	34127	34134	75 %	25 %	0 %	0 %	153935787
73	NC_009698	GATA	2	8	34207	34214	50 %	25 %	25 %	0 %	153935787
74	NC_009698	ATGT	2	8	34478	34485	25 %	50 %	25 %	0 %	153935787
75	NC_009698	AGAA	2	8	35137	35144	75 %	0 %	25 %	0 %	153935787
76	NC_009698	TAAA	2	8	35187	35194	75 %	25 %	0 %	0 %	153935787
77	NC_009698	TAAA	2	8	35199	35206	75 %	25 %	0 %	0 %	153935787
78	NC_009698	TAAA	2	8	35235	35242	75 %	25 %	0 %	0 %	153935787
79	NC_009698	AATG	2	8	35440	35447	50 %	25 %	25 %	0 %	153935787
80	NC_009698	TGTA	2	8	35530	35537	25 %	50 %	25 %	0 %	153935787
81	NC_009698	AATA	2	8	35538	35545	75 %	25 %	0 %	0 %	153935787
82	NC_009698	AAGA	2	8	36789	36796	75 %	0 %	25 %	0 %	153937734
83	NC_009698	ATGA	2	8	37028	37035	50 %	25 %	25 %	0 %	153937691
84	NC_009698	ATGT	2	8	37244	37251	25 %	50 %	25 %	0 %	153937691
85	NC_009698	AATA	2	8	38352	38359	75 %	25 %	0 %	0 %	153935315
86	NC_009698	AAAG	2	8	39331	39338	75 %	0 %	25 %	0 %	153935315
87	NC_009698	AGAA	2	8	39909	39916	75 %	0 %	25 %	0 %	153934643
88	NC_009698	TGCA	2	8	40048	40055	25 %	25 %	25 %	25 %	153934643
89	NC_009698	AAAG	2	8	40066	40073	75 %	0 %	25 %	0 %	153934643
90	NC_009698	GAAG	2	8	40750	40757	50 %	0 %	50 %	0 %	153937733
91	NC_009698	AATT	2	8	40960	40967	50 %	50 %	0 %	0 %	153936595
92	NC_009698	TTAT	2	8	41369	41376	25 %	75 %	0 %	0 %	153935371
93	NC_009698	AAAT	2	8	41721	41728	75 %	25 %	0 %	0 %	153937461
94	NC_009698	AATT	2	8	42433	42440	50 %	50 %	0 %	0 %	153936479
95	NC_009698	TAAA	2	8	42769	42776	75 %	25 %	0 %	0 %	153936479
96	NC_009698	GATT	2	8	42794	42801	25 %	50 %	25 %	0 %	153936479
97	NC_009698	ATAA	2	8	43356	43363	75 %	25 %	0 %	0 %	153935104
98	NC_009698	AATT	2	8	43460	43467	50 %	50 %	0 %	0 %	153935104
99	NC_009698	ATTA	2	8	43992	43999	50 %	50 %	0 %	0 %	153934545
100	NC_009698	ATAA	2	8	44224	44231	75 %	25 %	0 %	0 %	153934545
101	NC_009698	ATAA	2	8	44356	44363	75 %	25 %	0 %	0 %	153934545
102	NC_009698	ATAA	2	8	44674	44681	75 %	25 %	0 %	0 %	153937588
103	NC_009698	TTAG	2	8	45332	45339	25 %	50 %	25 %	0 %	153935856
104	NC_009698	CTAT	2	8	45467	45474	25 %	50 %	0 %	25 %	153935856
105	NC_009698	TAAA	2	8	45513	45520	75 %	25 %	0 %	0 %	153935856
106	NC_009698	AAAT	2	8	45655	45662	75 %	25 %	0 %	0 %	153935856
107	NC_009698	TAAA	2	8	45910	45917	75 %	25 %	0 %	0 %	153935856
108	NC_009698	ATAA	2	8	46068	46075	75 %	25 %	0 %	0 %	153935425
109	NC_009698	TCTT	2	8	46206	46213	0 %	75 %	0 %	25 %	153935425
110	NC_009698	TTTA	2	8	46447	46454	25 %	75 %	0 %	0 %	153935425
111	NC_009698	GAAA	2	8	46544	46551	75 %	0 %	25 %	0 %	153935425
112	NC_009698	TTTA	2	8	47048	47055	25 %	75 %	0 %	0 %	153935425
113	NC_009698	ATTT	2	8	47311	47318	25 %	75 %	0 %	0 %	153934499
114	NC_009698	ATTT	2	8	47348	47355	25 %	75 %	0 %	0 %	153934499
115	NC_009698	AAAT	2	8	47375	47382	75 %	25 %	0 %	0 %	153934499
116	NC_009698	TTTA	2	8	47432	47439	25 %	75 %	0 %	0 %	153934499
117	NC_009698	GAAG	2	8	47871	47878	50 %	0 %	50 %	0 %	153934499
118	NC_009698	GATG	2	8	53724	53731	25 %	25 %	50 %	0 %	153937546
119	NC_009698	CAAA	2	8	60672	60679	75 %	0 %	0 %	25 %	153934922
120	NC_009698	AGAT	2	8	61441	61448	50 %	25 %	25 %	0 %	153934549
121	NC_009698	GAAA	2	8	62006	62013	75 %	0 %	25 %	0 %	153934549
122	NC_009698	TGAT	2	8	68197	68204	25 %	50 %	25 %	0 %	153936847
123	NC_009698	AAAG	2	8	68667	68674	75 %	0 %	25 %	0 %	153936847
124	NC_009698	GATA	2	8	68708	68715	50 %	25 %	25 %	0 %	153936847
125	NC_009698	CTAT	2	8	75731	75738	25 %	50 %	0 %	25 %	153935897
126	NC_009698	TCAT	2	8	75926	75933	25 %	50 %	0 %	25 %	153935897
127	NC_009698	CTAT	2	8	76199	76206	25 %	50 %	0 %	25 %	153935897
128	NC_009698	ATAA	2	8	76218	76225	75 %	25 %	0 %	0 %	153935897
129	NC_009698	CAAG	2	8	76477	76484	50 %	0 %	25 %	25 %	153937176
130	NC_009698	ATTT	2	8	78022	78029	25 %	75 %	0 %	0 %	153936188
131	NC_009698	TAGA	2	8	78098	78105	50 %	25 %	25 %	0 %	153936188
132	NC_009698	CTAG	3	12	78211	78222	25 %	25 %	25 %	25 %	153936188
133	NC_009698	TTTA	2	8	79928	79935	25 %	75 %	0 %	0 %	153935270
134	NC_009698	AGAA	2	8	80159	80166	75 %	0 %	25 %	0 %	153935270
135	NC_009698	TTTA	2	8	80653	80660	25 %	75 %	0 %	0 %	153935270
136	NC_009698	CAAT	2	8	80824	80831	50 %	25 %	0 %	25 %	153935270
137	NC_009698	AGGT	2	8	81313	81320	25 %	25 %	50 %	0 %	153937766
138	NC_009698	GGAA	2	8	81482	81489	50 %	0 %	50 %	0 %	153937766
139	NC_009698	TAGA	2	8	81534	81541	50 %	25 %	25 %	0 %	153937766
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