MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 chromosome

Total Repeats: 2572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009617	GTAATA	2	12	650	661	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150014893
2	NC_009617	GCCAGA	2	12	5838	5849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150014898
3	NC_009617	AATTAT	2	12	6173	6184	50 %	50 %	0 %	0 %	150014898
4	NC_009617	AAGAGC	2	12	7086	7097	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150014899
5	NC_009617	TTTAAA	2	12	7657	7668	50 %	50 %	0 %	0 %	150014899
6	NC_009617	CTGAAT	2	12	9081	9092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150014899
7	NC_009617	TTTAAA	2	12	16204	16215	50 %	50 %	0 %	0 %	150014902
8	NC_009617	GAAAAT	2	12	16580	16591	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150014902
9	NC_009617	TATAGA	2	12	19873	19884	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150014905
10	NC_009617	GATAGA	2	12	20689	20700	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150014905
11	NC_009617	TTAGAT	2	12	21664	21675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150014905
12	NC_009617	TGCAGC	2	12	22502	22513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150014906
13	NC_009617	AAGACA	2	12	25374	25385	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150014906
14	NC_009617	TTTCAG	2	12	25525	25536	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150014906
15	NC_009617	TGAAAT	2	12	31179	31190	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150014911
16	NC_009617	TCAAGG	2	12	32674	32685	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150014913
17	NC_009617	CATTAG	2	12	32714	32725	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150014913
18	NC_009617	TAGTTA	2	12	32939	32950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150014913
19	NC_009617	TGATAA	2	12	36480	36491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150014916
20	NC_009617	AACAGG	2	12	37501	37512	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150014917
21	NC_009617	TTTGGT	2	12	37964	37975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150014917
22	NC_009617	CAGCAA	2	12	40985	40996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	150014920
23	NC_009617	GTTATA	2	12	43128	43139	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150014921
24	NC_009617	GAAAAA	2	12	43335	43346	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150014921
25	NC_009617	TTAGCA	2	12	43887	43898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150014921
26	NC_009617	TAGAAG	2	12	44407	44418	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150014921
27	NC_009617	AAATAT	2	12	47577	47588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014924
28	NC_009617	AGGAAA	2	12	51968	51979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150014928
29	NC_009617	TCCAAA	2	12	53925	53936	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150014930
30	NC_009617	AGAGTA	2	12	54412	54423	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150014930
31	NC_009617	AAATAT	2	12	56536	56547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014932
32	NC_009617	TACAAG	2	12	56949	56960	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150014933
33	NC_009617	TTATTG	2	12	58310	58321	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150014935
34	NC_009617	TAGAAA	2	12	61017	61028	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150014938
35	NC_009617	AATGTG	2	12	62118	62129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014938
36	NC_009617	AATAGA	2	12	64735	64746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150014939
37	NC_009617	AGATTT	2	12	69006	69017	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150014945
38	NC_009617	ATTTTG	2	12	69407	69418	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150014945
39	NC_009617	AAAATA	2	12	70519	70530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	150014946
40	NC_009617	ATTAAA	2	12	74279	74290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014947
41	NC_009617	ACATTA	2	12	78515	78526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150014951
42	NC_009617	ATTGGT	2	12	82502	82513	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150014955
43	NC_009617	TTTAAA	2	12	87352	87363	50 %	50 %	0 %	0 %	150014960
44	NC_009617	TGAAGA	2	12	88774	88785	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150014960
45	NC_009617	ATTGAA	2	12	89021	89032	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150014960
46	NC_009617	ATATCA	2	12	90273	90284	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150014961
47	NC_009617	CAGATG	2	12	91899	91910	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150014962
48	NC_009617	AGCACC	2	12	92461	92472	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	150014962
49	NC_009617	TGAAGT	2	12	92482	92493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014962
50	NC_009617	AGGGAG	2	12	94237	94248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150014964
51	NC_009617	AAGGCA	2	12	95246	95257	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150014965
52	NC_009617	AAACCA	2	12	99139	99150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150014968
53	NC_009617	TCAATA	2	12	101394	101405	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150014969
54	NC_009617	ATCTTT	2	12	102857	102868	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150014970
55	NC_009617	AGCAGA	2	12	105483	105494	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	150014973
56	NC_009617	AGCAAA	2	12	111941	111952	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150014978
57	NC_009617	TTGAAG	2	12	121244	121255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014988
58	NC_009617	AAAGTG	2	12	121336	121347	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150014988
59	NC_009617	ATAGTT	2	12	125334	125345	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150014989
60	NC_009617	TAGATA	2	12	125754	125765	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150014989
61	NC_009617	ATTTTG	2	12	127334	127345	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150014990
62	NC_009617	TAACAT	2	12	127921	127932	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150014991
63	NC_009617	TATTTA	2	12	128568	128579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014992
64	NC_009617	TATTTA	2	12	128586	128597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150014992
65	NC_009617	GAAAAA	2	12	129977	129988	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150014992
66	NC_009617	GTAAAT	2	12	135283	135294	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150014997
67	NC_009617	GATATG	2	12	135562	135573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150014997
68	NC_009617	CAAAGA	2	12	136183	136194	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150014997
69	NC_009617	GGAATG	2	12	136297	136308	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	150014997
70	NC_009617	AATTAA	2	12	140647	140658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150014999
71	NC_009617	TGATGT	2	12	141370	141381	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	150015000
72	NC_009617	TTATTT	2	12	141407	141418	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150015000
73	NC_009617	ATTGGA	2	12	149158	149169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150015001
74	NC_009617	ATATTA	2	12	150567	150578	50 %	50 %	0 %	0 %	150015002
75	NC_009617	GCTTTC	2	12	151604	151615	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	150015003
76	NC_009617	GATTAT	2	12	152658	152669	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150015004
77	NC_009617	TTGATC	2	12	153170	153181	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150015005
78	NC_009617	AGGTTA	2	12	155503	155514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150015008
79	NC_009617	TATGAT	2	12	157488	157499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150015012
80	NC_009617	TAAAGA	2	12	159955	159966	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150015015
81	NC_009617	TTCAAT	2	12	163723	163734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	150015018
82	NC_009617	GGAATA	2	12	165096	165107	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150015019
83	NC_009617	ATATAA	2	12	166719	166730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150015020
84	NC_009617	AGGTTA	2	12	169484	169495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150015022
85	NC_009617	AAGATA	2	12	172253	172264	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150015025
86	NC_009617	ACTTCA	2	12	177026	177037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150015032
87	NC_009617	AGGATT	2	12	179154	179165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150015035
88	NC_009617	TCAAGA	2	12	180990	181001	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150015036
89	NC_009617	CAAGAA	2	12	188388	188399	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150015040
90	NC_009617	AGTTGA	2	12	188492	188503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150015040
91	NC_009617	AAACTG	2	12	188569	188580	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150015040
92	NC_009617	ATTCAA	2	12	189295	189306	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150015040
93	NC_009617	ATTGAA	2	12	195860	195871	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150015049
94	NC_009617	AATGCT	2	12	198874	198885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	150015057
95	NC_009617	GTTGGT	2	12	199566	199577	0 %	50 %	50 %	0 %	150015058
96	NC_009617	CGTTGG	2	12	200368	200379	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	150015060
97	NC_009617	ATTGCT	2	12	203432	203443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	150015065
98	NC_009617	AAGCAA	2	12	204859	204870	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150015068
99	NC_009617	TTAACA	2	12	210266	210277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	150015076
100	NC_009617	GCAATG	2	12	210539	210550	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	150015076
101	NC_009617	TGGAAA	2	12	211322	211333	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150015077
102	NC_009617	GAAAAA	2	12	216810	216821	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	150015084
103	NC_009617	TTAAAG	2	12	217081	217092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150015084
104	NC_009617	ATATTT	2	12	217725	217736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150015085
105	NC_009617	ATGGAA	2	12	226700	226711	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150015090
106	NC_009617	AAAAGT	2	12	229180	229191	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150015093
107	NC_009617	TAAATT	2	12	229678	229689	50 %	50 %	0 %	0 %	150015093
108	NC_009617	TCAACA	2	12	233113	233124	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	150015096
109	NC_009617	AGATGG	2	12	233694	233705	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	150015096
110	NC_009617	GTTCCA	2	12	237016	237027	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	150015100
111	NC_009617	TTTCAT	2	12	241191	241202	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	150015105
112	NC_009617	TAAAAT	2	12	241210	241221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150015105
113	NC_009617	AATGAC	2	12	242741	242752	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150015106
114	NC_009617	TGAATA	2	12	244741	244752	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	150015108
115	NC_009617	AGGTAT	2	12	246418	246429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150015109
116	NC_009617	ATATTA	2	12	247443	247454	50 %	50 %	0 %	0 %	150015109
117	NC_009617	GAAACA	2	12	248030	248041	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150015110
118	NC_009617	AAACGA	2	12	250304	250315	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	150015111
119	NC_009617	AATTGG	2	12	253007	253018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150015114
120	NC_009617	CTGCAG	2	12	253135	253146	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	150015114
121	NC_009617	GGGCTT	2	12	253147	253158	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	150015114
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232	NC_009617	AGACAT	2	12	486621	486632	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150015288
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234	NC_009617	TTTTTA	2	12	489000	489011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	150015290
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236	NC_009617	ATTGTT	2	12	490762	490773	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	150015292
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467	NC_009617	GATAAA	2	12	999124	999135	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150015706
468	NC_009617	ATGGAA	2	12	999311	999322	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150015706
469	NC_009617	ATATGG	2	12	1000978	1000989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150015708
470	NC_009617	ATCAGA	2	12	1005270	1005281	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150015712
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496	NC_009617	CATGAA	2	12	1066962	1066973	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	150015760
497	NC_009617	TTTAAA	2	12	1067509	1067520	50 %	50 %	0 %	0 %	150015761
498	NC_009617	ATCAGC	2	12	1069246	1069257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	150015761
499	NC_009617	TAGAAG	2	12	1071999	1072010	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150015764
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