MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 95135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009480	TCG	2	6	158205	158210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271283
3002	NC_009480	AGG	2	6	158211	158216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271283
3003	NC_009480	CGA	2	6	158247	158252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271283
3004	NC_009480	ACGC	2	8	158259	158266	25 %	0 %	25 %	50 %	148271283
3005	NC_009480	TGA	2	6	158439	158444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271283
3006	NC_009480	GA	3	6	158505	158510	50 %	0 %	50 %	0 %	148271283
3007	NC_009480	TG	3	6	159406	159411	0 %	50 %	50 %	0 %	148271284
3008	NC_009480	CCG	2	6	159469	159474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3009	NC_009480	CGT	2	6	159492	159497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3010	NC_009480	GC	3	6	159510	159515	0 %	0 %	50 %	50 %	148271284
3011	NC_009480	CGGTGA	2	12	159518	159529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148271284
3012	NC_009480	CCGGG	2	10	159545	159554	0 %	0 %	60 %	40 %	148271284
3013	NC_009480	GTC	2	6	159600	159605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3014	NC_009480	GCC	2	6	159609	159614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3015	NC_009480	CGC	2	6	159686	159691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3016	NC_009480	TCG	2	6	159703	159708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3017	NC_009480	CGG	2	6	159761	159766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271284
3018	NC_009480	CGA	2	6	159779	159784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3019	NC_009480	CGC	2	6	159791	159796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3020	NC_009480	GGTG	2	8	159818	159825	0 %	25 %	75 %	0 %	148271284
3021	NC_009480	CG	3	6	159828	159833	0 %	0 %	50 %	50 %	148271284
3022	NC_009480	GAA	2	6	159840	159845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271284
3023	NC_009480	GAGCTT	2	12	159927	159938	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148271284
3024	NC_009480	TCG	2	6	159970	159975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3025	NC_009480	CAG	2	6	160029	160034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3026	NC_009480	GCC	2	6	160086	160091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3027	NC_009480	CATGT	2	10	160092	160101	20 %	40 %	20 %	20 %	148271284
3028	NC_009480	GAAGCC	2	12	160107	160118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3029	NC_009480	GGAGAG	2	12	160125	160136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271284
3030	NC_009480	GGA	2	6	160173	160178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271284
3031	NC_009480	CGC	2	6	160184	160189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3032	NC_009480	GCC	2	6	160212	160217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3033	NC_009480	CGC	2	6	160256	160261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3034	NC_009480	CTC	2	6	160263	160268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271284
3035	NC_009480	TTG	2	6	160291	160296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148271284
3036	NC_009480	CGT	2	6	160340	160345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3037	NC_009480	CGA	2	6	160409	160414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3038	NC_009480	TCGGGG	2	12	160642	160653	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148271284
3039	NC_009480	TCG	2	6	160780	160785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3040	NC_009480	AGG	2	6	160787	160792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271284
3041	NC_009480	GTG	2	6	160804	160809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271284
3042	NC_009480	GTC	2	6	160847	160852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3043	NC_009480	GCC	2	6	161067	161072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3044	NC_009480	TTC	2	6	161104	161109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271284
3045	NC_009480	GCT	2	6	161168	161173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3046	NC_009480	GCC	2	6	161247	161252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3047	NC_009480	TGG	2	6	161291	161296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271284
3048	NC_009480	CGA	2	6	161333	161338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3049	NC_009480	GTCGC	2	10	161341	161350	0 %	20 %	40 %	40 %	148271284
3050	NC_009480	GCC	2	6	161385	161390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3051	NC_009480	GGT	2	6	161408	161413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271284
3052	NC_009480	GAT	2	6	161430	161435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271284
3053	NC_009480	CTG	2	6	161441	161446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3054	NC_009480	GTGAG	2	10	161447	161456	20 %	20 %	60 %	0 %	148271284
3055	NC_009480	CGC	2	6	161489	161494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3056	NC_009480	TGG	2	6	161510	161515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271284
3057	NC_009480	CGA	2	6	161525	161530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3058	NC_009480	GCC	2	6	161532	161537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271284
3059	NC_009480	CGT	2	6	161552	161557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271284
3060	NC_009480	CCGC	2	8	161777	161784	0 %	0 %	25 %	75 %	148271285
3061	NC_009480	GGA	2	6	161795	161800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271285
3062	NC_009480	GAT	2	6	161811	161816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271285
3063	NC_009480	CCG	2	6	161834	161839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271285
3064	NC_009480	GAT	2	6	161844	161849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271285
3065	NC_009480	ATG	2	6	161941	161946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271285
3066	NC_009480	GCA	2	6	161951	161956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271285
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3068	NC_009480	CGA	2	6	161975	161980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271285
3069	NC_009480	TCA	2	6	162014	162019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271285
3070	NC_009480	CG	3	6	162070	162075	0 %	0 %	50 %	50 %	148271285
3071	NC_009480	CGG	3	9	162098	162106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271285
3072	NC_009480	TGA	2	6	162143	162148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271285
3073	NC_009480	GGC	2	6	162192	162197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271285
3074	NC_009480	GCC	2	6	162309	162314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271285
3075	NC_009480	CGC	2	6	162395	162400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271285
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3078	NC_009480	CGA	2	6	162486	162491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271285
3079	NC_009480	GC	3	6	162530	162535	0 %	0 %	50 %	50 %	148271285
3080	NC_009480	CAGGAT	2	12	162537	162548	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148271285
3081	NC_009480	GGT	2	6	162576	162581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271285
3082	NC_009480	GAC	2	6	162615	162620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271285
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3084	NC_009480	GTG	2	6	162649	162654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271285
3085	NC_009480	GAA	2	6	162686	162691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271286
3086	NC_009480	CGG	2	6	162724	162729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271286
3087	NC_009480	CGCGGC	2	12	162743	162754	0 %	0 %	50 %	50 %	148271286
3088	NC_009480	TCA	2	6	162796	162801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271286
3089	NC_009480	CGA	2	6	162916	162921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271286
3090	NC_009480	GCGCA	2	10	162935	162944	20 %	0 %	40 %	40 %	148271286
3091	NC_009480	GCGG	2	8	162971	162978	0 %	0 %	75 %	25 %	148271286
3092	NC_009480	CG	3	6	163001	163006	0 %	0 %	50 %	50 %	148271286
3093	NC_009480	GAT	3	9	163019	163027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271286
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3097	NC_009480	GGA	2	6	163210	163215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271286
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3099	NC_009480	CGA	2	6	163345	163350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271286
3100	NC_009480	GAT	2	6	163469	163474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271286
3101	NC_009480	GAT	2	6	163478	163483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271286
3102	NC_009480	GAT	2	6	163502	163507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271286
3103	NC_009480	GCG	2	6	163515	163520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271286
3104	NC_009480	CTC	2	6	163540	163545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271286
3105	NC_009480	GTG	2	6	163575	163580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271286
3106	NC_009480	TGG	2	6	163600	163605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271286
3107	NC_009480	TCT	2	6	163718	163723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271287
3108	NC_009480	CGA	2	6	163733	163738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271287
3109	NC_009480	ACG	2	6	163772	163777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271287
3110	NC_009480	CGT	2	6	163805	163810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271287
3111	NC_009480	GACGTT	2	12	163827	163838	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148271287
3112	NC_009480	TGG	2	6	163859	163864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271287
3113	NC_009480	CGG	2	6	163923	163928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271287
3114	NC_009480	CGG	2	6	163937	163942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271287
3115	NC_009480	CCG	2	6	163954	163959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271287
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3117	NC_009480	CAG	2	6	163986	163991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271287
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3119	NC_009480	CCG	2	6	164086	164091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271287
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3230	NC_009480	GC	3	6	168101	168106	0 %	0 %	50 %	50 %	148271290
3231	NC_009480	CGA	2	6	168142	168147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271290
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3233	NC_009480	CG	4	8	168203	168210	0 %	0 %	50 %	50 %	148271290
3234	NC_009480	TAC	2	6	168240	168245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271290
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3236	NC_009480	CGGCG	2	10	168269	168278	0 %	0 %	60 %	40 %	148271290
3237	NC_009480	CAC	2	6	168311	168316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271290
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3483	NC_009480	GCG	2	6	175864	175869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271298
3484	NC_009480	GC	3	6	175879	175884	0 %	0 %	50 %	50 %	148271298
3485	NC_009480	GCCGAG	2	12	175898	175909	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148271298
3486	NC_009480	CGT	2	6	175945	175950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271298
3487	NC_009480	CGG	2	6	175974	175979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271298
3488	NC_009480	CGT	2	6	176011	176016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271298
3489	NC_009480	CGCC	2	8	176023	176030	0 %	0 %	25 %	75 %	148271298
3490	NC_009480	GTC	2	6	176063	176068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271298
3491	NC_009480	ACG	2	6	176103	176108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271298
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3495	NC_009480	AGCG	2	8	176202	176209	25 %	0 %	50 %	25 %	148271298
3496	NC_009480	GGC	2	6	176238	176243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271298
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3499	NC_009480	CGG	2	6	176346	176351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271298
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