MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 95135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_009480	TGC	2	6	117076	117081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271255
2003	NC_009480	TCC	2	6	117097	117102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271255
2004	NC_009480	ATC	2	6	117225	117230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271256
2005	NC_009480	GGA	2	6	117231	117236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271256
2006	NC_009480	CGG	2	6	117242	117247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271256
2007	NC_009480	CGG	2	6	117253	117258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271256
2008	NC_009480	GAG	2	6	117282	117287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271256
2009	NC_009480	GCGCG	2	10	117308	117317	0 %	0 %	60 %	40 %	148271256
2010	NC_009480	TAC	2	6	117348	117353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271256
2011	NC_009480	CGG	2	6	117356	117361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271256
2012	NC_009480	CTG	2	6	117387	117392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271256
2013	NC_009480	TCGC	2	8	117405	117412	0 %	25 %	25 %	50 %	148271256
2014	NC_009480	GC	3	6	117414	117419	0 %	0 %	50 %	50 %	148271256
2015	NC_009480	GTGCGG	2	12	117432	117443	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148271256
2016	NC_009480	GTC	2	6	117450	117455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271256
2017	NC_009480	ACG	2	6	117526	117531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271256
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2019	NC_009480	GCGCCG	2	12	117550	117561	0 %	0 %	50 %	50 %	148271256
2020	NC_009480	CGG	2	6	117566	117571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271256
2021	NC_009480	GGC	2	6	117579	117584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271256
2022	NC_009480	CTC	2	6	117590	117595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271256
2023	NC_009480	GGA	2	6	117611	117616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271256
2024	NC_009480	CAT	2	6	117626	117631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271256
2025	NC_009480	CTC	2	6	117636	117641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271256
2026	NC_009480	TAC	2	6	117647	117652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271256
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2029	NC_009480	CGC	2	6	117766	117771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271256
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2032	NC_009480	CG	3	6	117889	117894	0 %	0 %	50 %	50 %	148271256
2033	NC_009480	GC	3	6	117896	117901	0 %	0 %	50 %	50 %	148271256
2034	NC_009480	CGTC	2	8	117926	117933	0 %	25 %	25 %	50 %	148271256
2035	NC_009480	AGC	2	6	117953	117958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271256
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2037	NC_009480	CGGG	2	8	118115	118122	0 %	0 %	75 %	25 %	148271256
2038	NC_009480	CGG	2	6	118123	118128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271256
2039	NC_009480	CGA	2	6	118130	118135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271256
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2041	NC_009480	GCCC	2	8	118166	118173	0 %	0 %	25 %	75 %	148271256
2042	NC_009480	CCT	2	6	118193	118198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271256
2043	NC_009480	TCG	2	6	118216	118221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271256
2044	NC_009480	CGC	2	6	118241	118246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271256
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2046	NC_009480	ATC	2	6	118266	118271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271256
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2050	NC_009480	GAC	3	9	118347	118355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271256
2051	NC_009480	TCG	2	6	118375	118380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271256
2052	NC_009480	CCT	2	6	118511	118516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271256
2053	NC_009480	GCC	2	6	118536	118541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271256
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2055	NC_009480	GCC	2	6	118590	118595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271256
2056	NC_009480	TGG	2	6	118606	118611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271256
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2120	NC_009480	CGA	2	6	121248	121253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2121	NC_009480	CGA	4	12	121353	121364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2122	NC_009480	GCT	2	6	121385	121390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2123	NC_009480	CGT	2	6	121398	121403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2124	NC_009480	TGGC	2	8	121421	121428	0 %	25 %	50 %	25 %	148271260
2125	NC_009480	ACGTCG	2	12	121454	121465	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2126	NC_009480	TCCA	2	8	121486	121493	25 %	25 %	0 %	50 %	148271260
2127	NC_009480	CCA	2	6	121518	121523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271260
2128	NC_009480	GGC	3	9	121594	121602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271260
2129	NC_009480	ACGG	2	8	121659	121666	25 %	0 %	50 %	25 %	148271260
2130	NC_009480	GGA	2	6	121693	121698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271260
2131	NC_009480	GA	3	6	121697	121702	50 %	0 %	50 %	0 %	148271260
2132	NC_009480	CTG	2	6	121704	121709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2133	NC_009480	AGC	2	6	121751	121756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2134	NC_009480	CGAT	2	8	121758	121765	25 %	25 %	25 %	25 %	148271260
2135	NC_009480	CCT	2	6	121797	121802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271260
2136	NC_009480	CGAGT	2	10	121804	121813	20 %	20 %	40 %	20 %	148271260
2137	NC_009480	CTC	2	6	121927	121932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271260
2138	NC_009480	GGA	2	6	121941	121946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271260
2139	NC_009480	CGG	2	6	121953	121958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271260
2140	NC_009480	GGC	2	6	122011	122016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271260
2141	NC_009480	GAC	2	6	122017	122022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2142	NC_009480	GCCGT	2	10	122030	122039	0 %	20 %	40 %	40 %	148271260
2143	NC_009480	TCG	2	6	122102	122107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2144	NC_009480	CT	5	10	122242	122251	0 %	50 %	0 %	50 %	148271260
2145	NC_009480	GCC	2	6	122278	122283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271260
2146	NC_009480	TCGC	2	8	122285	122292	0 %	25 %	25 %	50 %	148271260
2147	NC_009480	CGA	2	6	122301	122306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2148	NC_009480	CGA	2	6	122385	122390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2149	NC_009480	TCG	2	6	122505	122510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2150	NC_009480	CGA	2	6	122523	122528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2151	NC_009480	TCG	2	6	122574	122579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2152	NC_009480	CTT	2	6	122607	122612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271260
2153	NC_009480	TCT	2	6	122643	122648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271260
2154	NC_009480	CG	3	6	122691	122696	0 %	0 %	50 %	50 %	148271260
2155	NC_009480	CGG	2	6	122721	122726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271260
2156	NC_009480	CGG	2	6	122749	122754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271260
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2158	NC_009480	ACG	2	6	122849	122854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271260
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2161	NC_009480	TCG	2	6	122925	122930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271260
2162	NC_009480	ATCG	2	8	123158	123165	25 %	25 %	25 %	25 %	148271261
2163	NC_009480	ACG	2	6	123275	123280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271261
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2165	NC_009480	GCCG	2	8	123293	123300	0 %	0 %	50 %	50 %	148271261
2166	NC_009480	GCG	2	6	123324	123329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271261
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2173	NC_009480	CGC	2	6	123629	123634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271261
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2184	NC_009480	CGA	2	6	123906	123911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271261
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2200	NC_009480	CGT	2	6	124678	124683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271261
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2220	NC_009480	GAC	2	6	125548	125553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271262
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2226	NC_009480	GGGAT	2	10	125672	125681	20 %	20 %	60 %	0 %	148271262
2227	NC_009480	GAAG	2	8	125715	125722	50 %	0 %	50 %	0 %	148271262
2228	NC_009480	GTA	2	6	125725	125730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271262
2229	NC_009480	GCA	2	6	125736	125741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271262
2230	NC_009480	TGC	2	6	125948	125953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271263
2231	NC_009480	CGG	2	6	125983	125988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271263
2232	NC_009480	GTCGC	2	10	126007	126016	0 %	20 %	40 %	40 %	148271263
2233	NC_009480	GAG	2	6	126069	126074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271263
2234	NC_009480	CAG	2	6	126078	126083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271263
2235	NC_009480	CGG	2	6	126092	126097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271263
2236	NC_009480	CTG	2	6	126114	126119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271263
2237	NC_009480	GTAGAG	2	12	126135	126146	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	148271263
2238	NC_009480	GCC	2	6	126174	126179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271263
2239	NC_009480	CGT	2	6	126191	126196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271263
2240	NC_009480	TCG	2	6	126208	126213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271263
2241	NC_009480	CCG	2	6	126226	126231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271263
2242	NC_009480	TGG	2	6	126233	126238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271263
2243	NC_009480	GAT	2	6	126255	126260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271263
2244	NC_009480	GAT	2	6	126321	126326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271263
2245	NC_009480	CGC	2	6	126327	126332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271263
2246	NC_009480	CG	3	6	126344	126349	0 %	0 %	50 %	50 %	148271263
2247	NC_009480	CGC	2	6	126363	126368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271263
2248	NC_009480	CGA	2	6	126554	126559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271263
2249	NC_009480	AGC	2	6	126568	126573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271263
2250	NC_009480	GGCGAT	2	12	126636	126647	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148271263
2251	NC_009480	GA	4	8	126690	126697	50 %	0 %	50 %	0 %	148271263
2252	NC_009480	GGC	2	6	126710	126715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271263
2253	NC_009480	CGA	2	6	126743	126748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271263
2254	NC_009480	AGG	2	6	126805	126810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271263
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2261	NC_009480	GTT	2	6	127229	127234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148271264
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2264	NC_009480	CTG	2	6	127253	127258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271264
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2267	NC_009480	GCT	3	9	127324	127332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271264
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2273	NC_009480	GTC	2	6	127586	127591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271264
2274	NC_009480	GTCGT	2	10	127602	127611	0 %	40 %	40 %	20 %	148271264
2275	NC_009480	TCT	2	6	127615	127620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271264
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2348	NC_009480	ACG	2	6	130452	130457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271266
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2350	NC_009480	CGA	2	6	130486	130491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271266
2351	NC_009480	GAGGTC	2	12	130601	130612	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148271266
2352	NC_009480	GTC	2	6	130614	130619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271266
2353	NC_009480	GCG	2	6	130638	130643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271266
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2357	NC_009480	TCA	2	6	130819	130824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271266
2358	NC_009480	CG	3	6	131092	131097	0 %	0 %	50 %	50 %	148271267
2359	NC_009480	AGG	2	6	131181	131186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271267
2360	NC_009480	AGC	2	6	131247	131252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271267
2361	NC_009480	GC	3	6	131295	131300	0 %	0 %	50 %	50 %	148271267
2362	NC_009480	CGG	2	6	131305	131310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271267
2363	NC_009480	CGC	2	6	131323	131328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271267
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2365	NC_009480	TCA	3	9	131349	131357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271267
2366	NC_009480	TCG	2	6	131403	131408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271267
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2374	NC_009480	GGT	2	6	131614	131619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271267
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2382	NC_009480	GCC	2	6	131834	131839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271267
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2482	NC_009480	GAT	2	6	136379	136384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271271
2483	NC_009480	AGG	2	6	136389	136394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271271
2484	NC_009480	CAG	2	6	136397	136402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271271
2485	NC_009480	GCC	2	6	136476	136481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271271
2486	NC_009480	AGG	2	6	136491	136496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271271
2487	NC_009480	AGGA	2	8	136524	136531	50 %	0 %	50 %	0 %	148271271
2488	NC_009480	CAG	2	6	136538	136543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271271
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2491	NC_009480	CGA	2	6	136567	136572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271271
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2493	NC_009480	CGAGT	2	10	136616	136625	20 %	20 %	40 %	20 %	148271271
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2496	NC_009480	GAGC	2	8	136802	136809	25 %	0 %	50 %	25 %	148271271
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2499	NC_009480	CGT	2	6	136913	136918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271271
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