MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 95135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009480	CCCGCG	2	12	35051	35062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271208
1002	NC_009480	GCA	2	6	35063	35068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271208
1003	NC_009480	TCC	2	6	35080	35085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271208
1004	NC_009480	CG	4	8	35091	35098	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
1005	NC_009480	GAC	2	6	35100	35105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271208
1006	NC_009480	CGT	2	6	35108	35113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271208
1007	NC_009480	CGC	2	6	35117	35122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271208
1008	NC_009480	CG	3	6	35139	35144	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
1009	NC_009480	GC	3	6	35157	35162	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
1010	NC_009480	CAT	2	6	35178	35183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271208
1011	NC_009480	GCA	2	6	35189	35194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271208
1012	NC_009480	GGA	2	6	35198	35203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271208
1013	NC_009480	CGC	2	6	35213	35218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271208
1014	NC_009480	CGA	2	6	35271	35276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271208
1015	NC_009480	CGG	2	6	35291	35296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271208
1016	NC_009480	GC	3	6	35310	35315	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
1017	NC_009480	CCA	2	6	35324	35329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271208
1018	NC_009480	CCA	2	6	35384	35389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271208
1019	NC_009480	GTC	2	6	35424	35429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271208
1020	NC_009480	TCG	2	6	35440	35445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271208
1021	NC_009480	GCCC	2	8	35488	35495	0 %	0 %	25 %	75 %	148271208
1022	NC_009480	GTGCC	2	10	35542	35551	0 %	20 %	40 %	40 %	148271208
1023	NC_009480	GGCGC	2	10	35558	35567	0 %	0 %	60 %	40 %	148271208
1024	NC_009480	AGT	2	6	35579	35584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271208
1025	NC_009480	GCACGA	2	12	35606	35617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271208
1026	NC_009480	CG	3	6	35619	35624	0 %	0 %	50 %	50 %	148271208
1027	NC_009480	GGCGG	2	10	35700	35709	0 %	0 %	80 %	20 %	148271208
1028	NC_009480	GTG	2	6	35841	35846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271209
1029	NC_009480	CCCA	2	8	35855	35862	25 %	0 %	0 %	75 %	148271209
1030	NC_009480	CGC	2	6	35897	35902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271209
1031	NC_009480	CGC	2	6	35907	35912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271209
1032	NC_009480	CG	3	6	35939	35944	0 %	0 %	50 %	50 %	148271209
1033	NC_009480	GAC	2	6	35975	35980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271209
1034	NC_009480	GAG	2	6	36036	36041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271209
1035	NC_009480	GTC	2	6	36042	36047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271209
1036	NC_009480	CGC	2	6	36060	36065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271209
1037	NC_009480	TAC	2	6	36066	36071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271209
1038	NC_009480	GAGGCC	2	12	36102	36113	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148271209
1039	NC_009480	GC	4	8	36126	36133	0 %	0 %	50 %	50 %	148271209
1040	NC_009480	CGG	2	6	36136	36141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271209
1041	NC_009480	CGC	2	6	36155	36160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271209
1042	NC_009480	CG	3	6	36170	36175	0 %	0 %	50 %	50 %	148271209
1043	NC_009480	GTG	2	6	36186	36191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271209
1044	NC_009480	CG	3	6	36196	36201	0 %	0 %	50 %	50 %	148271209
1045	NC_009480	CGG	2	6	36211	36216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271209
1046	NC_009480	CG	3	6	36219	36224	0 %	0 %	50 %	50 %	148271209
1047	NC_009480	GAG	2	6	36320	36325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271210
1048	NC_009480	GCCG	2	8	36348	36355	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
1049	NC_009480	GC	3	6	36379	36384	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
1050	NC_009480	GCT	2	6	36391	36396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271210
1051	NC_009480	GCT	2	6	36445	36450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271210
1052	NC_009480	GCCG	2	8	36463	36470	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
1053	NC_009480	CTC	2	6	36478	36483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271210
1054	NC_009480	CTC	2	6	36506	36511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271210
1055	NC_009480	GCC	3	9	36524	36532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271210
1056	NC_009480	CTC	2	6	36533	36538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271210
1057	NC_009480	TGG	2	6	36561	36566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271210
1058	NC_009480	GGC	3	9	36601	36609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271210
1059	NC_009480	GCCGT	2	10	36617	36626	0 %	20 %	40 %	40 %	148271210
1060	NC_009480	CGG	2	6	36637	36642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271210
1061	NC_009480	CGCGGC	2	12	36646	36657	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
1062	NC_009480	CGA	2	6	36673	36678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271210
1063	NC_009480	GCT	2	6	36745	36750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271210
1064	NC_009480	CTCG	2	8	36760	36767	0 %	25 %	25 %	50 %	148271210
1065	NC_009480	CG	3	6	36808	36813	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
1066	NC_009480	TCG	2	6	36819	36824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271210
1067	NC_009480	GTC	2	6	36827	36832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271210
1068	NC_009480	GC	3	6	36846	36851	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
1069	NC_009480	TCG	2	6	36855	36860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271210
1070	NC_009480	GCG	2	6	36861	36866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271210
1071	NC_009480	GCGCGG	2	12	36934	36945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271210
1072	NC_009480	CGT	2	6	37027	37032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271210
1073	NC_009480	CTCG	2	8	37039	37046	0 %	25 %	25 %	50 %	148271210
1074	NC_009480	GCC	2	6	37073	37078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271210
1075	NC_009480	CCG	2	6	37107	37112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271210
1076	NC_009480	GCGAC	2	10	37116	37125	20 %	0 %	40 %	40 %	148271210
1077	NC_009480	CGC	2	6	37180	37185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271210
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1081	NC_009480	CGC	2	6	37297	37302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271210
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1086	NC_009480	CGC	2	6	37429	37434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271210
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1091	NC_009480	CG	5	10	37517	37526	0 %	0 %	50 %	50 %	148271210
1092	NC_009480	CGG	2	6	37532	37537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271210
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1094	NC_009480	CCG	2	6	37616	37621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271211
1095	NC_009480	GCC	2	6	37648	37653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271211
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1103	NC_009480	CAGGT	2	10	37914	37923	20 %	20 %	40 %	20 %	148271211
1104	NC_009480	CAC	2	6	37932	37937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271211
1105	NC_009480	TCG	2	6	40169	40174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1106	NC_009480	GC	3	6	40176	40181	0 %	0 %	50 %	50 %	148271212
1107	NC_009480	CGA	2	6	40182	40187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1108	NC_009480	CGC	3	9	40191	40199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271212
1109	NC_009480	CGC	2	6	40203	40208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271212
1110	NC_009480	CGA	3	9	40254	40262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1111	NC_009480	GCC	2	6	40267	40272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271212
1112	NC_009480	CGC	3	9	40284	40292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271212
1113	NC_009480	CCG	2	6	40349	40354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271212
1114	NC_009480	ACG	2	6	40355	40360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1115	NC_009480	TGCAGG	2	12	40391	40402	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148271212
1116	NC_009480	CCG	2	6	40403	40408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271212
1117	NC_009480	CG	4	8	40407	40414	0 %	0 %	50 %	50 %	148271212
1118	NC_009480	ACC	2	6	40436	40441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271212
1119	NC_009480	TCG	2	6	40490	40495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1120	NC_009480	CGT	2	6	40512	40517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1121	NC_009480	GCTCGA	2	12	40518	40529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1122	NC_009480	GGC	2	6	40549	40554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271212
1123	NC_009480	CGCC	2	8	40562	40569	0 %	0 %	25 %	75 %	148271212
1124	NC_009480	AGC	2	6	40577	40582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1125	NC_009480	TGC	2	6	40646	40651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1126	NC_009480	TCG	2	6	40670	40675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1127	NC_009480	GCC	2	6	40677	40682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271212
1128	NC_009480	CCG	2	6	40715	40720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271212
1129	NC_009480	CGACGT	2	12	40728	40739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1130	NC_009480	CGC	2	6	40740	40745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271212
1131	NC_009480	GCC	2	6	40753	40758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271212
1132	NC_009480	CGT	2	6	40776	40781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271212
1133	NC_009480	CGA	2	6	40788	40793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271212
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1140	NC_009480	CG	3	6	40996	41001	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
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1144	NC_009480	CGAGAT	2	12	41057	41068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	148271213
1145	NC_009480	CGT	2	6	41069	41074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271213
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1147	NC_009480	CGGC	2	8	41108	41115	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
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1154	NC_009480	GC	3	6	41270	41275	0 %	0 %	50 %	50 %	148271213
1155	NC_009480	CGA	2	6	41311	41316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271213
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1162	NC_009480	CAC	2	6	41544	41549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271213
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1231	NC_009480	TC	3	6	49029	49034	0 %	50 %	0 %	50 %	148271217
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1237	NC_009480	CG	3	6	49482	49487	0 %	0 %	50 %	50 %	148271217
1238	NC_009480	GAGTGC	2	12	49508	49519	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148271217
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1240	NC_009480	TCA	2	6	49564	49569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271217
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1243	NC_009480	CCG	2	6	49827	49832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271218
1244	NC_009480	GGCCGC	2	12	49886	49897	0 %	0 %	50 %	50 %	148271218
1245	NC_009480	ATC	2	6	49938	49943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271218
1246	NC_009480	GCC	2	6	49950	49955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271218
1247	NC_009480	CTC	2	6	49967	49972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271218
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1249	NC_009480	CCA	2	6	50101	50106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271218
1250	NC_009480	AT	3	6	50385	50390	50 %	50 %	0 %	0 %	148271219
1251	NC_009480	GCG	2	6	50406	50411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271219
1252	NC_009480	GGC	2	6	50417	50422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271219
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1255	NC_009480	ACT	2	6	50575	50580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271219
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1368	NC_009480	GAC	3	9	62707	62715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271224
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1370	NC_009480	GGC	2	6	63440	63445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271225
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1372	NC_009480	TTG	3	9	63471	63479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148271225
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1495	NC_009480	AT	3	6	71127	71132	50 %	50 %	0 %	0 %	148271230
1496	NC_009480	GGT	2	6	71187	71192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271230
1497	NC_009480	GC	3	6	71210	71215	0 %	0 %	50 %	50 %	148271230
1498	NC_009480	GAA	2	6	71221	71226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271230
1499	NC_009480	TTAA	2	8	71266	71273	50 %	50 %	0 %	0 %	148271230
1500	NC_009480	TCA	2	6	71287	71292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271230

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