MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 95135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009480	CAG	2	6	245290	245295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271360
5502	NC_009480	CGA	2	6	245316	245321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271360
5503	NC_009480	CGA	2	6	245337	245342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271360
5504	NC_009480	GCG	2	6	245343	245348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271360
5505	NC_009480	GGGCG	2	10	245365	245374	0 %	0 %	80 %	20 %	148271360
5506	NC_009480	AGG	2	6	245385	245390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271360
5507	NC_009480	GGC	2	6	245492	245497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271361
5508	NC_009480	CGGGCT	2	12	245503	245514	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148271361
5509	NC_009480	CGA	3	9	245575	245583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271361
5510	NC_009480	GGC	2	6	245585	245590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271361
5511	NC_009480	GGC	2	6	245609	245614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271361
5512	NC_009480	CTC	2	6	245667	245672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271361
5513	NC_009480	GGT	2	6	245701	245706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271361
5514	NC_009480	AGCG	2	8	245714	245721	25 %	0 %	50 %	25 %	148271361
5515	NC_009480	TGG	2	6	245858	245863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271362
5516	NC_009480	ACG	2	6	245869	245874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271362
5517	NC_009480	TGC	2	6	245939	245944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271362
5518	NC_009480	CGT	2	6	245985	245990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271362
5519	NC_009480	GAG	2	6	245992	245997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271362
5520	NC_009480	CGTG	2	8	246009	246016	0 %	25 %	50 %	25 %	148271362
5521	NC_009480	GCCCG	2	10	246042	246051	0 %	0 %	40 %	60 %	148271362
5522	NC_009480	CGCC	2	8	246056	246063	0 %	0 %	25 %	75 %	148271362
5523	NC_009480	GCTGGG	2	12	246086	246097	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148271362
5524	NC_009480	TCG	2	6	246098	246103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271362
5525	NC_009480	TCG	2	6	246146	246151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271362
5526	NC_009480	CG	3	6	246173	246178	0 %	0 %	50 %	50 %	148271362
5527	NC_009480	CGT	3	9	246186	246194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271362
5528	NC_009480	CGC	2	6	246197	246202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271362
5529	NC_009480	TTC	2	6	246217	246222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271362
5530	NC_009480	TGG	2	6	246227	246232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271362
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5532	NC_009480	GC	4	8	246242	246249	0 %	0 %	50 %	50 %	148271362
5533	NC_009480	GAG	2	6	246253	246258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271362
5534	NC_009480	GCT	2	6	246264	246269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271362
5535	NC_009480	CG	3	6	246283	246288	0 %	0 %	50 %	50 %	148271362
5536	NC_009480	GC	3	6	246312	246317	0 %	0 %	50 %	50 %	148271362
5537	NC_009480	TCC	2	6	246341	246346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271362
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5540	NC_009480	ACG	2	6	246425	246430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271362
5541	NC_009480	CGA	2	6	246444	246449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271362
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5543	NC_009480	CGC	2	6	246497	246502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271362
5544	NC_009480	GCTC	2	8	246578	246585	0 %	25 %	25 %	50 %	148271362
5545	NC_009480	CTC	2	6	246616	246621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271362
5546	NC_009480	TCG	2	6	246629	246634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271362
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5548	NC_009480	CGA	2	6	246708	246713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271362
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5551	NC_009480	CCTC	2	8	246752	246759	0 %	25 %	0 %	75 %	148271362
5552	NC_009480	CGT	2	6	246780	246785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271362
5553	NC_009480	CCA	2	6	246786	246791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271362
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5555	NC_009480	CGC	2	6	246855	246860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271362
5556	NC_009480	TGC	2	6	246863	246868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271362
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5558	NC_009480	TGC	2	6	246962	246967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271362
5559	NC_009480	CGG	2	6	246989	246994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271362
5560	NC_009480	CCG	2	6	247004	247009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271362
5561	NC_009480	CCGC	2	8	247013	247020	0 %	0 %	25 %	75 %	148271362
5562	NC_009480	CCCG	2	8	247024	247031	0 %	0 %	25 %	75 %	148271362
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5570	NC_009480	ACG	2	6	247252	247257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271363
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5572	NC_009480	CGG	2	6	247313	247318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271363
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5600	NC_009480	GC	3	6	248206	248211	0 %	0 %	50 %	50 %	148271363
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5621	NC_009480	CTG	2	6	248894	248899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271364
5622	NC_009480	CGT	3	9	248923	248931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271364
5623	NC_009480	CGA	2	6	248937	248942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271364
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5858	NC_009480	GC	3	6	256568	256573	0 %	0 %	50 %	50 %	148271373
5859	NC_009480	GTC	2	6	256592	256597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271373
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5862	NC_009480	CGT	3	9	256702	256710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271373
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5971	NC_009480	GCC	2	6	259893	259898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271376
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5978	NC_009480	CGA	2	6	260132	260137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271376
5979	NC_009480	GCTCGC	2	12	260190	260201	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148271376
5980	NC_009480	GCT	3	9	260202	260210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271376
5981	NC_009480	TTC	2	6	260236	260241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271376
5982	NC_009480	TGC	3	9	260246	260254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271376
5983	NC_009480	GGT	2	6	260274	260279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271376
5984	NC_009480	CGC	2	6	260315	260320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271376
5985	NC_009480	ATC	2	6	260335	260340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271376
5986	NC_009480	TGA	3	9	260444	260452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271376
5987	NC_009480	GGC	2	6	260493	260498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271376
5988	NC_009480	ATC	2	6	260551	260556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271376
5989	NC_009480	CAC	2	6	260562	260567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271376
5990	NC_009480	TGA	2	6	260585	260590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271376
5991	NC_009480	TCT	2	6	260594	260599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271376
5992	NC_009480	CGA	2	6	260615	260620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271376
5993	NC_009480	CGA	2	6	260654	260659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271376
5994	NC_009480	CAG	2	6	260683	260688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271376
5995	NC_009480	CCGGC	2	10	260708	260717	0 %	0 %	40 %	60 %	148271376
5996	NC_009480	ATG	2	6	260734	260739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271376
5997	NC_009480	GCT	2	6	260766	260771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271376
5998	NC_009480	AAG	2	6	260785	260790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271376
5999	NC_009480	CGG	2	6	260822	260827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271377
6000	NC_009480	AGC	2	6	260872	260877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271377

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