MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 95135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009480	CTCGCG	2	12	227566	227577	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148271345
5002	NC_009480	CGG	2	6	227640	227645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271345
5003	NC_009480	ACC	2	6	227674	227679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271345
5004	NC_009480	CGC	2	6	227733	227738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271345
5005	NC_009480	GGC	2	6	227739	227744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271345
5006	NC_009480	CGT	2	6	227745	227750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
5007	NC_009480	GC	3	6	227764	227769	0 %	0 %	50 %	50 %	148271345
5008	NC_009480	GGC	2	6	227770	227775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271345
5009	NC_009480	CGGC	2	8	227816	227823	0 %	0 %	50 %	50 %	148271345
5010	NC_009480	ATC	2	6	227845	227850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271345
5011	NC_009480	CGA	2	6	227922	227927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271345
5012	NC_009480	TCG	2	6	227999	228004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
5013	NC_009480	CGA	3	9	228009	228017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271345
5014	NC_009480	CCT	2	6	228027	228032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271345
5015	NC_009480	CTCG	2	8	228039	228046	0 %	25 %	25 %	50 %	148271345
5016	NC_009480	CGG	2	6	228095	228100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271345
5017	NC_009480	CGG	2	6	228104	228109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271345
5018	NC_009480	TCG	2	6	228125	228130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
5019	NC_009480	CGC	2	6	228140	228145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271345
5020	NC_009480	CG	3	6	228154	228159	0 %	0 %	50 %	50 %	148271345
5021	NC_009480	TCG	2	6	228161	228166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
5022	NC_009480	CG	4	8	228177	228184	0 %	0 %	50 %	50 %	148271345
5023	NC_009480	CTG	2	6	228202	228207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
5024	NC_009480	GCC	2	6	228211	228216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271345
5025	NC_009480	TCG	2	6	228293	228298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
5026	NC_009480	GCGG	3	12	228329	228340	0 %	0 %	75 %	25 %	148271345
5027	NC_009480	GCT	2	6	228486	228491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271346
5028	NC_009480	TTC	2	6	228520	228525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271346
5029	NC_009480	TCG	2	6	228593	228598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271346
5030	NC_009480	TCG	2	6	228647	228652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271346
5031	NC_009480	TTC	2	6	228661	228666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271346
5032	NC_009480	CCG	2	6	228683	228688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271346
5033	NC_009480	CTG	2	6	228709	228714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271346
5034	NC_009480	CGC	2	6	228717	228722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271346
5035	NC_009480	GCC	2	6	228730	228735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271346
5036	NC_009480	CT	3	6	228744	228749	0 %	50 %	0 %	50 %	148271346
5037	NC_009480	CTC	2	6	228805	228810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271346
5038	NC_009480	CTCGC	2	10	228829	228838	0 %	20 %	20 %	60 %	148271346
5039	NC_009480	ATC	2	6	228886	228891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271346
5040	NC_009480	CCT	2	6	228909	228914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271346
5041	NC_009480	GTC	2	6	228916	228921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271346
5042	NC_009480	CAC	2	6	229954	229959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271347
5043	NC_009480	CGA	2	6	230017	230022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5044	NC_009480	CCG	2	6	230054	230059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271347
5045	NC_009480	CCG	3	9	230068	230076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271347
5046	NC_009480	CG	3	6	230109	230114	0 %	0 %	50 %	50 %	148271347
5047	NC_009480	GCT	3	9	230140	230148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5048	NC_009480	CTC	2	6	230240	230245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271347
5049	NC_009480	GC	3	6	230261	230266	0 %	0 %	50 %	50 %	148271347
5050	NC_009480	GCCCC	2	10	230308	230317	0 %	0 %	20 %	80 %	148271347
5051	NC_009480	GCA	2	6	230347	230352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5052	NC_009480	ACT	2	6	230394	230399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271347
5053	NC_009480	CTG	2	6	230408	230413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5054	NC_009480	TCGT	2	8	230441	230448	0 %	50 %	25 %	25 %	148271347
5055	NC_009480	CTG	2	6	230468	230473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5056	NC_009480	CGG	2	6	230500	230505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271347
5057	NC_009480	ACG	2	6	230562	230567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5058	NC_009480	CGT	2	6	230623	230628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5059	NC_009480	GCT	2	6	230629	230634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5060	NC_009480	GC	3	6	230645	230650	0 %	0 %	50 %	50 %	148271347
5061	NC_009480	ACT	2	6	230667	230672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271347
5062	NC_009480	GACC	2	8	230674	230681	25 %	0 %	25 %	50 %	148271347
5063	NC_009480	GCT	2	6	230686	230691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5064	NC_009480	CGG	2	6	230692	230697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271347
5065	NC_009480	ACG	2	6	230805	230810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5066	NC_009480	GCA	2	6	230815	230820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5067	NC_009480	GCC	2	6	230852	230857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271347
5068	NC_009480	GC	4	8	230860	230867	0 %	0 %	50 %	50 %	148271347
5069	NC_009480	GAG	2	6	230936	230941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271347
5070	NC_009480	GC	4	8	230944	230951	0 %	0 %	50 %	50 %	148271347
5071	NC_009480	TCC	2	6	230976	230981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271347
5072	NC_009480	TCG	2	6	230994	230999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5073	NC_009480	CCGA	2	8	231077	231084	25 %	0 %	25 %	50 %	148271347
5074	NC_009480	CTC	2	6	231119	231124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271347
5075	NC_009480	GC	3	6	231195	231200	0 %	0 %	50 %	50 %	148271347
5076	NC_009480	CGA	2	6	231223	231228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271347
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5079	NC_009480	TCG	2	6	231276	231281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
5080	NC_009480	GC	3	6	231291	231296	0 %	0 %	50 %	50 %	148271347
5081	NC_009480	CG	4	8	231349	231356	0 %	0 %	50 %	50 %	148271347
5082	NC_009480	GCT	2	6	231361	231366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271347
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5084	NC_009480	GGCACG	4	24	231398	231421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148271347
5085	NC_009480	GGCG	2	8	231442	231449	0 %	0 %	75 %	25 %	148271347
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5089	NC_009480	GC	3	6	231532	231537	0 %	0 %	50 %	50 %	148271348
5090	NC_009480	CGT	2	6	231546	231551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271348
5091	NC_009480	CGA	2	6	231555	231560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271348
5092	NC_009480	TGC	2	6	231566	231571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271348
5093	NC_009480	CG	4	8	231585	231592	0 %	0 %	50 %	50 %	148271348
5094	NC_009480	TCG	2	6	231596	231601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271348
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5102	NC_009480	GC	3	6	231745	231750	0 %	0 %	50 %	50 %	148271348
5103	NC_009480	CGC	3	9	231748	231756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271348
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5105	NC_009480	GCC	2	6	231799	231804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271348
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5109	NC_009480	CGA	2	6	231885	231890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271348
5110	NC_009480	CGG	2	6	231912	231917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271348
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5114	NC_009480	CG	3	6	231989	231994	0 %	0 %	50 %	50 %	148271348
5115	NC_009480	CG	3	6	232044	232049	0 %	0 %	50 %	50 %	148271348
5116	NC_009480	TCT	2	6	232097	232102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271348
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5119	NC_009480	GAC	2	6	232271	232276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271349
5120	NC_009480	TCG	2	6	232322	232327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271349
5121	NC_009480	ATC	2	6	232441	232446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271349
5122	NC_009480	GGCC	2	8	232461	232468	0 %	0 %	50 %	50 %	148271349
5123	NC_009480	GCA	2	6	232469	232474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271349
5124	NC_009480	GAG	2	6	232477	232482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271349
5125	NC_009480	TTC	2	6	232492	232497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271349
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5137	NC_009480	CCGCGG	2	12	232897	232908	0 %	0 %	50 %	50 %	148271350
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5152	NC_009480	GC	3	6	233337	233342	0 %	0 %	50 %	50 %	148271351
5153	NC_009480	CGG	2	6	233344	233349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271351
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5231	NC_009480	GAT	2	6	236341	236346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271352
5232	NC_009480	CCCGCA	2	12	236367	236378	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	148271352
5233	NC_009480	CTG	2	6	236405	236410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271352
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5237	NC_009480	TCGG	2	8	236486	236493	0 %	25 %	50 %	25 %	148271352
5238	NC_009480	TCG	2	6	236577	236582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271352
5239	NC_009480	TCA	2	6	236613	236618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271352
5240	NC_009480	CGC	2	6	236629	236634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271352
5241	NC_009480	GAT	2	6	236635	236640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271352
5242	NC_009480	CGCC	2	8	236647	236654	0 %	0 %	25 %	75 %	148271352
5243	NC_009480	CGA	2	6	236695	236700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271352
5244	NC_009480	TTC	2	6	236744	236749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271352
5245	NC_009480	CAC	2	6	236767	236772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271352
5246	NC_009480	CGC	2	6	236851	236856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271352
5247	NC_009480	GC	3	6	236896	236901	0 %	0 %	50 %	50 %	148271352
5248	NC_009480	TCA	2	6	236904	236909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271352
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5250	NC_009480	GCC	2	6	236943	236948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271352
5251	NC_009480	AGGG	2	8	236976	236983	25 %	0 %	75 %	0 %	148271352
5252	NC_009480	CCA	2	6	237059	237064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271353
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5254	NC_009480	CAC	2	6	237084	237089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271353
5255	NC_009480	CGT	2	6	237098	237103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271353
5256	NC_009480	CG	3	6	237111	237116	0 %	0 %	50 %	50 %	148271353
5257	NC_009480	CAC	2	6	237132	237137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271353
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5259	NC_009480	CG	3	6	237171	237176	0 %	0 %	50 %	50 %	148271353
5260	NC_009480	TCG	2	6	237217	237222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271353
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5267	NC_009480	CGGCG	2	10	237353	237362	0 %	0 %	60 %	40 %	148271353
5268	NC_009480	CG	3	6	237361	237366	0 %	0 %	50 %	50 %	148271353
5269	NC_009480	ACG	2	6	237418	237423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271353
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5271	NC_009480	ACC	2	6	237532	237537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271353
5272	NC_009480	CAG	2	6	237540	237545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271353
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5344	NC_009480	GAG	2	6	240060	240065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271356
5345	NC_009480	TGA	2	6	240082	240087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271356
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5348	NC_009480	TCG	2	6	240157	240162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271356
5349	NC_009480	CGGCCT	2	12	240170	240181	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148271356
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5351	NC_009480	GCA	3	9	240194	240202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271356
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5355	NC_009480	CCCG	2	8	240321	240328	0 %	0 %	25 %	75 %	148271356
5356	NC_009480	CGT	2	6	240338	240343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271356
5357	NC_009480	CGC	2	6	240398	240403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271356
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5359	NC_009480	GCC	2	6	240411	240416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271356
5360	NC_009480	CGC	2	6	240464	240469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271356
5361	NC_009480	GCGCC	2	10	240482	240491	0 %	0 %	40 %	60 %	148271356
5362	NC_009480	ACCA	2	8	240498	240505	50 %	0 %	0 %	50 %	148271356
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5364	NC_009480	GTC	2	6	240546	240551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271356
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5380	NC_009480	CGA	2	6	241186	241191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271357
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5386	NC_009480	GC	3	6	241554	241559	0 %	0 %	50 %	50 %	148271357
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5480	NC_009480	GC	3	6	244532	244537	0 %	0 %	50 %	50 %	148271360
5481	NC_009480	CGA	2	6	244548	244553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271360
5482	NC_009480	GCCG	2	8	244554	244561	0 %	0 %	50 %	50 %	148271360
5483	NC_009480	CCA	2	6	244627	244632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271360
5484	NC_009480	GCC	2	6	244667	244672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271360
5485	NC_009480	CGCGG	2	10	244710	244719	0 %	0 %	60 %	40 %	148271360
5486	NC_009480	CGT	2	6	244755	244760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271360
5487	NC_009480	CG	3	6	244834	244839	0 %	0 %	50 %	50 %	148271360
5488	NC_009480	CGC	2	6	244870	244875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271360
5489	NC_009480	CGGG	2	8	244917	244924	0 %	0 %	75 %	25 %	148271360
5490	NC_009480	GGCCG	2	10	244927	244936	0 %	0 %	60 %	40 %	148271360
5491	NC_009480	CGA	2	6	245052	245057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271360
5492	NC_009480	GC	4	8	245088	245095	0 %	0 %	50 %	50 %	148271360
5493	NC_009480	TGC	2	6	245105	245110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271360
5494	NC_009480	ATC	2	6	245138	245143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271360
5495	NC_009480	CGC	2	6	245155	245160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271360
5496	NC_009480	CGC	2	6	245163	245168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271360
5497	NC_009480	GCCG	2	8	245190	245197	0 %	0 %	50 %	50 %	148271360
5498	NC_009480	CGT	2	6	245208	245213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271360
5499	NC_009480	CGGC	2	8	245226	245233	0 %	0 %	50 %	50 %	148271360
5500	NC_009480	G	6	6	245235	245240	0 %	0 %	100 %	0 %	148271360

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