MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 95135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_009480	GC	4	8	210843	210850	0 %	0 %	50 %	50 %	148271328
4503	NC_009480	CGG	2	6	210872	210877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271328
4504	NC_009480	GC	3	6	210882	210887	0 %	0 %	50 %	50 %	148271328
4505	NC_009480	ACC	2	6	210898	210903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271328
4506	NC_009480	ACC	2	6	211338	211343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271329
4507	NC_009480	GGT	2	6	211349	211354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271329
4508	NC_009480	GC	3	6	211402	211407	0 %	0 %	50 %	50 %	148271329
4509	NC_009480	CCGT	2	8	211416	211423	0 %	25 %	25 %	50 %	148271329
4510	NC_009480	CGTC	2	8	211507	211514	0 %	25 %	25 %	50 %	148271329
4511	NC_009480	CGA	2	6	211550	211555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4512	NC_009480	AAG	2	6	211557	211562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271329
4513	NC_009480	CCGC	2	8	211582	211589	0 %	0 %	25 %	75 %	148271329
4514	NC_009480	TCA	2	6	211651	211656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271329
4515	NC_009480	ACG	2	6	211675	211680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4516	NC_009480	AGG	2	6	211699	211704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271329
4517	NC_009480	CAT	2	6	211736	211741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271329
4518	NC_009480	GCC	2	6	211758	211763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271329
4519	NC_009480	AGG	2	6	211789	211794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271329
4520	NC_009480	CGG	3	9	211820	211828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271329
4521	NC_009480	CTC	2	6	211845	211850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271329
4522	NC_009480	GAC	3	9	211863	211871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4523	NC_009480	CGG	2	6	211916	211921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271329
4524	NC_009480	CGA	2	6	211922	211927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4525	NC_009480	TCG	2	6	211942	211947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4526	NC_009480	ACC	2	6	211948	211953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271329
4527	NC_009480	AGC	2	6	212011	212016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4528	NC_009480	AGG	2	6	212023	212028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271329
4529	NC_009480	CCG	2	6	212029	212034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271329
4530	NC_009480	GAA	2	6	212042	212047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271329
4531	NC_009480	AGCTC	2	10	212050	212059	20 %	20 %	20 %	40 %	148271329
4532	NC_009480	CCA	2	6	212062	212067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271329
4533	NC_009480	CGGCC	2	10	212108	212117	0 %	0 %	40 %	60 %	148271329
4534	NC_009480	CGA	2	6	212123	212128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4535	NC_009480	GAG	2	6	212151	212156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271329
4536	NC_009480	ACGA	2	8	212160	212167	50 %	0 %	25 %	25 %	148271329
4537	NC_009480	GTCG	2	8	212222	212229	0 %	25 %	50 %	25 %	148271329
4538	NC_009480	TCG	2	6	212251	212256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4539	NC_009480	CGT	2	6	212279	212284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4540	NC_009480	GAA	2	6	212294	212299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271329
4541	NC_009480	GGC	2	6	212307	212312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271329
4542	NC_009480	CAA	2	6	212321	212326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271329
4543	NC_009480	GTC	2	6	212346	212351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4544	NC_009480	TCC	2	6	212404	212409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271329
4545	NC_009480	C	6	6	212422	212427	0 %	0 %	0 %	100 %	148271329
4546	NC_009480	CAT	2	6	212456	212461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271329
4547	NC_009480	CAC	2	6	212516	212521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271329
4548	NC_009480	CGA	2	6	212525	212530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4549	NC_009480	CCGT	2	8	212538	212545	0 %	25 %	25 %	50 %	148271329
4550	NC_009480	ACA	2	6	212587	212592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271329
4551	NC_009480	CTCG	2	8	212753	212760	0 %	25 %	25 %	50 %	148271329
4552	NC_009480	AGG	2	6	212764	212769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271329
4553	NC_009480	GAG	2	6	212796	212801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271329
4554	NC_009480	CGG	2	6	212806	212811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271329
4555	NC_009480	CGC	2	6	212823	212828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271329
4556	NC_009480	CAA	2	6	212846	212851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271329
4557	NC_009480	AGC	2	6	212857	212862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4558	NC_009480	TCGA	2	8	212871	212878	25 %	25 %	25 %	25 %	148271329
4559	NC_009480	TCA	2	6	212884	212889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271329
4560	NC_009480	ACG	2	6	212896	212901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
4561	NC_009480	CGA	3	9	212972	212980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
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4564	NC_009480	GAC	2	6	213111	213116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271329
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4569	NC_009480	CGGA	2	8	213252	213259	25 %	0 %	50 %	25 %	148271330
4570	NC_009480	CGG	2	6	213270	213275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271330
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4589	NC_009480	GC	3	6	214185	214190	0 %	0 %	50 %	50 %	148271331
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4603	NC_009480	AGA	2	6	214545	214550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271331
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4605	NC_009480	CAT	2	6	214603	214608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271331
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4608	NC_009480	CG	3	6	214837	214842	0 %	0 %	50 %	50 %	148271331
4609	NC_009480	CGCGA	2	10	214974	214983	20 %	0 %	40 %	40 %	148271332
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4613	NC_009480	CG	3	6	215189	215194	0 %	0 %	50 %	50 %	148271332
4614	NC_009480	CTCGAG	2	12	215199	215210	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	148271332
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4618	NC_009480	CGGCGA	2	12	215309	215320	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148271332
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4621	NC_009480	CCGA	2	8	215358	215365	25 %	0 %	25 %	50 %	148271332
4622	NC_009480	GCG	2	6	215382	215387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271332
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4985	NC_009480	GGT	2	6	227223	227228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271345
4986	NC_009480	CGTC	2	8	227240	227247	0 %	25 %	25 %	50 %	148271345
4987	NC_009480	CCTC	2	8	227270	227277	0 %	25 %	0 %	75 %	148271345
4988	NC_009480	CGC	2	6	227365	227370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271345
4989	NC_009480	TCG	3	9	227381	227389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
4990	NC_009480	GC	3	6	227390	227395	0 %	0 %	50 %	50 %	148271345
4991	NC_009480	TCG	2	6	227408	227413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
4992	NC_009480	GCT	3	9	227415	227423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
4993	NC_009480	CTC	2	6	227434	227439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271345
4994	NC_009480	GCT	2	6	227451	227456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
4995	NC_009480	CGT	2	6	227466	227471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
4996	NC_009480	CCG	2	6	227489	227494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271345
4997	NC_009480	GTC	2	6	227500	227505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271345
4998	NC_009480	CG	3	6	227531	227536	0 %	0 %	50 %	50 %	148271345
4999	NC_009480	CGC	2	6	227541	227546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271345
5000	NC_009480	GCG	2	6	227560	227565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271345

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