MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 plasmid pCM2

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009479	GC	3	6	600	605	0 %	0 %	50 %	50 %	148271111
2	NC_009479	GC	3	6	615	620	0 %	0 %	50 %	50 %	148271111
3	NC_009479	CG	3	6	1819	1824	0 %	0 %	50 %	50 %	148271112
4	NC_009479	GC	3	6	5614	5619	0 %	0 %	50 %	50 %	148271117
5	NC_009479	GC	4	8	6177	6184	0 %	0 %	50 %	50 %	148271118
6	NC_009479	GC	3	6	6414	6419	0 %	0 %	50 %	50 %	148271118
7	NC_009479	GC	3	6	6469	6474	0 %	0 %	50 %	50 %	148271118
8	NC_009479	CA	4	8	6825	6832	50 %	0 %	0 %	50 %	148271118
9	NC_009479	CG	3	6	7021	7026	0 %	0 %	50 %	50 %	148271118
10	NC_009479	CG	3	6	7383	7388	0 %	0 %	50 %	50 %	148271119
11	NC_009479	CG	3	6	7653	7658	0 %	0 %	50 %	50 %	148271119
12	NC_009479	GC	5	10	8151	8160	0 %	0 %	50 %	50 %	148271120
13	NC_009479	CG	3	6	8168	8173	0 %	0 %	50 %	50 %	148271120
14	NC_009479	GC	3	6	8324	8329	0 %	0 %	50 %	50 %	148271121
15	NC_009479	CG	3	6	8721	8726	0 %	0 %	50 %	50 %	148271122
16	NC_009479	CA	3	6	8804	8809	50 %	0 %	0 %	50 %	148271122
17	NC_009479	CG	3	6	8850	8855	0 %	0 %	50 %	50 %	148271122
18	NC_009479	GC	3	6	9612	9617	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
19	NC_009479	GC	3	6	9761	9766	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
20	NC_009479	CG	3	6	10366	10371	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
21	NC_009479	GC	4	8	10567	10574	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
22	NC_009479	GC	3	6	10670	10675	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
23	NC_009479	GC	3	6	11354	11359	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
24	NC_009479	CG	5	10	11685	11694	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
25	NC_009479	CG	3	6	12184	12189	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
26	NC_009479	GC	3	6	12249	12254	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
27	NC_009479	GC	3	6	13275	13280	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
28	NC_009479	GC	3	6	13419	13424	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
29	NC_009479	CG	3	6	13757	13762	0 %	0 %	50 %	50 %	148271123
30	NC_009479	GC	3	6	14998	15003	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
31	NC_009479	CG	5	10	15009	15018	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
32	NC_009479	CG	3	6	15288	15293	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
33	NC_009479	CG	3	6	15573	15578	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
34	NC_009479	GC	3	6	15868	15873	0 %	0 %	50 %	50 %	148271125
35	NC_009479	CG	4	8	16844	16851	0 %	0 %	50 %	50 %	148271126
36	NC_009479	TG	3	6	16867	16872	0 %	50 %	50 %	0 %	148271126
37	NC_009479	CG	4	8	17039	17046	0 %	0 %	50 %	50 %	148271126
38	NC_009479	GC	3	6	17089	17094	0 %	0 %	50 %	50 %	148271126
39	NC_009479	GA	3	6	17146	17151	50 %	0 %	50 %	0 %	148271126
40	NC_009479	GC	3	6	18001	18006	0 %	0 %	50 %	50 %	148271128
41	NC_009479	GC	3	6	18101	18106	0 %	0 %	50 %	50 %	148271128
42	NC_009479	CG	3	6	18298	18303	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
43	NC_009479	CG	3	6	18342	18347	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
44	NC_009479	CG	3	6	18353	18358	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
45	NC_009479	GC	3	6	18419	18424	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
46	NC_009479	GC	3	6	18587	18592	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
47	NC_009479	GA	3	6	18713	18718	50 %	0 %	50 %	0 %	148271127
48	NC_009479	GC	3	6	19047	19052	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
49	NC_009479	CG	3	6	19187	19192	0 %	0 %	50 %	50 %	148271127
50	NC_009479	TG	3	6	19797	19802	0 %	50 %	50 %	0 %	148271130
51	NC_009479	AG	3	6	20042	20047	50 %	0 %	50 %	0 %	148271130
52	NC_009479	TC	3	6	20167	20172	0 %	50 %	0 %	50 %	148271130
53	NC_009479	TG	3	6	22209	22214	0 %	50 %	50 %	0 %	148271131
54	NC_009479	CG	3	6	22232	22237	0 %	0 %	50 %	50 %	148271131
55	NC_009479	AT	3	6	23337	23342	50 %	50 %	0 %	0 %	148271132
56	NC_009479	CG	3	6	24170	24175	0 %	0 %	50 %	50 %	148271133
57	NC_009479	CG	3	6	24951	24956	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
58	NC_009479	CG	3	6	24961	24966	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
59	NC_009479	GC	3	6	25204	25209	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
60	NC_009479	TC	3	6	25243	25248	0 %	50 %	0 %	50 %	148271135
61	NC_009479	CG	3	6	25405	25410	0 %	0 %	50 %	50 %	148271135
62	NC_009479	CG	3	6	25957	25962	0 %	0 %	50 %	50 %	148271136
63	NC_009479	GC	3	6	26046	26051	0 %	0 %	50 %	50 %	148271136
64	NC_009479	GC	3	6	26532	26537	0 %	0 %	50 %	50 %	148271136
65	NC_009479	GA	3	6	27282	27287	50 %	0 %	50 %	0 %	148271137
66	NC_009479	GC	5	10	27680	27689	0 %	0 %	50 %	50 %	148271137
67	NC_009479	CG	3	6	28378	28383	0 %	0 %	50 %	50 %	148271138
68	NC_009479	CG	3	6	28404	28409	0 %	0 %	50 %	50 %	148271138
69	NC_009479	CG	3	6	28551	28556	0 %	0 %	50 %	50 %	148271138
70	NC_009479	GC	3	6	28729	28734	0 %	0 %	50 %	50 %	148271138
71	NC_009479	CG	3	6	29414	29419	0 %	0 %	50 %	50 %	148271139
72	NC_009479	CG	4	8	29477	29484	0 %	0 %	50 %	50 %	148271139
73	NC_009479	CG	3	6	29775	29780	0 %	0 %	50 %	50 %	148271140
74	NC_009479	GC	3	6	29788	29793	0 %	0 %	50 %	50 %	148271140
75	NC_009479	GC	3	6	30337	30342	0 %	0 %	50 %	50 %	148271140
76	NC_009479	CG	3	6	30404	30409	0 %	0 %	50 %	50 %	148271140
77	NC_009479	GC	3	6	32596	32601	0 %	0 %	50 %	50 %	148271141
78	NC_009479	GC	4	8	33497	33504	0 %	0 %	50 %	50 %	148271142
79	NC_009479	GC	3	6	35152	35157	0 %	0 %	50 %	50 %	148271143
80	NC_009479	GC	3	6	37015	37020	0 %	0 %	50 %	50 %	148271143
81	NC_009479	CG	3	6	39122	39127	0 %	0 %	50 %	50 %	148271144
82	NC_009479	GA	3	6	39633	39638	50 %	0 %	50 %	0 %	148271145
83	NC_009479	GC	3	6	40039	40044	0 %	0 %	50 %	50 %	148271145
84	NC_009479	GA	3	6	40622	40627	50 %	0 %	50 %	0 %	148271146
85	NC_009479	CG	3	6	40718	40723	0 %	0 %	50 %	50 %	148271146
86	NC_009479	CG	3	6	41715	41720	0 %	0 %	50 %	50 %	148271147
87	NC_009479	TA	3	6	42685	42690	50 %	50 %	0 %	0 %	148271148
88	NC_009479	CG	3	6	43415	43420	0 %	0 %	50 %	50 %	148271149
89	NC_009479	GC	3	6	44706	44711	0 %	0 %	50 %	50 %	148271150
90	NC_009479	CG	3	6	45582	45587	0 %	0 %	50 %	50 %	148271151
91	NC_009479	CT	3	6	45599	45604	0 %	50 %	0 %	50 %	148271151
92	NC_009479	TG	3	6	45618	45623	0 %	50 %	50 %	0 %	148271151
93	NC_009479	GC	3	6	46422	46427	0 %	0 %	50 %	50 %	148271152
94	NC_009479	GC	3	6	47125	47130	0 %	0 %	50 %	50 %	148271154
95	NC_009479	TG	3	6	48050	48055	0 %	50 %	50 %	0 %	148271155
96	NC_009479	CG	3	6	48196	48201	0 %	0 %	50 %	50 %	148271155
97	NC_009479	GC	3	6	50177	50182	0 %	0 %	50 %	50 %	148271157
98	NC_009479	CG	3	6	50637	50642	0 %	0 %	50 %	50 %	148271158
99	NC_009479	GC	3	6	50656	50661	0 %	0 %	50 %	50 %	148271158
100	NC_009479	GA	3	6	51866	51871	50 %	0 %	50 %	0 %	148271159
101	NC_009479	GC	3	6	52465	52470	0 %	0 %	50 %	50 %	148271160
102	NC_009479	TC	3	6	53821	53826	0 %	50 %	0 %	50 %	148271161
103	NC_009479	TC	3	6	55736	55741	0 %	50 %	0 %	50 %	148271162
104	NC_009479	GA	3	6	55924	55929	50 %	0 %	50 %	0 %	148271162
105	NC_009479	GC	3	6	61200	61205	0 %	0 %	50 %	50 %	148271163
106	NC_009479	GC	3	6	61255	61260	0 %	0 %	50 %	50 %	148271163
107	NC_009479	CG	3	6	61477	61482	0 %	0 %	50 %	50 %	148271164
108	NC_009479	CG	3	6	61521	61526	0 %	0 %	50 %	50 %	148271164
109	NC_009479	GA	3	6	61654	61659	50 %	0 %	50 %	0 %	148271164
110	NC_009479	GC	3	6	62275	62280	0 %	0 %	50 %	50 %	148271164
111	NC_009479	GC	3	6	63563	63568	0 %	0 %	50 %	50 %	148271165
112	NC_009479	GC	3	6	63960	63965	0 %	0 %	50 %	50 %	148271166
113	NC_009479	GC	3	6	66518	66523	0 %	0 %	50 %	50 %	148271170
114	NC_009479	GC	3	6	66601	66606	0 %	0 %	50 %	50 %	148271171
115	NC_009479	GC	3	6	67273	67278	0 %	0 %	50 %	50 %	148271172
116	NC_009479	CG	4	8	67460	67467	0 %	0 %	50 %	50 %	148271172
117	NC_009479	CG	3	6	67817	67822	0 %	0 %	50 %	50 %	148271173
118	NC_009479	CT	3	6	68283	68288	0 %	50 %	0 %	50 %	148271174
119	NC_009479	GC	3	6	69124	69129	0 %	0 %	50 %	50 %	148271175
120	NC_009479	GC	3	6	69399	69404	0 %	0 %	50 %	50 %	148271176
121	NC_009479	CT	3	6	69730	69735	0 %	50 %	0 %	50 %	148271177
122	NC_009479	TC	3	6	69892	69897	0 %	50 %	0 %	50 %	148271177

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.