MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum R plasmid pCGR1

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009343	TGC	2	6	2630	2635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297096
2	NC_009343	ACA	2	6	2665	2670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297096
3	NC_009343	CAG	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
4	NC_009343	GCA	3	9	2948	2956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
5	NC_009343	CAG	2	6	2982	2987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
6	NC_009343	CGG	2	6	3005	3010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297096
7	NC_009343	CAG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
8	NC_009343	GCA	2	6	3026	3031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
9	NC_009343	GCA	3	9	3059	3067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
10	NC_009343	CAG	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297096
11	NC_009343	TGG	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297096
12	NC_009343	GGC	2	6	3129	3134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297096
13	NC_009343	GCA	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297097
14	NC_009343	ACG	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297097
15	NC_009343	GCG	2	6	3814	3819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297097
16	NC_009343	ACA	3	9	3980	3988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297097
17	NC_009343	GTG	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297097
18	NC_009343	TGG	3	9	4070	4078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297097
19	NC_009343	TCA	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297098
20	NC_009343	TGG	2	6	5189	5194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297098
21	NC_009343	CGA	2	6	5268	5273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297098
22	NC_009343	GTC	2	6	5299	5304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297098
23	NC_009343	GTG	2	6	5337	5342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297098
24	NC_009343	GTG	3	9	10907	10915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297099
25	NC_009343	TCT	2	6	10954	10959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297099
26	NC_009343	CGC	2	6	11003	11008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297099
27	NC_009343	GGT	2	6	11126	11131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297099
28	NC_009343	GGT	2	6	13008	13013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297100
29	NC_009343	CAC	2	6	13019	13024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297100
30	NC_009343	GAT	2	6	13206	13211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297100
31	NC_009343	CGA	2	6	13250	13255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297100
32	NC_009343	GAA	2	6	13275	13280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297100
33	NC_009343	GTT	2	6	13293	13298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297100
34	NC_009343	CGA	2	6	13304	13309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297100
35	NC_009343	TTG	2	6	13675	13680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297101
36	NC_009343	ACC	2	6	13756	13761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297101
37	NC_009343	CGA	2	6	13796	13801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297101
38	NC_009343	AGG	2	6	13867	13872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145297101
39	NC_009343	ATC	2	6	13873	13878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297101
40	NC_009343	TGA	2	6	13890	13895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297101
41	NC_009343	CAC	2	6	15344	15349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297102
42	NC_009343	GAA	2	6	15421	15426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297103
43	NC_009343	AAG	2	6	15434	15439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297103
44	NC_009343	ATG	2	6	15572	15577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297103
45	NC_009343	CAT	2	6	15598	15603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297103
46	NC_009343	GTG	2	6	15606	15611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297103
47	NC_009343	TTG	2	6	16456	16461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297104
48	NC_009343	TGT	2	6	16501	16506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297104
49	NC_009343	GAC	2	6	16554	16559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297104
50	NC_009343	CAC	2	6	16610	16615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297104
51	NC_009343	TTG	2	6	16618	16623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297104
52	NC_009343	CCA	2	6	16923	16928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297104
53	NC_009343	TGA	2	6	17090	17095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297104
54	NC_009343	GCC	2	6	17225	17230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297104
55	NC_009343	GCG	2	6	17404	17409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297104
56	NC_009343	GCG	2	6	19131	19136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297105
57	NC_009343	TGG	2	6	19138	19143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297105
58	NC_009343	CTA	2	6	19156	19161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297105
59	NC_009343	CTT	2	6	19225	19230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297105
60	NC_009343	TCC	2	6	19371	19376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145297105
61	NC_009343	CAC	2	6	19418	19423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297105
62	NC_009343	CGG	2	6	19582	19587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297105
63	NC_009343	CGT	2	6	19775	19780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297106
64	NC_009343	CCA	2	6	19918	19923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297106
65	NC_009343	TGC	2	6	19959	19964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297106
66	NC_009343	TGA	2	6	20072	20077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297106
67	NC_009343	CGC	2	6	20195	20200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297107
68	NC_009343	TTC	2	6	20215	20220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297107
69	NC_009343	TCG	2	6	20266	20271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297107
70	NC_009343	TGC	2	6	20319	20324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297107
71	NC_009343	TCC	2	6	20550	20555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145297107
72	NC_009343	AGG	2	6	20603	20608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145297107
73	NC_009343	GTT	2	6	20661	20666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297107
74	NC_009343	GTA	2	6	20670	20675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297107
75	NC_009343	CGG	2	6	21161	21166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297108
76	NC_009343	AGC	2	6	21182	21187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297108
77	NC_009343	CGA	2	6	21225	21230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297108
78	NC_009343	CCT	2	6	21375	21380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145297108
79	NC_009343	AAC	2	6	21400	21405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297108
80	NC_009343	GAC	2	6	21433	21438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297108
81	NC_009343	CAC	2	6	21531	21536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297108
82	NC_009343	AGC	2	6	21546	21551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297108
83	NC_009343	CCG	2	6	21563	21568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297108
84	NC_009343	ACG	2	6	21602	21607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297108
85	NC_009343	ACC	2	6	21629	21634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297108
86	NC_009343	TAC	2	6	21902	21907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297109
87	NC_009343	TCG	2	6	21915	21920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297109
88	NC_009343	AGA	2	6	22044	22049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297109
89	NC_009343	GTT	2	6	22181	22186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297109
90	NC_009343	CCA	2	6	22284	22289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297109
91	NC_009343	CTG	2	6	22338	22343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145297109
92	NC_009343	CGG	2	6	22360	22365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297109
93	NC_009343	ACC	2	6	22403	22408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297109
94	NC_009343	CCA	2	6	22420	22425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297109
95	NC_009343	TCA	2	6	23436	23441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297110
96	NC_009343	CTT	2	6	23488	23493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297110
97	NC_009343	ACA	2	6	23592	23597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145297110
98	NC_009343	GAA	2	6	23621	23626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145297110
99	NC_009343	CGG	2	6	23644	23649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145297110
100	NC_009343	GCA	2	6	23675	23680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297110
101	NC_009343	GCA	2	6	23701	23706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297110
102	NC_009343	GAC	2	6	24329	24334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297111
103	NC_009343	ACC	3	9	24479	24487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297111
104	NC_009343	ACC	2	6	24872	24877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297112
105	NC_009343	CAT	2	6	24893	24898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297112
106	NC_009343	CGA	3	9	24983	24991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297112
107	NC_009343	ACG	2	6	25027	25032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297112
108	NC_009343	CTA	2	6	25079	25084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297112
109	NC_009343	TCT	2	6	26170	26175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145297113
110	NC_009343	TGG	3	9	26340	26348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
111	NC_009343	GCA	2	6	26398	26403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
112	NC_009343	GTG	3	9	26411	26419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
113	NC_009343	GCA	2	6	26467	26472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
114	NC_009343	GAT	2	6	26485	26490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145297113
115	NC_009343	CGC	2	6	26583	26588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145297113
116	NC_009343	TGG	2	6	26685	26690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
117	NC_009343	TTG	2	6	26789	26794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145297113
118	NC_009343	CAT	2	6	26847	26852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145297113
119	NC_009343	ACC	2	6	26861	26866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297113
120	NC_009343	GCA	4	12	26872	26883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
121	NC_009343	CCA	2	6	26969	26974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297113
122	NC_009343	GTG	2	6	27008	27013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145297113
123	NC_009343	GCA	2	6	27181	27186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
124	NC_009343	CAG	2	6	27187	27192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
125	NC_009343	CCA	2	6	27215	27220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145297113
126	NC_009343	GCA	2	6	27244	27249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145297113
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.