MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum R chromosome

Total Repeats: 1646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009342	GCCTG	2	10	735	744	0 %	20 %	40 %	40 %	145294043
2	NC_009342	ACCTG	2	10	1044	1053	20 %	20 %	20 %	40 %	145294043
3	NC_009342	CACCG	2	10	1281	1290	20 %	0 %	20 %	60 %	145294043
4	NC_009342	TCGCA	2	10	2501	2510	20 %	20 %	20 %	40 %	145294045
5	NC_009342	AACGC	2	10	3151	3160	40 %	0 %	20 %	40 %	145294045
6	NC_009342	CATCG	2	10	3733	3742	20 %	20 %	20 %	40 %	145294046
7	NC_009342	TGGTG	2	10	3911	3920	0 %	40 %	60 %	0 %	145294046
8	NC_009342	GCGCG	2	10	4948	4957	0 %	0 %	60 %	40 %	145294047
9	NC_009342	CGCAG	2	10	8693	8702	20 %	0 %	40 %	40 %	145294049
10	NC_009342	CGGAT	2	10	10130	10139	20 %	20 %	40 %	20 %	145294052
11	NC_009342	CGCAC	2	10	13584	13593	20 %	0 %	20 %	60 %	145294055
12	NC_009342	CGTGG	2	10	14489	14498	0 %	20 %	60 %	20 %	145294056
13	NC_009342	CGCAC	2	10	17745	17754	20 %	0 %	20 %	60 %	145294058
14	NC_009342	CCCAA	2	10	22031	22040	40 %	0 %	0 %	60 %	145294062
15	NC_009342	CATCG	2	10	22809	22818	20 %	20 %	20 %	40 %	145294062
16	NC_009342	TTGGG	2	10	23222	23231	0 %	40 %	60 %	0 %	145294063
17	NC_009342	TTCAC	2	10	24713	24722	20 %	40 %	0 %	40 %	145294065
18	NC_009342	GGTGC	2	10	26087	26096	0 %	20 %	60 %	20 %	145294067
19	NC_009342	CAGTG	2	10	28060	28069	20 %	20 %	40 %	20 %	145294068
20	NC_009342	GCTGC	2	10	32212	32221	0 %	20 %	40 %	40 %	145294070
21	NC_009342	TTTGC	2	10	33486	33495	0 %	60 %	20 %	20 %	145294071
22	NC_009342	GGTGT	2	10	34846	34855	0 %	40 %	60 %	0 %	145294072
23	NC_009342	ACCGC	2	10	39344	39353	20 %	0 %	20 %	60 %	145294076
24	NC_009342	TCCGC	2	10	39723	39732	0 %	20 %	20 %	60 %	145294076
25	NC_009342	CACGA	2	10	42320	42329	40 %	0 %	20 %	40 %	145294078
26	NC_009342	CGACG	2	10	49700	49709	20 %	0 %	40 %	40 %	145294084
27	NC_009342	CAGAT	2	10	51011	51020	40 %	20 %	20 %	20 %	145294085
28	NC_009342	GATTC	2	10	52875	52884	20 %	40 %	20 %	20 %	145294087
29	NC_009342	TTGCT	2	10	58990	58999	0 %	60 %	20 %	20 %	145294094
30	NC_009342	CATTT	2	10	62517	62526	20 %	60 %	0 %	20 %	145294097
31	NC_009342	GCGCA	2	10	62556	62565	20 %	0 %	40 %	40 %	145294097
32	NC_009342	CATCA	2	10	62952	62961	40 %	20 %	0 %	40 %	145294097
33	NC_009342	ACCAA	2	10	65835	65844	60 %	0 %	0 %	40 %	145294099
34	NC_009342	TGATC	2	10	65875	65884	20 %	40 %	20 %	20 %	145294099
35	NC_009342	CCATG	2	10	65900	65909	20 %	20 %	20 %	40 %	145294099
36	NC_009342	AGCGC	2	10	66780	66789	20 %	0 %	40 %	40 %	145294100
37	NC_009342	GGTTT	2	10	70715	70724	0 %	60 %	40 %	0 %	145294103
38	NC_009342	GATAA	2	10	74393	74402	60 %	20 %	20 %	0 %	145294106
39	NC_009342	GACAA	2	10	76075	76084	60 %	0 %	20 %	20 %	145294107
40	NC_009342	GAAGC	2	10	79362	79371	40 %	0 %	40 %	20 %	145294109
41	NC_009342	TCAAA	2	10	81844	81853	60 %	20 %	0 %	20 %	145294111
42	NC_009342	CGCAA	2	10	82335	82344	40 %	0 %	20 %	40 %	145294112
43	NC_009342	GTTCC	2	10	87295	87304	0 %	40 %	20 %	40 %	145294118
44	NC_009342	GTACT	2	10	89117	89126	20 %	40 %	20 %	20 %	145294120
45	NC_009342	GTTTA	2	10	92953	92962	20 %	60 %	20 %	0 %	145294124
46	NC_009342	AGCGC	2	10	96481	96490	20 %	0 %	40 %	40 %	145294126
47	NC_009342	GGCAT	2	10	100689	100698	20 %	20 %	40 %	20 %	145294130
48	NC_009342	CACAG	2	10	101361	101370	40 %	0 %	20 %	40 %	145294131
49	NC_009342	TGGAA	2	10	103744	103753	40 %	20 %	40 %	0 %	145294134
50	NC_009342	CCCAT	2	10	111348	111357	20 %	20 %	0 %	60 %	145294137
51	NC_009342	TCCAA	2	10	111630	111639	40 %	20 %	0 %	40 %	145294137
52	NC_009342	ATGTG	2	10	114920	114929	20 %	40 %	40 %	0 %	145294140
53	NC_009342	GTGTC	2	10	116011	116020	0 %	40 %	40 %	20 %	145294141
54	NC_009342	ACTTC	2	10	118387	118396	20 %	40 %	0 %	40 %	145294143
55	NC_009342	CACTC	2	10	120894	120903	20 %	20 %	0 %	60 %	145294147
56	NC_009342	TTCCA	2	10	121552	121561	20 %	40 %	0 %	40 %	145294147
57	NC_009342	TTCTG	2	10	122968	122977	0 %	60 %	20 %	20 %	145294149
58	NC_009342	CGATG	2	10	124793	124802	20 %	20 %	40 %	20 %	145294152
59	NC_009342	TTCAG	2	10	126469	126478	20 %	40 %	20 %	20 %	145294153
60	NC_009342	CCTGG	2	10	128543	128552	0 %	20 %	40 %	40 %	145294153
61	NC_009342	TGGAA	2	10	130867	130876	40 %	20 %	40 %	0 %	145294155
62	NC_009342	CGGAA	2	10	131423	131432	40 %	0 %	40 %	20 %	145294155
63	NC_009342	CCGTT	2	10	132120	132129	0 %	40 %	20 %	40 %	145294155
64	NC_009342	GCCGA	2	10	133773	133782	20 %	0 %	40 %	40 %	145294156
65	NC_009342	GAAGC	2	10	136161	136170	40 %	0 %	40 %	20 %	229232842
66	NC_009342	TTCGG	2	10	137330	137339	0 %	40 %	40 %	20 %	145294159
67	NC_009342	TAATC	2	10	138185	138194	40 %	40 %	0 %	20 %	145294159
68	NC_009342	AGCGA	2	10	139749	139758	40 %	0 %	40 %	20 %	145294162
69	NC_009342	ATGGG	2	10	139928	139937	20 %	20 %	60 %	0 %	145294162
70	NC_009342	CGGGG	2	10	140166	140175	0 %	0 %	80 %	20 %	145294162
71	NC_009342	ACATC	2	10	140499	140508	40 %	20 %	0 %	40 %	145294162
72	NC_009342	ATGCC	2	10	140882	140891	20 %	20 %	20 %	40 %	145294162
73	NC_009342	TCAGG	2	10	141293	141302	20 %	20 %	40 %	20 %	145294163
74	NC_009342	CCGTC	2	10	141778	141787	0 %	20 %	20 %	60 %	145294163
75	NC_009342	GGCCA	2	10	144737	144746	20 %	0 %	40 %	40 %	145294167
76	NC_009342	CCGCG	2	10	150077	150086	0 %	0 %	40 %	60 %	145294171
77	NC_009342	CAGGA	2	10	151075	151084	40 %	0 %	40 %	20 %	145294171
78	NC_009342	CGCAG	2	10	158650	158659	20 %	0 %	40 %	40 %	145294185
79	NC_009342	CGATG	2	10	158719	158728	20 %	20 %	40 %	20 %	145294185
80	NC_009342	GCCAG	2	10	159162	159171	20 %	0 %	40 %	40 %	145294186
81	NC_009342	CAGGT	2	10	160141	160150	20 %	20 %	40 %	20 %	145294186
82	NC_009342	TCCTC	2	10	161558	161567	0 %	40 %	0 %	60 %	145294187
83	NC_009342	GCCAC	2	10	161573	161582	20 %	0 %	20 %	60 %	145294187
84	NC_009342	TGATG	2	10	162008	162017	20 %	40 %	40 %	0 %	145294188
85	NC_009342	GGCTG	2	10	163439	163448	0 %	20 %	60 %	20 %	145294189
86	NC_009342	CCTGA	2	10	164243	164252	20 %	20 %	20 %	40 %	145294189
87	NC_009342	CGCTC	2	10	168023	168032	0 %	20 %	20 %	60 %	145294192
88	NC_009342	CAGCG	2	10	168847	168856	20 %	0 %	40 %	40 %	145294192
89	NC_009342	GTGTG	2	10	169185	169194	0 %	40 %	60 %	0 %	145294193
90	NC_009342	CTGGA	2	10	171054	171063	20 %	20 %	40 %	20 %	145294196
91	NC_009342	TGGAT	2	10	174649	174658	20 %	40 %	40 %	0 %	145294201
92	NC_009342	CGGGG	2	10	177647	177656	0 %	0 %	80 %	20 %	145294205
93	NC_009342	GACGG	2	10	178995	179004	20 %	0 %	60 %	20 %	145294206
94	NC_009342	GCCTC	2	10	179077	179086	0 %	20 %	20 %	60 %	145294206
95	NC_009342	CGTTG	2	10	183720	183729	0 %	40 %	40 %	20 %	145294211
96	NC_009342	GTCAG	2	10	184618	184627	20 %	20 %	40 %	20 %	145294212
97	NC_009342	TCTGT	2	10	186297	186306	0 %	60 %	20 %	20 %	145294213
98	NC_009342	ATGAA	2	10	188882	188891	60 %	20 %	20 %	0 %	145294215
99	NC_009342	TGCGC	2	10	188951	188960	0 %	20 %	40 %	40 %	145294215
100	NC_009342	GGCGG	2	10	189964	189973	0 %	0 %	80 %	20 %	145294216
101	NC_009342	GAGAG	2	10	190433	190442	40 %	0 %	60 %	0 %	145294216
102	NC_009342	TGCAT	2	10	191129	191138	20 %	40 %	20 %	20 %	145294216
103	NC_009342	GGAGT	2	10	198530	198539	20 %	20 %	60 %	0 %	145294223
104	NC_009342	CCCGG	2	10	199350	199359	0 %	0 %	40 %	60 %	145294224
105	NC_009342	CTTTT	2	10	200761	200770	0 %	80 %	0 %	20 %	145294226
106	NC_009342	GGCAA	2	10	205645	205654	40 %	0 %	40 %	20 %	145294231
107	NC_009342	CGCTG	2	10	206143	206152	0 %	20 %	40 %	40 %	145294232
108	NC_009342	GCCAC	2	10	207275	207284	20 %	0 %	20 %	60 %	145294232
109	NC_009342	CTGAG	2	10	207333	207342	20 %	20 %	40 %	20 %	145294232
110	NC_009342	AGGGA	2	10	211616	211625	40 %	0 %	60 %	0 %	145294237
111	NC_009342	TTCAC	2	10	213435	213444	20 %	40 %	0 %	40 %	145294239
112	NC_009342	CCCAA	2	10	214657	214666	40 %	0 %	0 %	60 %	145294241
113	NC_009342	GGGCG	2	10	216971	216980	0 %	0 %	80 %	20 %	145294243
114	NC_009342	CACCC	2	10	217572	217581	20 %	0 %	0 %	80 %	145294245
115	NC_009342	CTTTT	2	10	219991	220000	0 %	80 %	0 %	20 %	145294246
116	NC_009342	CCCGC	2	10	223644	223653	0 %	0 %	20 %	80 %	145294248
117	NC_009342	CTTTT	2	10	225542	225551	0 %	80 %	0 %	20 %	145294250
118	NC_009342	ATGAA	2	10	225611	225620	60 %	20 %	20 %	0 %	145294250
119	NC_009342	CTTGG	2	10	232938	232947	0 %	40 %	40 %	20 %	145294259
120	NC_009342	CAAAC	2	10	236193	236202	60 %	0 %	0 %	40 %	145294262
121	NC_009342	CCAGA	2	10	237570	237579	40 %	0 %	20 %	40 %	145294264
122	NC_009342	GGCGT	2	10	239218	239227	0 %	20 %	60 %	20 %	145294264
123	NC_009342	ATGGA	2	10	240085	240094	40 %	20 %	40 %	0 %	145294265
124	NC_009342	CAAAA	2	10	240151	240160	80 %	0 %	0 %	20 %	145294265
125	NC_009342	TGCTG	2	10	242042	242051	0 %	40 %	40 %	20 %	145294268
126	NC_009342	GCTGT	2	10	242808	242817	0 %	40 %	40 %	20 %	145294269
127	NC_009342	GCCCC	2	10	243071	243080	0 %	0 %	20 %	80 %	145294269
128	NC_009342	GTCGC	2	10	245694	245703	0 %	20 %	40 %	40 %	145294274
129	NC_009342	ACGAC	2	10	250033	250042	40 %	0 %	20 %	40 %	145294276
130	NC_009342	CAGGA	2	10	250892	250901	40 %	0 %	40 %	20 %	145294277
131	NC_009342	GTGAG	2	10	251160	251169	20 %	20 %	60 %	0 %	145294277
132	NC_009342	GCTCA	2	10	251449	251458	20 %	20 %	20 %	40 %	145294277
133	NC_009342	CCGGT	2	10	253756	253765	0 %	20 %	40 %	40 %	145294279
134	NC_009342	GCGCA	2	10	255066	255075	20 %	0 %	40 %	40 %	145294280
135	NC_009342	CGTGG	2	10	257432	257441	0 %	20 %	60 %	20 %	145294282
136	NC_009342	GTATT	2	10	261116	261125	20 %	60 %	20 %	0 %	145294285
137	NC_009342	GCACC	2	10	262408	262417	20 %	0 %	20 %	60 %	145294286
138	NC_009342	TGAAG	2	10	263905	263914	40 %	20 %	40 %	0 %	145294287
139	NC_009342	TGGAC	2	10	267139	267148	20 %	20 %	40 %	20 %	145294290
140	NC_009342	TTGAG	2	10	267720	267729	20 %	40 %	40 %	0 %	145294290
141	NC_009342	ACTGA	2	10	268215	268224	40 %	20 %	20 %	20 %	145294291
142	NC_009342	GGGTG	2	10	268770	268779	0 %	20 %	80 %	0 %	145294293
143	NC_009342	ACCGC	2	10	269912	269921	20 %	0 %	20 %	60 %	145294294
144	NC_009342	TGTGC	2	10	270144	270153	0 %	40 %	40 %	20 %	145294294
145	NC_009342	CACCT	2	10	270430	270439	20 %	20 %	0 %	60 %	145294294
146	NC_009342	CGCTG	2	10	274220	274229	0 %	20 %	40 %	40 %	145294297
147	NC_009342	GGTTC	2	10	280941	280950	0 %	40 %	40 %	20 %	145294304
148	NC_009342	CCTTT	2	10	282056	282065	0 %	60 %	0 %	40 %	145294306
149	NC_009342	GATGC	2	10	282442	282451	20 %	20 %	40 %	20 %	145294306
150	NC_009342	AAGCG	2	10	286211	286220	40 %	0 %	40 %	20 %	145294308
151	NC_009342	CACCG	2	10	288287	288296	20 %	0 %	20 %	60 %	145294308
152	NC_009342	CCGCA	2	10	290467	290476	20 %	0 %	20 %	60 %	145294309
153	NC_009342	TAGGT	2	10	293298	293307	20 %	40 %	40 %	0 %	145294311
154	NC_009342	TGAAG	2	10	295659	295668	40 %	20 %	40 %	0 %	145294311
155	NC_009342	TGCCG	2	10	295800	295809	0 %	20 %	40 %	40 %	145294311
156	NC_009342	GCTCC	2	10	297324	297333	0 %	20 %	20 %	60 %	145294312
157	NC_009342	CCTGG	2	10	298759	298768	0 %	20 %	40 %	40 %	145294313
158	NC_009342	ATCAA	2	10	299780	299789	60 %	20 %	0 %	20 %	145294314
159	NC_009342	GGCAG	2	10	300440	300449	20 %	0 %	60 %	20 %	145294314
160	NC_009342	CGCAG	2	10	309846	309855	20 %	0 %	40 %	40 %	145294327
161	NC_009342	CCCAA	2	10	311027	311036	40 %	0 %	0 %	60 %	145294328
162	NC_009342	ACTCC	2	10	312206	312215	20 %	20 %	0 %	60 %	145294330
163	NC_009342	GCGGA	2	10	314841	314850	20 %	0 %	60 %	20 %	145294332
164	NC_009342	CCAGT	2	10	315497	315506	20 %	20 %	20 %	40 %	145294332
165	NC_009342	CGGTG	2	10	315987	315996	0 %	20 %	60 %	20 %	145294333
166	NC_009342	GTGAT	2	10	316299	316308	20 %	40 %	40 %	0 %	145294334
167	NC_009342	ATTAA	2	10	317195	317204	60 %	40 %	0 %	0 %	145294335
168	NC_009342	CGCAG	2	10	318736	318745	20 %	0 %	40 %	40 %	145294337
169	NC_009342	AGCAA	2	10	319120	319129	60 %	0 %	20 %	20 %	145294337
170	NC_009342	CAGAT	2	10	319741	319750	40 %	20 %	20 %	20 %	145294338
171	NC_009342	GGTGC	2	10	323803	323812	0 %	20 %	60 %	20 %	145294343
172	NC_009342	TGATT	2	10	323880	323889	20 %	60 %	20 %	0 %	145294343
173	NC_009342	ATCGC	2	10	324787	324796	20 %	20 %	20 %	40 %	145294343
174	NC_009342	GAACT	2	10	332111	332120	40 %	20 %	20 %	20 %	145294350
175	NC_009342	GTTCC	2	10	332235	332244	0 %	40 %	20 %	40 %	145294350
176	NC_009342	GCCAT	2	10	335255	335264	20 %	20 %	20 %	40 %	145294353
177	NC_009342	GCGCA	2	10	336179	336188	20 %	0 %	40 %	40 %	145294354
178	NC_009342	ATCTA	2	10	337447	337456	40 %	40 %	0 %	20 %	145294354
179	NC_009342	CTGGC	2	10	337528	337537	0 %	20 %	40 %	40 %	145294355
180	NC_009342	TGACC	2	10	338783	338792	20 %	20 %	20 %	40 %	145294356
181	NC_009342	ACCTG	2	10	344506	344515	20 %	20 %	20 %	40 %	145294359
182	NC_009342	GAAGA	2	10	345164	345173	60 %	0 %	40 %	0 %	145294360
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184	NC_009342	GCTCC	2	10	348492	348501	0 %	20 %	20 %	60 %	145294363
185	NC_009342	CCGCT	2	10	348813	348822	0 %	20 %	20 %	60 %	145294363
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191	NC_009342	GGTGC	2	10	357730	357739	0 %	20 %	60 %	20 %	145294368
192	NC_009342	TTGAA	2	10	362036	362045	40 %	40 %	20 %	0 %	145294369
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198	NC_009342	TGTCG	2	10	371945	371954	0 %	40 %	40 %	20 %	145294376
199	NC_009342	TTCCA	2	10	377081	377090	20 %	40 %	0 %	40 %	145294384
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201	NC_009342	GCCAC	2	10	380825	380834	20 %	0 %	20 %	60 %	145294390
202	NC_009342	GTTGG	2	10	381056	381065	0 %	40 %	60 %	0 %	145294391
203	NC_009342	TGCCA	2	10	382047	382056	20 %	20 %	20 %	40 %	145294392
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209	NC_009342	CACTG	2	10	388424	388433	20 %	20 %	20 %	40 %	145294397
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214	NC_009342	CGGGG	2	10	398260	398269	0 %	0 %	80 %	20 %	145294408
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223	NC_009342	GCGTG	2	10	412426	412435	0 %	20 %	60 %	20 %	145294422
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233	NC_009342	CTGTG	2	10	428559	428568	0 %	40 %	40 %	20 %	145294440
234	NC_009342	GCCGT	2	10	429981	429990	0 %	20 %	40 %	40 %	145294440
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236	NC_009342	ACCAC	2	10	433008	433017	40 %	0 %	0 %	60 %	145294442
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238	NC_009342	GCTGA	2	10	438245	438254	20 %	20 %	40 %	20 %	145294447
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240	NC_009342	AAGGC	2	10	441798	441807	40 %	0 %	40 %	20 %	145294450
241	NC_009342	CGCGC	2	10	446472	446481	0 %	0 %	40 %	60 %	145294455
242	NC_009342	GCGCA	2	10	447362	447371	20 %	0 %	40 %	40 %	145294456
243	NC_009342	AATGG	2	10	448053	448062	40 %	20 %	40 %	0 %	145294456
244	NC_009342	TGACC	2	10	449585	449594	20 %	20 %	20 %	40 %	145294457
245	NC_009342	GCGGT	2	10	454242	454251	0 %	20 %	60 %	20 %	145294461
246	NC_009342	GATTT	2	10	458934	458943	20 %	60 %	20 %	0 %	145294465
247	NC_009342	CAAAC	2	10	459465	459474	60 %	0 %	0 %	40 %	145294466
248	NC_009342	TGTTT	2	10	464314	464323	0 %	80 %	20 %	0 %	145294469
249	NC_009342	CCAAA	2	10	465402	465411	60 %	0 %	0 %	40 %	145294471
250	NC_009342	AAAGG	2	10	470022	470031	60 %	0 %	40 %	0 %	145294477
251	NC_009342	CAGTT	2	10	470719	470728	20 %	40 %	20 %	20 %	145294478
252	NC_009342	GTTGC	2	10	470810	470819	0 %	40 %	40 %	20 %	145294478
253	NC_009342	TGAAA	2	10	473279	473288	60 %	20 %	20 %	0 %	145294479
254	NC_009342	CACTC	2	10	485125	485134	20 %	20 %	0 %	60 %	145294481
255	NC_009342	GTGCT	2	10	486731	486740	0 %	40 %	40 %	20 %	145294481
256	NC_009342	TTGAG	2	10	488942	488951	20 %	40 %	40 %	0 %	145294482
257	NC_009342	GTTTG	2	10	490145	490154	0 %	60 %	40 %	0 %	145294482
258	NC_009342	CATTG	2	10	493153	493162	20 %	40 %	20 %	20 %	145294485
259	NC_009342	GGATC	2	10	493795	493804	20 %	20 %	40 %	20 %	145294486
260	NC_009342	CGGCG	2	10	494942	494951	0 %	0 %	60 %	40 %	145294487
261	NC_009342	GGACA	2	10	497921	497930	40 %	0 %	40 %	20 %	145294489
262	NC_009342	TCTGT	2	10	498082	498091	0 %	60 %	20 %	20 %	145294489
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380	NC_009342	GGCAA	2	10	740652	740661	40 %	0 %	40 %	20 %	145294734
381	NC_009342	GCATG	2	10	744403	744412	20 %	20 %	40 %	20 %	145294738
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383	NC_009342	CGGTT	2	10	746557	746566	0 %	40 %	40 %	20 %	145294739
384	NC_009342	CTCGG	2	10	747397	747406	0 %	20 %	40 %	40 %	145294741
385	NC_009342	GCGAT	2	10	747444	747453	20 %	20 %	40 %	20 %	145294741
386	NC_009342	CCCAT	2	10	750071	750080	20 %	20 %	0 %	60 %	145294743
387	NC_009342	CAGCG	2	10	753679	753688	20 %	0 %	40 %	40 %	145294746
388	NC_009342	TTTGG	2	10	755612	755621	0 %	60 %	40 %	0 %	145294747
389	NC_009342	GGATT	2	10	756881	756890	20 %	40 %	40 %	0 %	145294747
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