MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium difficile 630

Total Repeats: 3158

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009089	TTAAA	2	10	2322	2331	60 %	40 %	0 %	0 %	400927236
2	NC_009089	TAAAA	2	10	2993	3002	80 %	20 %	0 %	0 %	126697569
3	NC_009089	TTGTT	2	10	4891	4900	0 %	80 %	20 %	0 %	126697571
4	NC_009089	AAGAA	2	10	5992	6001	80 %	0 %	20 %	0 %	126697571
5	NC_009089	ATATT	2	10	6204	6213	40 %	60 %	0 %	0 %	126697572
6	NC_009089	AGTGT	2	10	6667	6676	20 %	40 %	40 %	0 %	126697572
7	NC_009089	AAAGA	2	10	6903	6912	80 %	0 %	20 %	0 %	126697572
8	NC_009089	AGATA	2	10	7370	7379	60 %	20 %	20 %	0 %	126697572
9	NC_009089	TAAAT	2	10	7757	7766	60 %	40 %	0 %	0 %	126697572
10	NC_009089	AAGAA	2	10	8665	8674	80 %	0 %	20 %	0 %	126697573
11	NC_009089	GCTCT	2	10	8900	8909	0 %	40 %	20 %	40 %	126697574
12	NC_009089	ATTTA	2	10	9910	9919	40 %	60 %	0 %	0 %	126697577
13	NC_009089	CTAGA	2	10	10572	10581	40 %	20 %	20 %	20 %	126697577
14	NC_009089	ACAAA	2	10	16289	16298	80 %	0 %	0 %	20 %	126697578
15	NC_009089	CAAAA	2	10	17164	17173	80 %	0 %	0 %	20 %	126697579
16	NC_009089	AGATA	2	10	18191	18200	60 %	20 %	20 %	0 %	126697580
17	NC_009089	TTTGT	2	10	20589	20598	0 %	80 %	20 %	0 %	126697582
18	NC_009089	AATAA	2	10	20662	20671	80 %	20 %	0 %	0 %	126697582
19	NC_009089	TTAAT	2	10	21074	21083	40 %	60 %	0 %	0 %	126697582
20	NC_009089	AAATT	2	10	23581	23590	60 %	40 %	0 %	0 %	126697585
21	NC_009089	GAAAT	2	10	34161	34170	60 %	20 %	20 %	0 %	126697586
22	NC_009089	ATATT	2	10	35462	35471	40 %	60 %	0 %	0 %	126697587
23	NC_009089	GTTCA	2	10	35564	35573	20 %	40 %	20 %	20 %	126697587
24	NC_009089	AGTTA	2	10	35655	35664	40 %	40 %	20 %	0 %	126697587
25	NC_009089	ATATT	2	10	36933	36942	40 %	60 %	0 %	0 %	126697587
26	NC_009089	AGGTA	2	10	37923	37932	40 %	20 %	40 %	0 %	126697587
27	NC_009089	AATGG	2	10	38002	38011	40 %	20 %	40 %	0 %	126697587
28	NC_009089	TAATT	2	10	38296	38305	40 %	60 %	0 %	0 %	126697587
29	NC_009089	TACAT	2	10	39694	39703	40 %	40 %	0 %	20 %	400927238
30	NC_009089	AAAAT	2	10	39774	39783	80 %	20 %	0 %	0 %	400927238
31	NC_009089	TTGAA	2	10	39807	39816	40 %	40 %	20 %	0 %	400927238
32	NC_009089	TGGAA	2	10	40276	40285	40 %	20 %	40 %	0 %	400927238
33	NC_009089	AAGGT	2	10	41326	41335	40 %	20 %	40 %	0 %	126697589
34	NC_009089	AGATG	2	10	43762	43771	40 %	20 %	40 %	0 %	126697592
35	NC_009089	TTTTG	2	10	48675	48684	0 %	80 %	20 %	0 %	126697595
36	NC_009089	TAGAT	2	10	50006	50015	40 %	40 %	20 %	0 %	126697596
37	NC_009089	GAGTG	2	10	54254	54263	20 %	20 %	60 %	0 %	126697599
38	NC_009089	ATGTT	2	10	56619	56628	20 %	60 %	20 %	0 %	126697600
39	NC_009089	CAAAT	2	10	57929	57938	60 %	20 %	0 %	20 %	126697601
40	NC_009089	AAATA	2	10	60454	60463	80 %	20 %	0 %	0 %	126697604
41	NC_009089	TAAAA	2	10	61366	61375	80 %	20 %	0 %	0 %	126697604
42	NC_009089	ATTCA	2	10	62579	62588	40 %	40 %	0 %	20 %	126697605
43	NC_009089	GAAGA	2	10	63895	63904	60 %	0 %	40 %	0 %	126697606
44	NC_009089	AGAAA	2	10	65066	65075	80 %	0 %	20 %	0 %	126697606
45	NC_009089	AAAAG	2	10	65960	65969	80 %	0 %	20 %	0 %	126697606
46	NC_009089	CAAAT	2	10	66292	66301	60 %	20 %	0 %	20 %	126697606
47	NC_009089	ACTCT	2	10	66648	66657	20 %	40 %	0 %	40 %	126697606
48	NC_009089	AATTT	2	10	66760	66769	40 %	60 %	0 %	0 %	126697607
49	NC_009089	GAATA	2	10	68960	68969	60 %	20 %	20 %	0 %	126697609
50	NC_009089	AAGAA	2	10	69702	69711	80 %	0 %	20 %	0 %	126697611
51	NC_009089	ACAGA	2	10	73569	73578	60 %	0 %	20 %	20 %	126697615
52	NC_009089	GTTAG	2	10	74978	74987	20 %	40 %	40 %	0 %	126697615
53	NC_009089	CCATA	2	10	75888	75897	40 %	20 %	0 %	40 %	126697616
54	NC_009089	TGTGG	2	10	76405	76414	0 %	40 %	60 %	0 %	126697616
55	NC_009089	AGAAA	2	10	77758	77767	80 %	0 %	20 %	0 %	126697617
56	NC_009089	AAATT	2	10	77966	77975	60 %	40 %	0 %	0 %	126697617
57	NC_009089	AATAG	2	10	78443	78452	60 %	20 %	20 %	0 %	126697617
58	NC_009089	AGCTA	2	10	80956	80965	40 %	20 %	20 %	20 %	126697620
59	NC_009089	GAAAA	2	10	85749	85758	80 %	0 %	20 %	0 %	126697627
60	NC_009089	AAAAT	2	10	86652	86661	80 %	20 %	0 %	0 %	126697629
61	NC_009089	TTCTA	2	10	89580	89589	20 %	60 %	0 %	20 %	126697632
62	NC_009089	AATTA	2	10	89688	89697	60 %	40 %	0 %	0 %	126697632
63	NC_009089	AGTAG	2	10	92038	92047	40 %	20 %	40 %	0 %	126697633
64	NC_009089	TAATA	2	10	93741	93750	60 %	40 %	0 %	0 %	126697633
65	NC_009089	GGTAT	2	10	95457	95466	20 %	40 %	40 %	0 %	126697634
66	NC_009089	AGGGA	2	10	103222	103231	40 %	0 %	60 %	0 %	126697640
67	NC_009089	TGAGA	2	10	105022	105031	40 %	20 %	40 %	0 %	126697643
68	NC_009089	AATTA	2	10	105631	105640	60 %	40 %	0 %	0 %	126697644
69	NC_009089	AAAGA	2	10	106153	106162	80 %	0 %	20 %	0 %	126697646
70	NC_009089	TAATG	2	10	108402	108411	40 %	40 %	20 %	0 %	400927242
71	NC_009089	AGAAA	2	10	109672	109681	80 %	0 %	20 %	0 %	126697654
72	NC_009089	CCAAA	2	10	110125	110134	60 %	0 %	0 %	40 %	126697655
73	NC_009089	TAAGA	2	10	110187	110196	60 %	20 %	20 %	0 %	126697655
74	NC_009089	TAAAA	2	10	113204	113213	80 %	20 %	0 %	0 %	126697660
75	NC_009089	TTATG	2	10	118174	118183	20 %	60 %	20 %	0 %	126697670
76	NC_009089	TAGTA	2	10	118314	118323	40 %	40 %	20 %	0 %	126697670
77	NC_009089	ATATC	2	10	121335	121344	40 %	40 %	0 %	20 %	126697674
78	NC_009089	AGAAA	2	10	123514	123523	80 %	0 %	20 %	0 %	126697677
79	NC_009089	TAAAT	2	10	139855	139864	60 %	40 %	0 %	0 %	126697679
80	NC_009089	AATAT	2	10	153969	153978	60 %	40 %	0 %	0 %	126697681
81	NC_009089	CAACT	2	10	154105	154114	40 %	20 %	0 %	40 %	126697681
82	NC_009089	AATTA	2	10	155656	155665	60 %	40 %	0 %	0 %	126697682
83	NC_009089	ATAAA	2	10	155877	155886	80 %	20 %	0 %	0 %	126697682
84	NC_009089	TTATA	2	10	156051	156060	40 %	60 %	0 %	0 %	126697683
85	NC_009089	AGAAA	2	10	156362	156371	80 %	0 %	20 %	0 %	126697684
86	NC_009089	ACTAA	2	10	157106	157115	60 %	20 %	0 %	20 %	126697684
87	NC_009089	AGAAA	2	10	158405	158414	80 %	0 %	20 %	0 %	126697686
88	NC_009089	TTAAT	2	10	159179	159188	40 %	60 %	0 %	0 %	126697687
89	NC_009089	TAATG	2	10	159516	159525	40 %	40 %	20 %	0 %	126697688
90	NC_009089	TGATA	2	10	159651	159660	40 %	40 %	20 %	0 %	126697688
91	NC_009089	AGAAA	2	10	161520	161529	80 %	0 %	20 %	0 %	126697690
92	NC_009089	GATGT	2	10	161972	161981	20 %	40 %	40 %	0 %	400927244
93	NC_009089	TGTGG	2	10	162046	162055	0 %	40 %	60 %	0 %	400927244
94	NC_009089	ATTGA	2	10	162136	162145	40 %	40 %	20 %	0 %	400927244
95	NC_009089	AAGAA	2	10	162830	162839	80 %	0 %	20 %	0 %	400927244
96	NC_009089	TAACT	2	10	166295	166304	40 %	40 %	0 %	20 %	126697693
97	NC_009089	CAAAA	2	10	170866	170875	80 %	0 %	0 %	20 %	126697697
98	NC_009089	AAATT	2	10	170922	170931	60 %	40 %	0 %	0 %	126697697
99	NC_009089	AGATA	2	10	172126	172135	60 %	20 %	20 %	0 %	126697699
100	NC_009089	GAACT	2	10	173898	173907	40 %	20 %	20 %	20 %	126697701
101	NC_009089	TTAAA	2	10	178674	178683	60 %	40 %	0 %	0 %	126697704
102	NC_009089	ATTTA	2	10	179964	179973	40 %	60 %	0 %	0 %	126697705
103	NC_009089	ATTAT	2	10	180245	180254	40 %	60 %	0 %	0 %	126697705
104	NC_009089	AAGAA	2	10	182928	182937	80 %	0 %	20 %	0 %	126697707
105	NC_009089	TAAAA	2	10	182948	182957	80 %	20 %	0 %	0 %	126697707
106	NC_009089	GAAAA	2	10	182981	182990	80 %	0 %	20 %	0 %	126697708
107	NC_009089	GCAAA	2	10	183617	183626	60 %	0 %	20 %	20 %	126697709
108	NC_009089	ATAGA	2	10	187427	187436	60 %	20 %	20 %	0 %	126697713
109	NC_009089	AAACT	2	10	188654	188663	60 %	20 %	0 %	20 %	126697714
110	NC_009089	TGAAA	2	10	192299	192308	60 %	20 %	20 %	0 %	126697716
111	NC_009089	AAATC	2	10	193225	193234	60 %	20 %	0 %	20 %	400927245
112	NC_009089	AATAC	2	10	193301	193310	60 %	20 %	0 %	20 %	400927245
113	NC_009089	AGAAA	2	10	193328	193337	80 %	0 %	20 %	0 %	400927245
114	NC_009089	AAAAG	2	10	193533	193542	80 %	0 %	20 %	0 %	400927245
115	NC_009089	AATTT	2	10	196227	196236	40 %	60 %	0 %	0 %	126697718
116	NC_009089	CTAAT	2	10	199406	199415	40 %	40 %	0 %	20 %	126697721
117	NC_009089	AAATA	2	10	200598	200607	80 %	20 %	0 %	0 %	126697723
118	NC_009089	AAGAA	2	10	200652	200661	80 %	0 %	20 %	0 %	126697723
119	NC_009089	TGGAA	2	10	205674	205683	40 %	20 %	40 %	0 %	126697727
120	NC_009089	AAGTT	2	10	209618	209627	40 %	40 %	20 %	0 %	126697729
121	NC_009089	TACTA	2	10	212470	212479	40 %	40 %	0 %	20 %	126697731
122	NC_009089	AGGAA	2	10	212617	212626	60 %	0 %	40 %	0 %	126697731
123	NC_009089	TTTGA	2	10	214331	214340	20 %	60 %	20 %	0 %	126697732
124	NC_009089	AAGGA	2	10	214377	214386	60 %	0 %	40 %	0 %	126697732
125	NC_009089	TAGAT	2	10	222236	222245	40 %	40 %	20 %	0 %	126697739
126	NC_009089	AAGCT	2	10	224352	224361	40 %	20 %	20 %	20 %	126697741
127	NC_009089	TTTTC	2	10	225636	225645	0 %	80 %	0 %	20 %	126697742
128	NC_009089	AATAA	2	10	229933	229942	80 %	20 %	0 %	0 %	126697746
129	NC_009089	AATGC	2	10	232560	232569	40 %	20 %	20 %	20 %	126697747
130	NC_009089	TAAAA	2	10	233406	233415	80 %	20 %	0 %	0 %	126697749
131	NC_009089	GAATA	2	10	233762	233771	60 %	20 %	20 %	0 %	126697749
132	NC_009089	GTATA	2	10	234235	234244	40 %	40 %	20 %	0 %	126697749
133	NC_009089	TTTAG	2	10	235082	235091	20 %	60 %	20 %	0 %	126697750
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135	NC_009089	CTTAT	2	10	239545	239554	20 %	60 %	0 %	20 %	126697754
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