MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 65849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_009012	CAG	2	6	80911	80916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972580
1503	NC_009012	TAT	2	6	80977	80982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972580
1504	NC_009012	AGG	2	6	81198	81203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972580
1505	NC_009012	AAGT	2	8	81209	81216	50 %	25 %	25 %	0 %	125972580
1506	NC_009012	GGC	2	6	81235	81240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972580
1507	NC_009012	TCC	2	6	81303	81308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125972580
1508	NC_009012	A	6	6	81403	81408	100 %	0 %	0 %	0 %	125972580
1509	NC_009012	ACA	2	6	81440	81445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972580
1510	NC_009012	GGC	2	6	81520	81525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972580
1511	NC_009012	GCC	2	6	81624	81629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	125972580
1512	NC_009012	ACC	2	6	81670	81675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125972580
1513	NC_009012	GAT	2	6	81718	81723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972580
1514	NC_009012	GA	3	6	81747	81752	50 %	0 %	50 %	0 %	125972580
1515	NC_009012	ACA	2	6	81791	81796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972580
1516	NC_009012	TTA	2	6	81797	81802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972580
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1518	NC_009012	GATT	2	8	81924	81931	25 %	50 %	25 %	0 %	125972580
1519	NC_009012	TGC	2	6	81935	81940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972580
1520	NC_009012	TACC	2	8	82001	82008	25 %	25 %	0 %	50 %	125972580
1521	NC_009012	TAT	2	6	82012	82017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972580
1522	NC_009012	GGA	2	6	82075	82080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972580
1523	NC_009012	AAG	2	6	82082	82087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972580
1524	NC_009012	GAAG	2	8	82158	82165	50 %	0 %	50 %	0 %	125972580
1525	NC_009012	AG	4	8	82205	82212	50 %	0 %	50 %	0 %	125972580
1526	NC_009012	ACA	2	6	82213	82218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972580
1527	NC_009012	TAT	2	6	82291	82296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972580
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1531	NC_009012	AAG	2	6	82680	82685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972580
1532	NC_009012	TGC	2	6	82794	82799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972580
1533	NC_009012	TGT	2	6	82860	82865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972580
1534	NC_009012	TA	3	6	82867	82872	50 %	50 %	0 %	0 %	125972580
1535	NC_009012	ATG	2	6	82928	82933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972580
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1541	NC_009012	AGGAT	2	10	83260	83269	40 %	20 %	40 %	0 %	125972580
1542	NC_009012	A	6	6	83283	83288	100 %	0 %	0 %	0 %	125972580
1543	NC_009012	GGC	2	6	83377	83382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972580
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1545	NC_009012	TTC	2	6	83429	83434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972580
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1547	NC_009012	TCG	2	6	83596	83601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972580
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1551	NC_009012	GCTG	2	8	83661	83668	0 %	25 %	50 %	25 %	125972580
1552	NC_009012	TAA	2	6	83732	83737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972580
1553	NC_009012	AGG	2	6	83775	83780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972580
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1555	NC_009012	AAT	2	6	83980	83985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972580
1556	NC_009012	TGG	2	6	84002	84007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972580
1557	NC_009012	TTC	2	6	84044	84049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972580
1558	NC_009012	AAG	2	6	84052	84057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972580
1559	NC_009012	GGA	2	6	84105	84110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972580
1560	NC_009012	CAT	2	6	84185	84190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972580
1561	NC_009012	GAA	2	6	84214	84219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972580
1562	NC_009012	TA	3	6	84299	84304	50 %	50 %	0 %	0 %	125972580
1563	NC_009012	TA	3	6	84335	84340	50 %	50 %	0 %	0 %	125972580
1564	NC_009012	AGAGA	2	10	84375	84384	60 %	0 %	40 %	0 %	125972580
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1573	NC_009012	TTA	2	6	84933	84938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972580
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1579	NC_009012	TA	3	6	85252	85257	50 %	50 %	0 %	0 %	125972580
1580	NC_009012	CAGG	2	8	85276	85283	25 %	0 %	50 %	25 %	125972580
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1598	NC_009012	A	6	6	86694	86699	100 %	0 %	0 %	0 %	125972580
1599	NC_009012	ATGAC	2	10	86711	86720	40 %	20 %	20 %	20 %	125972580
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1606	NC_009012	A	6	6	87157	87162	100 %	0 %	0 %	0 %	125972580
1607	NC_009012	CGG	2	6	87170	87175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972580
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1609	NC_009012	TGA	2	6	87363	87368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972580
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1611	NC_009012	AT	3	6	87445	87450	50 %	50 %	0 %	0 %	125972580
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1613	NC_009012	TCCT	2	8	87572	87579	0 %	50 %	0 %	50 %	125972580
1614	NC_009012	AG	3	6	87596	87601	50 %	0 %	50 %	0 %	125972580
1615	NC_009012	TG	4	8	87723	87730	0 %	50 %	50 %	0 %	125972580
1616	NC_009012	CAAAG	2	10	87802	87811	60 %	0 %	20 %	20 %	125972580
1617	NC_009012	A	6	6	87878	87883	100 %	0 %	0 %	0 %	125972580
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