MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 65849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009012	AAGG	2	8	281763	281770	50 %	0 %	50 %	0 %	125972755
5003	NC_009012	GAT	2	6	281804	281809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972755
5004	NC_009012	TAA	3	9	281843	281851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972755
5005	NC_009012	GGAC	2	8	282308	282315	25 %	0 %	50 %	25 %	125972756
5006	NC_009012	GGAAA	2	10	282370	282379	60 %	0 %	40 %	0 %	125972756
5007	NC_009012	A	6	6	282432	282437	100 %	0 %	0 %	0 %	125972756
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5010	NC_009012	GCTT	2	8	282543	282550	0 %	50 %	25 %	25 %	125972756
5011	NC_009012	TGA	2	6	282615	282620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972756
5012	NC_009012	TGT	2	6	282624	282629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972756
5013	NC_009012	A	6	6	282643	282648	100 %	0 %	0 %	0 %	125972756
5014	NC_009012	GAA	2	6	282664	282669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972756
5015	NC_009012	CTT	2	6	282682	282687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972756
5016	NC_009012	TG	3	6	282725	282730	0 %	50 %	50 %	0 %	125972756
5017	NC_009012	GCT	2	6	282732	282737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972756
5018	NC_009012	GGC	2	6	282762	282767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972756
5019	NC_009012	ACC	2	6	282782	282787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	125972756
5020	NC_009012	GTT	2	6	282871	282876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972756
5021	NC_009012	ATG	2	6	282937	282942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972756
5022	NC_009012	TCAA	2	8	282952	282959	50 %	25 %	0 %	25 %	125972756
5023	NC_009012	CGA	2	6	283011	283016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972756
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5025	NC_009012	GTT	2	6	283177	283182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972756
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5033	NC_009012	CAAAA	2	10	283601	283610	80 %	0 %	0 %	20 %	125972756
5034	NC_009012	GAG	2	6	283663	283668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972756
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5039	NC_009012	CGA	2	6	283991	283996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972756
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5041	NC_009012	TGG	2	6	284105	284110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972756
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5045	NC_009012	ATA	2	6	284318	284323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972756
5046	NC_009012	TAC	2	6	284335	284340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972756
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5049	NC_009012	TGA	2	6	284412	284417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972756
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5057	NC_009012	TTG	2	6	285230	285235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972757
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5074	NC_009012	GGA	2	6	286587	286592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972758
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5093	NC_009012	AAT	2	6	287618	287623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972761
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5101	NC_009012	AACAT	2	10	287967	287976	60 %	20 %	0 %	20 %	125972761
5102	NC_009012	A	6	6	287978	287983	100 %	0 %	0 %	0 %	125972761
5103	NC_009012	TTG	2	6	287998	288003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972761
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5110	NC_009012	GAA	2	6	288514	288519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972761
5111	NC_009012	GTT	2	6	288545	288550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972761
5112	NC_009012	T	6	6	288613	288618	0 %	100 %	0 %	0 %	125972761
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5115	NC_009012	AT	3	6	288808	288813	50 %	50 %	0 %	0 %	125972761
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5496	NC_009012	GTT	2	6	310346	310351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972774
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5499	NC_009012	AAT	2	6	310576	310581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972774
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