MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium thermocellum ATCC 27405 chromosome

Total Repeats: 65849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009012	TGAG	2	8	250999	251006	25 %	25 %	50 %	0 %	125972730
4502	NC_009012	A	7	7	251012	251018	100 %	0 %	0 %	0 %	125972730
4503	NC_009012	A	6	6	251029	251034	100 %	0 %	0 %	0 %	125972730
4504	NC_009012	CTT	2	6	251085	251090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972730
4505	NC_009012	GA	3	6	251105	251110	50 %	0 %	50 %	0 %	125972730
4506	NC_009012	ACAG	2	8	251115	251122	50 %	0 %	25 %	25 %	125972730
4507	NC_009012	TGT	2	6	251162	251167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972730
4508	NC_009012	AG	4	8	251216	251223	50 %	0 %	50 %	0 %	125972730
4509	NC_009012	CGT	2	6	251345	251350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972730
4510	NC_009012	AAC	2	6	251454	251459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972730
4511	NC_009012	AG	3	6	251624	251629	50 %	0 %	50 %	0 %	125972730
4512	NC_009012	CTT	2	6	251637	251642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972730
4513	NC_009012	TCT	2	6	251682	251687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972730
4514	NC_009012	AACAA	2	10	251692	251701	80 %	0 %	0 %	20 %	125972730
4515	NC_009012	T	7	7	251732	251738	0 %	100 %	0 %	0 %	125972730
4516	NC_009012	GAG	2	6	251757	251762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972730
4517	NC_009012	T	6	6	251792	251797	0 %	100 %	0 %	0 %	125972731
4518	NC_009012	T	6	6	251803	251808	0 %	100 %	0 %	0 %	125972731
4519	NC_009012	CAG	2	6	251816	251821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972731
4520	NC_009012	AGA	2	6	251954	251959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972731
4521	NC_009012	T	6	6	251962	251967	0 %	100 %	0 %	0 %	125972731
4522	NC_009012	GAG	2	6	252008	252013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972731
4523	NC_009012	ATGG	2	8	252022	252029	25 %	25 %	50 %	0 %	125972731
4524	NC_009012	CCTG	2	8	252073	252080	0 %	25 %	25 %	50 %	125972731
4525	NC_009012	CTT	2	6	252134	252139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972731
4526	NC_009012	A	7	7	252145	252151	100 %	0 %	0 %	0 %	125972731
4527	NC_009012	AAG	2	6	252418	252423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972731
4528	NC_009012	CAA	2	6	252517	252522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972731
4529	NC_009012	GAT	2	6	252551	252556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972731
4530	NC_009012	GAG	2	6	252593	252598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972731
4531	NC_009012	AT	3	6	252624	252629	50 %	50 %	0 %	0 %	125972732
4532	NC_009012	GCG	2	6	252672	252677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972732
4533	NC_009012	T	6	6	252699	252704	0 %	100 %	0 %	0 %	125972732
4534	NC_009012	TTC	2	6	252816	252821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972732
4535	NC_009012	TGC	2	6	252823	252828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972732
4536	NC_009012	A	6	6	252840	252845	100 %	0 %	0 %	0 %	125972732
4537	NC_009012	TG	3	6	252848	252853	0 %	50 %	50 %	0 %	125972732
4538	NC_009012	ATG	2	6	252864	252869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972732
4539	NC_009012	TTG	2	6	252897	252902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972732
4540	NC_009012	T	7	7	252913	252919	0 %	100 %	0 %	0 %	125972732
4541	NC_009012	GGT	2	6	252928	252933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	125972732
4542	NC_009012	ATGA	2	8	252971	252978	50 %	25 %	25 %	0 %	125972732
4543	NC_009012	TAA	2	6	253017	253022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972732
4544	NC_009012	GATG	2	8	253081	253088	25 %	25 %	50 %	0 %	125972732
4545	NC_009012	CAT	2	6	253103	253108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972732
4546	NC_009012	CGA	2	6	253117	253122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972732
4547	NC_009012	TCC	2	6	253126	253131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	125972732
4548	NC_009012	T	6	6	253210	253215	0 %	100 %	0 %	0 %	125972732
4549	NC_009012	TGCCT	2	10	253217	253226	0 %	40 %	20 %	40 %	125972732
4550	NC_009012	TGT	2	6	253300	253305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	125972732
4551	NC_009012	GA	3	6	253317	253322	50 %	0 %	50 %	0 %	125972732
4552	NC_009012	CTT	2	6	253331	253336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972732
4553	NC_009012	AGA	2	6	253367	253372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972732
4554	NC_009012	CTT	2	6	253388	253393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	125972732
4555	NC_009012	GAAA	2	8	253403	253410	75 %	0 %	25 %	0 %	125972732
4556	NC_009012	GCG	2	6	253466	253471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	125972732
4557	NC_009012	ACGGC	2	10	253484	253493	20 %	0 %	40 %	40 %	125972732
4558	NC_009012	T	7	7	253506	253512	0 %	100 %	0 %	0 %	125972732
4559	NC_009012	AGAA	2	8	253570	253577	75 %	0 %	25 %	0 %	125972732
4560	NC_009012	GCA	2	6	253585	253590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	125972732
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4562	NC_009012	TGC	2	6	253693	253698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	125972732
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4567	NC_009012	GAG	2	6	253895	253900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	125972732
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4571	NC_009012	CAT	2	6	254114	254119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	125972732
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4574	NC_009012	GA	3	6	254330	254335	50 %	0 %	50 %	0 %	125972732
4575	NC_009012	AAC	2	6	254338	254343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972732
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4579	NC_009012	GACGG	2	10	254619	254628	20 %	0 %	60 %	20 %	125972732
4580	NC_009012	TGA	2	6	254641	254646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972732
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4590	NC_009012	A	7	7	255163	255169	100 %	0 %	0 %	0 %	125972733
4591	NC_009012	ATA	2	6	255171	255176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	125972733
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4598	NC_009012	T	6	6	255526	255531	0 %	100 %	0 %	0 %	125972734
4599	NC_009012	T	6	6	255537	255542	0 %	100 %	0 %	0 %	125972734
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4605	NC_009012	T	7	7	255787	255793	0 %	100 %	0 %	0 %	125972734
4606	NC_009012	ATCTT	2	10	255895	255904	20 %	60 %	0 %	20 %	125972734
4607	NC_009012	CAA	2	6	255961	255966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972734
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4612	NC_009012	CACCG	2	10	256130	256139	20 %	0 %	20 %	60 %	125972734
4613	NC_009012	TA	3	6	256194	256199	50 %	50 %	0 %	0 %	125972734
4614	NC_009012	TTTG	2	8	256226	256233	0 %	75 %	25 %	0 %	125972734
4615	NC_009012	ATT	2	6	256295	256300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972734
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4625	NC_009012	CAGT	2	8	257037	257044	25 %	25 %	25 %	25 %	125972735
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4997	NC_009012	ACA	2	6	281454	281459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	125972755
4998	NC_009012	TAT	2	6	281599	281604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	125972755
4999	NC_009012	GAA	2	6	281642	281647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	125972755
5000	NC_009012	ATG	2	6	281723	281728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	125972755

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