MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pTet

Total Repeats: 1132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008790	TGACA	2	10	38717	38726	40 %	20 %	20 %	20 %	121999296
1002	NC_008790	CAA	2	6	38742	38747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121999296
1003	NC_008790	A	6	6	38746	38751	100 %	0 %	0 %	0 %	121999296
1004	NC_008790	AAG	2	6	38771	38776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999296
1005	NC_008790	AGA	2	6	38789	38794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999296
1006	NC_008790	AAG	2	6	38803	38808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999296
1007	NC_008790	AAAC	2	8	38867	38874	75 %	0 %	0 %	25 %	121999296
1008	NC_008790	GCAAT	2	10	38891	38900	40 %	20 %	20 %	20 %	121999296
1009	NC_008790	AAACA	2	10	39013	39022	80 %	0 %	0 %	20 %	121999296
1010	NC_008790	AGCA	2	8	39023	39030	50 %	0 %	25 %	25 %	121999296
1011	NC_008790	TAC	2	6	39035	39040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121999296
1012	NC_008790	GCAAT	2	10	39053	39062	40 %	20 %	20 %	20 %	121999296
1013	NC_008790	TGG	3	9	39105	39113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121999296
1014	NC_008790	TAT	2	6	39150	39155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999296
1015	NC_008790	ATA	2	6	39177	39182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999296
1016	NC_008790	GAA	2	6	39300	39305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999297
1017	NC_008790	A	7	7	39304	39310	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1018	NC_008790	TTG	2	6	39327	39332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121999297
1019	NC_008790	T	6	6	39407	39412	0 %	100 %	0 %	0 %	121999297
1020	NC_008790	TTA	2	6	39418	39423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999297
1021	NC_008790	TAT	2	6	39449	39454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999297
1022	NC_008790	A	7	7	39455	39461	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1023	NC_008790	A	7	7	39495	39501	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1024	NC_008790	A	6	6	39517	39522	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1025	NC_008790	TGAATT	2	12	39566	39577	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	121999297
1026	NC_008790	T	6	6	39589	39594	0 %	100 %	0 %	0 %	121999297
1027	NC_008790	AAAT	2	8	39652	39659	75 %	25 %	0 %	0 %	121999297
1028	NC_008790	TAA	2	6	39698	39703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999297
1029	NC_008790	A	6	6	39702	39707	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1030	NC_008790	TCA	2	6	39712	39717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121999297
1031	NC_008790	ATA	2	6	39727	39732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999297
1032	NC_008790	T	7	7	39784	39790	0 %	100 %	0 %	0 %	121999297
1033	NC_008790	ATA	2	6	39799	39804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999297
1034	NC_008790	A	6	6	39809	39814	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1035	NC_008790	TTA	2	6	39815	39820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999297
1036	NC_008790	A	6	6	39835	39840	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1037	NC_008790	AT	3	6	39897	39902	50 %	50 %	0 %	0 %	121999297
1038	NC_008790	AAG	2	6	39952	39957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999297
1039	NC_008790	AATT	2	8	39983	39990	50 %	50 %	0 %	0 %	121999297
1040	NC_008790	TAAA	2	8	39997	40004	75 %	25 %	0 %	0 %	121999297
1041	NC_008790	A	6	6	40055	40060	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1042	NC_008790	AT	3	6	40107	40112	50 %	50 %	0 %	0 %	121999297
1043	NC_008790	TAA	3	9	40130	40138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999297
1044	NC_008790	TAAAA	2	10	40160	40169	80 %	20 %	0 %	0 %	121999297
1045	NC_008790	A	7	7	40178	40184	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1046	NC_008790	ATT	2	6	40191	40196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999297
1047	NC_008790	AGAA	2	8	40237	40244	75 %	0 %	25 %	0 %	121999297
1048	NC_008790	TA	3	6	40272	40277	50 %	50 %	0 %	0 %	121999297
1049	NC_008790	TAA	2	6	40279	40284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121999297
1050	NC_008790	ATTAA	2	10	40293	40302	60 %	40 %	0 %	0 %	121999297
1051	NC_008790	TAATT	2	10	40316	40325	40 %	60 %	0 %	0 %	121999297
1052	NC_008790	A	8	8	40390	40397	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1053	NC_008790	A	6	6	40406	40411	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1054	NC_008790	A	6	6	40413	40418	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1055	NC_008790	AGA	2	6	40430	40435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999297
1056	NC_008790	AGA	2	6	40457	40462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999297
1057	NC_008790	A	7	7	40513	40519	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1058	NC_008790	AAG	3	9	40532	40540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999297
1059	NC_008790	AGG	2	6	40586	40591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121999297
1060	NC_008790	A	6	6	40619	40624	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1061	NC_008790	AAG	2	6	40675	40680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999297
1062	NC_008790	A	6	6	40696	40701	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1063	NC_008790	A	6	6	40717	40722	100 %	0 %	0 %	0 %	121999297
1064	NC_008790	ACAA	2	8	40743	40750	75 %	0 %	0 %	25 %	121999298
1065	NC_008790	TAC	2	6	40804	40809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121999298
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1068	NC_008790	ATTTT	2	10	40864	40873	20 %	80 %	0 %	0 %	121999298
1069	NC_008790	ATT	2	6	40894	40899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999298
1070	NC_008790	GAT	2	6	40912	40917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999298
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1072	NC_008790	ACA	2	6	41323	41328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121999299
1073	NC_008790	GTG	2	6	41354	41359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121999299
1074	NC_008790	CAA	2	6	41393	41398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121999299
1075	NC_008790	CAG	2	6	41447	41452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121999299
1076	NC_008790	GGA	2	6	41469	41474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121999299
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1079	NC_008790	T	7	7	41645	41651	0 %	100 %	0 %	0 %	121999299
1080	NC_008790	GATT	2	8	41676	41683	25 %	50 %	25 %	0 %	121999299
1081	NC_008790	AAAGC	2	10	41707	41716	60 %	0 %	20 %	20 %	121999299
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1086	NC_008790	TCA	2	6	41992	41997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121999299
1087	NC_008790	GGC	2	6	42059	42064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121999299
1088	NC_008790	TA	4	8	42081	42088	50 %	50 %	0 %	0 %	121999299
1089	NC_008790	TTA	2	6	42113	42118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999299
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1091	NC_008790	ATG	2	6	42227	42232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999299
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1093	NC_008790	TAC	2	6	42414	42419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121999299
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1095	NC_008790	T	6	6	42441	42446	0 %	100 %	0 %	0 %	121999299
1096	NC_008790	TA	4	8	42528	42535	50 %	50 %	0 %	0 %	121999299
1097	NC_008790	AATC	2	8	42682	42689	50 %	25 %	0 %	25 %	121999299
1098	NC_008790	ATGG	2	8	42743	42750	25 %	25 %	50 %	0 %	121999299
1099	NC_008790	TAT	2	6	42790	42795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999299
1100	NC_008790	GCT	2	6	42825	42830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121999299
1101	NC_008790	A	7	7	42858	42864	100 %	0 %	0 %	0 %	121999299
1102	NC_008790	TC	3	6	42924	42929	0 %	50 %	0 %	50 %	121999299
1103	NC_008790	ATG	2	6	42941	42946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999299
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1105	NC_008790	ATTT	2	8	43122	43129	25 %	75 %	0 %	0 %	121999299
1106	NC_008790	CGC	2	6	43138	43143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121999299
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1108	NC_008790	GAA	2	6	43662	43667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999300
1109	NC_008790	GA	3	6	43977	43982	50 %	0 %	50 %	0 %	121999301
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1111	NC_008790	AGCAG	2	10	44000	44009	40 %	0 %	40 %	20 %	121999301
1112	NC_008790	AG	3	6	44014	44019	50 %	0 %	50 %	0 %	121999301
1113	NC_008790	AAG	2	6	44075	44080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999301
1114	NC_008790	CGAG	2	8	44093	44100	25 %	0 %	50 %	25 %	121999301
1115	NC_008790	TGA	2	6	44114	44119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999301
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1117	NC_008790	AG	3	6	44162	44167	50 %	0 %	50 %	0 %	121999301
1118	NC_008790	GCAGA	2	10	44170	44179	40 %	0 %	40 %	20 %	121999301
1119	NC_008790	TCA	2	6	44189	44194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121999301
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1123	NC_008790	TGA	2	6	44396	44401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121999302
1124	NC_008790	AGA	2	6	44405	44410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999302
1125	NC_008790	T	7	7	44439	44445	0 %	100 %	0 %	0 %	121999302
1126	NC_008790	TGT	2	6	44516	44521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121999302
1127	NC_008790	AGTA	2	8	44533	44540	50 %	25 %	25 %	0 %	121999302
1128	NC_008790	GTATT	2	10	44898	44907	20 %	60 %	20 %	0 %	121999303
1129	NC_008790	TTAT	2	8	44912	44919	25 %	75 %	0 %	0 %	121999303
1130	NC_008790	AGA	2	6	44933	44938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121999303
1131	NC_008790	TTTAC	2	10	44962	44971	20 %	60 %	0 %	20 %	121999303
1132	NC_008790	ATT	2	6	44979	44984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121999303

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