MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176 plasmid pVir

Total Repeats: 428

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008770	ATT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582658
2	NC_008770	AAG	2	6	146	151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582658
3	NC_008770	TTA	2	6	241	246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582658
4	NC_008770	GAT	2	6	298	303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582658
5	NC_008770	TAA	2	6	444	449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582658
6	NC_008770	ATT	2	6	531	536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582658
7	NC_008770	ATT	2	6	625	630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582658
8	NC_008770	ACA	2	6	654	659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582658
9	NC_008770	ACA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582659
10	NC_008770	AAT	2	6	819	824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582659
11	NC_008770	AGA	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582659
12	NC_008770	CTT	2	6	1255	1260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582659
13	NC_008770	CTT	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582659
14	NC_008770	AAG	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582659
15	NC_008770	CGA	2	6	1499	1504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582659
16	NC_008770	TTA	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582659
17	NC_008770	GAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582659
18	NC_008770	ATC	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582659
19	NC_008770	CAA	2	6	1776	1781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582660
20	NC_008770	CAA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582660
21	NC_008770	AGA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582660
22	NC_008770	GAA	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582660
23	NC_008770	AGA	2	6	1894	1899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582660
24	NC_008770	GAA	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582660
25	NC_008770	GAA	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582660
26	NC_008770	ATA	3	9	2028	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582660
27	NC_008770	GAA	2	6	2057	2062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582660
28	NC_008770	TCA	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582660
29	NC_008770	ATA	2	6	2118	2123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582660
30	NC_008770	TTC	2	6	2212	2217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582660
31	NC_008770	CAA	2	6	2265	2270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582660
32	NC_008770	ACA	2	6	2454	2459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582660
33	NC_008770	ATT	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582660
34	NC_008770	ATA	2	6	2550	2555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582660
35	NC_008770	TAA	3	9	2584	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582660
36	NC_008770	CTT	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582660
37	NC_008770	ATA	2	6	2676	2681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582660
38	NC_008770	AAG	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582660
39	NC_008770	TAG	2	6	2730	2735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582660
40	NC_008770	CAA	3	9	2747	2755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582660
41	NC_008770	CAA	2	6	2769	2774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582660
42	NC_008770	AAC	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582660
43	NC_008770	GAA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582661
44	NC_008770	AGA	3	9	2957	2965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582661
45	NC_008770	AAT	2	6	2999	3004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582661
46	NC_008770	TAA	2	6	3090	3095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582661
47	NC_008770	ATA	2	6	3110	3115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582662
48	NC_008770	TAA	2	6	3168	3173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582662
49	NC_008770	ATG	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582662
50	NC_008770	TGA	2	6	3294	3299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582662
51	NC_008770	AGA	2	6	3672	3677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582662
52	NC_008770	ATT	2	6	3738	3743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582662
53	NC_008770	AGA	2	6	3840	3845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582662
54	NC_008770	TAT	2	6	3858	3863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582662
55	NC_008770	ATT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582662
56	NC_008770	ATA	2	6	3902	3907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582662
57	NC_008770	TAT	2	6	3945	3950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582662
58	NC_008770	ATT	2	6	4026	4031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582662
59	NC_008770	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582663
60	NC_008770	AAT	2	6	4195	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582663
61	NC_008770	AGA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582663
62	NC_008770	TGA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582663
63	NC_008770	GAA	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582663
64	NC_008770	ATT	2	6	4506	4511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582664
65	NC_008770	AAT	2	6	4517	4522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582664
66	NC_008770	ATT	2	6	4545	4550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582664
67	NC_008770	TTA	2	6	4563	4568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582664
68	NC_008770	AAT	2	6	4592	4597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582664
69	NC_008770	GAA	2	6	4755	4760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582664
70	NC_008770	TGG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582664
71	NC_008770	CAC	2	6	4876	4881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582664
72	NC_008770	TAA	2	6	5006	5011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582664
73	NC_008770	TAT	2	6	5020	5025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582664
74	NC_008770	ATA	3	9	5041	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582664
75	NC_008770	ATG	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582664
76	NC_008770	AAG	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582664
77	NC_008770	ATT	2	6	5278	5283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582664
78	NC_008770	GAA	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582664
79	NC_008770	ATG	2	6	5401	5406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582664
80	NC_008770	TGA	2	6	5414	5419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582664
81	NC_008770	TTA	2	6	5718	5723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582664
82	NC_008770	GAT	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582664
83	NC_008770	ATT	2	6	5862	5867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582664
84	NC_008770	CAT	3	9	5965	5973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582664
85	NC_008770	TAA	2	6	6002	6007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582664
86	NC_008770	AAG	2	6	6019	6024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582664
87	NC_008770	AGA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582664
88	NC_008770	TAA	2	6	6182	6187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582664
89	NC_008770	ATG	2	6	6214	6219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582664
90	NC_008770	TAA	2	6	6224	6229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582664
91	NC_008770	TGA	2	6	6230	6235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582664
92	NC_008770	GAA	2	6	6306	6311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582664
93	NC_008770	AAT	2	6	6453	6458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582665
94	NC_008770	AGA	2	6	6468	6473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582665
95	NC_008770	AGA	2	6	6531	6536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582665
96	NC_008770	AGA	2	6	6558	6563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582665
97	NC_008770	TCT	2	6	6607	6612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582665
98	NC_008770	AAG	2	6	6736	6741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582666
99	NC_008770	AAG	2	6	6788	6793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582666
100	NC_008770	GAA	2	6	6798	6803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582666
101	NC_008770	ATT	2	6	6837	6842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582666
102	NC_008770	TGA	2	6	7061	7066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582666
103	NC_008770	AAG	2	6	7099	7104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582666
104	NC_008770	AAT	2	6	7425	7430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582666
105	NC_008770	CAA	2	6	7463	7468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582666
106	NC_008770	CTT	2	6	7469	7474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582666
107	NC_008770	ATT	2	6	7498	7503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582666
108	NC_008770	GAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582667
109	NC_008770	AGA	2	6	7811	7816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582667
110	NC_008770	GAA	2	6	7866	7871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582667
111	NC_008770	ATT	2	6	7983	7988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582667
112	NC_008770	ATA	2	6	8026	8031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582668
113	NC_008770	ATG	2	6	8269	8274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582668
114	NC_008770	CGC	2	6	8471	8476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582668
115	NC_008770	TAT	2	6	8555	8560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582668
116	NC_008770	ATT	2	6	8586	8591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582668
117	NC_008770	TGG	2	6	8888	8893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582668
118	NC_008770	CTA	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582668
119	NC_008770	ATT	3	9	9189	9197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121582669
120	NC_008770	TAA	2	6	9209	9214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582669
121	NC_008770	CTA	2	6	9256	9261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582669
122	NC_008770	TGG	2	6	9607	9612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582669
123	NC_008770	TAA	2	6	9638	9643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582669
124	NC_008770	TTG	2	6	9700	9705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582669
125	NC_008770	GAT	2	6	9738	9743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582669
126	NC_008770	AAT	2	6	9744	9749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582669
127	NC_008770	AAT	2	6	9810	9815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582669
128	NC_008770	AGA	2	6	9836	9841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582669
129	NC_008770	TAA	2	6	9962	9967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	121582669
130	NC_008770	AGA	2	6	10223	10228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582669
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132	NC_008770	AGA	3	9	10409	10417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582669
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.