MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides DSM 266 chromosome

Total Repeats: 51785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008639	ATCT	2	8	33391	33398	25 %	50 %	0 %	25 %	119355883
502	NC_008639	ATG	2	6	33484	33489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355883
503	NC_008639	GTT	2	6	33592	33597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355883
504	NC_008639	GAA	2	6	33715	33720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355883
505	NC_008639	CCCT	2	8	33733	33740	0 %	25 %	0 %	75 %	119355883
506	NC_008639	TA	3	6	33751	33756	50 %	50 %	0 %	0 %	119355883
507	NC_008639	CGGG	2	8	33757	33764	0 %	0 %	75 %	25 %	119355883
508	NC_008639	CT	4	8	33769	33776	0 %	50 %	0 %	50 %	119355883
509	NC_008639	TAC	2	6	33817	33822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119355883
510	NC_008639	GCT	3	9	33852	33860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355883
511	NC_008639	CT	3	6	33877	33882	0 %	50 %	0 %	50 %	119355883
512	NC_008639	CCTC	2	8	33902	33909	0 %	25 %	0 %	75 %	119355883
513	NC_008639	GAG	2	6	33991	33996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355883
514	NC_008639	TCG	2	6	34054	34059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355883
515	NC_008639	CAC	2	6	34077	34082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355883
516	NC_008639	TCT	2	6	34098	34103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355883
517	NC_008639	TGA	2	6	34148	34153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355883
518	NC_008639	CGG	2	6	34160	34165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355883
519	NC_008639	TTG	2	6	34184	34189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355883
520	NC_008639	ATG	2	6	34228	34233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355883
521	NC_008639	A	6	6	34238	34243	100 %	0 %	0 %	0 %	119355883
522	NC_008639	TCT	2	6	34348	34353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355884
523	NC_008639	A	7	7	34440	34446	100 %	0 %	0 %	0 %	119355884
524	NC_008639	TGC	2	6	34456	34461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355884
525	NC_008639	TCGT	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	119355884
526	NC_008639	TCGT	2	8	34626	34633	0 %	50 %	25 %	25 %	119355884
527	NC_008639	TTC	2	6	34713	34718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355884
528	NC_008639	GTT	2	6	34763	34768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355884
529	NC_008639	CTT	2	6	34811	34816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355884
530	NC_008639	TGC	2	6	34864	34869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355884
531	NC_008639	CGT	2	6	34906	34911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355884
532	NC_008639	GA	3	6	34931	34936	50 %	0 %	50 %	0 %	119355884
533	NC_008639	CTG	2	6	34953	34958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355884
534	NC_008639	GTTTGC	2	12	35080	35091	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	119355884
535	NC_008639	GGC	2	6	35195	35200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355884
536	NC_008639	GAA	2	6	35471	35476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355885
537	NC_008639	GCA	2	6	35487	35492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355885
538	NC_008639	TTG	2	6	35506	35511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355885
539	NC_008639	GTT	2	6	35568	35573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355885
540	NC_008639	TGA	2	6	35603	35608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355885
541	NC_008639	CG	3	6	35610	35615	0 %	0 %	50 %	50 %	119355885
542	NC_008639	TGA	2	6	35617	35622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355885
543	NC_008639	GAAA	2	8	35663	35670	75 %	0 %	25 %	0 %	119355885
544	NC_008639	A	6	6	35668	35673	100 %	0 %	0 %	0 %	119355885
545	NC_008639	ATT	2	6	35685	35690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355885
546	NC_008639	GGA	2	6	35816	35821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119355885
547	NC_008639	CAG	2	6	35880	35885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355885
548	NC_008639	AGC	2	6	35908	35913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355885
549	NC_008639	AGC	2	6	35968	35973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355885
550	NC_008639	A	8	8	36289	36296	100 %	0 %	0 %	0 %	119355885
551	NC_008639	ATCA	2	8	36337	36344	50 %	25 %	0 %	25 %	119355885
552	NC_008639	AGAC	2	8	36346	36353	50 %	0 %	25 %	25 %	119355885
553	NC_008639	A	6	6	36432	36437	100 %	0 %	0 %	0 %	119355885
554	NC_008639	CGA	2	6	36443	36448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355885
555	NC_008639	TTCT	2	8	36478	36485	0 %	75 %	0 %	25 %	119355885
556	NC_008639	GCTTC	2	10	36516	36525	0 %	40 %	20 %	40 %	119355885
557	NC_008639	ATG	2	6	36534	36539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355885
558	NC_008639	AT	3	6	36571	36576	50 %	50 %	0 %	0 %	119355885
559	NC_008639	A	6	6	36586	36591	100 %	0 %	0 %	0 %	119355885
560	NC_008639	CAGC	2	8	36740	36747	25 %	0 %	25 %	50 %	119355885
561	NC_008639	A	6	6	36750	36755	100 %	0 %	0 %	0 %	119355885
562	NC_008639	TTCTC	2	10	36819	36828	0 %	60 %	0 %	40 %	119355886
563	NC_008639	ATCTG	2	10	36862	36871	20 %	40 %	20 %	20 %	119355886
564	NC_008639	AGCG	2	8	36904	36911	25 %	0 %	50 %	25 %	119355886
565	NC_008639	TC	3	6	36956	36961	0 %	50 %	0 %	50 %	119355886
566	NC_008639	CTG	2	6	37062	37067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355886
567	NC_008639	GAAA	2	8	37148	37155	75 %	0 %	25 %	0 %	119355886
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569	NC_008639	TTC	3	9	37248	37256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355886
570	NC_008639	ATG	2	6	37282	37287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355886
571	NC_008639	CCT	2	6	37405	37410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119355886
572	NC_008639	TTGA	2	8	37456	37463	25 %	50 %	25 %	0 %	119355886
573	NC_008639	TTC	2	6	37511	37516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355886
574	NC_008639	TC	3	6	37546	37551	0 %	50 %	0 %	50 %	119355886
575	NC_008639	TTC	2	6	37707	37712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119355886
576	NC_008639	CCG	2	6	37730	37735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119355886
577	NC_008639	TCG	2	6	37753	37758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355886
578	NC_008639	CAG	2	6	37785	37790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355886
579	NC_008639	CAA	2	6	37937	37942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355886
580	NC_008639	TGA	2	6	37982	37987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355886
581	NC_008639	CGAT	2	8	38122	38129	25 %	25 %	25 %	25 %	119355886
582	NC_008639	ATG	2	6	38131	38136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355886
583	NC_008639	GGT	2	6	38184	38189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119355886
584	NC_008639	ACTTCG	2	12	38287	38298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	119355886
585	NC_008639	CAC	2	6	38319	38324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119355886
586	NC_008639	AACCG	2	10	38481	38490	40 %	0 %	20 %	40 %	119355886
587	NC_008639	CGA	2	6	38555	38560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355886
588	NC_008639	GT	3	6	38590	38595	0 %	50 %	50 %	0 %	119355886
589	NC_008639	AT	3	6	38668	38673	50 %	50 %	0 %	0 %	119355886
590	NC_008639	TGC	2	6	38928	38933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355887
591	NC_008639	TCG	2	6	39026	39031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355887
592	NC_008639	T	7	7	39036	39042	0 %	100 %	0 %	0 %	119355887
593	NC_008639	ATA	2	6	39046	39051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	119355887
594	NC_008639	GTT	2	6	39194	39199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355888
595	NC_008639	GGC	3	9	39363	39371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355888
596	NC_008639	A	6	6	39377	39382	100 %	0 %	0 %	0 %	119355888
597	NC_008639	CAA	2	6	39449	39454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355888
598	NC_008639	CGG	2	6	39465	39470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355888
599	NC_008639	ATG	2	6	39538	39543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355888
600	NC_008639	T	7	7	39627	39633	0 %	100 %	0 %	0 %	119355888
601	NC_008639	GTC	2	6	39636	39641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355888
602	NC_008639	GCG	2	6	39697	39702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355888
603	NC_008639	GCCA	2	8	39711	39718	25 %	0 %	25 %	50 %	119355888
604	NC_008639	GGT	2	6	39789	39794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119355888
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606	NC_008639	AGC	2	6	39932	39937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119355889
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608	NC_008639	AG	3	6	40058	40063	50 %	0 %	50 %	0 %	119355889
609	NC_008639	ATGG	2	8	40120	40127	25 %	25 %	50 %	0 %	119355889
610	NC_008639	GTC	2	6	40131	40136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119355889
611	NC_008639	AAC	2	6	40145	40150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119355889
612	NC_008639	ACGT	2	8	40156	40163	25 %	25 %	25 %	25 %	119355889
613	NC_008639	TGCC	2	8	40165	40172	0 %	25 %	25 %	50 %	119355889
614	NC_008639	C	6	6	40178	40183	0 %	0 %	0 %	100 %	119355889
615	NC_008639	AG	3	6	40184	40189	50 %	0 %	50 %	0 %	119355889
616	NC_008639	TC	3	6	40203	40208	0 %	50 %	0 %	50 %	119355889
617	NC_008639	GAA	2	6	40729	40734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119355890
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619	NC_008639	TTG	2	6	40791	40796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119355890
620	NC_008639	ATT	2	6	40820	40825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	119355890
621	NC_008639	GACGAT	2	12	40994	41005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	119355890
622	NC_008639	GAT	3	9	41003	41011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355890
623	NC_008639	GCGACG	2	12	41031	41042	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	119355890
624	NC_008639	GGC	2	6	41153	41158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355890
625	NC_008639	GGC	2	6	41160	41165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119355890
626	NC_008639	GAT	2	6	41179	41184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119355890
627	NC_008639	CGATT	2	10	41206	41215	20 %	40 %	20 %	20 %	119355890
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