MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 455

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008610	GAAATT	2	12	2482	2493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602062
2	NC_008610	TAGTGG	2	12	10382	10393	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118602067
3	NC_008610	AATTAA	2	12	13113	13124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602070
4	NC_008610	AAAATT	2	12	13989	14000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602070
5	NC_008610	ATCAAC	2	12	14539	14550	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118602071
6	NC_008610	TATTAG	2	12	17172	17183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602073
7	NC_008610	TATTGA	2	12	17325	17336	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602073
8	NC_008610	TCAAAA	2	12	20729	20740	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602076
9	NC_008610	TTTGGC	2	12	24776	24787	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118602079
10	NC_008610	CGATTA	2	12	30935	30946	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118602086
11	NC_008610	AATTCA	2	12	30971	30982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602086
12	NC_008610	AGCAAT	2	12	38463	38474	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118602092
13	NC_008610	CATGGC	2	12	38760	38771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118602092
14	NC_008610	AGCAAC	2	12	40387	40398	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118602094
15	NC_008610	ATTAGT	2	12	45949	45960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602098
16	NC_008610	ATCCAG	2	12	47540	47551	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602100
17	NC_008610	TACGCG	2	12	54920	54931	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118602104
18	NC_008610	ATTTTT	2	12	56757	56768	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118602107
19	NC_008610	ATTTTT	2	12	60285	60296	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118602109
20	NC_008610	GCGCAA	2	12	63002	63013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602112
21	NC_008610	ATTGCT	2	12	63251	63262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602112
22	NC_008610	ATTGAT	2	12	63836	63847	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602112
23	NC_008610	AAAGTG	2	12	64472	64483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602112
24	NC_008610	AACACA	2	12	70186	70197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602117
25	NC_008610	TAATGT	2	12	78212	78223	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602123
26	NC_008610	TTAGAT	2	12	78348	78359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602123
27	NC_008610	AATTAA	2	12	81897	81908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602126
28	NC_008610	TAAACT	2	12	86901	86912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602131
29	NC_008610	ATGTTT	2	12	90193	90204	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602133
30	NC_008610	AAGCAC	2	12	101157	101168	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118602139
31	NC_008610	TGAGCC	2	12	104142	104153	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	118602142
32	NC_008610	ATCGTG	2	12	106081	106092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602143
33	NC_008610	TGAAAT	2	12	106371	106382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602144
34	NC_008610	CCATTG	2	12	108025	108036	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118602147
35	NC_008610	GCATTG	2	12	126166	126177	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602158
36	NC_008610	AATACA	2	12	127393	127404	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602159
37	NC_008610	TTCAAA	2	12	133899	133910	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602165
38	NC_008610	TTAGTA	2	12	135357	135368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602166
39	NC_008610	TAAAGC	2	12	138239	138250	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118602170
40	NC_008610	GGTATG	2	12	142101	142112	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118602171
41	NC_008610	CAAGCT	2	12	148002	148013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602178
42	NC_008610	TATTGA	2	12	148838	148849	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602178
43	NC_008610	TTTGAT	2	12	150195	150206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602179
44	NC_008610	TATCTT	2	12	150241	150252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118602179
45	NC_008610	TTAATA	2	12	150541	150552	50 %	50 %	0 %	0 %	118602179
46	NC_008610	TATTAA	2	12	153081	153092	50 %	50 %	0 %	0 %	118602181
47	NC_008610	TTGATT	2	12	158474	158485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602185
48	NC_008610	GTGATT	2	12	159697	159708	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602186
49	NC_008610	GGTAAA	2	12	159946	159957	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602186
50	NC_008610	GCAAAA	2	12	161058	161069	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118602187
51	NC_008610	GGTTTT	2	12	161325	161336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602187
52	NC_008610	TGATGG	2	12	162312	162323	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118602188
53	NC_008610	TGTTAC	2	12	167000	167011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602191
54	NC_008610	CAAAAA	2	12	167580	167591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	118602191
55	NC_008610	GCTTTC	2	12	169020	169031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	118602193
56	NC_008610	CCAATG	2	12	187474	187485	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602208
57	NC_008610	TAGATG	2	12	189075	189086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602210
58	NC_008610	TCGTGC	2	12	192893	192904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602214
59	NC_008610	ATTTAT	2	12	193162	193173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602214
60	NC_008610	GTAAAG	2	12	196011	196022	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602220
61	NC_008610	TATTGT	2	12	198520	198531	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602227
62	NC_008610	TTACTA	2	12	198678	198689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118602228
63	NC_008610	AACAAA	2	12	202756	202767	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	118602235
64	NC_008610	AATTAT	2	12	203845	203856	50 %	50 %	0 %	0 %	118602238
65	NC_008610	ATAAGG	2	12	216354	216365	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602247
66	NC_008610	TGATAT	2	12	218453	218464	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602249
67	NC_008610	AAGTAA	2	12	221242	221253	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118602251
68	NC_008610	ATGAAA	2	12	221961	221972	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118602252
69	NC_008610	TAAAGG	2	12	223075	223086	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602252
70	NC_008610	GTGCAG	2	12	223257	223268	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118602252
71	NC_008610	AAACCA	2	12	230979	230990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602259
72	NC_008610	CAAGTC	2	12	231025	231036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602259
73	NC_008610	TACGGT	2	12	231056	231067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602259
74	NC_008610	GGCAAT	2	12	231679	231690	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118602260
75	NC_008610	CCATTT	2	12	245600	245611	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118602271
76	NC_008610	AATTTG	2	12	249947	249958	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602273
77	NC_008610	CGTGAA	2	12	253876	253887	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118602278
78	NC_008610	GAAAAT	2	12	254838	254849	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118602279
79	NC_008610	CGTGGT	2	12	255356	255367	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	118602280
80	NC_008610	AGGTGC	2	12	255694	255705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118602280
81	NC_008610	ATTGAA	2	12	256485	256496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602281
82	NC_008610	TGATCG	2	12	257252	257263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602281
83	NC_008610	CACTAT	2	12	266153	266164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602288
84	NC_008610	GTTATT	2	12	266578	266589	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602289
85	NC_008610	GCAGGT	2	12	267016	267027	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118602289
86	NC_008610	AGATAG	2	12	269298	269309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602289
87	NC_008610	TCACTA	2	12	272234	272245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602289
88	NC_008610	ACAATA	2	12	272855	272866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602289
89	NC_008610	TCTTAA	2	12	274740	274751	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118602289
90	NC_008610	ATATTA	2	12	274874	274885	50 %	50 %	0 %	0 %	118602289
91	NC_008610	TCCTAA	2	12	278766	278777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602293
92	NC_008610	TTGGTA	2	12	280561	280572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602293
93	NC_008610	TTTCCA	2	12	282620	282631	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118602295
94	NC_008610	AATACA	2	12	284494	284505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602297
95	NC_008610	TTTCTT	2	12	285672	285683	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	118602299
96	NC_008610	TACCTG	2	12	286428	286439	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118602300
97	NC_008610	GTTTTA	2	12	289094	289105	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118602301
98	NC_008610	ATATCA	2	12	293201	293212	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602306
99	NC_008610	TAAATT	2	12	293375	293386	50 %	50 %	0 %	0 %	118602307
100	NC_008610	TTAGGT	2	12	297683	297694	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602310
101	NC_008610	TGAGAA	2	12	298195	298206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602310
102	NC_008610	AATGAT	2	12	298870	298881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602311
103	NC_008610	TGTGTT	2	12	299785	299796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602312
104	NC_008610	CATGAC	2	12	302576	302587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602315
105	NC_008610	AAAAAC	2	12	304462	304473	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	118602317
106	NC_008610	ACAAAG	2	12	306381	306392	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118602318
107	NC_008610	ATTTAA	2	12	307023	307034	50 %	50 %	0 %	0 %	118602318
108	NC_008610	AAATGA	2	12	307706	307717	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118602319
109	NC_008610	TTCGTA	2	12	308015	308026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602319
110	NC_008610	CAAAGC	2	12	313728	313739	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118602327
111	NC_008610	TCAATA	2	12	315774	315785	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118602328
112	NC_008610	TTTCCA	2	12	316345	316356	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118602328
113	NC_008610	TTTATT	2	12	317546	317557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118602330
114	NC_008610	ATTTTT	2	12	318791	318802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118602331
115	NC_008610	AGCTTT	2	12	321496	321507	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602333
116	NC_008610	TAAAAC	2	12	322285	322296	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118602334
117	NC_008610	AAAAAG	2	12	326341	326352	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118602336
118	NC_008610	GATGTA	2	12	326523	326534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602336
119	NC_008610	TAAAGG	2	12	327602	327613	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602336
120	NC_008610	TCAAGG	2	12	328248	328259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118602337
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233	NC_008610	TGCTGA	2	12	588956	588967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602548
234	NC_008610	GTGAAA	2	12	593972	593983	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602551
235	NC_008610	CATCTG	2	12	594450	594461	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118602552
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334	NC_008610	TTAGCT	2	12	867430	867441	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118602788
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336	NC_008610	TAGGCT	2	12	873217	873228	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118602793
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340	NC_008610	CAACAG	2	12	891193	891204	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	118602804
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342	NC_008610	TGGTTC	2	12	895098	895109	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	118602808
343	NC_008610	AGTTAC	2	12	903158	903169	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118602818
344	NC_008610	AATTTG	2	12	905664	905675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118602819
345	NC_008610	CACCCA	2	12	906671	906682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602820
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348	NC_008610	TAGCAA	2	12	915992	916003	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118602830
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451	NC_008610	CTGAAA	2	12	1151620	1151631	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118603030
452	NC_008610	TAGCAT	2	12	1157237	1157248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118603034
453	NC_008610	GCTGAT	2	12	1157572	1157583	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118603034
454	NC_008610	GCAATT	2	12	1157602	1157613	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118603034
455	NC_008610	ATTAAA	2	12	1159450	1159461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118603035