MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Ruthia magnifica str. Cm (Calyptogena magnifica)

Total Repeats: 21136

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008610	TGC	2	6	297463	297468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602310
5502	NC_008610	GTTT	2	8	297483	297490	0 %	75 %	25 %	0 %	118602310
5503	NC_008610	TGGT	2	8	297513	297520	0 %	50 %	50 %	0 %	118602310
5504	NC_008610	TAA	2	6	297565	297570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602310
5505	NC_008610	CTTTT	2	10	297574	297583	0 %	80 %	0 %	20 %	118602310
5506	NC_008610	T	6	6	297580	297585	0 %	100 %	0 %	0 %	118602310
5507	NC_008610	AG	4	8	297590	297597	50 %	0 %	50 %	0 %	118602310
5508	NC_008610	TAA	2	6	297610	297615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602310
5509	NC_008610	TTA	2	6	297620	297625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602310
5510	NC_008610	GCA	2	6	297629	297634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602310
5511	NC_008610	TTAGGT	2	12	297683	297694	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118602310
5512	NC_008610	TAT	2	6	297739	297744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602310
5513	NC_008610	T	6	6	297778	297783	0 %	100 %	0 %	0 %	118602310
5514	NC_008610	A	6	6	297791	297796	100 %	0 %	0 %	0 %	118602310
5515	NC_008610	CA	3	6	297802	297807	50 %	0 %	0 %	50 %	118602310
5516	NC_008610	TTA	2	6	297821	297826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602310
5517	NC_008610	TGT	2	6	297852	297857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602310
5518	NC_008610	TTA	2	6	297861	297866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602310
5519	NC_008610	ATA	2	6	297882	297887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602310
5520	NC_008610	TTA	2	6	297896	297901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602310
5521	NC_008610	TTA	2	6	298031	298036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602310
5522	NC_008610	ATTTT	2	10	298119	298128	20 %	80 %	0 %	0 %	118602310
5523	NC_008610	TGAGAA	2	12	298195	298206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118602310
5524	NC_008610	AGC	2	6	298264	298269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602310
5525	NC_008610	TAT	2	6	298349	298354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602310
5526	NC_008610	G	6	6	298382	298387	0 %	0 %	100 %	0 %	118602310
5527	NC_008610	TTA	2	6	298409	298414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602310
5528	NC_008610	GAAT	2	8	298451	298458	50 %	25 %	25 %	0 %	118602310
5529	NC_008610	TGA	2	6	298478	298483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602311
5530	NC_008610	ATT	2	6	298564	298569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602311
5531	NC_008610	CAAA	2	8	298575	298582	75 %	0 %	0 %	25 %	118602311
5532	NC_008610	TGAT	2	8	298619	298626	25 %	50 %	25 %	0 %	118602311
5533	NC_008610	A	6	6	298627	298632	100 %	0 %	0 %	0 %	118602311
5534	NC_008610	TCAA	2	8	298637	298644	50 %	25 %	0 %	25 %	118602311
5535	NC_008610	AGA	2	6	298650	298655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602311
5536	NC_008610	CAA	2	6	298661	298666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602311
5537	NC_008610	CAA	2	6	298684	298689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602311
5538	NC_008610	TAA	3	9	298713	298721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602311
5539	NC_008610	TAT	2	6	298748	298753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602311
5540	NC_008610	AATGAT	2	12	298870	298881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118602311
5541	NC_008610	ATG	2	6	299011	299016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602311
5542	NC_008610	TTAG	2	8	299215	299222	25 %	50 %	25 %	0 %	118602311
5543	NC_008610	AG	3	6	299250	299255	50 %	0 %	50 %	0 %	118602311
5544	NC_008610	AT	3	6	299294	299299	50 %	50 %	0 %	0 %	118602311
5545	NC_008610	AGC	2	6	299355	299360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602311
5546	NC_008610	A	7	7	299389	299395	100 %	0 %	0 %	0 %	118602311
5547	NC_008610	GTT	2	6	299422	299427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602311
5548	NC_008610	AACC	2	8	299430	299437	50 %	0 %	0 %	50 %	118602311
5549	NC_008610	CAAT	2	8	299457	299464	50 %	25 %	0 %	25 %	118602311
5550	NC_008610	AGT	2	6	299490	299495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602311
5551	NC_008610	TTA	2	6	299558	299563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602311
5552	NC_008610	CATT	2	8	299583	299590	25 %	50 %	0 %	25 %	118602311
5553	NC_008610	AAT	2	6	299600	299605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118602311
5554	NC_008610	A	6	6	299632	299637	100 %	0 %	0 %	0 %	118602312
5555	NC_008610	TAT	2	6	299686	299691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602312
5556	NC_008610	TCA	2	6	299773	299778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602312
5557	NC_008610	TGTGTT	2	12	299785	299796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602312
5558	NC_008610	TGA	2	6	299827	299832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602312
5559	NC_008610	TGA	2	6	300001	300006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602312
5560	NC_008610	ATCA	2	8	300059	300066	50 %	25 %	0 %	25 %	118602312
5561	NC_008610	ATT	2	6	300075	300080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602312
5562	NC_008610	GTC	2	6	300135	300140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602312
5563	NC_008610	ATT	2	6	300341	300346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602312
5564	NC_008610	TGT	2	6	300361	300366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602312
5565	NC_008610	CCA	2	6	300645	300650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602312
5566	NC_008610	GT	3	6	300667	300672	0 %	50 %	50 %	0 %	118602312
5567	NC_008610	ATCC	2	8	300673	300680	25 %	25 %	0 %	50 %	118602312
5568	NC_008610	AGA	2	6	300688	300693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118602312
5569	NC_008610	TAT	2	6	300707	300712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602312
5570	NC_008610	A	6	6	300721	300726	100 %	0 %	0 %	0 %	118602312
5571	NC_008610	ACTTA	2	10	300734	300743	40 %	40 %	0 %	20 %	118602312
5572	NC_008610	TTA	2	6	300756	300761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602313
5573	NC_008610	A	6	6	300821	300826	100 %	0 %	0 %	0 %	118602313
5574	NC_008610	CAA	2	6	300868	300873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118602313
5575	NC_008610	TGG	3	9	300904	300912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602313
5576	NC_008610	TGA	2	6	300924	300929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602313
5577	NC_008610	TATC	2	8	300995	301002	25 %	50 %	0 %	25 %	118602313
5578	NC_008610	TAT	2	6	301068	301073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602313
5579	NC_008610	TAT	2	6	301102	301107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602313
5580	NC_008610	GTG	2	6	301155	301160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602313
5581	NC_008610	AGC	2	6	301168	301173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602313
5582	NC_008610	GTC	2	6	301197	301202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602313
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5586	NC_008610	A	7	7	301376	301382	100 %	0 %	0 %	0 %	118602313
5587	NC_008610	GT	3	6	301668	301673	0 %	50 %	50 %	0 %	118602314
5588	NC_008610	GTC	2	6	301707	301712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118602314
5589	NC_008610	AC	3	6	301720	301725	50 %	0 %	0 %	50 %	118602314
5590	NC_008610	CTT	2	6	301759	301764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118602314
5591	NC_008610	AAATT	2	10	301770	301779	60 %	40 %	0 %	0 %	118602314
5592	NC_008610	TGA	2	6	301807	301812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602314
5593	NC_008610	GGT	2	6	301891	301896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602314
5594	NC_008610	GTT	2	6	302051	302056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602315
5595	NC_008610	TGG	2	6	302087	302092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602315
5596	NC_008610	TTTG	2	8	302285	302292	0 %	75 %	25 %	0 %	118602315
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5600	NC_008610	TAT	2	6	302377	302382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602315
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5603	NC_008610	TGG	2	6	302471	302476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602315
5604	NC_008610	GTT	2	6	302481	302486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602315
5605	NC_008610	TAG	2	6	302512	302517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602315
5606	NC_008610	T	7	7	302546	302552	0 %	100 %	0 %	0 %	118602315
5607	NC_008610	A	6	6	302553	302558	100 %	0 %	0 %	0 %	118602315
5608	NC_008610	CCA	2	6	302565	302570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602315
5609	NC_008610	CA	3	6	302569	302574	50 %	0 %	0 %	50 %	118602315
5610	NC_008610	CATGAC	2	12	302576	302587	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118602315
5611	NC_008610	GCG	2	6	302598	302603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118602315
5612	NC_008610	TGT	2	6	302605	302610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602315
5613	NC_008610	GGTT	2	8	302616	302623	0 %	50 %	50 %	0 %	118602315
5614	NC_008610	TGG	2	6	302633	302638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602315
5615	NC_008610	GGC	2	6	302655	302660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118602315
5616	NC_008610	GCG	2	6	302664	302669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118602315
5617	NC_008610	CAG	2	6	302695	302700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118602315
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5619	NC_008610	ATC	2	6	302886	302891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602315
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5621	NC_008610	GTGG	2	8	302943	302950	0 %	25 %	75 %	0 %	118602315
5622	NC_008610	TAT	2	6	302951	302956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118602315
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5624	NC_008610	T	6	6	303001	303006	0 %	100 %	0 %	0 %	118602315
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5995	NC_008610	ACC	2	6	322535	322540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118602334
5996	NC_008610	GC	3	6	322588	322593	0 %	0 %	50 %	50 %	118602334
5997	NC_008610	TGA	2	6	322623	322628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118602334
5998	NC_008610	TGG	2	6	322985	322990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118602335
5999	NC_008610	GTT	2	6	323138	323143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118602335
6000	NC_008610	TCA	2	6	323164	323169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118602335

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