MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium novyi NT chromosome

Total Repeats: 1429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008593	TGAGGT	2	12	2052	2063	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118444639
2	NC_008593	TAGAAG	2	12	2319	2330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118444639
3	NC_008593	TATTGA	2	12	7798	7809	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118443230
4	NC_008593	ATAAAA	2	12	7845	7856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118443230
5	NC_008593	TATTTA	2	12	9912	9923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444149
6	NC_008593	ATAGCT	2	12	15982	15993	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	118444184
7	NC_008593	TATATG	2	12	21209	21220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118444302
8	NC_008593	GACTTG	2	12	21500	21511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118444302
9	NC_008593	CCAAAT	2	12	27873	27884	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118443392
10	NC_008593	TCATTT	2	12	29736	29747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	118442930
11	NC_008593	TTTTAT	2	12	30516	30527	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118444610
12	NC_008593	CAGGTG	2	12	31662	31673	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	118444065
13	NC_008593	CAATAC	2	12	31954	31965	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118444065
14	NC_008593	AAGGAA	2	12	33003	33014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444000
15	NC_008593	AAATTT	2	12	34239	34250	50 %	50 %	0 %	0 %	118444000
16	NC_008593	ATGCCC	2	12	35494	35505	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	118443206
17	NC_008593	TAGTAT	2	12	39020	39031	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118444142
18	NC_008593	TGCTAT	2	12	39384	39395	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118444142
19	NC_008593	TCTAAA	2	12	39631	39642	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118444142
20	NC_008593	AAAAGT	2	12	45613	45624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118444515
21	NC_008593	GTGGAA	2	12	49724	49735	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	118444296
22	NC_008593	GGAAAA	2	12	50389	50400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443895
23	NC_008593	TATTGA	2	12	52171	52182	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118444146
24	NC_008593	TAAAAT	2	12	52955	52966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444342
25	NC_008593	AATAGC	2	12	53940	53951	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118443320
26	NC_008593	TTTATA	2	12	55047	55058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443506
27	NC_008593	TTAAAG	2	12	56556	56567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118443798
28	NC_008593	ATTAAA	2	12	60000	60011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443931
29	NC_008593	TAGGAA	2	12	65902	65913	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118444438
30	NC_008593	AGCAAT	2	12	66599	66610	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118444438
31	NC_008593	AATTTG	2	12	69283	69294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118443337
32	NC_008593	GATAAA	2	12	70707	70718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118443882
33	NC_008593	AAACAT	2	12	71632	71643	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118443215
34	NC_008593	CCATAT	2	12	71870	71881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118443215
35	NC_008593	TCCATG	2	12	73194	73205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118443016
36	NC_008593	GAAAAG	2	12	76929	76940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444120
37	NC_008593	TAAAAA	2	12	78846	78857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118444677
38	NC_008593	CATTCT	2	12	80061	80072	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	118444270
39	NC_008593	ATTTAG	2	12	85090	85101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118443270
40	NC_008593	TTGATA	2	12	85795	85806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118443270
41	NC_008593	TAGATT	2	12	91349	91360	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118444261
42	NC_008593	AGATAA	2	12	91839	91850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118444261
43	NC_008593	ATGATA	2	12	92312	92323	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118444261
44	NC_008593	TGGAGA	2	12	92533	92544	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	118444261
45	NC_008593	TATAAA	2	12	92905	92916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443848
46	NC_008593	ATTAAA	2	12	95718	95729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443187
47	NC_008593	TTTAAT	2	12	97084	97095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444097
48	NC_008593	GAAAAA	2	12	99302	99313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118443679
49	NC_008593	ATTTTT	2	12	99710	99721	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118443698
50	NC_008593	TAAAAA	2	12	103074	103085	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118442888
51	NC_008593	AAAGAT	2	12	103530	103541	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118443394
52	NC_008593	TATTTG	2	12	103607	103618	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118443394
53	NC_008593	AGGAAC	2	12	106624	106635	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118443155
54	NC_008593	GCAAGT	2	12	107399	107410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118443431
55	NC_008593	CAGGAG	2	12	107862	107873	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	118443431
56	NC_008593	GGTTGA	2	12	111260	111271	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	118443699
57	NC_008593	TGCACT	2	12	111793	111804	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118444265
58	NC_008593	TATTTG	2	12	111930	111941	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118444265
59	NC_008593	AGAAAA	2	12	114678	114689	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118443314
60	NC_008593	TAAAAT	2	12	117391	117402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444072
61	NC_008593	ACAGGA	2	12	117752	117763	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118444591
62	NC_008593	TGAAAA	2	12	121687	121698	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118443264
63	NC_008593	AAAGGA	2	12	124625	124636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118443393
64	NC_008593	CAAACT	2	12	125205	125216	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	118443393
65	NC_008593	TAAAGA	2	12	125384	125395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118443393
66	NC_008593	TTGATA	2	12	127520	127531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118442897
67	NC_008593	TACAAA	2	12	130676	130687	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118444695
68	NC_008593	GCAGAA	2	12	135037	135048	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118444629
69	NC_008593	ATTAAG	2	12	135054	135065	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118444629
70	NC_008593	AGTAGA	2	12	135573	135584	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118444629
71	NC_008593	GAAAAA	2	12	138425	138436	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118443619
72	NC_008593	TATATT	2	12	141074	141085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118444361
73	NC_008593	TATTGA	2	12	141353	141364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118444361
74	NC_008593	ATATTA	2	12	142146	142157	50 %	50 %	0 %	0 %	118444361
75	NC_008593	ATTAAC	2	12	143237	143248	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118444361
76	NC_008593	GCTTAT	2	12	143712	143723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	118444361
77	NC_008593	AAAGTA	2	12	145494	145505	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118443543
78	NC_008593	TACCTA	2	12	147793	147804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118444612
79	NC_008593	TTATAT	2	12	150971	150982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443675
80	NC_008593	AAATAT	2	12	151182	151193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443675
81	NC_008593	GAAAAG	2	12	151820	151831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444683
82	NC_008593	TATATT	2	12	153328	153339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118443535
83	NC_008593	TGATAA	2	12	154111	154122	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118443535
84	NC_008593	ATAAAA	2	12	154566	154577	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	118443535
85	NC_008593	TTGAAG	2	12	157201	157212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443133
86	NC_008593	TATAAA	2	12	162291	162302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118443370
87	NC_008593	AGGAGA	2	12	162648	162659	50 %	0 %	50 %	0 %	118443370
88	NC_008593	GCAATG	2	12	163260	163271	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	118442953
89	NC_008593	GTAAAA	2	12	164268	164279	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118444643
90	NC_008593	TAGATA	2	12	165215	165226	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118444238
91	NC_008593	TAGGAA	2	12	168350	168361	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118444015
92	NC_008593	ATTTTG	2	12	175819	175830	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	118443031
93	NC_008593	TAATGA	2	12	179861	179872	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118443872
94	NC_008593	GAAAAA	2	12	180682	180693	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	118444399
95	NC_008593	TTGTAG	2	12	180959	180970	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118444399
96	NC_008593	TAAAAG	2	12	181933	181944	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118443051
97	NC_008593	ATCCAG	2	12	182553	182564	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	118444080
98	NC_008593	AAAGAT	2	12	183155	183166	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118444080
99	NC_008593	AGTAGA	2	12	185673	185684	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	118442966
100	NC_008593	TTTTTA	2	12	186990	187001	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	118443795
101	NC_008593	TTTAAA	2	12	188517	188528	50 %	50 %	0 %	0 %	118444156
102	NC_008593	GAAAAG	2	12	191784	191795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118444343
103	NC_008593	TAGATA	2	12	192159	192170	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	118443940
104	NC_008593	CAGAAG	2	12	195423	195434	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118444516
105	NC_008593	TTGAAG	2	12	195866	195877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118442945
106	NC_008593	AAATTA	2	12	196057	196068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118442945
107	NC_008593	TTAATA	2	12	197230	197241	50 %	50 %	0 %	0 %	118444217
108	NC_008593	TACTAA	2	12	199069	199080	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	118442860
109	NC_008593	GATTTG	2	12	201118	201129	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	118443645
110	NC_008593	TAAATA	2	12	204680	204691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118444688
111	NC_008593	ACTTGC	2	12	208708	208719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	118442912
112	NC_008593	TTAGAT	2	12	211490	211501	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	118444634
113	NC_008593	TGAAAA	2	12	213817	213828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118442910
114	NC_008593	AAAGAT	2	12	214100	214111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118442910
115	NC_008593	GCAAAA	2	12	217081	217092	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118443284
116	NC_008593	AAAGTA	2	12	219962	219973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118443261
117	NC_008593	AGAAGC	2	12	221236	221247	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	118444059
118	NC_008593	CAGTTG	2	12	222534	222545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	118443491
119	NC_008593	GGATTA	2	12	222659	222670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443491
120	NC_008593	ATTAGG	2	12	223655	223666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118443602
121	NC_008593	TCAAGA	2	12	224432	224443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	118443602
122	NC_008593	ATAAAC	2	12	225223	225234	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	118443602
123	NC_008593	CAAGAA	2	12	232019	232030	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	118444241
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352	NC_008593	AATGAA	2	12	625385	625396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	118444206
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