MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PV

Total Repeats: 2629

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008512	ATT	2	6	141	146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334903
2	NC_008512	ATT	2	6	178	183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334903
3	NC_008512	AAT	2	6	241	246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
4	NC_008512	TAA	2	6	368	373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
5	NC_008512	ATA	2	6	374	379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
6	NC_008512	TAA	2	6	482	487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
7	NC_008512	ATT	2	6	614	619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334903
8	NC_008512	AAT	2	6	636	641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
9	NC_008512	AGA	2	6	652	657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334903
10	NC_008512	TAC	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334903
11	NC_008512	TAT	2	6	741	746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334903
12	NC_008512	ATG	2	6	784	789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334903
13	NC_008512	CAG	2	6	794	799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334903
14	NC_008512	ATT	2	6	841	846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334903
15	NC_008512	TAA	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
16	NC_008512	AGA	2	6	1005	1010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334903
17	NC_008512	TAA	2	6	1037	1042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
18	NC_008512	TCT	2	6	1051	1056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334903
19	NC_008512	TAA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
20	NC_008512	ATA	2	6	1109	1114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
21	NC_008512	ATT	2	6	1133	1138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334903
22	NC_008512	TAA	2	6	1158	1163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
23	NC_008512	TAA	2	6	1266	1271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
24	NC_008512	TAA	2	6	1277	1282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334903
25	NC_008512	ATT	3	9	1332	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334904
26	NC_008512	AGC	2	6	1364	1369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116334904
27	NC_008512	TAA	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
28	NC_008512	AAT	2	6	1403	1408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
29	NC_008512	AGG	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116334904
30	NC_008512	TGG	2	6	1502	1507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334904
31	NC_008512	AAT	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
32	NC_008512	TAG	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334904
33	NC_008512	ATT	2	6	1550	1555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334904
34	NC_008512	ATT	2	6	1686	1691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334904
35	NC_008512	ATT	3	9	1749	1757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334904
36	NC_008512	TTA	2	6	1774	1779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334904
37	NC_008512	ATT	2	6	1915	1920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334904
38	NC_008512	TAA	3	9	1988	1996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
39	NC_008512	ATA	2	6	2023	2028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
40	NC_008512	TAA	2	6	2033	2038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
41	NC_008512	ATA	2	6	2146	2151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
42	NC_008512	ATC	2	6	2155	2160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334904
43	NC_008512	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
44	NC_008512	ATT	2	6	2317	2322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334904
45	NC_008512	TAA	2	6	2366	2371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
46	NC_008512	GAA	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334904
47	NC_008512	CTT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334904
48	NC_008512	TTG	2	6	2434	2439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116334904
49	NC_008512	TAA	2	6	2623	2628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
50	NC_008512	TTA	2	6	2636	2641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334904
51	NC_008512	TAA	2	6	2761	2766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
52	NC_008512	AAT	2	6	2812	2817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334904
53	NC_008512	ATT	4	12	2856	2867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334905
54	NC_008512	TAA	2	6	2901	2906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334905
55	NC_008512	ATT	2	6	2916	2921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334905
56	NC_008512	TTA	2	6	2942	2947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334905
57	NC_008512	TAA	2	6	3053	3058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334905
58	NC_008512	AAT	2	6	3129	3134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334905
59	NC_008512	AAT	2	6	3144	3149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334905
60	NC_008512	TAT	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334905
61	NC_008512	ATT	2	6	3297	3302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334905
62	NC_008512	AAT	2	6	3489	3494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334906
63	NC_008512	TTA	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334906
64	NC_008512	TCA	2	6	3510	3515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334906
65	NC_008512	ATC	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334906
66	NC_008512	AGG	2	6	3566	3571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116334906
67	NC_008512	TAT	2	6	3616	3621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334906
68	NC_008512	ATT	2	6	3647	3652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334906
69	NC_008512	TAT	2	6	3738	3743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334907
70	NC_008512	AAT	2	6	3831	3836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334907
71	NC_008512	TTA	2	6	3875	3880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334907
72	NC_008512	TTA	2	6	3889	3894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334907
73	NC_008512	TTA	2	6	3970	3975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334907
74	NC_008512	TTA	2	6	3989	3994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334907
75	NC_008512	ATA	3	9	4052	4060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334907
76	NC_008512	ATT	2	6	4066	4071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334907
77	NC_008512	ATT	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334907
78	NC_008512	ATT	2	6	4314	4319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334908
79	NC_008512	AAT	2	6	4358	4363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334909
80	NC_008512	AAT	2	6	4500	4505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334909
81	NC_008512	AAT	2	6	4589	4594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334909
82	NC_008512	ATT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
83	NC_008512	TAT	2	6	4817	4822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
84	NC_008512	ATT	2	6	4842	4847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
85	NC_008512	TCT	2	6	4878	4883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334909
86	NC_008512	TAA	2	6	4885	4890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334909
87	NC_008512	ATT	2	6	4893	4898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
88	NC_008512	ATT	2	6	4935	4940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
89	NC_008512	ATG	2	6	5050	5055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334909
90	NC_008512	ATT	2	6	5159	5164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
91	NC_008512	ATC	2	6	5171	5176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116334909
92	NC_008512	CTT	2	6	5275	5280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116334909
93	NC_008512	CAA	2	6	5287	5292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334909
94	NC_008512	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334909
95	NC_008512	GCT	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334909
96	NC_008512	ATT	2	6	5415	5420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
97	NC_008512	TAA	2	6	5524	5529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334909
98	NC_008512	ATG	2	6	5569	5574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334909
99	NC_008512	ATT	2	6	5603	5608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
100	NC_008512	ATT	2	6	5680	5685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
101	NC_008512	ACA	2	6	5722	5727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334909
102	NC_008512	TAA	2	6	5755	5760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334909
103	NC_008512	TAT	2	6	5782	5787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
104	NC_008512	ATT	2	6	5789	5794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334909
105	NC_008512	AAC	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334910
106	NC_008512	TAT	3	9	5947	5955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334910
107	NC_008512	TAA	3	9	5982	5990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334910
108	NC_008512	AAT	2	6	6023	6028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334910
109	NC_008512	ATT	2	6	6032	6037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334910
110	NC_008512	TAA	3	9	6184	6192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334910
111	NC_008512	ATT	2	6	6245	6250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334910
112	NC_008512	ATA	2	6	6266	6271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334910
113	NC_008512	ATT	2	6	6303	6308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334910
114	NC_008512	TAA	2	6	6309	6314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334910
115	NC_008512	CTG	3	9	6429	6437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334910
116	NC_008512	TAA	2	6	6471	6476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334910
117	NC_008512	ATA	2	6	6521	6526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334910
118	NC_008512	GAA	2	6	6548	6553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334911
119	NC_008512	TAG	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334911
120	NC_008512	CAA	3	9	6661	6669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116334911
121	NC_008512	ATA	2	6	6677	6682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334911
122	NC_008512	GTA	2	6	6704	6709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334911
123	NC_008512	ATA	2	6	6821	6826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334911
124	NC_008512	ATT	2	6	6835	6840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334911
125	NC_008512	ATA	2	6	6902	6907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334911
126	NC_008512	AGG	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116334911
127	NC_008512	TGG	2	6	6978	6983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116334911
128	NC_008512	ATG	2	6	7009	7014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116334911
129	NC_008512	TAA	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334911
130	NC_008512	TAT	2	6	7102	7107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334911
131	NC_008512	AGA	2	6	7215	7220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334911
132	NC_008512	ATA	2	6	7259	7264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116334911
133	NC_008512	ATT	2	6	7302	7307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116334911
134	NC_008512	GAA	2	6	7310	7315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116334911
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137	NC_008512	CTG	2	6	7430	7435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116334911
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