MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 6465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008262	TA	4	8	1167	1174	50 %	50 %	0 %	0 %	110803386
2	NC_008262	CT	3	6	1240	1245	0 %	50 %	0 %	50 %	110803386
3	NC_008262	GA	3	6	2126	2131	50 %	0 %	50 %	0 %	110803106
4	NC_008262	TA	3	6	3394	3399	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
5	NC_008262	TA	3	6	3516	3521	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
6	NC_008262	CA	3	6	3542	3547	50 %	0 %	0 %	50 %	110802319
7	NC_008262	TC	3	6	3740	3745	0 %	50 %	0 %	50 %	110802319
8	NC_008262	AT	3	6	3919	3924	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
9	NC_008262	GA	3	6	3947	3952	50 %	0 %	50 %	0 %	110802319
10	NC_008262	AT	3	6	3975	3980	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
11	NC_008262	AT	3	6	4053	4058	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
12	NC_008262	AT	4	8	4178	4185	50 %	50 %	0 %	0 %	110802319
13	NC_008262	GA	3	6	4506	4511	50 %	0 %	50 %	0 %	110802474
14	NC_008262	AT	3	6	6540	6545	50 %	50 %	0 %	0 %	110803693
15	NC_008262	GA	3	6	6546	6551	50 %	0 %	50 %	0 %	110803693
16	NC_008262	TA	3	6	6574	6579	50 %	50 %	0 %	0 %	110803693
17	NC_008262	TA	3	6	6593	6598	50 %	50 %	0 %	0 %	110803693
18	NC_008262	AG	3	6	6618	6623	50 %	0 %	50 %	0 %	110803693
19	NC_008262	AT	3	6	6896	6901	50 %	50 %	0 %	0 %	110803693
20	NC_008262	AT	3	6	7221	7226	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
21	NC_008262	AT	3	6	7743	7748	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
22	NC_008262	AG	3	6	7841	7846	50 %	0 %	50 %	0 %	110801534
23	NC_008262	TA	3	6	7877	7882	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
24	NC_008262	TA	3	6	7978	7983	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
25	NC_008262	AG	4	8	8040	8047	50 %	0 %	50 %	0 %	110801534
26	NC_008262	AC	3	6	8141	8146	50 %	0 %	0 %	50 %	110801534
27	NC_008262	AT	3	6	8457	8462	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
28	NC_008262	AG	3	6	8498	8503	50 %	0 %	50 %	0 %	110801534
29	NC_008262	AC	3	6	8572	8577	50 %	0 %	0 %	50 %	110801534
30	NC_008262	AT	3	6	8678	8683	50 %	50 %	0 %	0 %	110801534
31	NC_008262	AG	3	6	15440	15445	50 %	0 %	50 %	0 %	110801545
32	NC_008262	AT	4	8	15591	15598	50 %	50 %	0 %	0 %	110801545
33	NC_008262	TA	3	6	16357	16362	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
34	NC_008262	AT	3	6	16560	16565	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
35	NC_008262	TA	3	6	16654	16659	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
36	NC_008262	AG	3	6	17760	17765	50 %	0 %	50 %	0 %	110802161
37	NC_008262	AT	3	6	17806	17811	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
38	NC_008262	TA	3	6	17903	17908	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
39	NC_008262	AT	3	6	18005	18010	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
40	NC_008262	GA	3	6	18192	18197	50 %	0 %	50 %	0 %	110802161
41	NC_008262	TA	4	8	18448	18455	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
42	NC_008262	TA	3	6	18541	18546	50 %	50 %	0 %	0 %	110802161
43	NC_008262	AG	3	6	19439	19444	50 %	0 %	50 %	0 %	110803344
44	NC_008262	AT	3	6	20061	20066	50 %	50 %	0 %	0 %	110803344
45	NC_008262	AT	3	6	20417	20422	50 %	50 %	0 %	0 %	110803344
46	NC_008262	AG	3	6	20428	20433	50 %	0 %	50 %	0 %	110803344
47	NC_008262	AT	3	6	20543	20548	50 %	50 %	0 %	0 %	110803928
48	NC_008262	GA	3	6	21351	21356	50 %	0 %	50 %	0 %	110801909
49	NC_008262	AG	3	6	21642	21647	50 %	0 %	50 %	0 %	110801909
50	NC_008262	AC	3	6	21675	21680	50 %	0 %	0 %	50 %	110801909
51	NC_008262	AT	3	6	22368	22373	50 %	50 %	0 %	0 %	110801909
52	NC_008262	AT	3	6	22739	22744	50 %	50 %	0 %	0 %	110802696
53	NC_008262	AT	3	6	24547	24552	50 %	50 %	0 %	0 %	110802429
54	NC_008262	TA	3	6	25027	25032	50 %	50 %	0 %	0 %	110803720
55	NC_008262	AT	3	6	25081	25086	50 %	50 %	0 %	0 %	110803720
56	NC_008262	AT	3	6	25150	25155	50 %	50 %	0 %	0 %	110803720
57	NC_008262	AT	4	8	25256	25263	50 %	50 %	0 %	0 %	110803720
58	NC_008262	CT	4	8	25877	25884	0 %	50 %	0 %	50 %	110801704
59	NC_008262	TA	3	6	26202	26207	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
60	NC_008262	AT	3	6	26985	26990	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
61	NC_008262	AT	3	6	27158	27163	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
62	NC_008262	AG	3	6	27175	27180	50 %	0 %	50 %	0 %	110802216
63	NC_008262	AG	3	6	27217	27222	50 %	0 %	50 %	0 %	110802216
64	NC_008262	TA	3	6	27280	27285	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
65	NC_008262	AG	3	6	27586	27591	50 %	0 %	50 %	0 %	110802216
66	NC_008262	AG	3	6	28542	28547	50 %	0 %	50 %	0 %	110802216
67	NC_008262	TA	3	6	28573	28578	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
68	NC_008262	AT	3	6	28609	28614	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
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71	NC_008262	AT	3	6	29543	29548	50 %	50 %	0 %	0 %	110802216
72	NC_008262	GA	5	10	29854	29863	50 %	0 %	50 %	0 %	110802763
73	NC_008262	AT	4	8	30402	30409	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
74	NC_008262	TA	4	8	30967	30974	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
75	NC_008262	AT	3	6	31012	31017	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
76	NC_008262	AG	3	6	31025	31030	50 %	0 %	50 %	0 %	110802763
77	NC_008262	TA	3	6	31223	31228	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
78	NC_008262	TA	3	6	31640	31645	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
79	NC_008262	GA	3	6	31831	31836	50 %	0 %	50 %	0 %	110802763
80	NC_008262	TA	3	6	32744	32749	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
81	NC_008262	AG	3	6	32793	32798	50 %	0 %	50 %	0 %	110802763
82	NC_008262	TA	3	6	32990	32995	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
83	NC_008262	TA	3	6	33147	33152	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
84	NC_008262	TA	3	6	33366	33371	50 %	50 %	0 %	0 %	110802763
85	NC_008262	AT	3	6	33702	33707	50 %	50 %	0 %	0 %	110802983
86	NC_008262	AT	3	6	33726	33731	50 %	50 %	0 %	0 %	110802983
87	NC_008262	AT	3	6	34745	34750	50 %	50 %	0 %	0 %	110802983
88	NC_008262	AT	3	6	35055	35060	50 %	50 %	0 %	0 %	110803547
89	NC_008262	AT	3	6	35447	35452	50 %	50 %	0 %	0 %	110803547
90	NC_008262	AT	4	8	36523	36530	50 %	50 %	0 %	0 %	110803943
91	NC_008262	AT	3	6	36805	36810	50 %	50 %	0 %	0 %	110803943
92	NC_008262	AC	3	6	37841	37846	50 %	0 %	0 %	50 %	110803414
93	NC_008262	AT	3	6	38369	38374	50 %	50 %	0 %	0 %	110803414
94	NC_008262	AT	4	8	38409	38416	50 %	50 %	0 %	0 %	110803414
95	NC_008262	TA	3	6	38665	38670	50 %	50 %	0 %	0 %	110803370
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97	NC_008262	AT	3	6	39350	39355	50 %	50 %	0 %	0 %	110803370
98	NC_008262	TA	3	6	40407	40412	50 %	50 %	0 %	0 %	110803517
99	NC_008262	AC	3	6	40923	40928	50 %	0 %	0 %	50 %	110803517
100	NC_008262	CT	3	6	41394	41399	0 %	50 %	0 %	50 %	110802920
101	NC_008262	TA	3	6	42049	42054	50 %	50 %	0 %	0 %	110802920
102	NC_008262	AG	3	6	42657	42662	50 %	0 %	50 %	0 %	110802708
103	NC_008262	AG	3	6	42697	42702	50 %	0 %	50 %	0 %	110802708
104	NC_008262	GA	3	6	43938	43943	50 %	0 %	50 %	0 %	110801484
105	NC_008262	GA	4	8	44113	44120	50 %	0 %	50 %	0 %	110801484
106	NC_008262	TG	3	6	44626	44631	0 %	50 %	50 %	0 %	110803707
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108	NC_008262	AT	3	6	46247	46252	50 %	50 %	0 %	0 %	110801812
109	NC_008262	TA	3	6	46536	46541	50 %	50 %	0 %	0 %	110802546
110	NC_008262	TA	3	6	47403	47408	50 %	50 %	0 %	0 %	110802546
111	NC_008262	AT	3	6	47457	47462	50 %	50 %	0 %	0 %	110802546
112	NC_008262	AT	3	6	47633	47638	50 %	50 %	0 %	0 %	110802546
113	NC_008262	AT	3	6	47756	47761	50 %	50 %	0 %	0 %	110802546
114	NC_008262	AT	3	6	48942	48947	50 %	50 %	0 %	0 %	110802823
115	NC_008262	AG	3	6	50719	50724	50 %	0 %	50 %	0 %	110802115
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118	NC_008262	TA	3	6	53528	53533	50 %	50 %	0 %	0 %	110802679
119	NC_008262	TA	3	6	53572	53577	50 %	50 %	0 %	0 %	110802679
120	NC_008262	TA	3	6	54670	54675	50 %	50 %	0 %	0 %	110802003
121	NC_008262	AT	3	6	55482	55487	50 %	50 %	0 %	0 %	110802801
122	NC_008262	AT	3	6	56389	56394	50 %	50 %	0 %	0 %	110802801
123	NC_008262	AT	3	6	56517	56522	50 %	50 %	0 %	0 %	110802801
124	NC_008262	GA	3	6	57523	57528	50 %	0 %	50 %	0 %	110802411
125	NC_008262	AT	3	6	57539	57544	50 %	50 %	0 %	0 %	110802411
126	NC_008262	TA	3	6	57858	57863	50 %	50 %	0 %	0 %	110802027
127	NC_008262	TA	3	6	58116	58121	50 %	50 %	0 %	0 %	110802027
128	NC_008262	TA	3	6	58536	58541	50 %	50 %	0 %	0 %	110802027
129	NC_008262	AT	4	8	58865	58872	50 %	50 %	0 %	0 %	110802620
130	NC_008262	TA	3	6	58883	58888	50 %	50 %	0 %	0 %	110802620
131	NC_008262	AT	3	6	58991	58996	50 %	50 %	0 %	0 %	110802620
132	NC_008262	AG	3	6	59364	59369	50 %	0 %	50 %	0 %	110802620
133	NC_008262	AT	3	6	60152	60157	50 %	50 %	0 %	0 %	110802975
134	NC_008262	TA	4	8	60278	60285	50 %	50 %	0 %	0 %	110802975
135	NC_008262	AT	3	6	60314	60319	50 %	50 %	0 %	0 %	110802975
136	NC_008262	AG	3	6	60837	60842	50 %	0 %	50 %	0 %	110803673
137	NC_008262	GA	3	6	61457	61462	50 %	0 %	50 %	0 %	110803673
138	NC_008262	TA	3	6	62184	62189	50 %	50 %	0 %	0 %	110803673
139	NC_008262	AT	3	6	62314	62319	50 %	50 %	0 %	0 %	110803673
140	NC_008262	TA	3	6	62353	62358	50 %	50 %	0 %	0 %	110803673
141	NC_008262	TG	3	6	63256	63261	0 %	50 %	50 %	0 %	110802201
142	NC_008262	TA	3	6	63597	63602	50 %	50 %	0 %	0 %	110802201
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