MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 2282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008262	ATTCA	2	10	908	917	40 %	40 %	0 %	20 %	110803386
2	NC_008262	ACAAT	2	10	2459	2468	60 %	20 %	0 %	20 %	110803106
3	NC_008262	AACTA	2	10	8763	8772	60 %	20 %	0 %	20 %	110801534
4	NC_008262	ATATT	2	10	8894	8903	40 %	60 %	0 %	0 %	110801534
5	NC_008262	ATTAT	2	10	15494	15503	40 %	60 %	0 %	0 %	110801545
6	NC_008262	AAATG	2	10	17059	17068	60 %	20 %	20 %	0 %	110802161
7	NC_008262	ATATA	2	10	17308	17317	60 %	40 %	0 %	0 %	110802161
8	NC_008262	AGAAT	2	10	18471	18480	60 %	20 %	20 %	0 %	110802161
9	NC_008262	TGAAA	2	10	18634	18643	60 %	20 %	20 %	0 %	110802161
10	NC_008262	ATTAA	2	10	18915	18924	60 %	40 %	0 %	0 %	110802161
11	NC_008262	TTAGA	2	10	19622	19631	40 %	40 %	20 %	0 %	110803344
12	NC_008262	TAAAT	2	10	20145	20154	60 %	40 %	0 %	0 %	110803344
13	NC_008262	ATAAA	2	10	21365	21374	80 %	20 %	0 %	0 %	110801909
14	NC_008262	TAAAA	2	10	24574	24583	80 %	20 %	0 %	0 %	110802429
15	NC_008262	TAGAA	2	10	25707	25716	60 %	20 %	20 %	0 %	110803720
16	NC_008262	TAAAT	2	10	27687	27696	60 %	40 %	0 %	0 %	110802216
17	NC_008262	AAAAT	2	10	28511	28520	80 %	20 %	0 %	0 %	110802216
18	NC_008262	TAAAT	2	10	28998	29007	60 %	40 %	0 %	0 %	110802216
19	NC_008262	AGCAA	2	10	31966	31975	60 %	0 %	20 %	20 %	110802763
20	NC_008262	GATTG	2	10	32483	32492	20 %	40 %	40 %	0 %	110802763
21	NC_008262	ATCAC	2	10	35671	35680	40 %	20 %	0 %	40 %	110803547
22	NC_008262	TTTCC	2	10	36169	36178	0 %	60 %	0 %	40 %	110803943
23	NC_008262	AGAAA	2	10	38131	38140	80 %	0 %	20 %	0 %	110803414
24	NC_008262	AAATA	2	10	42627	42636	80 %	20 %	0 %	0 %	110802708
25	NC_008262	TGATA	2	10	44190	44199	40 %	40 %	20 %	0 %	110801484
26	NC_008262	ATGAA	2	10	44913	44922	60 %	20 %	20 %	0 %	110803166
27	NC_008262	ATGTT	2	10	45231	45240	20 %	60 %	20 %	0 %	110803166
28	NC_008262	TCATA	2	10	45931	45940	40 %	40 %	0 %	20 %	110801812
29	NC_008262	AAATA	2	10	47145	47154	80 %	20 %	0 %	0 %	110802546
30	NC_008262	TATAA	2	10	49339	49348	60 %	40 %	0 %	0 %	110802823
31	NC_008262	TTAAT	2	10	50821	50830	40 %	60 %	0 %	0 %	110802115
32	NC_008262	TAGTA	2	10	51109	51118	40 %	40 %	20 %	0 %	110801537
33	NC_008262	AATTT	2	10	51987	51996	40 %	60 %	0 %	0 %	110803179
34	NC_008262	AGTTA	2	10	52282	52291	40 %	40 %	20 %	0 %	110803179
35	NC_008262	AGGAA	2	10	53718	53727	60 %	0 %	40 %	0 %	110802679
36	NC_008262	TTATT	2	10	57555	57564	20 %	80 %	0 %	0 %	110802411
37	NC_008262	TTTAT	2	10	57811	57820	20 %	80 %	0 %	0 %	110802411
38	NC_008262	TATTT	2	10	58370	58379	20 %	80 %	0 %	0 %	110802027
39	NC_008262	ATTTA	2	10	58385	58394	40 %	60 %	0 %	0 %	110802027
40	NC_008262	AATTT	2	10	58697	58706	40 %	60 %	0 %	0 %	110802620
41	NC_008262	AATAA	2	10	59735	59744	80 %	20 %	0 %	0 %	110803070
42	NC_008262	TTTCT	2	10	64973	64982	0 %	80 %	0 %	20 %	110801801
43	NC_008262	TTTAG	2	10	65073	65082	20 %	60 %	20 %	0 %	110801801
44	NC_008262	ATTTA	2	10	66396	66405	40 %	60 %	0 %	0 %	110803119
45	NC_008262	AAGTT	2	10	67193	67202	40 %	40 %	20 %	0 %	110802391
46	NC_008262	TAAAT	2	10	69589	69598	60 %	40 %	0 %	0 %	110801940
47	NC_008262	GGAAT	2	10	70187	70196	40 %	20 %	40 %	0 %	110802685
48	NC_008262	GTTTA	2	10	72694	72703	20 %	60 %	20 %	0 %	110801674
49	NC_008262	AAGAT	2	10	72766	72775	60 %	20 %	20 %	0 %	110801674
50	NC_008262	TATAA	2	10	72894	72903	60 %	40 %	0 %	0 %	110801674
51	NC_008262	TAGTT	2	10	73196	73205	20 %	60 %	20 %	0 %	110801674
52	NC_008262	GAGTA	2	10	73368	73377	40 %	20 %	40 %	0 %	110802367
53	NC_008262	AAAAT	2	10	74013	74022	80 %	20 %	0 %	0 %	110802367
54	NC_008262	AAGTT	2	10	81867	81876	40 %	40 %	20 %	0 %	110803445
55	NC_008262	AGATA	2	10	84850	84859	60 %	20 %	20 %	0 %	110803125
56	NC_008262	TTGGA	2	10	91892	91901	20 %	40 %	40 %	0 %	110803423
57	NC_008262	ATATT	2	10	92605	92614	40 %	60 %	0 %	0 %	110803423
58	NC_008262	GAAAA	2	10	93579	93588	80 %	0 %	20 %	0 %	110802271
59	NC_008262	AAAAT	2	10	93606	93615	80 %	20 %	0 %	0 %	110802271
60	NC_008262	GAAAA	2	10	94078	94087	80 %	0 %	20 %	0 %	110802271
61	NC_008262	GATTT	2	10	94743	94752	20 %	60 %	20 %	0 %	110802271
62	NC_008262	AAGGA	2	10	100936	100945	60 %	0 %	40 %	0 %	110802434
63	NC_008262	TTATA	2	10	104940	104949	40 %	60 %	0 %	0 %	110803021
64	NC_008262	ATTAT	2	10	113111	113120	40 %	60 %	0 %	0 %	110803548
65	NC_008262	CTTTA	2	10	123272	123281	20 %	60 %	0 %	20 %	110802289
66	NC_008262	GAAAA	2	10	123686	123695	80 %	0 %	20 %	0 %	110802289
67	NC_008262	GATAA	2	10	124189	124198	60 %	20 %	20 %	0 %	110802289
68	NC_008262	AAATT	2	10	124706	124715	60 %	40 %	0 %	0 %	110802289
69	NC_008262	TACAT	2	10	124872	124881	40 %	40 %	0 %	20 %	110802289
70	NC_008262	TGGAA	2	10	125073	125082	40 %	20 %	40 %	0 %	110802289
71	NC_008262	GAATG	2	10	129128	129137	40 %	20 %	40 %	0 %	110803299
72	NC_008262	CTAAT	2	10	130753	130762	40 %	40 %	0 %	20 %	110803647
73	NC_008262	TAATT	2	10	133723	133732	40 %	60 %	0 %	0 %	110802139
74	NC_008262	CTATT	2	10	135296	135305	20 %	60 %	0 %	20 %	110802030
75	NC_008262	TAACA	2	10	139402	139411	60 %	20 %	0 %	20 %	110803728
76	NC_008262	GCAAG	2	10	140701	140710	40 %	0 %	40 %	20 %	110802967
77	NC_008262	GATTA	2	10	140948	140957	40 %	40 %	20 %	0 %	110802967
78	NC_008262	ATTTT	2	10	143424	143433	20 %	80 %	0 %	0 %	110803411
79	NC_008262	TATAT	2	10	146693	146702	40 %	60 %	0 %	0 %	110803481
80	NC_008262	TAGAT	2	10	147169	147178	40 %	40 %	20 %	0 %	110801908
81	NC_008262	AAGAG	2	10	147221	147230	60 %	0 %	40 %	0 %	110801908
82	NC_008262	TATTT	2	10	147964	147973	20 %	80 %	0 %	0 %	110802284
83	NC_008262	TGGAA	2	10	150693	150702	40 %	20 %	40 %	0 %	110803520
84	NC_008262	ATTAA	2	10	150949	150958	60 %	40 %	0 %	0 %	110803520
85	NC_008262	AGAAA	2	10	152686	152695	80 %	0 %	20 %	0 %	110803062
86	NC_008262	TAACA	2	10	155897	155906	60 %	20 %	0 %	20 %	110803468
87	NC_008262	TACCA	2	10	156873	156882	40 %	20 %	0 %	40 %	110802821
88	NC_008262	TGCTA	2	10	157570	157579	20 %	40 %	20 %	20 %	110802821
89	NC_008262	AATTG	2	10	157630	157639	40 %	40 %	20 %	0 %	110802821
90	NC_008262	ATTAT	2	10	158031	158040	40 %	60 %	0 %	0 %	110802558
91	NC_008262	ATTTA	2	10	158042	158051	40 %	60 %	0 %	0 %	110802558
92	NC_008262	AAGAG	2	10	158672	158681	60 %	0 %	40 %	0 %	110801845
93	NC_008262	TGTCA	2	10	161688	161697	20 %	40 %	20 %	20 %	110803371
94	NC_008262	ATTTA	2	10	164348	164357	40 %	60 %	0 %	0 %	110803198
95	NC_008262	TAAAA	2	10	168349	168358	80 %	20 %	0 %	0 %	258676974
96	NC_008262	ATAAA	2	10	168504	168513	80 %	20 %	0 %	0 %	258676974
97	NC_008262	CAAAT	2	10	172098	172107	60 %	20 %	0 %	20 %	110803189
98	NC_008262	TTATA	2	10	172604	172613	40 %	60 %	0 %	0 %	110803767
99	NC_008262	TATAT	2	10	173653	173662	40 %	60 %	0 %	0 %	110801681
100	NC_008262	ATTTT	2	10	174015	174024	20 %	80 %	0 %	0 %	110801681
101	NC_008262	ATTAT	2	10	176664	176673	40 %	60 %	0 %	0 %	110802896
102	NC_008262	AGAAA	2	10	180799	180808	80 %	0 %	20 %	0 %	110802268
103	NC_008262	ATTAA	2	10	180938	180947	60 %	40 %	0 %	0 %	110802268
104	NC_008262	AGAAA	2	10	182370	182379	80 %	0 %	20 %	0 %	110802889
105	NC_008262	AAAGA	2	10	182695	182704	80 %	0 %	20 %	0 %	110802889
106	NC_008262	ACTTT	2	10	183327	183336	20 %	60 %	0 %	20 %	110803407
107	NC_008262	TGATT	2	10	187667	187676	20 %	60 %	20 %	0 %	110803180
108	NC_008262	TTATT	2	10	189458	189467	20 %	80 %	0 %	0 %	110802239
109	NC_008262	AAATA	2	10	192646	192655	80 %	20 %	0 %	0 %	110802773
110	NC_008262	AAGAA	2	10	193590	193599	80 %	0 %	20 %	0 %	110803740
111	NC_008262	AAGGA	2	10	193808	193817	60 %	0 %	40 %	0 %	110803740
112	NC_008262	TTACT	2	10	193954	193963	20 %	60 %	0 %	20 %	110803740
113	NC_008262	ATGGA	2	10	194924	194933	40 %	20 %	40 %	0 %	110801712
114	NC_008262	AAATT	2	10	195013	195022	60 %	40 %	0 %	0 %	110801712
115	NC_008262	ATTCA	2	10	195961	195970	40 %	40 %	0 %	20 %	110801917
116	NC_008262	TAAAT	2	10	196660	196669	60 %	40 %	0 %	0 %	110801917
117	NC_008262	GCTAT	2	10	196924	196933	20 %	40 %	20 %	20 %	110801917
118	NC_008262	GAAAA	2	10	197043	197052	80 %	0 %	20 %	0 %	110801917
119	NC_008262	CTTTA	2	10	199261	199270	20 %	60 %	0 %	20 %	110803242
120	NC_008262	TTTAT	2	10	199277	199286	20 %	80 %	0 %	0 %	110803242
121	NC_008262	AATAG	2	10	200063	200072	60 %	20 %	20 %	0 %	110803242
122	NC_008262	ACAAA	2	10	202498	202507	80 %	0 %	0 %	20 %	110803242
123	NC_008262	GTGGA	2	10	205511	205520	20 %	20 %	60 %	0 %	110802969
124	NC_008262	TTTGA	2	10	206799	206808	20 %	60 %	20 %	0 %	110803436
125	NC_008262	CAATT	2	10	207653	207662	40 %	40 %	0 %	20 %	110803266
126	NC_008262	ATAGC	2	10	207712	207721	40 %	20 %	20 %	20 %	110803266
127	NC_008262	ATGGT	2	10	208409	208418	20 %	40 %	40 %	0 %	110803266
128	NC_008262	CATAA	2	10	211972	211981	60 %	20 %	0 %	20 %	110803150
129	NC_008262	TTATT	2	10	212300	212309	20 %	80 %	0 %	0 %	110802440
130	NC_008262	GAAGT	2	10	213788	213797	40 %	20 %	40 %	0 %	110803631
131	NC_008262	AAAGA	2	10	215331	215340	80 %	0 %	20 %	0 %	110801754
132	NC_008262	GAAAA	2	10	220229	220238	80 %	0 %	20 %	0 %	110802554
133	NC_008262	AGTAG	2	10	225923	225932	40 %	20 %	40 %	0 %	110803084
134	NC_008262	AGAGG	2	10	226032	226041	40 %	0 %	60 %	0 %	110801709
135	NC_008262	AAAAG	2	10	226378	226387	80 %	0 %	20 %	0 %	110801709
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