MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 63743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008262	GTT	2	6	212593	212598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110802440
4002	NC_008262	TTTA	2	8	212607	212614	25 %	75 %	0 %	0 %	110802440
4003	NC_008262	TTC	2	6	212775	212780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110802440
4004	NC_008262	T	7	7	212812	212818	0 %	100 %	0 %	0 %	110802440
4005	NC_008262	CCA	2	6	212886	212891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110802440
4006	NC_008262	ACA	2	6	212914	212919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110802440
4007	NC_008262	T	7	7	212935	212941	0 %	100 %	0 %	0 %	110802440
4008	NC_008262	TCA	2	6	213008	213013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110802440
4009	NC_008262	TA	3	6	213051	213056	50 %	50 %	0 %	0 %	110802440
4010	NC_008262	CTG	2	6	213101	213106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110802440
4011	NC_008262	A	6	6	213128	213133	100 %	0 %	0 %	0 %	110802440
4012	NC_008262	CTTT	2	8	213160	213167	0 %	75 %	0 %	25 %	110802440
4013	NC_008262	T	6	6	213165	213170	0 %	100 %	0 %	0 %	110802440
4014	NC_008262	A	7	7	213211	213217	100 %	0 %	0 %	0 %	110802440
4015	NC_008262	ATA	2	6	213595	213600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803631
4016	NC_008262	GAT	2	6	213618	213623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803631
4017	NC_008262	AATT	2	8	213698	213705	50 %	50 %	0 %	0 %	110803631
4018	NC_008262	CAA	3	9	213749	213757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110803631
4019	NC_008262	GAAGT	2	10	213788	213797	40 %	20 %	40 %	0 %	110803631
4020	NC_008262	AGA	2	6	213852	213857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803631
4021	NC_008262	T	6	6	213859	213864	0 %	100 %	0 %	0 %	110803631
4022	NC_008262	TGA	2	6	213915	213920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803631
4023	NC_008262	TA	3	6	213961	213966	50 %	50 %	0 %	0 %	110803631
4024	NC_008262	ATG	2	6	213979	213984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803631
4025	NC_008262	CAG	2	6	213986	213991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110803631
4026	NC_008262	GA	3	6	213999	214004	50 %	0 %	50 %	0 %	110803631
4027	NC_008262	AGA	2	6	214047	214052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803631
4028	NC_008262	AGAA	2	8	214141	214148	75 %	0 %	25 %	0 %	110803631
4029	NC_008262	TAT	2	6	214539	214544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803473
4030	NC_008262	AGC	2	6	214560	214565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110803473
4031	NC_008262	AGC	2	6	214578	214583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110803473
4032	NC_008262	TGA	2	6	214605	214610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803473
4033	NC_008262	AAG	2	6	214625	214630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803473
4034	NC_008262	AAT	2	6	214653	214658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803473
4035	NC_008262	GAT	2	6	214672	214677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803473
4036	NC_008262	TA	3	6	214687	214692	50 %	50 %	0 %	0 %	110803473
4037	NC_008262	GAAG	2	8	214704	214711	50 %	0 %	50 %	0 %	110803473
4038	NC_008262	AT	3	6	214841	214846	50 %	50 %	0 %	0 %	110803473
4039	NC_008262	AGA	2	6	214854	214859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803473
4040	NC_008262	AGA	2	6	214962	214967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803473
4041	NC_008262	GAA	2	6	215006	215011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803473
4042	NC_008262	AGA	2	6	215022	215027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803473
4043	NC_008262	AAAG	2	8	215031	215038	75 %	0 %	25 %	0 %	110803473
4044	NC_008262	CAG	2	6	215060	215065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110803473
4045	NC_008262	CAA	2	6	215092	215097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110803473
4046	NC_008262	AAAT	2	8	215125	215132	75 %	25 %	0 %	0 %	110803473
4047	NC_008262	TATT	2	8	215175	215182	25 %	75 %	0 %	0 %	110801754
4048	NC_008262	ATT	2	6	215187	215192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801754
4049	NC_008262	AAT	2	6	215241	215246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801754
4050	NC_008262	ATGT	2	8	215261	215268	25 %	50 %	25 %	0 %	110801754
4051	NC_008262	AGG	2	6	215289	215294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110801754
4052	NC_008262	TGA	2	6	215325	215330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801754
4053	NC_008262	AAAGA	2	10	215331	215340	80 %	0 %	20 %	0 %	110801754
4054	NC_008262	AAG	2	6	215414	215419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801754
4055	NC_008262	TAC	2	6	215439	215444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801754
4056	NC_008262	ATG	2	6	215456	215461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801754
4057	NC_008262	CAG	2	6	215468	215473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110801754
4058	NC_008262	CTA	2	6	215484	215489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110801754
4059	NC_008262	AAT	2	6	215529	215534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801754
4060	NC_008262	ATT	2	6	215635	215640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801754
4061	NC_008262	CAG	3	9	215654	215662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110801754
4062	NC_008262	TTA	2	6	215671	215676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801754
4063	NC_008262	TGA	2	6	215724	215729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801754
4064	NC_008262	ATG	2	6	215731	215736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801754
4065	NC_008262	GCT	2	6	215821	215826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110801754
4066	NC_008262	TAA	2	6	215879	215884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801754
4067	NC_008262	AAT	2	6	215896	215901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801754
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4069	NC_008262	AAG	2	6	215975	215980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801754
4070	NC_008262	GAA	2	6	215986	215991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801754
4071	NC_008262	TAA	2	6	216015	216020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801754
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4073	NC_008262	TAA	2	6	216031	216036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801754
4074	NC_008262	GTT	2	6	216171	216176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110802361
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4080	NC_008262	ATAAAG	2	12	216475	216486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	110802361
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4082	NC_008262	TAT	2	6	216568	216573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802361
4083	NC_008262	TTTA	2	8	216595	216602	25 %	75 %	0 %	0 %	110802361
4084	NC_008262	TAG	2	6	216607	216612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802361
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4089	NC_008262	TGG	2	6	216746	216751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110802361
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4091	NC_008262	AT	3	6	216826	216831	50 %	50 %	0 %	0 %	110802361
4092	NC_008262	TTA	2	6	216849	216854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802361
4093	NC_008262	GGA	3	9	216861	216869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110802361
4094	NC_008262	TCA	2	6	216882	216887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110802361
4095	NC_008262	TAC	4	12	216920	216931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110802361
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4102	NC_008262	TA	3	6	217139	217144	50 %	50 %	0 %	0 %	110802361
4103	NC_008262	TCAA	2	8	217154	217161	50 %	25 %	0 %	25 %	110802361
4104	NC_008262	CAA	2	6	217189	217194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110802361
4105	NC_008262	CAAA	2	8	217248	217255	75 %	0 %	0 %	25 %	110802361
4106	NC_008262	AT	4	8	217265	217272	50 %	50 %	0 %	0 %	110802361
4107	NC_008262	AAT	2	6	217295	217300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802361
4108	NC_008262	TGG	2	6	217322	217327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110802361
4109	NC_008262	TTC	2	6	217410	217415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110802361
4110	NC_008262	A	6	6	217416	217421	100 %	0 %	0 %	0 %	110802361
4111	NC_008262	TGG	2	6	217487	217492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110802361
4112	NC_008262	CTCAAT	2	12	217573	217584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110802361
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4114	NC_008262	TAC	2	6	217620	217625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110802361
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4118	NC_008262	ATT	2	6	217787	217792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110803219
4119	NC_008262	AAG	2	6	217808	217813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803219
4120	NC_008262	A	6	6	217827	217832	100 %	0 %	0 %	0 %	110803219
4121	NC_008262	TAA	2	6	217833	217838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110803219
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4123	NC_008262	AGA	2	6	217923	217928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110803219
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4494	NC_008262	TAA	2	6	244695	244700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802656
4495	NC_008262	AGAT	2	8	244711	244718	50 %	25 %	25 %	0 %	110802656
4496	NC_008262	A	6	6	244732	244737	100 %	0 %	0 %	0 %	110802656
4497	NC_008262	ATAG	2	8	244757	244764	50 %	25 %	25 %	0 %	110802656
4498	NC_008262	TAT	2	6	244768	244773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802656
4499	NC_008262	ATTT	2	8	244788	244795	25 %	75 %	0 %	0 %	110802656
4500	NC_008262	ATC	2	6	244798	244803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110802656

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