MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens SM101 chromosome

Total Repeats: 63743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_008262	ATT	2	6	73097	73102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801674
1503	NC_008262	AT	3	6	73166	73171	50 %	50 %	0 %	0 %	110801674
1504	NC_008262	TAA	2	6	73183	73188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801674
1505	NC_008262	TAGTT	2	10	73196	73205	20 %	60 %	20 %	0 %	110801674
1506	NC_008262	TAT	2	6	73271	73276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801674
1507	NC_008262	TACTTA	2	12	73314	73325	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	110801674
1508	NC_008262	AAG	2	6	73332	73337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801674
1509	NC_008262	A	6	6	73351	73356	100 %	0 %	0 %	0 %	110801674
1510	NC_008262	GAGTA	2	10	73368	73377	40 %	20 %	40 %	0 %	110802367
1511	NC_008262	ATA	2	6	73455	73460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802367
1512	NC_008262	TAAAAA	2	12	73493	73504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	110802367
1513	NC_008262	TTAAAT	2	12	73513	73524	50 %	50 %	0 %	0 %	110802367
1514	NC_008262	AGA	2	6	73532	73537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802367
1515	NC_008262	AAGA	2	8	73565	73572	75 %	0 %	25 %	0 %	110802367
1516	NC_008262	AT	3	6	73602	73607	50 %	50 %	0 %	0 %	110802367
1517	NC_008262	A	6	6	73634	73639	100 %	0 %	0 %	0 %	110802367
1518	NC_008262	ATTTAG	2	12	73651	73662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	110802367
1519	NC_008262	TAT	2	6	73681	73686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802367
1520	NC_008262	ATGT	2	8	73693	73700	25 %	50 %	25 %	0 %	110802367
1521	NC_008262	AT	3	6	73724	73729	50 %	50 %	0 %	0 %	110802367
1522	NC_008262	ATAAAT	2	12	73737	73748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802367
1523	NC_008262	AGA	2	6	73832	73837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802367
1524	NC_008262	ATT	2	6	73846	73851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802367
1525	NC_008262	CTA	2	6	73888	73893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110802367
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1527	NC_008262	AAAAT	2	10	74013	74022	80 %	20 %	0 %	0 %	110802367
1528	NC_008262	TTG	2	6	74059	74064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110802367
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1531	NC_008262	GA	3	6	74273	74278	50 %	0 %	50 %	0 %	110802367
1532	NC_008262	GTT	2	6	74425	74430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110802928
1533	NC_008262	AG	4	8	74466	74473	50 %	0 %	50 %	0 %	110802928
1534	NC_008262	TGT	2	6	74496	74501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110802928
1535	NC_008262	TAT	2	6	74527	74532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802928
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1537	NC_008262	AAG	2	6	74597	74602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802928
1538	NC_008262	TA	3	6	74637	74642	50 %	50 %	0 %	0 %	110802928
1539	NC_008262	TA	3	6	74708	74713	50 %	50 %	0 %	0 %	110802928
1540	NC_008262	A	6	6	74807	74812	100 %	0 %	0 %	0 %	110802928
1541	NC_008262	TAA	2	6	74862	74867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802928
1542	NC_008262	AG	3	6	74875	74880	50 %	0 %	50 %	0 %	110802928
1543	NC_008262	TC	3	6	74900	74905	0 %	50 %	0 %	50 %	110802928
1544	NC_008262	TGA	2	6	74925	74930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802928
1545	NC_008262	AGA	2	6	74952	74957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802928
1546	NC_008262	ATA	2	6	75008	75013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802928
1547	NC_008262	ATTTTC	2	12	80672	80683	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	110802721
1548	NC_008262	TGG	2	6	80696	80701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110802721
1549	NC_008262	AGT	3	9	80729	80737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802721
1550	NC_008262	TGA	2	6	80753	80758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802721
1551	NC_008262	TA	3	6	80769	80774	50 %	50 %	0 %	0 %	110802721
1552	NC_008262	GAA	2	6	80778	80783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802721
1553	NC_008262	AAGA	2	8	80787	80794	75 %	0 %	25 %	0 %	110802721
1554	NC_008262	AGA	2	6	80837	80842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802721
1555	NC_008262	TA	3	6	80893	80898	50 %	50 %	0 %	0 %	110802721
1556	NC_008262	A	7	7	80898	80904	100 %	0 %	0 %	0 %	110802721
1557	NC_008262	ATA	2	6	80914	80919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802721
1558	NC_008262	GAT	2	6	80958	80963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802721
1559	NC_008262	TAA	2	6	81026	81031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802721
1560	NC_008262	AGC	2	6	81041	81046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110802721
1561	NC_008262	A	6	6	81077	81082	100 %	0 %	0 %	0 %	110802721
1562	NC_008262	TAA	2	6	81095	81100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802721
1563	NC_008262	ATT	2	6	81101	81106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802721
1564	NC_008262	AAT	2	6	81120	81125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802721
1565	NC_008262	CTT	2	6	81157	81162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110802721
1566	NC_008262	AAG	2	6	81172	81177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802721
1567	NC_008262	ATG	2	6	81184	81189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802721
1568	NC_008262	ATA	2	6	81190	81195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802721
1569	NC_008262	T	6	6	81240	81245	0 %	100 %	0 %	0 %	110802721
1570	NC_008262	AAT	2	6	81246	81251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802721
1571	NC_008262	ATT	2	6	81260	81265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802721
1572	NC_008262	TAAA	2	8	81319	81326	75 %	25 %	0 %	0 %	110802721
1573	NC_008262	A	7	7	81324	81330	100 %	0 %	0 %	0 %	110802721
1574	NC_008262	TGT	2	6	81578	81583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110802721
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1577	NC_008262	TTA	2	6	81667	81672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802721
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1581	NC_008262	AGTT	2	8	81814	81821	25 %	50 %	25 %	0 %	110803445
1582	NC_008262	AAGTT	2	10	81867	81876	40 %	40 %	20 %	0 %	110803445
1583	NC_008262	TAG	2	6	81883	81888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110803445
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1593	NC_008262	TA	5	10	82347	82356	50 %	50 %	0 %	0 %	110801924
1594	NC_008262	TAAA	2	8	82373	82380	75 %	25 %	0 %	0 %	110801924
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1598	NC_008262	ATT	2	6	82531	82536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801924
1599	NC_008262	TTGG	2	8	82625	82632	0 %	50 %	50 %	0 %	110801924
1600	NC_008262	A	6	6	82639	82644	100 %	0 %	0 %	0 %	110801924
1601	NC_008262	TAA	2	6	82688	82693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801924
1602	NC_008262	ATA	2	6	82736	82741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801924
1603	NC_008262	T	7	7	82745	82751	0 %	100 %	0 %	0 %	110801924
1604	NC_008262	TATT	2	8	82768	82775	25 %	75 %	0 %	0 %	110801924
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1607	NC_008262	ACA	2	6	82826	82831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110801924
1608	NC_008262	AG	3	6	83175	83180	50 %	0 %	50 %	0 %	110802663
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1610	NC_008262	GAAT	2	8	83201	83208	50 %	25 %	25 %	0 %	110802663
1611	NC_008262	ATT	2	6	83243	83248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110802663
1612	NC_008262	AGGA	2	8	83284	83291	50 %	0 %	50 %	0 %	110802663
1613	NC_008262	AGTT	2	8	83357	83364	25 %	50 %	25 %	0 %	110802663
1614	NC_008262	AG	3	6	83411	83416	50 %	0 %	50 %	0 %	110802663
1615	NC_008262	ATA	2	6	83479	83484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110802663
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1618	NC_008262	AAG	2	6	83533	83538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110802663
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1623	NC_008262	ATAA	2	8	83667	83674	75 %	25 %	0 %	0 %	110802663
1624	NC_008262	AT	3	6	83676	83681	50 %	50 %	0 %	0 %	110802663
1625	NC_008262	TGA	2	6	83690	83695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110802663
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