MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 45112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008261	AGA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
2	NC_008261	AAT	2	6	426	431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
3	NC_008261	ATA	2	6	453	458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
4	NC_008261	ATA	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
5	NC_008261	TTA	2	6	594	599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799791
6	NC_008261	AGA	3	9	665	673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
7	NC_008261	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
8	NC_008261	ATG	2	6	721	726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
9	NC_008261	TGA	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
10	NC_008261	GCA	2	6	828	833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110799791
11	NC_008261	ATT	2	6	875	880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799791
12	NC_008261	GGA	2	6	888	893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110799791
13	NC_008261	TTC	2	6	940	945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799791
14	NC_008261	AGT	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
15	NC_008261	ATC	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799791
16	NC_008261	TTA	2	6	1003	1008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799791
17	NC_008261	GAT	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
18	NC_008261	TTA	2	6	1068	1073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799791
19	NC_008261	GAT	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
20	NC_008261	AAG	2	6	1114	1119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
21	NC_008261	TTC	2	6	1122	1127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799791
22	NC_008261	ATC	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799791
23	NC_008261	AGA	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
24	NC_008261	ACC	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110799791
25	NC_008261	CTA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799791
26	NC_008261	AAT	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
27	NC_008261	ATA	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
28	NC_008261	TAA	2	6	1478	1483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
29	NC_008261	ATT	2	6	1531	1536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799791
30	NC_008261	AGA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
31	NC_008261	GAA	2	6	1656	1661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
32	NC_008261	TGG	2	6	1664	1669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799791
33	NC_008261	TAC	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799791
34	NC_008261	TGA	2	6	1727	1732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
35	NC_008261	CAA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110798947
36	NC_008261	TAA	2	6	2308	2313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798947
37	NC_008261	AGA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798947
38	NC_008261	TTA	2	6	2397	2402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798947
39	NC_008261	AGA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798947
40	NC_008261	CTT	2	6	2500	2505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110798947
41	NC_008261	TTC	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110798947
42	NC_008261	TAT	2	6	2548	2553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798947
43	NC_008261	TAG	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798947
44	NC_008261	AGA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798947
45	NC_008261	ATT	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798947
46	NC_008261	ATG	2	6	2803	2808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798947
47	NC_008261	TTA	2	6	2811	2816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798947
48	NC_008261	TGA	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798947
49	NC_008261	AGA	2	6	2981	2986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798947
50	NC_008261	TAT	2	6	3113	3118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798947
51	NC_008261	AAG	2	6	3309	3314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799682
52	NC_008261	TGA	2	6	3466	3471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799682
53	NC_008261	AGA	2	6	3923	3928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801062
54	NC_008261	AAG	3	9	3959	3967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801062
55	NC_008261	TAT	2	6	4005	4010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801062
56	NC_008261	ATA	2	6	4027	4032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801062
57	NC_008261	AGA	2	6	4211	4216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801062
58	NC_008261	ATA	2	6	4255	4260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801062
59	NC_008261	GAT	2	6	4344	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801062
60	NC_008261	ATA	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801062
61	NC_008261	ATA	2	6	4446	4451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801062
62	NC_008261	TTA	3	9	4479	4487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801062
63	NC_008261	GAT	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801062
64	NC_008261	TAA	2	6	4561	4566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801062
65	NC_008261	AGA	2	6	4580	4585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801062
66	NC_008261	GTA	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800243
67	NC_008261	TTG	2	6	4793	4798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110800243
68	NC_008261	TCA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800243
69	NC_008261	ATG	2	6	5188	5193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
70	NC_008261	GTA	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
71	NC_008261	TCA	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799437
72	NC_008261	TTG	2	6	5299	5304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110799437
73	NC_008261	TGA	2	6	5315	5320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
74	NC_008261	TGA	2	6	5387	5392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
75	NC_008261	GGC	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110799437
76	NC_008261	TGG	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799437
77	NC_008261	GAA	2	6	5700	5705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
78	NC_008261	TGA	2	6	5786	5791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
79	NC_008261	AGA	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
80	NC_008261	AGA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
81	NC_008261	GGT	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799437
82	NC_008261	ATG	2	6	5884	5889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
83	NC_008261	ATG	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
84	NC_008261	TAA	2	6	5984	5989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799437
85	NC_008261	GGT	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799437
86	NC_008261	AGA	2	6	6066	6071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
87	NC_008261	CTG	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110799437
88	NC_008261	AGA	2	6	6257	6262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
89	NC_008261	TTA	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799437
90	NC_008261	AAG	2	6	6329	6334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
91	NC_008261	AAG	2	6	6368	6373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
92	NC_008261	TCA	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799437
93	NC_008261	TGG	2	6	6455	6460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799437
94	NC_008261	AAT	2	6	6518	6523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799437
95	NC_008261	ATA	2	6	6637	6642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799437
96	NC_008261	AAT	3	9	6644	6652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799437
97	NC_008261	TAT	2	6	6694	6699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799437
98	NC_008261	TTC	2	6	6705	6710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799437
99	NC_008261	ACC	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110799437
100	NC_008261	TGC	3	9	6815	6823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110799437
101	NC_008261	ATA	2	6	6831	6836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799437
102	NC_008261	TGG	2	6	6845	6850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799437
103	NC_008261	TAG	2	6	6857	6862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
104	NC_008261	ACT	2	6	6921	6926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799437
105	NC_008261	ATT	2	6	6947	6952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799437
106	NC_008261	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
107	NC_008261	AAG	2	6	7025	7030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
108	NC_008261	AGA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
109	NC_008261	TTG	2	6	7186	7191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110800886
110	NC_008261	AGA	2	6	7236	7241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800886
111	NC_008261	ACC	2	6	7330	7335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110800886
112	NC_008261	TCA	2	6	7347	7352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800886
113	NC_008261	ATG	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800886
114	NC_008261	TTG	2	6	7405	7410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110800886
115	NC_008261	CAG	2	6	7447	7452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110800886
116	NC_008261	TAA	2	6	7514	7519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800886
117	NC_008261	TCA	2	6	7611	7616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800886
118	NC_008261	CTA	2	6	7636	7641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800886
119	NC_008261	ACC	2	6	7646	7651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110800886
120	NC_008261	CAG	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110800886
121	NC_008261	AAT	3	9	7763	7771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800886
122	NC_008261	GCT	2	6	7791	7796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110800886
123	NC_008261	TAG	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800886
124	NC_008261	ATA	2	6	7869	7874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800886
125	NC_008261	TAA	2	6	7898	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800886
126	NC_008261	AGA	2	6	8184	8189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800886
127	NC_008261	TAA	2	6	8204	8209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800886
128	NC_008261	TAA	2	6	8242	8247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800886
129	NC_008261	ATA	2	6	8257	8262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800886
130	NC_008261	TGA	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800886
131	NC_008261	ATA	2	6	8280	8285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800886
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