MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 73009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_008261	AAG	2	6	223658	223663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799393
4503	NC_008261	ATT	2	6	223754	223759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799393
4504	NC_008261	AAT	2	6	223782	223787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799393
4505	NC_008261	TTA	2	6	223803	223808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799393
4506	NC_008261	GCA	2	6	223899	223904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110799393
4507	NC_008261	ATT	2	6	223907	223912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799393
4508	NC_008261	CAG	2	6	223921	223926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110799393
4509	NC_008261	TGG	2	6	223979	223984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799393
4510	NC_008261	TAC	2	6	223988	223993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799393
4511	NC_008261	A	7	7	224063	224069	100 %	0 %	0 %	0 %	110799393
4512	NC_008261	CAG	2	6	224167	224172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110799393
4513	NC_008261	GGA	2	6	224178	224183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110799393
4514	NC_008261	AGA	2	6	224300	224305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799393
4515	NC_008261	T	6	6	224323	224328	0 %	100 %	0 %	0 %	110799393
4516	NC_008261	AAT	2	6	224341	224346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799393
4517	NC_008261	TAT	2	6	224382	224387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800614
4518	NC_008261	TATT	2	8	224394	224401	25 %	75 %	0 %	0 %	110800614
4519	NC_008261	AAT	2	6	224404	224409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800614
4520	NC_008261	CTTT	2	8	224412	224419	0 %	75 %	0 %	25 %	110800614
4521	NC_008261	TGG	2	6	224440	224445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110800614
4522	NC_008261	TGA	2	6	224449	224454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800614
4523	NC_008261	AGA	2	6	224461	224466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800614
4524	NC_008261	TGA	2	6	224482	224487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800614
4525	NC_008261	ATT	2	6	224512	224517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800614
4526	NC_008261	TAT	2	6	224547	224552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800614
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4533	NC_008261	T	6	6	224786	224791	0 %	100 %	0 %	0 %	110800998
4534	NC_008261	GAA	2	6	224806	224811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110800998
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4537	NC_008261	AAT	2	6	224861	224866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800998
4538	NC_008261	TTG	2	6	224881	224886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110800998
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4540	NC_008261	ATT	2	6	224967	224972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800998
4541	NC_008261	T	6	6	225089	225094	0 %	100 %	0 %	0 %	110800998
4542	NC_008261	TAA	2	6	225103	225108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800998
4543	NC_008261	ATTTAT	2	12	225122	225133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110800998
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4547	NC_008261	TA	3	6	225271	225276	50 %	50 %	0 %	0 %	110800998
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4550	NC_008261	TTACAT	2	12	225344	225355	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	110800998
4551	NC_008261	TAA	2	6	225364	225369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110800998
4552	NC_008261	TATT	2	8	225397	225404	25 %	75 %	0 %	0 %	110800998
4553	NC_008261	AGTAG	2	10	225406	225415	40 %	20 %	40 %	0 %	110800998
4554	NC_008261	TA	3	6	225434	225439	50 %	50 %	0 %	0 %	110798586
4555	NC_008261	AGA	2	6	225448	225453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798586
4556	NC_008261	TAATTA	2	12	225457	225468	50 %	50 %	0 %	0 %	110798586
4557	NC_008261	AGAGG	2	10	225515	225524	40 %	0 %	60 %	0 %	110798586
4558	NC_008261	CTT	2	6	225597	225602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110798586
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4561	NC_008261	AAT	2	6	225652	225657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798586
4562	NC_008261	CAAC	2	8	225700	225707	50 %	0 %	0 %	50 %	110798586
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4564	NC_008261	AAAAG	2	10	225861	225870	80 %	0 %	20 %	0 %	110798586
4565	NC_008261	ATT	2	6	225970	225975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798586
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4570	NC_008261	TGA	2	6	226207	226212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798586
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4574	NC_008261	TGA	2	6	226963	226968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798768
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4583	NC_008261	TTATC	2	10	227490	227499	20 %	60 %	0 %	20 %	110799595
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4590	NC_008261	TCA	2	6	227849	227854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799595
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4593	NC_008261	CTT	2	6	228006	228011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799595
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4596	NC_008261	ATA	2	6	228069	228074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799595
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4601	NC_008261	GAT	2	6	228537	228542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801116
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4605	NC_008261	TGA	2	6	228709	228714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801116
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4607	NC_008261	AGAA	2	8	228916	228923	75 %	0 %	25 %	0 %	110801116
4608	NC_008261	T	6	6	228931	228936	0 %	100 %	0 %	0 %	110801116
4609	NC_008261	GCTA	2	8	228937	228944	25 %	25 %	25 %	25 %	110801116
4610	NC_008261	T	6	6	228992	228997	0 %	100 %	0 %	0 %	110801116
4611	NC_008261	TTA	2	6	229022	229027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801116
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4614	NC_008261	TA	3	6	229131	229136	50 %	50 %	0 %	0 %	110801116
4615	NC_008261	T	6	6	229183	229188	0 %	100 %	0 %	0 %	110801116
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4618	NC_008261	TACTT	2	10	229231	229240	20 %	60 %	0 %	20 %	110801116
4619	NC_008261	GAA	2	6	229256	229261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801116
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4999	NC_008261	GGA	2	6	252331	252336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110801233
5000	NC_008261	TTG	2	6	252344	252349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110801233

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