MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 88507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008255	ATTG	2	8	153864	153871	25 %	50 %	25 %	0 %	110636554
3002	NC_008255	ATG	2	6	153872	153877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636554
3003	NC_008255	GCA	2	6	154021	154026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636554
3004	NC_008255	AAAGAA	2	12	154030	154041	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	110636554
3005	NC_008255	TTG	2	6	154054	154059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636554
3006	NC_008255	CG	3	6	154060	154065	0 %	0 %	50 %	50 %	110636554
3007	NC_008255	ACA	2	6	154166	154171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636554
3008	NC_008255	TGA	2	6	154212	154217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636554
3009	NC_008255	AGG	2	6	154274	154279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636554
3010	NC_008255	ATCT	2	8	154341	154348	25 %	50 %	0 %	25 %	110636554
3011	NC_008255	GTT	2	6	154380	154385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636554
3012	NC_008255	ATT	2	6	154391	154396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636554
3013	NC_008255	CAG	2	6	154426	154431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636554
3014	NC_008255	TTA	2	6	154432	154437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636554
3015	NC_008255	TGA	2	6	154503	154508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636554
3016	NC_008255	ATGG	2	8	154525	154532	25 %	25 %	50 %	0 %	110636554
3017	NC_008255	AGA	2	6	154590	154595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636554
3018	NC_008255	ATT	2	6	154631	154636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636554
3019	NC_008255	AGA	2	6	154683	154688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636554
3020	NC_008255	TGT	4	12	154719	154730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636554
3021	NC_008255	AAC	2	6	154782	154787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636554
3022	NC_008255	TGGT	2	8	154853	154860	0 %	50 %	50 %	0 %	110636554
3023	NC_008255	ATT	2	6	154884	154889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636554
3024	NC_008255	AAG	2	6	154952	154957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636554
3025	NC_008255	GTT	2	6	154963	154968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636554
3026	NC_008255	ATTAA	2	10	155032	155041	60 %	40 %	0 %	0 %	110636554
3027	NC_008255	GTC	2	6	155135	155140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636554
3028	NC_008255	AAG	2	6	155246	155251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636554
3029	NC_008255	A	6	6	155302	155307	100 %	0 %	0 %	0 %	110636554
3030	NC_008255	GAA	2	6	155311	155316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636554
3031	NC_008255	TAC	2	6	155484	155489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636554
3032	NC_008255	GAA	2	6	155554	155559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636554
3033	NC_008255	CAG	2	6	155576	155581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636554
3034	NC_008255	GAA	2	6	155605	155610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636554
3035	NC_008255	A	6	6	155651	155656	100 %	0 %	0 %	0 %	110636554
3036	NC_008255	ATT	2	6	155749	155754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636554
3037	NC_008255	TTACA	2	10	155814	155823	40 %	40 %	0 %	20 %	110636554
3038	NC_008255	ATT	2	6	155919	155924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636554
3039	NC_008255	GTT	2	6	155949	155954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636554
3040	NC_008255	AG	3	6	156040	156045	50 %	0 %	50 %	0 %	110636554
3041	NC_008255	CAG	2	6	156052	156057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636554
3042	NC_008255	CAG	2	6	156064	156069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636554
3043	NC_008255	AG	3	6	156079	156084	50 %	0 %	50 %	0 %	110636554
3044	NC_008255	GAA	2	6	156139	156144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636554
3045	NC_008255	TTCG	2	8	156173	156180	0 %	50 %	25 %	25 %	110636554
3046	NC_008255	GTACA	2	10	156214	156223	40 %	20 %	20 %	20 %	110636554
3047	NC_008255	TTA	2	6	156274	156279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636554
3048	NC_008255	GT	4	8	156288	156295	0 %	50 %	50 %	0 %	110636554
3049	NC_008255	GAA	2	6	156301	156306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636554
3050	NC_008255	GTT	2	6	156310	156315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636555
3051	NC_008255	AATG	2	8	156337	156344	50 %	25 %	25 %	0 %	110636555
3052	NC_008255	ATT	2	6	156386	156391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636555
3053	NC_008255	CATA	2	8	156477	156484	50 %	25 %	0 %	25 %	110636555
3054	NC_008255	A	7	7	156521	156527	100 %	0 %	0 %	0 %	110636555
3055	NC_008255	CAG	2	6	156528	156533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636555
3056	NC_008255	TAC	2	6	156535	156540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636555
3057	NC_008255	GC	3	6	156572	156577	0 %	0 %	50 %	50 %	110636555
3058	NC_008255	TA	3	6	156639	156644	50 %	50 %	0 %	0 %	110636555
3059	NC_008255	CAG	2	6	156652	156657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636555
3060	NC_008255	CAG	2	6	156680	156685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636555
3061	NC_008255	TA	3	6	156687	156692	50 %	50 %	0 %	0 %	110636555
3062	NC_008255	TA	3	6	156714	156719	50 %	50 %	0 %	0 %	110636555
3063	NC_008255	AGGT	2	8	156750	156757	25 %	25 %	50 %	0 %	110636555
3064	NC_008255	GCG	2	6	156776	156781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636555
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3067	NC_008255	GCA	2	6	156891	156896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636556
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3069	NC_008255	TTGA	2	8	157053	157060	25 %	50 %	25 %	0 %	110636556
3070	NC_008255	A	6	6	157064	157069	100 %	0 %	0 %	0 %	110636556
3071	NC_008255	TTGCG	2	10	157087	157096	0 %	40 %	40 %	20 %	110636556
3072	NC_008255	GAA	2	6	157122	157127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636556
3073	NC_008255	A	7	7	157126	157132	100 %	0 %	0 %	0 %	110636556
3074	NC_008255	ATGC	2	8	157167	157174	25 %	25 %	25 %	25 %	110636556
3075	NC_008255	ATG	2	6	157183	157188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636556
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3079	NC_008255	AATT	2	8	157261	157268	50 %	50 %	0 %	0 %	110636556
3080	NC_008255	GAA	2	6	157281	157286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636556
3081	NC_008255	GCG	2	6	157297	157302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636556
3082	NC_008255	CAT	2	6	157352	157357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636556
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3084	NC_008255	GTAT	2	8	157411	157418	25 %	50 %	25 %	0 %	110636556
3085	NC_008255	TGC	2	6	157469	157474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636556
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3087	NC_008255	CAG	2	6	157544	157549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636556
3088	NC_008255	TGAA	2	8	157660	157667	50 %	25 %	25 %	0 %	110636556
3089	NC_008255	AGC	2	6	157687	157692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636556
3090	NC_008255	A	7	7	157698	157704	100 %	0 %	0 %	0 %	110636556
3091	NC_008255	GATA	2	8	157745	157752	50 %	25 %	25 %	0 %	110636556
3092	NC_008255	AGC	2	6	157811	157816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636556
3093	NC_008255	T	6	6	157823	157828	0 %	100 %	0 %	0 %	110636556
3094	NC_008255	AGA	2	6	157871	157876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636556
3095	NC_008255	CTA	2	6	157883	157888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636556
3096	NC_008255	A	6	6	157894	157899	100 %	0 %	0 %	0 %	110636556
3097	NC_008255	ACG	2	6	157933	157938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636556
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3101	NC_008255	T	7	7	158117	158123	0 %	100 %	0 %	0 %	110636557
3102	NC_008255	T	6	6	158133	158138	0 %	100 %	0 %	0 %	110636557
3103	NC_008255	TTA	2	6	158149	158154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636557
3104	NC_008255	TAC	2	6	158175	158180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636557
3105	NC_008255	TAC	2	6	158183	158188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636557
3106	NC_008255	ATTT	2	8	158246	158253	25 %	75 %	0 %	0 %	110636557
3107	NC_008255	TAA	3	9	158254	158262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636557
3108	NC_008255	GAT	2	6	158286	158291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636557
3109	NC_008255	GAAA	2	8	158312	158319	75 %	0 %	25 %	0 %	110636557
3110	NC_008255	ATG	2	6	158334	158339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636557
3111	NC_008255	CAT	3	9	158386	158394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636557
3112	NC_008255	A	6	6	158396	158401	100 %	0 %	0 %	0 %	110636557
3113	NC_008255	TCATAA	2	12	158438	158449	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	110636557
3114	NC_008255	AGC	2	6	158453	158458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636557
3115	NC_008255	AAATAA	2	12	158470	158481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	110636557
3116	NC_008255	AT	3	6	158517	158522	50 %	50 %	0 %	0 %	110636557
3117	NC_008255	ACAATA	2	12	158569	158580	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	110636557
3118	NC_008255	ATT	2	6	158617	158622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636557
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3121	NC_008255	T	7	7	158686	158692	0 %	100 %	0 %	0 %	110636558
3122	NC_008255	A	6	6	158714	158719	100 %	0 %	0 %	0 %	110636558
3123	NC_008255	ATTG	2	8	158758	158765	25 %	50 %	25 %	0 %	110636558
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3234	NC_008255	T	8	8	163967	163974	0 %	100 %	0 %	0 %	110636561
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3238	NC_008255	T	6	6	164080	164085	0 %	100 %	0 %	0 %	110636561
3239	NC_008255	GTTGA	2	10	164100	164109	20 %	40 %	40 %	0 %	110636561
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3242	NC_008255	CATA	2	8	164297	164304	50 %	25 %	0 %	25 %	110636562
3243	NC_008255	AAATA	2	10	164353	164362	80 %	20 %	0 %	0 %	110636562
3244	NC_008255	GAA	2	6	164366	164371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636562
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3247	NC_008255	ATG	2	6	164443	164448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636562
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3367	NC_008255	CTG	2	6	170645	170650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636566
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3494	NC_008255	CTG	2	6	175759	175764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636572
3495	NC_008255	A	6	6	175770	175775	100 %	0 %	0 %	0 %	110636572
3496	NC_008255	TGA	2	6	176170	176175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636573
3497	NC_008255	ACAAT	2	10	176177	176186	60 %	20 %	0 %	20 %	110636573
3498	NC_008255	TTA	2	6	176217	176222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636573
3499	NC_008255	CAT	2	6	176349	176354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636573
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