MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 88507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008255	AGA	2	6	23846	23851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636448
502	NC_008255	TTGC	2	8	23904	23911	0 %	50 %	25 %	25 %	110636448
503	NC_008255	GCT	2	6	23952	23957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636448
504	NC_008255	AAC	2	6	24003	24008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636448
505	NC_008255	CTA	2	6	24014	24019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636448
506	NC_008255	GAAA	2	8	24032	24039	75 %	0 %	25 %	0 %	110636448
507	NC_008255	A	6	6	24246	24251	100 %	0 %	0 %	0 %	110636448
508	NC_008255	A	6	6	24270	24275	100 %	0 %	0 %	0 %	110636448
509	NC_008255	ATTG	2	8	24302	24309	25 %	50 %	25 %	0 %	110636448
510	NC_008255	A	7	7	24312	24318	100 %	0 %	0 %	0 %	110636448
511	NC_008255	AATAA	2	10	24340	24349	80 %	20 %	0 %	0 %	110636448
512	NC_008255	TAA	2	6	24362	24367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636449
513	NC_008255	TTCT	2	8	24369	24376	0 %	75 %	0 %	25 %	110636449
514	NC_008255	ATTT	2	8	24378	24385	25 %	75 %	0 %	0 %	110636449
515	NC_008255	A	7	7	24391	24397	100 %	0 %	0 %	0 %	110636449
516	NC_008255	TGT	2	6	24402	24407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636449
517	NC_008255	GTT	2	6	24442	24447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636449
518	NC_008255	TA	3	6	24474	24479	50 %	50 %	0 %	0 %	110636449
519	NC_008255	CAA	2	6	24485	24490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636449
520	NC_008255	CAG	2	6	24519	24524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636449
521	NC_008255	CTAT	2	8	24574	24581	25 %	50 %	0 %	25 %	110636449
522	NC_008255	TTA	2	6	24613	24618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636449
523	NC_008255	A	6	6	24651	24656	100 %	0 %	0 %	0 %	110636449
524	NC_008255	TAAA	2	8	24779	24786	75 %	25 %	0 %	0 %	110636449
525	NC_008255	A	6	6	24814	24819	100 %	0 %	0 %	0 %	110636449
526	NC_008255	GATA	2	8	24849	24856	50 %	25 %	25 %	0 %	110636449
527	NC_008255	TTG	2	6	24881	24886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636449
528	NC_008255	TAA	3	9	24990	24998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636449
529	NC_008255	CCAA	2	8	25045	25052	50 %	0 %	0 %	50 %	110636449
530	NC_008255	A	7	7	25080	25086	100 %	0 %	0 %	0 %	110636449
531	NC_008255	AT	3	6	25108	25113	50 %	50 %	0 %	0 %	110636450
532	NC_008255	AAAAG	2	10	25161	25170	80 %	0 %	20 %	0 %	110636450
533	NC_008255	GAA	2	6	25207	25212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636450
534	NC_008255	ACA	2	6	25223	25228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636450
535	NC_008255	GAA	2	6	25238	25243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636450
536	NC_008255	AGC	2	6	25248	25253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636450
537	NC_008255	A	7	7	25254	25260	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
538	NC_008255	TTG	2	6	25283	25288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636450
539	NC_008255	AGT	2	6	25312	25317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636450
540	NC_008255	GAT	2	6	25375	25380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636450
541	NC_008255	GAA	2	6	25394	25399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636450
542	NC_008255	AGA	2	6	25417	25422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636450
543	NC_008255	TCAT	2	8	25476	25483	25 %	50 %	0 %	25 %	110636450
544	NC_008255	CGC	2	6	25517	25522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110636450
545	NC_008255	ATGCAC	2	12	25542	25553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	110636450
546	NC_008255	AGA	2	6	25567	25572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636450
547	NC_008255	GAA	2	6	25631	25636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636450
548	NC_008255	A	6	6	25635	25640	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
549	NC_008255	A	6	6	25672	25677	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
550	NC_008255	A	6	6	25690	25695	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
551	NC_008255	TCA	2	6	25724	25729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636450
552	NC_008255	AAAGAA	2	12	25730	25741	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	110636450
553	NC_008255	A	6	6	25745	25750	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
554	NC_008255	TGC	2	6	25810	25815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636450
555	NC_008255	CGAA	2	8	25816	25823	50 %	0 %	25 %	25 %	110636450
556	NC_008255	A	7	7	25822	25828	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
557	NC_008255	TAA	2	6	25864	25869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636450
558	NC_008255	A	7	7	25881	25887	100 %	0 %	0 %	0 %	110636450
559	NC_008255	GCA	2	6	26122	26127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636450
560	NC_008255	GAA	2	6	26183	26188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636450
561	NC_008255	ATG	2	6	26398	26403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636451
562	NC_008255	TTG	2	6	26471	26476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636451
563	NC_008255	TCTT	2	8	26477	26484	0 %	75 %	0 %	25 %	110636451
564	NC_008255	A	7	7	26494	26500	100 %	0 %	0 %	0 %	110636451
565	NC_008255	AAG	2	6	26558	26563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636451
566	NC_008255	GAC	2	6	26593	26598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636451
567	NC_008255	A	6	6	26601	26606	100 %	0 %	0 %	0 %	110636451
568	NC_008255	TAC	2	6	26695	26700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636452
569	NC_008255	A	6	6	26703	26708	100 %	0 %	0 %	0 %	110636452
570	NC_008255	AT	3	6	26888	26893	50 %	50 %	0 %	0 %	110636452
571	NC_008255	TAT	3	9	26955	26963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636452
572	NC_008255	GCC	2	6	26966	26971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110636452
573	NC_008255	TGA	2	6	26979	26984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636452
574	NC_008255	TCC	2	6	26998	27003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	110636452
575	NC_008255	TTC	2	6	27066	27071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636452
576	NC_008255	CGG	2	6	27072	27077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636452
577	NC_008255	CAG	2	6	27080	27085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636452
578	NC_008255	CAT	2	6	27168	27173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636452
579	NC_008255	CTT	2	6	27227	27232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636452
580	NC_008255	AAG	2	6	27258	27263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636452
581	NC_008255	CAGGA	2	10	27299	27308	40 %	0 %	40 %	20 %	110636452
582	NC_008255	TTC	2	6	27327	27332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636452
583	NC_008255	AAG	2	6	27398	27403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636452
584	NC_008255	CA	3	6	27444	27449	50 %	0 %	0 %	50 %	110636452
585	NC_008255	A	6	6	27469	27474	100 %	0 %	0 %	0 %	110636452
586	NC_008255	TTA	2	6	27508	27513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636452
587	NC_008255	TTC	2	6	27521	27526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636452
588	NC_008255	TAT	2	6	27532	27537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636452
589	NC_008255	AAC	2	6	27543	27548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636452
590	NC_008255	AAG	2	6	27637	27642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636452
591	NC_008255	A	7	7	27672	27678	100 %	0 %	0 %	0 %	110636452
592	NC_008255	ATG	2	6	27719	27724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636452
593	NC_008255	CTA	2	6	27726	27731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636452
594	NC_008255	TCG	2	6	27750	27755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636452
595	NC_008255	TAA	2	6	27758	27763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636452
596	NC_008255	TGT	2	6	27803	27808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636452
597	NC_008255	CAA	5	15	27812	27826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636452
598	NC_008255	ATC	2	6	27845	27850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636452
599	NC_008255	TGCA	2	8	27893	27900	25 %	25 %	25 %	25 %	110636452
600	NC_008255	GAA	2	6	27991	27996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636452
601	NC_008255	ATT	2	6	28002	28007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636452
602	NC_008255	ACT	2	6	28019	28024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636452
603	NC_008255	TAT	2	6	28077	28082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636453
604	NC_008255	TG	4	8	28111	28118	0 %	50 %	50 %	0 %	110636453
605	NC_008255	ATA	2	6	28137	28142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636453
606	NC_008255	ACT	2	6	28157	28162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636453
607	NC_008255	ATT	2	6	28190	28195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636453
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609	NC_008255	TGC	2	6	28278	28283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636453
610	NC_008255	ATT	2	6	28332	28337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636453
611	NC_008255	GAA	2	6	28436	28441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636453
612	NC_008255	TTG	2	6	28458	28463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636453
613	NC_008255	TTG	2	6	28785	28790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636453
614	NC_008255	ACAT	2	8	28796	28803	50 %	25 %	0 %	25 %	110636453
615	NC_008255	TTG	2	6	28830	28835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636453
616	NC_008255	A	6	6	28961	28966	100 %	0 %	0 %	0 %	110636453
617	NC_008255	TTTA	2	8	29028	29035	25 %	75 %	0 %	0 %	110636453
618	NC_008255	GCA	2	6	29061	29066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636453
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620	NC_008255	AGC	3	9	29117	29125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636453
621	NC_008255	GC	3	6	29139	29144	0 %	0 %	50 %	50 %	110636453
622	NC_008255	TAT	2	6	29165	29170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636453
623	NC_008255	ATC	2	6	29254	29259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636453
624	NC_008255	GATT	2	8	29283	29290	25 %	50 %	25 %	0 %	110636453
625	NC_008255	A	6	6	29297	29302	100 %	0 %	0 %	0 %	110636453
626	NC_008255	TAT	2	6	29390	29395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636453
627	NC_008255	TC	3	6	29424	29429	0 %	50 %	0 %	50 %	110636453
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629	NC_008255	TAT	2	6	29572	29577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636454
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