MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406 chromosome

Total Repeats: 88507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008255	CAATT	2	10	229246	229255	40 %	40 %	0 %	20 %	110636610
4502	NC_008255	TTA	2	6	229313	229318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636610
4503	NC_008255	CGG	2	6	229379	229384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636610
4504	NC_008255	TGT	2	6	229415	229420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636610
4505	NC_008255	CTG	2	6	229433	229438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636610
4506	NC_008255	TTCA	2	8	229476	229483	25 %	50 %	0 %	25 %	110636610
4507	NC_008255	ACA	2	6	229489	229494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636610
4508	NC_008255	A	6	6	229533	229538	100 %	0 %	0 %	0 %	110636610
4509	NC_008255	TGGGA	2	10	229570	229579	20 %	20 %	60 %	0 %	110636610
4510	NC_008255	TTCT	2	8	229586	229593	0 %	75 %	0 %	25 %	110636610
4511	NC_008255	TAA	2	6	229598	229603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636610
4512	NC_008255	CAA	2	6	229615	229620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636610
4513	NC_008255	AAT	2	6	229638	229643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636611
4514	NC_008255	CAAT	2	8	229647	229654	50 %	25 %	0 %	25 %	110636611
4515	NC_008255	TGT	2	6	229703	229708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636611
4516	NC_008255	TTA	2	6	229716	229721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636611
4517	NC_008255	TGG	2	6	229791	229796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110636611
4518	NC_008255	GTAT	2	8	229802	229809	25 %	50 %	25 %	0 %	110636611
4519	NC_008255	TAC	2	6	229820	229825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636611
4520	NC_008255	A	7	7	229826	229832	100 %	0 %	0 %	0 %	110636611
4521	NC_008255	GAAA	2	8	229871	229878	75 %	0 %	25 %	0 %	110636611
4522	NC_008255	GAG	2	6	229923	229928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110636611
4523	NC_008255	CAG	2	6	229957	229962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636611
4524	NC_008255	TGGA	2	8	229992	229999	25 %	25 %	50 %	0 %	110636611
4525	NC_008255	AG	3	6	230040	230045	50 %	0 %	50 %	0 %	110636611
4526	NC_008255	ATT	2	6	230115	230120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636611
4527	NC_008255	ATT	2	6	230272	230277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636611
4528	NC_008255	TGCGGG	2	12	230315	230326	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	110636611
4529	NC_008255	TTAAA	2	10	230398	230407	60 %	40 %	0 %	0 %	110636611
4530	NC_008255	TAT	2	6	230444	230449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636611
4531	NC_008255	GAT	2	6	230559	230564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636611
4532	NC_008255	CAA	2	6	230610	230615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636611
4533	NC_008255	TTC	2	6	230633	230638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636611
4534	NC_008255	A	6	6	230751	230756	100 %	0 %	0 %	0 %	110636611
4535	NC_008255	A	6	6	230811	230816	100 %	0 %	0 %	0 %	110636611
4536	NC_008255	A	7	7	230931	230937	100 %	0 %	0 %	0 %	110636612
4537	NC_008255	T	8	8	230950	230957	0 %	100 %	0 %	0 %	110636612
4538	NC_008255	CTTA	2	8	230979	230986	25 %	50 %	0 %	25 %	110636612
4539	NC_008255	AGA	2	6	231017	231022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636612
4540	NC_008255	TAT	2	6	231041	231046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636612
4541	NC_008255	AAG	2	6	231118	231123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636612
4542	NC_008255	TGA	2	6	231499	231504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636612
4543	NC_008255	ACAGAA	2	12	231604	231615	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	110636612
4544	NC_008255	CT	3	6	231728	231733	0 %	50 %	0 %	50 %	110636613
4545	NC_008255	GTT	2	6	231757	231762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636613
4546	NC_008255	AT	3	6	231832	231837	50 %	50 %	0 %	0 %	110636613
4547	NC_008255	CCG	2	6	231840	231845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110636613
4548	NC_008255	T	8	8	231877	231884	0 %	100 %	0 %	0 %	110636613
4549	NC_008255	GCT	2	6	231962	231967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636613
4550	NC_008255	GTTG	2	8	231998	232005	0 %	50 %	50 %	0 %	110636613
4551	NC_008255	AAT	2	6	232057	232062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636613
4552	NC_008255	T	6	6	232180	232185	0 %	100 %	0 %	0 %	110636614
4553	NC_008255	TTC	2	6	232197	232202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636614
4554	NC_008255	TCCAT	2	10	232329	232338	20 %	40 %	0 %	40 %	110636614
4555	NC_008255	ATATC	2	10	232365	232374	40 %	40 %	0 %	20 %	110636614
4556	NC_008255	CAA	2	6	232404	232409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636614
4557	NC_008255	TCT	2	6	232425	232430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636614
4558	NC_008255	T	6	6	232453	232458	0 %	100 %	0 %	0 %	110636614
4559	NC_008255	TAA	2	6	232583	232588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636615
4560	NC_008255	T	6	6	232589	232594	0 %	100 %	0 %	0 %	110636615
4561	NC_008255	AAT	2	6	232595	232600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636615
4562	NC_008255	ATC	2	6	232601	232606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636615
4563	NC_008255	CGT	2	6	232607	232612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636615
4564	NC_008255	TTCC	2	8	232615	232622	0 %	50 %	0 %	50 %	110636615
4565	NC_008255	TAT	2	6	232739	232744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636615
4566	NC_008255	CTT	2	6	232787	232792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110636615
4567	NC_008255	T	6	6	232909	232914	0 %	100 %	0 %	0 %	110636615
4568	NC_008255	GTA	3	9	232938	232946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636615
4569	NC_008255	T	6	6	232962	232967	0 %	100 %	0 %	0 %	110636615
4570	NC_008255	ATA	2	6	233211	233216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636615
4571	NC_008255	TTA	2	6	233256	233261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636615
4572	NC_008255	AT	3	6	233281	233286	50 %	50 %	0 %	0 %	110636615
4573	NC_008255	CAA	2	6	233389	233394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110636615
4574	NC_008255	A	6	6	233413	233418	100 %	0 %	0 %	0 %	110636615
4575	NC_008255	AAT	2	6	233456	233461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636615
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4577	NC_008255	A	6	6	233479	233484	100 %	0 %	0 %	0 %	110636615
4578	NC_008255	GTT	2	6	233485	233490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636615
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4580	NC_008255	ATT	2	6	233544	233549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636615
4581	NC_008255	AAT	2	6	233554	233559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636616
4582	NC_008255	TTGT	2	8	233572	233579	0 %	75 %	25 %	0 %	110636616
4583	NC_008255	TCA	3	9	233582	233590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636616
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4585	NC_008255	TTTCT	2	10	233647	233656	0 %	80 %	0 %	20 %	110636616
4586	NC_008255	ATC	2	6	233686	233691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636616
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4588	NC_008255	TGTT	2	8	233902	233909	0 %	75 %	25 %	0 %	110636616
4589	NC_008255	GAA	2	6	233915	233920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636616
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4591	NC_008255	GAA	2	6	234014	234019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636616
4592	NC_008255	GTATT	2	10	234047	234056	20 %	60 %	20 %	0 %	110636616
4593	NC_008255	TCAA	2	8	234071	234078	50 %	25 %	0 %	25 %	110636616
4594	NC_008255	GCTT	2	8	234138	234145	0 %	50 %	25 %	25 %	110636616
4595	NC_008255	T	6	6	234178	234183	0 %	100 %	0 %	0 %	110636616
4596	NC_008255	T	6	6	234206	234211	0 %	100 %	0 %	0 %	110636616
4597	NC_008255	GAC	2	6	234246	234251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636616
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4599	NC_008255	T	6	6	234412	234417	0 %	100 %	0 %	0 %	110636616
4600	NC_008255	CAT	2	6	234420	234425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636616
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4602	NC_008255	TCTGA	2	10	234487	234496	20 %	40 %	20 %	20 %	110636616
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4605	NC_008255	CTG	2	6	234601	234606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110636616
4606	NC_008255	TAA	2	6	234669	234674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110636616
4607	NC_008255	ATC	2	6	234703	234708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636616
4608	NC_008255	GTT	2	6	234710	234715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636616
4609	NC_008255	CAT	2	6	234718	234723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110636616
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4611	NC_008255	GCA	2	6	234830	234835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110636616
4612	NC_008255	GAA	2	6	234862	234867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110636616
4613	NC_008255	ATT	2	6	235030	235035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636617
4614	NC_008255	TCTG	2	8	235053	235060	0 %	50 %	25 %	25 %	110636617
4615	NC_008255	TTG	2	6	235069	235074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636617
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4618	NC_008255	TTA	2	6	235254	235259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636617
4619	NC_008255	TTCATT	2	12	235265	235276	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	110636617
4620	NC_008255	T	6	6	235275	235280	0 %	100 %	0 %	0 %	110636617
4621	NC_008255	ACAT	2	8	235281	235288	50 %	25 %	0 %	25 %	110636617
4622	NC_008255	GCG	2	6	235312	235317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636617
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4865	NC_008255	TAT	2	6	246866	246871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110636625
4866	NC_008255	AAAAT	2	10	246907	246916	80 %	20 %	0 %	0 %	110636625
4867	NC_008255	TGG	2	6	246940	246945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110636625
4868	NC_008255	CGG	4	12	246965	246976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110636625
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4995	NC_008255	TGT	2	6	252347	252352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636632
4996	NC_008255	GTTC	2	8	252438	252445	0 %	50 %	25 %	25 %	110636632
4997	NC_008255	CAAA	2	8	252608	252615	75 %	0 %	0 %	25 %	110636632
4998	NC_008255	T	6	6	252633	252638	0 %	100 %	0 %	0 %	110636632
4999	NC_008255	GTT	2	6	252657	252662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110636632
5000	NC_008255	TGA	2	6	252680	252685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110636632

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