MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 megaplasmid

Total Repeats: 53839

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007974	GGTCAA	2	12	231605	231616	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94312623
5002	NC_007974	GCG	2	6	231627	231632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94312623
5003	NC_007974	CTG	2	6	231657	231662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312623
5004	NC_007974	TCT	2	6	231700	231705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94312623
5005	NC_007974	TGA	2	6	231715	231720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94312623
5006	NC_007974	GCT	2	6	231770	231775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312623
5007	NC_007974	CTG	2	6	231789	231794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312623
5008	NC_007974	ATG	2	6	231890	231895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94312623
5009	NC_007974	TAC	2	6	231989	231994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94312624
5010	NC_007974	CGT	2	6	232009	232014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312624
5011	NC_007974	CGTG	2	8	232035	232042	0 %	25 %	50 %	25 %	94312624
5012	NC_007974	CGA	2	6	232057	232062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94312624
5013	NC_007974	CGG	2	6	232075	232080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94312624
5014	NC_007974	TGC	2	6	232095	232100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312624
5015	NC_007974	CGA	3	9	232102	232110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94312624
5016	NC_007974	CT	3	6	232133	232138	0 %	50 %	0 %	50 %	94312624
5017	NC_007974	GCT	2	6	232155	232160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312624
5018	NC_007974	CTG	2	6	232187	232192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312624
5019	NC_007974	GC	3	6	232200	232205	0 %	0 %	50 %	50 %	94312624
5020	NC_007974	GAC	2	6	232261	232266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94312624
5021	NC_007974	GAA	2	6	232319	232324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94312624
5022	NC_007974	CG	3	6	232360	232365	0 %	0 %	50 %	50 %	94312624
5023	NC_007974	CCG	2	6	232405	232410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94312624
5024	NC_007974	CG	3	6	232466	232471	0 %	0 %	50 %	50 %	94312624
5025	NC_007974	CGA	2	6	232482	232487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94312624
5026	NC_007974	CG	3	6	232495	232500	0 %	0 %	50 %	50 %	94312624
5027	NC_007974	ATC	2	6	232689	232694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94312625
5028	NC_007974	CAGC	2	8	232697	232704	25 %	0 %	25 %	50 %	94312625
5029	NC_007974	GGT	2	6	232715	232720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94312625
5030	NC_007974	TGG	2	6	232741	232746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94312625
5031	NC_007974	CG	3	6	232747	232752	0 %	0 %	50 %	50 %	94312625
5032	NC_007974	GTC	2	6	232871	232876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312625
5033	NC_007974	GC	4	8	232907	232914	0 %	0 %	50 %	50 %	94312625
5034	NC_007974	CTG	2	6	232971	232976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312625
5035	NC_007974	CGC	2	6	233009	233014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94312625
5036	NC_007974	CG	3	6	233017	233022	0 %	0 %	50 %	50 %	94312625
5037	NC_007974	CGTG	2	8	233027	233034	0 %	25 %	50 %	25 %	94312625
5038	NC_007974	GGCGC	2	10	233055	233064	0 %	0 %	60 %	40 %	94312625
5039	NC_007974	TGC	2	6	233077	233082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312625
5040	NC_007974	GC	4	8	233081	233088	0 %	0 %	50 %	50 %	94312625
5041	NC_007974	TGT	2	6	233092	233097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94312625
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5043	NC_007974	G	6	6	233132	233137	0 %	0 %	100 %	0 %	94312625
5044	NC_007974	CGC	2	6	233164	233169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94312625
5045	NC_007974	TGC	2	6	233296	233301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312625
5046	NC_007974	CTG	3	9	233337	233345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312625
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5050	NC_007974	AGGC	2	8	233524	233531	25 %	0 %	50 %	25 %	94312625
5051	NC_007974	GAAG	2	8	233582	233589	50 %	0 %	50 %	0 %	94312625
5052	NC_007974	CGGC	2	8	233596	233603	0 %	0 %	50 %	50 %	94312625
5053	NC_007974	GTG	2	6	233616	233621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94312625
5054	NC_007974	GC	3	6	233671	233676	0 %	0 %	50 %	50 %	94312625
5055	NC_007974	GC	3	6	233693	233698	0 %	0 %	50 %	50 %	94312625
5056	NC_007974	ATGGC	2	10	233728	233737	20 %	20 %	40 %	20 %	94312626
5057	NC_007974	CGA	2	6	233795	233800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94312626
5058	NC_007974	ATC	2	6	233820	233825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94312626
5059	NC_007974	CGGC	2	8	233881	233888	0 %	0 %	50 %	50 %	94312626
5060	NC_007974	AAG	2	6	234033	234038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94312626
5061	NC_007974	CAT	2	6	234044	234049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94312626
5062	NC_007974	CGC	3	9	234050	234058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94312626
5063	NC_007974	GCAG	2	8	234059	234066	25 %	0 %	50 %	25 %	94312626
5064	NC_007974	CCG	2	6	234097	234102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94312626
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5066	NC_007974	CGA	2	6	234169	234174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94312627
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5068	NC_007974	CATCG	2	10	234213	234222	20 %	20 %	20 %	40 %	94312627
5069	NC_007974	TGC	2	6	234238	234243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312627
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5075	NC_007974	AGGCCA	2	12	234409	234420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94312627
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5077	NC_007974	CG	3	6	234499	234504	0 %	0 %	50 %	50 %	94312627
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5082	NC_007974	GCCG	2	8	234671	234678	0 %	0 %	50 %	50 %	94312627
5083	NC_007974	AAGGC	2	10	234733	234742	40 %	0 %	40 %	20 %	94312627
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5091	NC_007974	CG	3	6	235176	235181	0 %	0 %	50 %	50 %	94312628
5092	NC_007974	TGGCC	2	10	235213	235222	0 %	20 %	40 %	40 %	94312628
5093	NC_007974	TTG	2	6	235289	235294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94312628
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5102	NC_007974	GC	3	6	235802	235807	0 %	0 %	50 %	50 %	94312628
5103	NC_007974	CTG	2	6	235844	235849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312628
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5107	NC_007974	CCGG	2	8	235967	235974	0 %	0 %	50 %	50 %	94312628
5108	NC_007974	CCGA	2	8	235982	235989	25 %	0 %	25 %	50 %	94312628
5109	NC_007974	GCC	2	6	236041	236046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94312628
5110	NC_007974	GCA	2	6	236061	236066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94312628
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5119	NC_007974	CGC	2	6	236479	236484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94312629
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5124	NC_007974	TGA	2	6	236602	236607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94312629
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5240	NC_007974	GCCG	2	8	240834	240841	0 %	0 %	50 %	50 %	94312632
5241	NC_007974	CGG	2	6	240893	240898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94312632
5242	NC_007974	CGA	2	6	240930	240935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94312632
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5245	NC_007974	GCC	2	6	241144	241149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94312632
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5496	NC_007974	TGG	3	9	251237	251245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94312640
5497	NC_007974	CGT	2	6	251342	251347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312640
5498	NC_007974	TGC	2	6	251366	251371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94312640
5499	NC_007974	GCG	2	6	251390	251395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94312640
5500	NC_007974	CGC	2	6	251420	251425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94312640

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