MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 85498

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007973	CGGC	2	8	130183	130190	0 %	0 %	50 %	50 %	94309068
3002	NC_007973	GCA	2	6	130194	130199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309068
3003	NC_007973	GGC	2	6	130250	130255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309068
3004	NC_007973	GCC	2	6	130260	130265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309068
3005	NC_007973	CCG	2	6	130282	130287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309068
3006	NC_007973	GTT	2	6	130298	130303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94309068
3007	NC_007973	GC	3	6	130455	130460	0 %	0 %	50 %	50 %	94309069
3008	NC_007973	GCCAG	2	10	130498	130507	20 %	0 %	40 %	40 %	94309069
3009	NC_007973	TGGC	2	8	130510	130517	0 %	25 %	50 %	25 %	94309069
3010	NC_007973	AGC	2	6	130539	130544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309069
3011	NC_007973	TCG	2	6	130650	130655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309069
3012	NC_007973	CCA	2	6	130695	130700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309069
3013	NC_007973	AGC	2	6	130737	130742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309069
3014	NC_007973	CG	5	10	130783	130792	0 %	0 %	50 %	50 %	94309069
3015	NC_007973	GA	3	6	130798	130803	50 %	0 %	50 %	0 %	94309069
3016	NC_007973	TCGTGG	2	12	130855	130866	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	94309070
3017	NC_007973	TGGTCG	2	12	130876	130887	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	94309070
3018	NC_007973	TCG	3	9	130885	130893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309070
3019	NC_007973	GCC	2	6	130930	130935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309070
3020	NC_007973	CGG	2	6	130949	130954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309070
3021	NC_007973	TCG	3	9	130960	130968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309070
3022	NC_007973	GCGCGT	2	12	131000	131011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	94309070
3023	NC_007973	GGC	2	6	131097	131102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309070
3024	NC_007973	TTC	2	6	131127	131132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309070
3025	NC_007973	CCA	2	6	131148	131153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309070
3026	NC_007973	CGG	2	6	131159	131164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309070
3027	NC_007973	CGC	2	6	131180	131185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309070
3028	NC_007973	GCA	2	6	131249	131254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309070
3029	NC_007973	GCG	2	6	131319	131324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309070
3030	NC_007973	CGG	2	6	131326	131331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309070
3031	NC_007973	CGG	2	6	131351	131356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309070
3032	NC_007973	CGG	2	6	131396	131401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309070
3033	NC_007973	GCG	2	6	131449	131454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309070
3034	NC_007973	CGA	2	6	131477	131482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309070
3035	NC_007973	GC	3	6	131488	131493	0 %	0 %	50 %	50 %	94309070
3036	NC_007973	CGA	2	6	131543	131548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309070
3037	NC_007973	TTG	2	6	131557	131562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94309070
3038	NC_007973	ACG	2	6	131563	131568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309070
3039	NC_007973	CGA	2	6	131606	131611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309070
3040	NC_007973	GTC	3	9	131619	131627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309070
3041	NC_007973	CGT	2	6	131666	131671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309070
3042	NC_007973	AAG	2	6	131683	131688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94309070
3043	NC_007973	TGG	2	6	131735	131740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309070
3044	NC_007973	CAC	2	6	131814	131819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309070
3045	NC_007973	CG	4	8	131894	131901	0 %	0 %	50 %	50 %	94309070
3046	NC_007973	GCA	2	6	131924	131929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309070
3047	NC_007973	GGT	2	6	131931	131936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309070
3048	NC_007973	ATG	2	6	131989	131994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309070
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3050	NC_007973	CTT	2	6	132345	132350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309071
3051	NC_007973	CAG	2	6	132351	132356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309071
3052	NC_007973	CG	3	6	132371	132376	0 %	0 %	50 %	50 %	94309071
3053	NC_007973	TTC	2	6	132396	132401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309071
3054	NC_007973	CGT	2	6	132459	132464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309071
3055	NC_007973	TCG	2	6	132487	132492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309071
3056	NC_007973	GCT	2	6	132497	132502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309071
3057	NC_007973	GAA	2	6	132516	132521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94309071
3058	NC_007973	TCAG	2	8	132577	132584	25 %	25 %	25 %	25 %	94309071
3059	NC_007973	TGC	2	6	132593	132598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309071
3060	NC_007973	CTG	2	6	132608	132613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309071
3061	NC_007973	TTG	2	6	132620	132625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94309071
3062	NC_007973	CGG	2	6	132633	132638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309071
3063	NC_007973	CGT	3	9	132639	132647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309071
3064	NC_007973	GGC	2	6	132681	132686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309071
3065	NC_007973	CTGG	2	8	132696	132703	0 %	25 %	50 %	25 %	94309071
3066	NC_007973	TGC	2	6	132713	132718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309071
3067	NC_007973	GCC	2	6	132757	132762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309071
3068	NC_007973	GAG	2	6	132773	132778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94309071
3069	NC_007973	TGC	2	6	132836	132841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309071
3070	NC_007973	TTG	2	6	132857	132862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94309071
3071	NC_007973	AGGC	2	8	133198	133205	25 %	0 %	50 %	25 %	94309072
3072	NC_007973	CG	3	6	133229	133234	0 %	0 %	50 %	50 %	94309072
3073	NC_007973	GTT	2	6	133271	133276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94309072
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3077	NC_007973	CGGT	2	8	133480	133487	0 %	25 %	50 %	25 %	94309072
3078	NC_007973	TGA	3	9	133489	133497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309072
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3081	NC_007973	GC	3	6	133624	133629	0 %	0 %	50 %	50 %	94309072
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3084	NC_007973	GCA	2	6	133748	133753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309072
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3089	NC_007973	CAC	2	6	133992	133997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309072
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3092	NC_007973	TTC	2	6	134151	134156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309072
3093	NC_007973	TGC	2	6	134194	134199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309072
3094	NC_007973	AGC	2	6	134218	134223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309072
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3097	NC_007973	GCTGT	2	10	134498	134507	0 %	40 %	40 %	20 %	94309073
3098	NC_007973	GC	4	8	134520	134527	0 %	0 %	50 %	50 %	94309073
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3101	NC_007973	GATC	2	8	134662	134669	25 %	25 %	25 %	25 %	94309073
3102	NC_007973	TGG	2	6	134676	134681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309073
3103	NC_007973	CAGG	2	8	134705	134712	25 %	0 %	50 %	25 %	94309073
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3105	NC_007973	GCGT	2	8	135054	135061	0 %	25 %	50 %	25 %	94309074
3106	NC_007973	CGC	2	6	135075	135080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309074
3107	NC_007973	TGC	2	6	135087	135092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309074
3108	NC_007973	GCA	2	6	135186	135191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309074
3109	NC_007973	GCG	2	6	135192	135197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309074
3110	NC_007973	TG	3	6	135297	135302	0 %	50 %	50 %	0 %	94309074
3111	NC_007973	GC	4	8	135315	135322	0 %	0 %	50 %	50 %	94309074
3112	NC_007973	ACC	2	6	135345	135350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309074
3113	NC_007973	CG	3	6	135365	135370	0 %	0 %	50 %	50 %	94309074
3114	NC_007973	TGC	2	6	135372	135377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309074
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3118	NC_007973	TTC	2	6	135506	135511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309074
3119	NC_007973	GCT	2	6	135520	135525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309074
3120	NC_007973	CGATG	2	10	135562	135571	20 %	20 %	40 %	20 %	94309074
3121	NC_007973	CGC	2	6	135583	135588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309074
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3123	NC_007973	CGC	3	9	135634	135642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309074
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3494	NC_007973	GC	3	6	152118	152123	0 %	0 %	50 %	50 %	94309092
3495	NC_007973	GTG	2	6	152158	152163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309092
3496	NC_007973	CGC	2	6	152283	152288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309092
3497	NC_007973	GC	4	8	152287	152294	0 %	0 %	50 %	50 %	94309092
3498	NC_007973	CG	3	6	152308	152313	0 %	0 %	50 %	50 %	94309092
3499	NC_007973	AGA	2	6	152330	152335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94309092
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