MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 chromosome

Total Repeats: 85498

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_007973	GTA	2	6	241087	241092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309172
5502	NC_007973	GCT	2	6	241093	241098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309172
5503	NC_007973	CGT	2	6	241133	241138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309172
5504	NC_007973	CTG	2	6	241614	241619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309173
5505	NC_007973	ACT	2	6	241624	241629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309173
5506	NC_007973	TCA	2	6	241672	241677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309173
5507	NC_007973	GAT	2	6	241688	241693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309173
5508	NC_007973	ATC	2	6	241704	241709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309173
5509	NC_007973	GTG	2	6	241719	241724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309173
5510	NC_007973	GAA	2	6	241751	241756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94309173
5511	NC_007973	GTGG	2	8	241767	241774	0 %	25 %	75 %	0 %	94309173
5512	NC_007973	GCT	2	6	241781	241786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309173
5513	NC_007973	GCT	3	9	241814	241822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309173
5514	NC_007973	CACG	2	8	241835	241842	25 %	0 %	25 %	50 %	94309173
5515	NC_007973	TTC	2	6	241944	241949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309173
5516	NC_007973	CAT	2	6	241955	241960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309173
5517	NC_007973	TTC	2	6	242025	242030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309173
5518	NC_007973	GTG	2	6	242046	242051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309173
5519	NC_007973	GC	5	10	242057	242066	0 %	0 %	50 %	50 %	94309173
5520	NC_007973	ATC	2	6	242067	242072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309173
5521	NC_007973	TGG	2	6	242080	242085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309173
5522	NC_007973	TTC	2	6	242103	242108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309173
5523	NC_007973	GCT	2	6	242204	242209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309173
5524	NC_007973	TGG	2	6	242254	242259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309173
5525	NC_007973	GC	3	6	242274	242279	0 %	0 %	50 %	50 %	94309173
5526	NC_007973	ATC	2	6	242295	242300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309173
5527	NC_007973	GAA	2	6	242322	242327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94309173
5528	NC_007973	CTG	2	6	242328	242333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309173
5529	NC_007973	CTC	2	6	242351	242356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94309173
5530	NC_007973	GCTGC	2	10	242361	242370	0 %	20 %	40 %	40 %	94309173
5531	NC_007973	GCT	2	6	242401	242406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309173
5532	NC_007973	GGT	2	6	242414	242419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309173
5533	NC_007973	CCA	2	6	242506	242511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309173
5534	NC_007973	GCA	2	6	242531	242536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309173
5535	NC_007973	GCG	2	6	242581	242586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309173
5536	NC_007973	TCA	2	6	242602	242607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309173
5537	NC_007973	GTG	2	6	242628	242633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309173
5538	NC_007973	CGA	2	6	242635	242640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309173
5539	NC_007973	CG	3	6	242697	242702	0 %	0 %	50 %	50 %	94309173
5540	NC_007973	GGT	3	9	242735	242743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309173
5541	NC_007973	CGCC	2	8	242771	242778	0 %	0 %	25 %	75 %	94309173
5542	NC_007973	TGC	2	6	242788	242793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309173
5543	NC_007973	AGC	2	6	242811	242816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309173
5544	NC_007973	CGA	2	6	242970	242975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5545	NC_007973	GCCCG	2	10	243003	243012	0 %	0 %	40 %	60 %	94309174
5546	NC_007973	TGG	2	6	243040	243045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309174
5547	NC_007973	GCC	2	6	243052	243057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309174
5548	NC_007973	TGG	2	6	243065	243070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309174
5549	NC_007973	CGC	2	6	243123	243128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309174
5550	NC_007973	GCA	2	6	243132	243137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5551	NC_007973	TTCC	2	8	243202	243209	0 %	50 %	0 %	50 %	94309174
5552	NC_007973	GC	4	8	243237	243244	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5553	NC_007973	CAA	2	6	243285	243290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94309174
5554	NC_007973	CG	3	6	243319	243324	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5555	NC_007973	GCC	2	6	243364	243369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309174
5556	NC_007973	TCG	2	6	243395	243400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5557	NC_007973	CG	3	6	243440	243445	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5558	NC_007973	CGA	2	6	243483	243488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5559	NC_007973	CTA	2	6	243495	243500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309174
5560	NC_007973	GGC	2	6	243523	243528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309174
5561	NC_007973	GGT	2	6	243546	243551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94309174
5562	NC_007973	GC	3	6	243576	243581	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5563	NC_007973	CGA	2	6	243615	243620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5564	NC_007973	GTC	2	6	243639	243644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5565	NC_007973	GCC	2	6	243681	243686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309174
5566	NC_007973	CGC	2	6	243740	243745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309174
5567	NC_007973	GCTG	2	8	243779	243786	0 %	25 %	50 %	25 %	94309174
5568	NC_007973	CAC	2	6	243792	243797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94309174
5569	NC_007973	GCA	2	6	243839	243844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5570	NC_007973	GC	3	6	243881	243886	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5571	NC_007973	AATC	2	8	243927	243934	50 %	25 %	0 %	25 %	94309174
5572	NC_007973	CCG	2	6	243947	243952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309174
5573	NC_007973	GC	3	6	244000	244005	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5574	NC_007973	CGA	2	6	244010	244015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309174
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5576	NC_007973	CTGC	2	8	244044	244051	0 %	25 %	25 %	50 %	94309174
5577	NC_007973	GCC	2	6	244073	244078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309174
5578	NC_007973	GC	4	8	244080	244087	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5579	NC_007973	GCC	2	6	244103	244108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94309174
5580	NC_007973	GCT	2	6	244110	244115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5581	NC_007973	GC	4	8	244209	244216	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5582	NC_007973	GC	3	6	244233	244238	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
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5584	NC_007973	TGAAC	2	10	244308	244317	40 %	20 %	20 %	20 %	94309174
5585	NC_007973	GGC	2	6	244326	244331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309174
5586	NC_007973	ACA	2	6	244349	244354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94309174
5587	NC_007973	CG	3	6	244355	244360	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5588	NC_007973	TC	3	6	244401	244406	0 %	50 %	0 %	50 %	94309174
5589	NC_007973	CGTGCG	2	12	244494	244505	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	94309174
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5591	NC_007973	TGC	2	6	244523	244528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5592	NC_007973	CGA	2	6	244611	244616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5593	NC_007973	TGC	2	6	244634	244639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5594	NC_007973	TCG	2	6	244646	244651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309174
5595	NC_007973	CGGC	2	8	244676	244683	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5596	NC_007973	TTC	2	6	244801	244806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94309174
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5599	NC_007973	CGGC	2	8	244889	244896	0 %	0 %	50 %	50 %	94309174
5600	NC_007973	GCG	3	9	244907	244915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309174
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5604	NC_007973	GCG	2	6	245125	245130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309175
5605	NC_007973	CTG	2	6	245206	245211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309175
5606	NC_007973	CG	3	6	245377	245382	0 %	0 %	50 %	50 %	94309175
5607	NC_007973	GCTG	2	8	245415	245422	0 %	25 %	50 %	25 %	94309175
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5611	NC_007973	GTGCC	2	10	245618	245627	0 %	20 %	40 %	40 %	94309175
5612	NC_007973	GCG	2	6	245691	245696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94309175
5613	NC_007973	CGA	2	6	245739	245744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94309175
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5618	NC_007973	CAT	2	6	245850	245855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94309175
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5993	NC_007973	GATG	2	8	261909	261916	25 %	25 %	50 %	0 %	94309190
5994	NC_007973	GCT	2	6	261918	261923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94309190
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5997	NC_007973	GGA	2	6	262217	262222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94309191
5998	NC_007973	GAT	2	6	262250	262255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94309191
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