MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL28

Total Repeats: 2054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007972	GAC	2	6	30	35	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152722
2	NC_007972	TGC	2	6	77	82	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152722
3	NC_007972	GCC	2	6	146	151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152722
4	NC_007972	CTC	2	6	379	384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152722
5	NC_007972	GCG	2	6	402	407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152722
6	NC_007972	GTC	2	6	489	494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152722
7	NC_007972	CAT	2	6	726	731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152722
8	NC_007972	GGT	2	6	804	809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152722
9	NC_007972	CTC	2	6	956	961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152722
10	NC_007972	TGG	2	6	965	970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152722
11	NC_007972	TGC	2	6	1004	1009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152722
12	NC_007972	CAG	2	6	1044	1049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152722
13	NC_007972	GAC	2	6	1150	1155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152722
14	NC_007972	GAA	2	6	1183	1188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152722
15	NC_007972	CGG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434859
16	NC_007972	GCG	3	9	1384	1392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434859
17	NC_007972	CAA	2	6	1490	1495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291434859
18	NC_007972	CGA	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434859
19	NC_007972	CTG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434859
20	NC_007972	GCC	2	6	1840	1845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434859
21	NC_007972	GTC	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434859
22	NC_007972	GTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291434859
23	NC_007972	GAA	2	6	1943	1948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291434859
24	NC_007972	CAG	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434859
25	NC_007972	GAA	2	6	2103	2108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291434859
26	NC_007972	TCG	2	6	2567	2572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434860
27	NC_007972	GCC	2	6	2602	2607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434860
28	NC_007972	AGA	3	9	2844	2852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291434860
29	NC_007972	GAC	2	6	2872	2877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434860
30	NC_007972	CCA	2	6	2905	2910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291434860
31	NC_007972	AGA	2	6	2958	2963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291434860
32	NC_007972	CAG	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434860
33	NC_007972	AGA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291434860
34	NC_007972	GCT	2	6	3460	3465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434860
35	NC_007972	AGG	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291434860
36	NC_007972	TGC	2	6	3539	3544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434860
37	NC_007972	ACG	2	6	3574	3579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434860
38	NC_007972	CGT	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434861
39	NC_007972	GCG	2	6	5014	5019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434861
40	NC_007972	ACC	2	6	5050	5055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291434861
41	NC_007972	GCT	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434861
42	NC_007972	GCC	2	6	5099	5104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434861
43	NC_007972	GGA	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291434861
44	NC_007972	GCA	2	6	5124	5129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434861
45	NC_007972	GGT	2	6	5340	5345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291434861
46	NC_007972	CGC	2	6	5412	5417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434861
47	NC_007972	TCG	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434861
48	NC_007972	TCA	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291434861
49	NC_007972	GCT	2	6	5476	5481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434861
50	NC_007972	CCG	2	6	5630	5635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434862
51	NC_007972	CGA	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434862
52	NC_007972	GGT	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291434862
53	NC_007972	TGC	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434862
54	NC_007972	CGA	2	6	5777	5782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434862
55	NC_007972	GCC	2	6	5934	5939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434862
56	NC_007972	TGC	2	6	6073	6078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434862
57	NC_007972	CCG	2	6	6176	6181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434863
58	NC_007972	GCC	2	6	6189	6194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434863
59	NC_007972	TGC	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434863
60	NC_007972	TCC	2	6	6211	6216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291434863
61	NC_007972	GCA	2	6	6302	6307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434863
62	NC_007972	GAC	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434863
63	NC_007972	CCA	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291434863
64	NC_007972	GCC	2	6	6642	6647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434863
65	NC_007972	CAG	2	6	6759	6764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434863
66	NC_007972	AGC	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434863
67	NC_007972	GCT	2	6	6854	6859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434863
68	NC_007972	GCG	2	6	6873	6878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434863
69	NC_007972	TGG	2	6	6983	6988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291434863
70	NC_007972	CGC	2	6	6997	7002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434863
71	NC_007972	GCC	2	6	7031	7036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434863
72	NC_007972	AAG	2	6	7096	7101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291434863
73	NC_007972	CAG	2	6	7170	7175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434863
74	NC_007972	CGC	2	6	7230	7235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434863
75	NC_007972	GGT	2	6	7328	7333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291434863
76	NC_007972	GCA	2	6	7652	7657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434864
77	NC_007972	CGC	3	9	7766	7774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434864
78	NC_007972	GGC	2	6	7808	7813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434864
79	NC_007972	GCG	2	6	7862	7867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434864
80	NC_007972	GAC	2	6	7878	7883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434864
81	NC_007972	GGC	2	6	7989	7994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434864
82	NC_007972	GGC	2	6	8030	8035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434864
83	NC_007972	GCT	2	6	8036	8041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434864
84	NC_007972	GAA	2	6	8067	8072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291434864
85	NC_007972	CCG	2	6	8101	8106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434864
86	NC_007972	GCG	2	6	8121	8126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434864
87	NC_007972	GGC	2	6	8150	8155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434864
88	NC_007972	GCC	2	6	8160	8165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434864
89	NC_007972	AGG	2	6	8188	8193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291434864
90	NC_007972	TGG	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291434864
91	NC_007972	GGC	2	6	8216	8221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434864
92	NC_007972	CGG	2	6	8271	8276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434864
93	NC_007972	GGA	3	9	8351	8359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291434864
94	NC_007972	GTC	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434864
95	NC_007972	GAC	2	6	8472	8477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434865
96	NC_007972	CTG	2	6	8493	8498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434865
97	NC_007972	GCC	2	6	8513	8518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434865
98	NC_007972	CTT	2	6	8527	8532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291434865
99	NC_007972	CGG	2	6	8798	8803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434866
100	NC_007972	GCG	2	6	8811	8816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434866
101	NC_007972	CAT	2	6	8874	8879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	291434866
102	NC_007972	CGC	2	6	8913	8918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434866
103	NC_007972	GGC	2	6	9022	9027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291434866
104	NC_007972	TGC	2	6	9031	9036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434866
105	NC_007972	CCG	2	6	9065	9070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434866
106	NC_007972	TGC	2	6	9095	9100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434866
107	NC_007972	TGG	2	6	9249	9254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291434867
108	NC_007972	CCG	2	6	9296	9301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434867
109	NC_007972	TCG	2	6	9460	9465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434867
110	NC_007972	GAG	2	6	9516	9521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291434867
111	NC_007972	AGG	2	6	9842	9847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291434867
112	NC_007972	CGA	2	6	9875	9880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434868
113	NC_007972	GAC	2	6	9891	9896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434868
114	NC_007972	GTG	2	6	9950	9955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291434868
115	NC_007972	GAA	2	6	9979	9984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	291434868
116	NC_007972	AGT	2	6	10073	10078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291434868
117	NC_007972	TGA	2	6	10305	10310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291434869
118	NC_007972	TGC	2	6	10579	10584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434869
119	NC_007972	TCG	2	6	10629	10634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434869
120	NC_007972	TGG	2	6	10707	10712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291434869
121	NC_007972	ACG	2	6	10713	10718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434869
122	NC_007972	TCC	2	6	10753	10758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291434869
123	NC_007972	CGA	2	6	10783	10788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291434869
124	NC_007972	CTG	2	6	10913	10918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434869
125	NC_007972	TCG	2	6	10939	10944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291434869
126	NC_007972	GAT	2	6	10949	10954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291434869
127	NC_007972	GCC	2	6	10963	10968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291434869
128	NC_007972	CAA	3	9	11062	11070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	291434870
129	NC_007972	GAG	2	6	11157	11162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	291434870
130	NC_007972	CTT	2	6	11237	11242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291434870
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499	NC_007972	GCT	2	6	44183	44188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152600
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