MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL28

Total Repeats: 2935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_007972	GTG	2	6	58163	58168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152617
1002	NC_007972	A	6	6	58225	58230	100 %	0 %	0 %	0 %	94152617
1003	NC_007972	GC	3	6	58242	58247	0 %	0 %	50 %	50 %	94152617
1004	NC_007972	GTG	2	6	58253	58258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152617
1005	NC_007972	GCT	2	6	58273	58278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1006	NC_007972	GCC	2	6	58292	58297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152617
1007	NC_007972	CTG	2	6	58328	58333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1008	NC_007972	TGA	2	6	58377	58382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152617
1009	NC_007972	TCA	2	6	58425	58430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152617
1010	NC_007972	TCG	2	6	58431	58436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1011	NC_007972	GGC	2	6	58449	58454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152617
1012	NC_007972	CTG	2	6	58484	58489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1013	NC_007972	AAAG	2	8	58760	58767	75 %	0 %	25 %	0 %	94152617
1014	NC_007972	TTG	2	6	58863	58868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152617
1015	NC_007972	TGAACC	2	12	58899	58910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94152617
1016	NC_007972	GTC	2	6	58912	58917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1017	NC_007972	CGC	2	6	59038	59043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152617
1018	NC_007972	GCC	2	6	59053	59058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152617
1019	NC_007972	CAT	2	6	59077	59082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152617
1020	NC_007972	GAC	2	6	59116	59121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1021	NC_007972	AGA	2	6	59151	59156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152617
1022	NC_007972	CAA	2	6	59173	59178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152617
1023	NC_007972	ACG	2	6	59181	59186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1024	NC_007972	GA	3	6	59262	59267	50 %	0 %	50 %	0 %	94152617
1025	NC_007972	CGA	2	6	59272	59277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1026	NC_007972	GGC	2	6	59281	59286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152617
1027	NC_007972	GAA	2	6	59314	59319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152617
1028	NC_007972	GACG	2	8	59332	59339	25 %	0 %	50 %	25 %	94152617
1029	NC_007972	CGC	2	6	59392	59397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152617
1030	NC_007972	CCG	2	6	59491	59496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152617
1031	NC_007972	AGC	2	6	59526	59531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1032	NC_007972	GC	3	6	59553	59558	0 %	0 %	50 %	50 %	94152617
1033	NC_007972	AGGCC	2	10	59584	59593	20 %	0 %	40 %	40 %	94152617
1034	NC_007972	GCG	2	6	59674	59679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152617
1035	NC_007972	CGG	2	6	59701	59706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152617
1036	NC_007972	CGCGG	2	10	59737	59746	0 %	0 %	60 %	40 %	94152617
1037	NC_007972	GAAGT	2	10	59756	59765	40 %	20 %	40 %	0 %	94152617
1038	NC_007972	GCC	2	6	59767	59772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152617
1039	NC_007972	GGC	2	6	59815	59820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152617
1040	NC_007972	CAT	2	6	59836	59841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152617
1041	NC_007972	GCG	2	6	59867	59872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152617
1042	NC_007972	GCG	2	6	59897	59902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152617
1043	NC_007972	CCG	2	6	59922	59927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152617
1044	NC_007972	G	6	6	59944	59949	0 %	0 %	100 %	0 %	94152617
1045	NC_007972	GCT	2	6	59959	59964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1046	NC_007972	CGG	2	6	59991	59996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152617
1047	NC_007972	GATGG	2	10	60077	60086	20 %	20 %	60 %	0 %	94152617
1048	NC_007972	TGA	2	6	60138	60143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152617
1049	NC_007972	TGG	2	6	60150	60155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152617
1050	NC_007972	CT	3	6	60157	60162	0 %	50 %	0 %	50 %	94152617
1051	NC_007972	TACAGG	2	12	60187	60198	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94152617
1052	NC_007972	GTC	2	6	60227	60232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1053	NC_007972	AGC	2	6	60334	60339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152617
1054	NC_007972	CGC	2	6	60456	60461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152618
1055	NC_007972	ATG	2	6	60588	60593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152618
1056	NC_007972	GGC	2	6	60647	60652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152618
1057	NC_007972	TGA	2	6	60672	60677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152618
1058	NC_007972	CTG	3	9	60713	60721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152618
1059	NC_007972	GT	3	6	60732	60737	0 %	50 %	50 %	0 %	94152618
1060	NC_007972	GTG	2	6	60758	60763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152618
1061	NC_007972	GAT	2	6	60799	60804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152618
1062	NC_007972	CTG	2	6	60827	60832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152618
1063	NC_007972	GCT	2	6	60871	60876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152618
1064	NC_007972	TGCC	2	8	60886	60893	0 %	25 %	25 %	50 %	94152618
1065	NC_007972	AAC	2	6	60911	60916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152618
1066	NC_007972	GCT	2	6	60946	60951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152618
1067	NC_007972	GCCT	2	8	60956	60963	0 %	25 %	25 %	50 %	94152618
1068	NC_007972	ACC	2	6	60992	60997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152618
1069	NC_007972	GCG	2	6	61040	61045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152618
1070	NC_007972	ATC	2	6	61055	61060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152618
1071	NC_007972	TTGT	2	8	61091	61098	0 %	75 %	25 %	0 %	94152618
1072	NC_007972	ATT	2	6	61156	61161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94152618
1073	NC_007972	GGCTTT	2	12	61219	61230	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94152618
1074	NC_007972	GT	3	6	61242	61247	0 %	50 %	50 %	0 %	94152618
1075	NC_007972	GA	3	6	61260	61265	50 %	0 %	50 %	0 %	94152618
1076	NC_007972	GAGCAT	2	12	61271	61282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94152618
1077	NC_007972	ACG	2	6	61320	61325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152618
1078	NC_007972	AGCATG	2	12	61335	61346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	94152618
1079	NC_007972	ATGGG	2	10	61354	61363	20 %	20 %	60 %	0 %	94152618
1080	NC_007972	CAT	2	6	61433	61438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152618
1081	NC_007972	GTC	2	6	61560	61565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1082	NC_007972	AGT	2	6	61596	61601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152619
1083	NC_007972	GC	3	6	61613	61618	0 %	0 %	50 %	50 %	94152619
1084	NC_007972	CGC	2	6	61705	61710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152619
1085	NC_007972	TGC	2	6	61737	61742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1086	NC_007972	GT	3	6	61750	61755	0 %	50 %	50 %	0 %	94152619
1087	NC_007972	CAG	2	6	61778	61783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1088	NC_007972	ATGG	2	8	61853	61860	25 %	25 %	50 %	0 %	94152619
1089	NC_007972	TGC	2	6	61902	61907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1090	NC_007972	CGA	2	6	61942	61947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1091	NC_007972	GCCT	2	8	61982	61989	0 %	25 %	25 %	50 %	94152619
1092	NC_007972	GCC	2	6	62010	62015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152619
1093	NC_007972	CCG	2	6	62041	62046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152619
1094	NC_007972	CGC	2	6	62069	62074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152619
1095	NC_007972	TCCGCG	2	12	62124	62135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	94152619
1096	NC_007972	GGC	2	6	62330	62335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152619
1097	NC_007972	TC	3	6	62345	62350	0 %	50 %	0 %	50 %	94152619
1098	NC_007972	AGA	2	6	62374	62379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94152619
1099	NC_007972	ATCG	2	8	62386	62393	25 %	25 %	25 %	25 %	94152619
1100	NC_007972	CGT	2	6	62465	62470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1101	NC_007972	CAT	2	6	62480	62485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152619
1102	NC_007972	CAT	2	6	62600	62605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152619
1103	NC_007972	TGA	2	6	62621	62626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94152619
1104	NC_007972	GA	3	6	62646	62651	50 %	0 %	50 %	0 %	94152619
1105	NC_007972	GCG	2	6	62688	62693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152619
1106	NC_007972	CT	3	6	62726	62731	0 %	50 %	0 %	50 %	94152619
1107	NC_007972	CAG	2	6	62735	62740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1108	NC_007972	CGC	2	6	62823	62828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152619
1109	NC_007972	ATGG	2	8	62876	62883	25 %	25 %	50 %	0 %	94152619
1110	NC_007972	CG	3	6	62907	62912	0 %	0 %	50 %	50 %	94152619
1111	NC_007972	ACA	2	6	62955	62960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152619
1112	NC_007972	GCGCC	2	10	63017	63026	0 %	0 %	40 %	60 %	94152619
1113	NC_007972	TGG	2	6	63052	63057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152619
1114	NC_007972	GGC	2	6	63146	63151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152619
1115	NC_007972	TGC	2	6	63399	63404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1116	NC_007972	GCG	2	6	63414	63419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152619
1117	NC_007972	GTC	2	6	63467	63472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1118	NC_007972	GTC	2	6	63547	63552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1119	NC_007972	GCA	2	6	63586	63591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1120	NC_007972	GAC	2	6	63594	63599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1121	NC_007972	GCA	2	6	63612	63617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152619
1122	NC_007972	CA	3	6	63616	63621	50 %	0 %	0 %	50 %	94152619
1123	NC_007972	AAGC	2	8	63636	63643	50 %	0 %	25 %	25 %	94152619
1124	NC_007972	GGC	2	6	63652	63657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152619
1125	NC_007972	TTG	2	6	63662	63667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152619
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1127	NC_007972	CAC	2	6	63725	63730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152619
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1250	NC_007972	GCC	2	6	72448	72453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152627
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