MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Cupriavidus metallidurans CH34 plasmid pMOL28

Total Repeats: 2935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007972	GCGA	2	8	33234	33241	25 %	0 %	50 %	25 %	94152590
502	NC_007972	TCG	2	6	33273	33278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152590
503	NC_007972	GTG	2	6	33279	33284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152590
504	NC_007972	GCA	2	6	33319	33324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152590
505	NC_007972	GC	3	6	33339	33344	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
506	NC_007972	TTC	2	6	33354	33359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94152590
507	NC_007972	AGCC	2	8	33437	33444	25 %	0 %	25 %	50 %	94152590
508	NC_007972	ACC	2	6	33477	33482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152590
509	NC_007972	GC	3	6	33497	33502	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
510	NC_007972	CTG	2	6	33510	33515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152590
511	NC_007972	GCCATC	2	12	33591	33602	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	94152590
512	NC_007972	CGGC	2	8	33640	33647	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
513	NC_007972	GGC	2	6	33680	33685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152590
514	NC_007972	CGGC	2	8	33688	33695	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
515	NC_007972	CGG	2	6	33719	33724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152590
516	NC_007972	GCG	2	6	33729	33734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152590
517	NC_007972	GCCG	2	8	33752	33759	0 %	0 %	50 %	50 %	94152590
518	NC_007972	CAC	2	6	33813	33818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152590
519	NC_007972	ACCTTG	2	12	33843	33854	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94152590
520	NC_007972	AC	3	6	33886	33891	50 %	0 %	0 %	50 %	94152590
521	NC_007972	TCA	2	6	33898	33903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152590
522	NC_007972	CGG	2	6	33982	33987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152590
523	NC_007972	GTT	2	6	34034	34039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94152590
524	NC_007972	CAA	2	6	34088	34093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152590
525	NC_007972	AGC	2	6	34102	34107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152590
526	NC_007972	CTG	2	6	34112	34117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152590
527	NC_007972	GGCT	2	8	34167	34174	0 %	25 %	50 %	25 %	94152591
528	NC_007972	CTG	2	6	34214	34219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152591
529	NC_007972	TGC	2	6	34227	34232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152591
530	NC_007972	GGC	2	6	34253	34258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152591
531	NC_007972	CGC	2	6	34276	34281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152591
532	NC_007972	GCGG	2	8	34303	34310	0 %	0 %	75 %	25 %	94152591
533	NC_007972	GCG	2	6	34367	34372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152591
534	NC_007972	CGA	2	6	34378	34383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152591
535	NC_007972	CTG	2	6	34403	34408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152591
536	NC_007972	TCG	2	6	34416	34421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152591
537	NC_007972	CCGA	2	8	34472	34479	25 %	0 %	25 %	50 %	94152591
538	NC_007972	AAC	2	6	34510	34515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94152591
539	NC_007972	CCG	2	6	34634	34639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152592
540	NC_007972	CCGG	2	8	34751	34758	0 %	0 %	50 %	50 %	94152593
541	NC_007972	ATGG	2	8	34759	34766	25 %	25 %	50 %	0 %	94152593
542	NC_007972	ACG	2	6	34767	34772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152593
543	NC_007972	CGT	2	6	34826	34831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152593
544	NC_007972	GTG	2	6	34843	34848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152593
545	NC_007972	GCC	2	6	34984	34989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152593
546	NC_007972	GGGT	2	8	35076	35083	0 %	25 %	75 %	0 %	94152593
547	NC_007972	GCTG	2	8	35093	35100	0 %	25 %	50 %	25 %	94152593
548	NC_007972	CCG	2	6	35113	35118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152593
549	NC_007972	CGC	2	6	35213	35218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152593
550	NC_007972	TGC	2	6	35262	35267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152593
551	NC_007972	CCG	2	6	35321	35326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152593
552	NC_007972	TGG	2	6	35383	35388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152593
553	NC_007972	CGG	3	9	35479	35487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152593
554	NC_007972	GTCA	2	8	35502	35509	25 %	25 %	25 %	25 %	94152593
555	NC_007972	CCA	2	6	35521	35526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152593
556	NC_007972	ACC	3	9	35544	35552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152593
557	NC_007972	TGC	2	6	35556	35561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152593
558	NC_007972	TGC	2	6	35565	35570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152593
559	NC_007972	GCC	2	6	35589	35594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152593
560	NC_007972	CAG	2	6	35891	35896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152594
561	NC_007972	GCT	2	6	35999	36004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152594
562	NC_007972	GTG	2	6	36030	36035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152594
563	NC_007972	GC	3	6	36057	36062	0 %	0 %	50 %	50 %	94152594
564	NC_007972	GCC	2	6	36079	36084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152594
565	NC_007972	GCG	2	6	36106	36111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152594
566	NC_007972	GCC	3	9	36330	36338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152594
567	NC_007972	CGT	2	6	36428	36433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152595
568	NC_007972	CCG	3	9	36444	36452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152595
569	NC_007972	GAC	2	6	36488	36493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
570	NC_007972	TAC	2	6	36503	36508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152595
571	NC_007972	CAT	2	6	36532	36537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152595
572	NC_007972	TCC	2	6	36609	36614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94152595
573	NC_007972	GCC	2	6	36628	36633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152595
574	NC_007972	GCG	2	6	36868	36873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152595
575	NC_007972	CTGC	2	8	36887	36894	0 %	25 %	25 %	50 %	94152595
576	NC_007972	CTA	2	6	36952	36957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152595
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578	NC_007972	CGA	2	6	37000	37005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
579	NC_007972	GAC	2	6	37033	37038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
580	NC_007972	TGGC	2	8	37040	37047	0 %	25 %	50 %	25 %	94152595
581	NC_007972	CCA	2	6	37159	37164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152595
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583	NC_007972	GGC	2	6	37193	37198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152595
584	NC_007972	CCG	2	6	37209	37214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152595
585	NC_007972	GCG	2	6	37237	37242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152595
586	NC_007972	TGG	2	6	37254	37259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152595
587	NC_007972	CGA	2	6	37291	37296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
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589	NC_007972	CGC	2	6	37339	37344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152595
590	NC_007972	CAG	3	9	37358	37366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
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593	NC_007972	CCG	2	6	37710	37715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152595
594	NC_007972	TCA	2	6	37731	37736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152595
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596	NC_007972	ATCG	2	8	37775	37782	25 %	25 %	25 %	25 %	94152595
597	NC_007972	CTA	2	6	37786	37791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152595
598	NC_007972	GC	3	6	37800	37805	0 %	0 %	50 %	50 %	94152595
599	NC_007972	GCT	2	6	37984	37989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152595
600	NC_007972	CAT	2	6	38047	38052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152595
601	NC_007972	CGC	2	6	38076	38081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152595
602	NC_007972	GCG	2	6	38087	38092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152595
603	NC_007972	CTG	3	9	38162	38170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152595
604	NC_007972	CTG	3	9	38246	38254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152595
605	NC_007972	CGA	2	6	38362	38367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
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607	NC_007972	CAC	2	6	38443	38448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94152595
608	NC_007972	TCG	2	6	38453	38458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152595
609	NC_007972	GCA	2	6	38481	38486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
610	NC_007972	GCA	2	6	38523	38528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
611	NC_007972	GGT	2	6	38587	38592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94152595
612	NC_007972	GAG	2	6	38663	38668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94152595
613	NC_007972	CTG	2	6	38720	38725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152595
614	NC_007972	ACG	2	6	38799	38804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
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619	NC_007972	AGC	3	9	39141	39149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
620	NC_007972	CGG	2	6	39180	39185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152595
621	NC_007972	CGT	2	6	39187	39192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94152595
622	NC_007972	CGC	2	6	39282	39287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94152595
623	NC_007972	GCA	2	6	39330	39335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94152595
624	NC_007972	GGC	2	6	39471	39476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94152596
625	NC_007972	GC	3	6	39531	39536	0 %	0 %	50 %	50 %	94152596
626	NC_007972	CTA	2	6	39617	39622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94152596
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